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Apis mellifera
cluster # 1040 cluster # 1040       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1040#0 length = 773 sequences # 3  
consensusID : consensus_1040#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 773
fasta sequence 
                              [ATTATTTGCGCGAATTTGTATCAAGATGTTTGAAAATTCAAAATAGTTAATATATACATTCTGTACATAATGGCATATACAAAAAAAATTCAAAAATCNNAATTATTTTTGAATATATCGATATACATAAACATCAATTTGCAAAGATATAATTTAAAGATATAAAATAGCGTTTTAACTAGCTGGTATTTGTGGCAAACCAAATTCATCGACTAAAACTCCATCCTTATTTCTAACAGAGCTTGTACCAGGTTCTTTGTCAGGAGCACTAGGTGCCTTGATAGCATCATCCAAGTAACTGGTATCTTCGTCGATAGCTAAATCATCTCCAAGAGCTTCTAATTCAGCAGCTAATTCATCCTCATCTATATCTGGCATACCATAACTGCGACCCATTGCTTCTTGTACTTCGTCGGCTTGTTCTAACATGTCTGCTAAATCATCTTGAAGATCCTCGATTTGATCTATATTGATGTGTTTAAATTCTTTCTGCATTTGTTTAACTCCTTCTTTCATAGCAATTACAGTTGTTTGAGTATCTTTTAACGTTTGAGTAGCATAATTTGCTTGTTCCATGTTAAAAGCTTGTTGACGCAAATTATCTACTTGTGCTTCGTACATTTTACGTTGTTTCAAAATGCGCAATGCTTTAGCTTTTACAGAATTTTTTGCAGGACCTTCTCTCATTTTGGCCATTTGATCTTTGTACTTTTTTAATTCCGCGTCCAATTTCGCTATTTTTTTCTCTGCAGAATCCGCTCTACTGTCGACCC]

[+] EMBL BI508942             [ATTATTTGCGCGAATTTGTATCAAGATGTTTGAAAATTCAAAATAGTTAATATATACATTCTGTACATAATGGCATATACAAAAAAAATTCAAAAATCTCAATTATTTTTGAATATATCGATATACATAAACATCAATTTGCAAAGATATAATTTAAAGATATAAAATAGCGTTTTAACTAGCTGGTATTTGTGGCAAACCAAATTCATCGACTAAAACTCCATCCTTATTTCTAACAGAGCTTGTACCAGGTTCTTTGTCAGGAGCACTAGGTGCCTTGATAGCATCATCCAAGTAACTGGTATCTTCGTCGATAGCTAAATCATCTCCAAGAGCTTCTAATTCAGCAGCTAATTCATCCTCATCTATATCTGGCATACCATAACTGCGACCCATTGCTTCTTGTACTTCGTCGGCTTGTTCTAACATGTCTGCTAAATCATCTTGAAGATCCTCGATTTGATCTATGTTGATGTGTTTAAATTCTTTCTGCATTTGTTTAACTCCTTCTTTCATAGCAATTACAGTTGTTTGAGTATCTTTTAACGTTTGAGTAGCATAATTTGCTTGTTCCATGTTAAAAGCTTGTTGACGCAAATTATCTACTTGTGCTT                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL BI508589             [                                                                ACATAATGGCATATACAAAAAAAATTCAAAAATCNNAATTATTTTTGAATATATCGATATACATAAACATCAATTTGCAAAGATATAATTTAAAGATATAAAATAGCGTTTTAACTAGCTGGTATTTGTGGCAAACCAAATTCATCGACTAAAACTCCATCCTTATTTCTAACAGAGCTTGTACCAGGTTCTTTGTCAGGAGCACTAGGTGCCTTGATAGCATCATCCAAGTAACTGGTATCTTCGTCGATAGCTAAATCATCTCCAAGAGCTTCTAATTCAGCAGCTAATTCATCCTCATCTATATCTGGCATACCATAACTGCGACCCATTGCTTCTTGTACTTCGTCGGCTTGTTCTAACATGTCTGCTAAATCATCTTGAAGATCCTCGATTTGATCTATATTGATGTGTTTAAATTCTTTCTGCATTTGTTTAACTCCTTCTTTCATAGCAATTACAGTTGTTTGAGTATCTTTTAACGTTTGAGTAGCATAATTTGCTTGTTCCATGTTAAAAGCTTGTTGACGCAAATTATCTACTTGTGCTTCGTACATTTTACGTTGTTTCAAAATGCGCAATGCTTTAGCTTTTACAG                                                                                                               ]
[-] EMBL BI508172             [                                                                                                                          ATACATAAACATCAATTTGCAAAGATATAATTTAAAGATATAAAATAGCGTTTTAACTAGCTGGTATTTGTNNCAAACCAAATTCATCGACTAAAACTCCATCCTTATTTCTAACAGAGCTTGTACCAGGTTCTTTGTCAGGAGCACTAGGTGCCTTGATAGCATCATCCAAGTAACTGGTATCTTCGTCGATAGCTAAATCATCTCCAAGAGCTTCTAATTCAGCAGCTAATTCATCCTCATCTATATCTGGCATACCATAACTGCGACCCATTGCTTCTTGTACTTCGTCGGCTTGTTCTAACATGTCTGCTAAATCATCTTGAAGATCCTCGATTTGATCTATATTGATGTGTTTAAATTCTTTCTGCATTTGTTTAACTCCTTCTTTCATAGCAATTACAGTTGTTTGAGTATCTTTTAACGTTTGAGTAGCATAATTTGCTTGTTCCATGTTAAAAGCTTGTTGACGCAAATTATCTACTTGTGCTTCGTACATTTTACGTTGTTTCAAAATGCGCAATGCTTTAGCTTTTACAGAATTTTTTGCAGGACCTTCTCTCATTTTGGCCATTTGATCTTTGTACTTTTTTAATTCCGCGTCCAATTTCGCTATTTTTTTCTCTGCAGAATCCGCTCTACTGTCGACCC]




>consensus_1040#0
ATTATTTGCGCGAATTTGTATCAAGATGTTTGAAAATTCAAAATAGTTAATATATACATT
CTGTACATAATGGCATATACAAAAAAAATTCAAAAATCNNAATTATTTTTGAATATATCG
ATATACATAAACATCAATTTGCAAAGATATAATTTAAAGATATAAAATAGCGTTTTAACT
AGCTGGTATTTGTGGCAAACCAAATTCATCGACTAAAACTCCATCCTTATTTCTAACAGA
GCTTGTACCAGGTTCTTTGTCAGGAGCACTAGGTGCCTTGATAGCATCATCCAAGTAACT
GGTATCTTCGTCGATAGCTAAATCATCTCCAAGAGCTTCTAATTCAGCAGCTAATTCATC
CTCATCTATATCTGGCATACCATAACTGCGACCCATTGCTTCTTGTACTTCGTCGGCTTG
TTCTAACATGTCTGCTAAATCATCTTGAAGATCCTCGATTTGATCTATATTGATGTGTTT
AAATTCTTTCTGCATTTGTTTAACTCCTTCTTTCATAGCAATTACAGTTGTTTGAGTATC
TTTTAACGTTTGAGTAGCATAATTTGCTTGTTCCATGTTAAAAGCTTGTTGACGCAAATT
ATCTACTTGTGCTTCGTACATTTTACGTTGTTTCAAAATGCGCAATGCTTTAGCTTTTAC
AGAATTTTTTGCAGGACCTTCTCTCATTTTGGCCATTTGATCTTTGTACTTTTTTAATTC
CGCGTCCAATTTCGCTATTTTTTTCTCTGCAGAATCCGCTCTACTGTCGACCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)