Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 144 cluster # 144       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_144#0 length = 1583 sequences # 6  
consensusID : consensus_144#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1583
fasta sequence 
                              [ATTTGTAATATCCTAGAAAAAAAATGACAAAATGGTTGCTGTTGATGGTATGCCTTGGCATAGCTTGTCAAAATATTAGAGGTGGCGTTGTTCGAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGACAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTCAAGCTATGGATTCGACAAATACTATGNNGTACATGGTAGACAACAAAAATACTTTGATCATCTACCAAAATGCCGATGATTCTTTTCATCGATTGTCTTCCCACACTTTGAATCACAACTCTGACAAAATGTCAGATCAACAAGAAAATCTCACCTTGAAAGAAGTAGACAACAAAGTTTATGGAATGGCACTTAGTCCCGTGACGCATAATCTTTATTACAATTCTCCGTCTTCTGAGAATTTGTATTATGTTAACACAGAATCGTTAATGAAATCGGAAAATCAAGGAAATGACGTGCAATATGAAAGAGTCCAAGACGTTTTCGACAGTCAATTAACCGTTAAAGCAGTATCGAAAAATGGCGTACTCCTTTTCGGACTCGCGAATAATACTCTTAGTTGCTGGAACGAGCATCAGTCACTTGACAGACAAAATATCGATGTCGTAGCTCGAAATGAGGACACGCTTCAAATGGTCGTTAGTATGAAGATTAAGCAAAACGTTCCACAATCTGGCAGAGTTAATAATACGCAAAGAAATGAATATTTGTTGGCTTTAAGCGACAGAAACCAGAACGTGCTAAACAACGATCTTAATCTCGAACACGTGAACTTCCAAATTTTGGGCGCTAACGTAAACGACTTGATACGGAATAGTCGTTGCGCAAATTTTGACAATCAGGATAATAATCACTATAATCATAATCATAATCAAGCTCGTCATTCTTCAAAATCTGACAATCAGAATAACAATCAACATAACGATCAAGCTCATCATTCTTCAAAGTCTAACAATCGGCATAACAATAACGATTAAGCTCATCATTTTTCAAAATTTGATAATCAGAATAACAATCAGAATAACGATTAATATAATAATCAATTTTATCATTCTTTAAAATCTGTTAATTAATCTTTTCTCGATGTAAGTCAAATATTTTAAAAAAATTTCATTACATTATAAAACGATAAAATAAATATC]

[+] EMBL AMRJP572             [ATTTGTAATATCCTAGAAAAAAAATGACAAAATGGTTGCTGTTGATGGTATGCCTTGGCATAGCTTGTCAAAATATTAGAGGTGGCGTTGTTCGAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGACAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTCAAGCTATGGATTCGACAAATACTATGGTGTACATGGTAGACAACAAAAATACTTTGATCATCTACCAAAATGCCGATGATTCTTTTCATCGATTGTCTTCCCACACTTTGAATCACAACTCTGACAAAATGTCAGATCAACAAGAAAATCTCACCTTGAAAGAAGTAGACAACAAAGTTTATGGAATGGCACTTAGTCCCGTGACGCATAATCTTTATTACAATTCTCCGTCTTCTGAGAATTTGTATTATGTTAACACAGAATCGTTAATGAAATCGGAAAATCAAGGAAATGACGTGCAATATGAAAGAGTCCAAGACGTTTTCGACAGTCAATTAACCGTTAAAGCAGTATCGAAAAATGGCGTACTCCTTTTCGGACTCGCGAATAATACTCTTAGTTGCTGGAACGAGCATCAGTCACTTGACAGACAAAATATCGATGTCGTAGCTCGAAATGAGGACACGCTTCAAATGGTCGTTAGTATGAAGATTAAGCAAAACGTTCCACAATCTGGCAGAGTTAATAATACGCAAAGAAATGAATATTTGTTGGCTTTAAGCGACAGAAACCAGAACGTGCTAAACAACGATCTTAATCTCGAACACGTGAACTTCCAAATTTTGGGCGCTAACGTAAACGACTTGATACGGAATAGTCGTTGCGCAAATTTTGACAATCAGGATAATAATCACTATAATCATAATCATAATCAAGCTCGTCATTCTTCAAAATCTGACAATCAGAATAACAATCAACATAACGATCAAGCTCATCATTCTTCAAAGTCTAACAATCGGCATAACAATAACGATTAAGCTCATCATTTTTCAAAATTTGATAATCAGAATAACAATCAGAATAACGATTAATATAATAATCAATTTTATCATTCTTTAAAATCTGTTAATTAATCTTTTCTCGATGTAAGTCAAATATTTTAAAAAAATTTCATTACATTATAAAACGATAAAATAAATATC]
[+] EMBL BI514419             [                                                                    CAAAATATTAGAGGTGGCGTTGTTCGAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGACAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI512357             [                                                                                             GAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGACAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCNNCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI516947             [                                                                                                                        CAAATACGTTGAACGTGATTCACGAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGATAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCACAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGACTCGGGTCTTGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGCTCGCCTTTGATCTCAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTCAAGCTATGGATTCTACAAATACTATGNNGTACATGGTAGACAACAAAAATACTTTGATCATCTACCAAAATGCCGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI509410             [                                                                                                                                               gAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGATAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCACAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGACTCGGGTCTTGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGCTCGCCTTTGATCTCAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTCAAGCTATGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI515586             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCAATTAACCGTTAAAGCAGTATCGAAAAATGGCGTACTCCTTTTCGGACTCGCGAATAATACTCTTAGTTGCTGGAACGAGCATCAGTCACTTGACAGACAAAATATCGATGTCGTAGCTCGAAATGAGGACACGCTTCAAATGGTCGTTAGTATGAAGATTAAGCAAAACGTTCCACAATCTGGCAGAGTTAATAATACGCAAAGAAATGAATATTTGTTGGCTTTAAGCGACAGAAACCAGAACGTGCTAAACAACGATCTTAATCTCGAACACGTGAACTTCCAAATTTTGGGCGCTAACGTAAACGACTTGATACGGAATAGTCGTTGCGCAAATTTTGACAATCAGGATAATAATCACTATAATCATAATCATAATCAAGCTCGTCATTCTTCAAAATCTGACAATCAGAATAACAATCAACATAACGATCAAGCTCATCATTCTTCAAAGTCTAACAATCGGCATAACAATAACGATTAAGCTCATCATTTTTCAAAATTTGATAATCAGAATAACAATCAGAATAACGATTAATATAATAATCAATTTTA                                                                                              ]




>consensus_144#0
ATTTGTAATATCCTAGAAAAAAAATGACAAAATGGTTGCTGTTGATGGTATGCCTTGGCA
TAGCTTGTCAAAATATTAGAGGTGGCGTTGTTCGAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGA
CAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACG
AAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTG
ACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTT
CCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATC
CTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTG
CTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCGTCAATAATACGCAAC
CCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAG
TCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTC
AAGCTATGGATTCGACAAATACTATGNNGTACATGGTAGACAACAAAAATACTTTGATCA
TCTACCAAAATGCCGATGATTCTTTTCATCGATTGTCTTCCCACACTTTGAATCACAACT
CTGACAAAATGTCAGATCAACAAGAAAATCTCACCTTGAAAGAAGTAGACAACAAAGTTT
ATGGAATGGCACTTAGTCCCGTGACGCATAATCTTTATTACAATTCTCCGTCTTCTGAGA
ATTTGTATTATGTTAACACAGAATCGTTAATGAAATCGGAAAATCAAGGAAATGACGTGC
AATATGAAAGAGTCCAAGACGTTTTCGACAGTCAATTAACCGTTAAAGCAGTATCGAAAA
ATGGCGTACTCCTTTTCGGACTCGCGAATAATACTCTTAGTTGCTGGAACGAGCATCAGT
CACTTGACAGACAAAATATCGATGTCGTAGCTCGAAATGAGGACACGCTTCAAATGGTCG
TTAGTATGAAGATTAAGCAAAACGTTCCACAATCTGGCAGAGTTAATAATACGCAAAGAA
ATGAATATTTGTTGGCTTTAAGCGACAGAAACCAGAACGTGCTAAACAACGATCTTAATC
TCGAACACGTGAACTTCCAAATTTTGGGCGCTAACGTAAACGACTTGATACGGAATAGTC
GTTGCGCAAATTTTGACAATCAGGATAATAATCACTATAATCATAATCATAATCAAGCTC
GTCATTCTTCAAAATCTGACAATCAGAATAACAATCAACATAACGATCAAGCTCATCATT
CTTCAAAGTCTAACAATCGGCATAACAATAACGATTAAGCTCATCATTTTTCAAAATTTG
ATAATCAGAATAACAATCAGAATAACGATTAATATAATAATCAATTTTATCATTCTTTAA
AATCTGTTAATTAATCTTTTCTCGATGTAAGTCAAATATTTTAAAAAAATTTCATTACAT
TATAAAACGATAAAATAAATATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)