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Takifugu rubripes
cluster # 2614 cluster # 2614       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2614#0 length = 649 sequences # 9  

consensusID : consensus_2614#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 649
fasta sequence
                              [TTGGGTTGTTTTGCATTTTATTAATTAA-AAAGTACACTGTACATATTTACACAAAACACAAATTAATAATTTACTATTACCATTTACCATACAAAACATATGGGAAAAGTTCTGTATCTACATTGTTCATGAACCTGTAAAACTCTACATTTAATACGTAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACCACATCATTCGGACAGTGTTAAATTAATATACACATCACAGGATTTGATATTACACAAGAGACGTTCTTGTCGAAGTGTACTTTTGCACTAACAATGTTGCACAAACTCTAAATTTAATAATAATAATAAAACAAAAAACAGCCTGTTCTCTGCTCTCAGAACTTTTCTTCAATGATGTCACCTTTCTCTGTCTTGCTGCAGACAGTTTCGATCTCAGCCCTGCCGGGCAGCACACGTGTCCTCTGAGTGCTGAAGCGGATACCGTAGATGAAGTAGATGGCTAACCCCACTGCCATCCAAATAGCGTATCGTATCCACGTGTCTGGGCCTAACTGGACCATCAGGTAGGAATTGATAAAGATACTCAGTATAGGCAAAAACGGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGTGCCATTTTGGGGGTGTCTGAAGATCAGAGCGGTGTTGATCAGCACGATGGTGCC]

