These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2746#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 16 consensus length = 793 fasta sequence [AGTCAAGAAACAGGTTCCATTACTCACTTCGGTGGGAATTTCTTTACAATCTGTTACCCAAAAGCACCACACCCGCGGATACTGCCTTTGCGCCAAGACGCAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC-AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC-GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA-GCAGTCG-TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTTAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTGCCGCGCTACGAGGACGAGCTGACCGGCCTGGCCAAGACCAAATACATCTACTCCTCGGCCTAAAGGCCGAACCTGGACACACGCCCCATCGTGGTGTTTCCTCTCTCCCA] [+] EMBL CA590317 [AGTCAAGAAACAGGTTCCATTACTCACTTCGGTGGGAATTTCTTTACAATCTGTTACCCAAAAGCACCACACCCGCGGATACTGCCTTTGCGCCAAGACGCAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTTAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGT ] [+] EMBL FR0062863 [ TTACAATCTGTTACCCAAAAGCACCACACCCGCGGATACTGCCTTTGCGCCAAGACGCAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGGCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGAAGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATACG AGGACGAGTACCGGAAGCAGGAACGGTGCGTGGGACCCAGCCGCCCCCTCATGCAG ] [+] EMBL BU808287 [ AAAGCACCACACCCGCGGATACTGCCTTTGCGCCAAGACGCAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACTAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTTAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTG ] [+] EMBL BU808595 [ CTGCCTTTGCGCCAAGACGCAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCACACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTTAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTG ] [+] EMBL BU808321 [ CTGCCTTTGCGCCAAGACGCAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTTAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTGCCGCGCTACGAGGACGAG ] [+] EMBL BU807889 [ GCCTTTGCGCCAAGACGCAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTCAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTG ] [+] EMBL BU805776 [ GCCTTTGCGCCAAGACGCAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTTAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCC ] [+] EMBL CA846253 [ CTTAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGGTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTCAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTGCCGCGCTACGAGGACGAGCTGACCGGCCTGGCCAAGACCAAATACATCTACTCCTCGGCCTAAAGGCCGAACCTGGACACACGCCCCATCG ] [+] EMBL BU808574 [ CAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTTAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTG ] [+] EMBL BU806502 [ CAGAAGACGAACACACCCGTGTGCACCGCACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGTACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTCAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTGCCGCGCTACGAGGACGAGC ] [+] EMBL BU807282 [ GTGTGCACCGCACCGCGCGTCTTTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCA ] [+] EMBL BU808289 [ ACCGCGCGTCCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTTAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTGCCGCGCTACGAGGACGAGCTGAC ] [+] EMBL CA846179 [ ACCGTTCGACCCTGCACTCCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCTGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCTCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTCAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTGCCGCGCTACGAGGACGAGCTGACCGGCCTGGCCAAGACCAAATACATCTACTCCTCGGCCTAAAGGCCGAACCTGGACACACGCCCCATCGTGGTGTTTCCTCTCTCCCA] [+] EMBL BU808194 [ CCCTGCTCTGTGTCCCGGTCCACAAACTCCGGTCGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGCCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGAGGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCTCCTGCCCTTCGTGGGGGTGCTGTTGATCGTTGTCGTGGTCCTTCAGGTCATCGCCCTCATCATCTACCCCGTCAAGTTCAACGAGCTGATCTTCGAGGGCAACTATTACTACACCTGGGCGTACGGCTTCGGCTGGGGTGCCACCATCCTCTGCATCGGCTGCGCCATCCTCTTCTGCTGCCTGCCGCGCTACGAGGACGAGCTGACCGGCCTGGCCAAGACCAAATACATCTACTCCTCGGCCTAAAGGCCGAACCTGG ] [+] EMBL FR0061807 [ tTTGTCGGTCATGTTTCGCTGCGGGATAGGCTACCCCCGCTGC AGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGAGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGGGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACATCCCCCT ] [+] EMBL FR0061808 [ CGGGATAGCCTACCCCCGCTGCGAGGTGGATCCTGCCCCTGCTGCTGCTCTTCGCCATTATTTTTGACATAATCGCCATCGCCGCCACCTCCGGATGGGTCGAGGACGAGGACGCGAAGACCCACTACGCCAATATGTGGGACGAGTACC GAGGCAGGAACGGTGCGTGGGA GCAGTCG TCCCTCATGCAGTATGCCTGGGCCAAAGCCGTCGCCGCTCTGATGATCATCGGCCTCCTCGTCCTCATCGTCGCCTTCATCATCTCCTGCGTGGCGCTCTGCTGCTCGCTCAACAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |