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Apis mellifera
cluster # 124 cluster # 124       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_124#0 length = 767 sequences # 7  
consensusID : consensus_124#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 767
fasta sequence 
                              [AGGCCAGACCATTAGTNNCCGCATATTCCGNGTGCGNTGATAATATAATTTTAATTTCCNATCGGCGTATTCAACTTTTTTCAATATGTCAGACTGGGACACTACTCCTATTACTCTGCGAAAACGTCCCCCAAAAGCTTCAGTACTTAAATCGGAACAAGCAGTGAATGCTGCACGTCGTCAAGGTTTCGTGGTCGAAACTCAAGCAAAATGGGGTGGAGGAACAAATAAACAACACGTAGCAACTAAAAACACTGCTAAATTGGATAGAGAAACAGAAGAATTAAAACATGATAAAATTCCACTTGATCTTGGTAAATTAATTCAACAGGGAAGACAAAGTAAAGGATTATCTCAAAAAGATCTTGCAACAAAAGTGAATGAAAAAGCACAAGTTATCAATGACTATGAAGCAGGTCGTGGAATACCAAATCAAATGGTGATTGGCAAAATTGAACGAGTGTTGGGAATAAAATTACGTGGCAAAGATCGTGGTAAACCATTATCAACT-CCTGGGAATAAAAAGTGAATTTTGTGAAGAAGAATCTGTACTTCATACCTTCATATATTGTTCCCTACACAGAACTGCAAGAAAAATTGTAGGATTGAGAACAATTCTCACACTCTTTAACTTTCGTTATTTTATTATATTCTTTAAAATAAAATGTTATTTTATTAAATATATTATTGTTTATTATAAAGTAAATTGNNATAGTATGTCTTCATGTATAAAATACAAGAAGCACACTCTTATTTAATTTTAAATG]

[+] EMBL BG101684             [AGGCCAGACCATTAGTNNCCGCATATTCCGNGTGCGNTGATAATATAATTTTAATTTCCNATCGGCGTATTC NCTTTTTTCAATATGTCAGACTGGGACACTACTCCTATTACTCTGCGAAAACGTCCCCCAAAAGCTTCAGTACTTAAATCGGAACAAGCAGTGAATGCTGCACGTCGTCAAGGTTTCGTGGTCGAAACTCAAGCAAAATGGGGTGGAGGAACAAATAAACAACACGTAGCAACTAAAAACACTGCTAAATTGGATAGAGAAACAGAAGAATTAAAACATGATAAAATTCCACTTGATCTTGGTAAATTAATTCAACAGGGAAGACAAAGTAAAGGATTATCTCAAAAAGATCTTGCAACAAAAGTGAATGAAAAAGCACAAGTTATCAATGACTATGAAGCAGGTCGTGGAATACCAAATCAAATGGTGATTGGCAAAATTGAACGAGTGTTGGGAATAAAATTACGTGGCAAAGATCGTGGTAAACCATTATCAACTCCCTGGGAATAAAAAGTGAATTT                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI516925             [                                                    ttTTTTCTATCGGCGTATTCAACTTTTTTCAATATGTCAGACTGGGACACTACTCCTATTACTCTGCGAAAACGTCCCCCAAAAGCTTCAGTACTTAAATCGGAACAAGCAGTGAATGCTGCACGTCGTCAAGGTTTCGTGGTCGAAACTCAAGCAAAATGGGNNNGAGGAACAAATAAACAACACGTAGCAACTAAAAACACTGCTAAATTGGATAGAGAAACAGAAGAATTAAAACATGATAAAATTCCACTTGATCTTGGTAAATTAATTCAACAGGGAAGACAAAGTAAAGGATTATCTCAAAAAGATCTTGCAACAAAAGTGAATGAAAAAGCACAAGTTATCAATGACTATGAAGCAGGTCGTGGAATACCAAATCAAATGNNGATTGGCAAAATTGAACGAGTGTTGGGAATAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI509263             [                                                             TCGGCGTATTCAACTTTTTTCAATATGTCAGACTGGGACACTACTCCTATTACTCTGCGAAAACTTCCCCCAAAAGCTTCAGTACTTAAATCGGAACAAGCAGTGAATGCTGCACGTCGTCAAGGTTTCGTGGTCGAAACTCAAGCAAAATGGGGTGGAGGAACAAATAAACAACACGTAGCAACTAAAAACACTGCTAAATTGGATAGAGAAACAGAAGAATTAAAACATGATAAAATTCCACTTGATCTTGGTAAATTAATTCAACAGGGAAGACAAAGTAAAGGATTATCTCAAAAAGATCTTGCAACAAAAGTGAATGAAAAAGCACAAGTTATCAATGACTATGAAGCAGGTCGTGGAATACCAAATCAAATGGTGATTGGCAAAATTGAACGAGTGTTGGGAATAAAATTACGTGGCAAAGATCGTGGTAAACCATTATCAACT CCTGGGAATAAAAAGTGAATTTTGTGAAGAAGAATCTGTACTTCATACCTTCATATATTGTTCCCTACACAGAACTGCAAGAAAAATTGTAGGATTGAGAACAATTCTCACACTCTTTAACTTTCGTTATTTTATTATATTCTTTAAA                                                                                                            ]
[+] EMBL BI515585             [                                                                                                                                     AAAGCTTCAGTACTTAAATCGGAACAAGCAGTGAATGCTGCACGTCGTCAAGGTTTCGTGGTCGAAACTCAAGCAAAATGGGGTGGAGGAACAAATAAACAACACGTAGCAACTAAAAACACTGCTAAATTGGATAGAGAAACAGAAGAATTAAAACATGATAAAATTCCACTTGATCTTGGTAAATTAATTCAACAGGGAAGACAAAGTAAAGGATTATCTCAAAAAGATCTTGCAACAAAAGTGAATGAAAAAGCACAAGTTATCAATGACTATGAAGCAGGTCGTGGAATACCAAATCAAATGGTGATTGGCAAAATTGAACGAGTGTTGGGAATAAAATTACGTGGCAAAGATCGTGGTAAACCATTATCAACT CCTGGGAATAAAAAGTGAATTTTGTGAAGANNNATCTGTACTTCATACCTTCATATATTGTTCCCTACACAGAACTGCAAGAAAAATTGTAGGATTGAGAACAATTCTCA                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI516114             [                                                                                                                                       AGCTTCAGTACTTAAATCGGAACAAGCAGTGAATGCTGCACGTCGTCAAGGTTTCGTGGTCGAAACTCAAGCAAAATGGGGTGGAGGAACAAATAAACAACACGTAGCAACTAAAAACACTGCTAAATTGGATAGAGAAACAGAAGAATTAAAACATGATAAAATTCCACTTGATCTTGGTAAATTAATTCAACAGGGAAGACAAAGTAAAGGATTATCTCAAAAAGATCTTGCAACAAAAGTGAATGAAAAAGCACAAGTTATCAATGACTATGAAGCAGGTCGTGGAATACCAAATCAAATGGTGATTGGCAAAATTGAACGAGTGTTGGGAATAAAATTACGTGGCAAAGATCGTGGTAAACCATTATCAACT CCTGGGAATAAA                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI514158             [                                                                                                                                           TCAGTACTTAAATCGGAACAAGCAGTGAATGCTGCACGTCGTCAAGGTTTCGTGGTCGAAACTCAAGCAAAATGGGGTGGAGGAACAAATAAACAACACGTAGCAACTAAAAACACTGCTAAATTGGATAGAGAAACAGAAGAATTAAAACATGATAAAATTCCACTTGATCTTGGTAAATTAATTCAACAGGGAAGACAAAGTAAAGGATTATCTCAAAAAGATCTTGCAACAAAAGTGAATGAAAAAGCACAAGTTATCAATGACTATGAAGCAGGTCGTGGAATACCAAATCAAATGGTGATTGGCAAAATTGAACGAGTGTTGGGAATAAAATTACGTGGCAAAGATCGTGGTAAACCATTATCAACT CCTGGGAATAAAAAGTGAATTTTGTGAAGAAGAATCTGTACTTCATACCTTCATTTATTGTTCCCTACACAGAACTGCAAGAAAAATTGTAGGATTGAGAACAATTCTCACACTCTTTAACTTTCGTTATTTTATTATATTCTTTAAAATAAAA                                                                                                      ]
[+] EMBL BI507759             [                                                                                                                                                                       ATGCTGCACGTCGTCAAGGTTTCGTGGTCGAAACTCAAGCAAAATGGGGTGGAGGAACAAATAAACAACACGTAGCAACTAAAAACACTGCTAAATTGGATAGAGAAACAGAAGAATTAAAACATGATAAAATTCCACTTGATCTTGGTAAATTAATTCAACAGGGAAGACAAAGTAAAGGATTATCTCAAAAAGATCTTGCAACAAAAGTGAATGAAAAAGCACAAGTTATCAATGACTATGAAGCAGGTCGTGGAATACCAAATCAAATGGTGATTGGCAAAATTGAACGAGTGTTGGGAATAAAATTACGTGGCAAAGATCGTGGTAAACCATTATCAACT CCTGGGAATAAAAAGTGAATTTTGTGAAGAAGAATCTGTACTTCATACCTTCATATATTGTTCCCTACACAGAACTGCAAGAAAAATTGTAGGATTGAGAACAATTCTCACACTCTTTAACTTTCGTTATTTTATTATATTCTTTAAAATAAAATGTTATTTTATTAAATATATTATTGTTTATTATAAAGTAAATTGNNATAGTATGTCTTCATGTATAAAATACAAGAAGCACACTCTTATTTAATTTTAAATG]




>consensus_124#0
AGGCCAGACCATTAGTNNCCGCATATTCCGNGTGCGNTGATAATATAATTTTAATTTCCN
ATCGGCGTATTCAACTTTTTTCAATATGTCAGACTGGGACACTACTCCTATTACTCTGCG
AAAACGTCCCCCAAAAGCTTCAGTACTTAAATCGGAACAAGCAGTGAATGCTGCACGTCG
TCAAGGTTTCGTGGTCGAAACTCAAGCAAAATGGGGTGGAGGAACAAATAAACAACACGT
AGCAACTAAAAACACTGCTAAATTGGATAGAGAAACAGAAGAATTAAAACATGATAAAAT
TCCACTTGATCTTGGTAAATTAATTCAACAGGGAAGACAAAGTAAAGGATTATCTCAAAA
AGATCTTGCAACAAAAGTGAATGAAAAAGCACAAGTTATCAATGACTATGAAGCAGGTCG
TGGAATACCAAATCAAATGGTGATTGGCAAAATTGAACGAGTGTTGGGAATAAAATTACG
TGGCAAAGATCGTGGTAAACCATTATCAACTCCTGGGAATAAAAAGTGAATTTTGTGAAG
AAGAATCTGTACTTCATACCTTCATATATTGTTCCCTACACAGAACTGCAAGAAAAATTG
TAGGATTGAGAACAATTCTCACACTCTTTAACTTTCGTTATTTTATTATATTCTTTAAAA
TAAAATGTTATTTTATTAAATATATTATTGTTTATTATAAAGTAAATTGNNATAGTATGT
CTTCATGTATAAAATACAAGAAGCACACTCTTATTTAATTTTAAATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)