[+] EMBL CA329209             [TTGGGGTGGTTTGCATTTTATTAATTAA AAAGTACACTGTACATATTTACACAAAACACAAATTAATAATTTACTATTACCATTTACCATACAAAACATATGGGAAAAGTTCTGTATCTACATTGTTCATGAACCTGTAAAACTCTACATTTAATACGTAAAAAA    AAAAAAAAAAACCACATCATTCGGACAGTGTTAAATTAATATACACATCACAGGATTTGATATTACACAAGAAACGTTCTTGTCGAAGTGTACTTTTGCACTAACAATGTTGCACAAACTCTAAATTTAATAATAATAATAAAACAAAAAACAGCCTGTTCTCTGCTCTCAAAACTTTTCTTCAATGATGTCACCTTTCTCTGTCTTGCTGCAGACAGTTTCGATCTCAGCCCTGCCGGGCAGCACACGTGTCCTCTGAGTGCTGAAGCGGATACCGTAGATGAAGTAGATGGCTAACCCCACTGCCATCCAAATAGCGTATCGTATCCACGTGTCTGGGCCTAACTGGACCATCAGGTAGGAATTGATAAAGATACTCAGTATAGGCAAAAACGGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGTGCCATTTTGCGGTTGTCTGAAGATCAGAGCGGTGTTGATCAGCACGATGGTGCC]
[+] EMBL CA331852             [    GTTGTTTTGCATTTTATTAATTAA AAAGTACACTGTACATATTTACACAAAACACAAATTAATAATTTACTATTACCATTTACCATACAAAACATATGGGAAAAGTTCTGTATCTACATTGTTCATGAACCTGTAAAACTCTACATTTAATACGTAAAAAAAAAC AAAAAAAAAACCACATCATTCGGACAGTGTTAAATTAATATACACATCACAGGATTTGATATTACACAAGAGACGTTCTTGTCGAAGTGTACTTTTGCACTAACAATGTTGCACAAACTCTAAATTTAATAATAATAATAAAACAAAAAACAGCCTGTTCTCTGCTCTCAGAACTTTTCTTCAATGATGTCACCTTTCTCTGTCTTGCTGCAGACAGTTTCGATCTCAGCCCTGCCGGGCAGCACACGTGTCCTCTGAGTGCTGAAGCGGATACCGTAGATGAAGTAGATGGCTAACCCCACTGCCATCCAAATAGCGTATCGTATCCACGTGTCTGGGCCTAACTGGACCATCAGGTAGGAATTGATAAAGATACTCAGTATAGGC AAAACGGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGTGCCATTTTG                                             ]
[+] EMBL CA331672             [   tGTTGTTTTGCATTTTATTAATTAA AAAGTACACTGTACATATTTACACAAAACACAAATTAATAATTTACTATTACCATTTACCATACAAAACATATGGGAAAAGTTCTGTATCTACATTGTTCATGAACCTGTAAAACTCTACATTTAATACGTAAAAAAA   AAAAAAAAAAACCACATCATTCGGACAGTGTTAAATTAATATACACATCACAGGATTTGATATTACACAAGAGACGTTCTTGTCGAAGTGTACTTTTGCACTAACAATGTTGCACAAACTCTAAATTTAATAATAATAATAAAACAAAAAACAGCCTGTTCTCTGCTCTCAGAACTTTTCTTCAATGATGTCGCCTTTCTCTGTCTTGCTGCAGACAGTTTCGATCTCAGCCCTGCCGGGCAGCACACGTGTCCTCTGAGTGCTGAAGCGGATACCGTAGATGAAGTAGATGGCTAACCCCACTGCCATCCAAATAGCGTATCGTATCCACGTGTCTGGGCCTAACTGGACCATCAGGTAGGAATTGATAAAGATACTCAGTATAGGCAAAAACGGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGTGCCATTTTG                                             ]
[+] EMBL CA331758             [    GTTGTTTTGCATTTTATTTATTCA AAAGTACACTGTACATATTTACACAAAACACAAATTAATAATTTACTATTACCATTTACCATACAAAACATATGGGAAAAGTTCTGTATCTACATTGTTCATGAACCTGTAAAACTCTACATTTAATACGTAAAAAAA   AAAAAAAAAAACCACATCATTCGGACAGTGTTAAATTAATGTACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CA331941             [      TGTTTTGCATTTTATTAATTAA AAAGTACACTGTACATATTTACACAAAACACAAATTAATAATTTACTATTACCATTTACCATACAAAACATATGGGAAAAGTTCTGTATCTACATTGTTCATGAACCTGTAAAACTCTACATTTAATACGTAAAAAAAAAC AAAAAAAAAACCACATCATTCGGACAGTGTTAAATTAATATACACATCACAGGATTTGATATTACACAAGAGACGTTCTTGTCGAAGTGTACTTTTGCACTAACAATGTTGCACAAACTCTAAATTTAATAATAATAATAAAACAAAAAACAGCCTGTTCTCTGCTCTCAGAACTTTTCTTCAATGATGTCACCTTTCTCTGTCTTGCTGCAGACAGTTTCGATCTCAGCCCTGCCGGGCAGCACACGTGTCCTCTGAGTGCTGAAGCGGATACCGTAGATGAAGTAGATGGCTAACCCCACTGCCATCCAAATAGCGTATCGTATCCACGTGTCTGGGCCTAACTGGACCATCAGGTAGGAATTGATAAAGATACTCAGTATAGGCAAAAACGGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGTGCCATTTTG                                             ]
[+] EMBL CA331807             [      TGGTTTGCATTTTATTAATTAACAAAGTACACTGTACATATTTACACAAAACACAAATTAATAATTTACTATTACCATTTACCATACAAAACATATGGGAAAAGTTCTGTATCTACATTGTTCATGAACCTGTAAAACTCTACATTTAATACGTAAAAAAAAAC AAAAAAAAAACCACATCATTCGGACAGTGTTAAATTAATATACACATCACAGGATTTGATATTACACAAGAGACGTTCTTGTCGAAGTGTACTTTTGCACTAACAATGTTGCACAAACTCTAAATTTAATAATAATAATAAAACAAAAAACAGCCTGTTCTCTGCTCTCAGAACTTTTCTTCAATGATGTCACCTTTCTCTGTCTTGCTGCAGACAGTTTCGATCTCAGCCCTGCCGGGCAGCACACGTGTCCTCTGAGTGCTGAAGCGGATACCGTAGATGAAGTAGATGGCTAACCCCACTGCCATCCAAATAGCGTATCGTATCCACGTGTCTGGGCCTAACTGGACCATCAGGTAGGAATTGATAAAGATACTCAGTATAGGCAAAAACGGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGTGCCAT                                                 ]
[+] EMBL CA332089             [      TGTTTTGCATTTTATTAATTAA AAAGTACACTGTACATATTTACACAAAACACAAATTAATAATTTACTATTACCATTTACCATACAAAACATATGGGAAAAGTTCTGTATCTACATTGTTCATGAACCTGTAAAACTCTACATTTAATACGTAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACCACATCATTCGGACAGTGTTAAATTAATATACACATCACAGGATTTGATATTACACAAGAGACGTTCTTGTCGAAGTGTACTTTTGCACTAACAATGTTGCACAAACTCTAAATTTAATAATAATAATAAAACAAAAAACAGCCTGTTCTCTGCTCTCAGAACTTTTCTTCAATGATGTCACCTTTCTCTGTCTTGCTGCAGACAGTTTCGATCTCAGCCCTGCCGGGCAGCACACGTGTCCTCTGAGTGCTGAAGCGGATACCGTAGATGAAGTAGATGGCTAACCCCACTGCCATCCAAATAGCGTATCGTATCCACGTGTCTGGGCCTAACTGGACCATCAGGTAGGAATTGATAAAGATACTCAGTATAGGCAAAAACGGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGTGCCATTTTG                                             ]
[+] EMBL CA331617             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATAGATGGCTAACCCCACTGGCATCCAAATAGCGCATCGTATCCACGTGGTTGGGCCTAACTGGACCATCAGGGATGAATTGATAAAAATACTCCGTATAGGCAAAAACCGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGTGCCAATTTGGGGGTG                                       ]
[+] EMBL CA332066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATATATGGGTAACCCCACTGCCATCCAAATAGGGTATCGTATCCACCAGTCTGGGCCTAACTGGACCATCAGGCAGGAATTGATAAAGATACCCAGTATAGGCAAAAACGGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGAGCCATTTTG                                             ]


>consensus_2614#0 TTGGGTTGTTTTGCATTTTATTAATTAAAAAGTACACTGTACATATTTACACAAAACACA AATTAATAATTTACTATTACCATTTACCATACAAAACATATGGGAAAAGTTCTGTATCTA CATTGTTCATGAACCTGTAAAACTCTACATTTAATACGTAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA CCACATCATTCGGACAGTGTTAAATTAATATACACATCACAGGATTTGATATTACACAAG AGACGTTCTTGTCGAAGTGTACTTTTGCACTAACAATGTTGCACAAACTCTAAATTTAAT AATAATAATAAAACAAAAAACAGCCTGTTCTCTGCTCTCAGAACTTTTCTTCAATGATGT CACCTTTCTCTGTCTTGCTGCAGACAGTTTCGATCTCAGCCCTGCCGGGCAGCACACGTG TCCTCTGAGTGCTGAAGCGGATACCGTAGATGAAGTAGATGGCTAACCCCACTGCCATCC AAATAGCGTATCGTATCCACGTGTCTGGGCCTAACTGGACCATCAGGTAGGAATTGATAA AGATACTCAGTATAGGCAAAAACGGAACTAAAGGCATCATGAAGGTTGCTTTGGTGCCAT TTTGGGGGTGTCTGAAGATCAGAGCGGTGTTGATCAGCACGATGGTGCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)