Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 153 cluster # 153       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_153#0 length = 677 sequences # 6  
consensusID : consensus_153#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 677
fasta sequence 
                              [TGTCCAAATATACGATTGTAATGGTACGTCATGGAGAAAGTGAATGGAATAAATTGAATTTATTTTGTGGATGGTATGATTCCCATTTATCCGATAAAGGTAAGATTGAAGCAATTTCAGCAGGAAAAGCAATCAGAGACGCAAAATTCACTTTTGATATTGCTCATACATCATTATTATCAAGGGCTCAAGATACTCTTAAAGCAATTCTTAAAGAAATAGGACAAGAAAACATTACTGTTCAAAAGACATGGCGATTAAATGAACGTCATTATGGAGGTTTGACTGGTTTAAATAAAGCTGAAACTGCTGCTAAATATGGTGAAGAACAAGTTCAAATTTGGAGAAGATCTTTTGATACACCTCCTCCACCTATGGAACCAGATCATAAATATTATGAAATAATAGTAAATGATCCTAGATATGCAAATGATCCAAAACCAGAGGAATTTCCTAAATTTGAGTCTCTCAAATTAACAATTGAAAGGACATTACCATATTGGAATAATACTATTATTCCTCAATTAAAAGAAGGGAAAAGAATTATCATAGCTGCTCATGGAAATAGTTTGCGTGGCATAGTTAAACATTTAGATGAAATGAGTAACGATGAAATCATGAAATTAAATTTACCAACTGGTATTCCATTTGTTTATGAATTAGATGAAAATTTCAAG]

[+] EMBL BI508141             [TGTCCAAATATACGATTGTAATGGTACGTCATGGAGAAAGTGAATGGAATAAATTGAATTTATTTTGTGGATGGTATGATTCCCATTTATCCGATAAAGGTAAGATTGAAGCAATTTCAGCAGGAAAAGCAATCAGAGACGCAAAATTCACTTTTGATATTGCTCATACATCATTATTATCAAGGGCTCAAGATACTCTTAAAGCAATTCTTAAAGAAATAGGACAAGAAAACATTACTGTTCAAAAGACATGGCGATTAAATGAACGTCATTATGGAGGTTTGACTGGTTTAAATAAAGCTGAAACTGCTGCTAAATATGGTGAAGAACAAGTTCAAATTTGGAGAAGATCTTTTGATACACCTCCTCCACCTATGGAACCAGATCATAAATATTATGAAATAATAGTAAATGATCCTAGATATGCAAATGATCCAAAACCAGAGGAATTTCCTAAATTTGAGTCTCTCAAATTAACAATTGAAAGGACATTACCATATTGGAATAATACTATTATTCCTCAATTAAAAGAAGGGAAAAGAATTATCATAGCTGCTCATGGAAATAGTTTGCGTGGCATAGTTAAACATTTAGATGAAATGAGTAACGATGAAATCATGAAATTAAATTTACCAACTGGTATTCCATTTGTTTATGAATTAGATGAAAATTTCAAG]
[+] EMBL BI505803             [TGTCCAAATATACGATTGTAATGGTACGTCATGGAGAAAGTGAATGGAATAAATTGAATTTATTTTGTGGATGGTATGATTCCCATTTATCCGATAAAGGTAAGATTGAAGCAATTTCAGCAGGAAAAGCAATCAGAGACGCAAAATTCACTTTTGATATTGCTCATACATCATTATTATCAAGGGCTCAAGATACTCTTAAAGCAATTCTTAAAGAAATAGGACAAGAAAACATTACTGTTCAAAAGACATGGCGATTAAATGAACGTCATTATGGAGGTTTGACTGGTTTAAATAAAGCTGAAACTGCTGCTAAATATGGTGAAGAACAAGTTCAAATTTGGAGAAGATCTTTTGATACACCTCCTCCACCTATGGAACCAGATCATAAATATTATGAAATAATAGTAAATGATCCTAGATATGCAAATGATCCAAAACCAGAGGAATTTCCTAAATTTGAGTCTCTCAAATTAACAATTGAAAGGACATTACCATATTGGAATAATACTATTATTCCTCAATTAAAAGAAGGGAAAAGAATTATCATAGCTGCTCATGGAAATAGTTTGCGTGGCATAGTTAAACAT                                                                                       ]
[+] EMBL BI504612             [    CAAATATACGATTGTAATGGTACGTCATGGAGAAAGTGAATGGAATAAATTGAATTTATTTTGTGGATGGTATGATTCCCATTTATCCGATAAAGGTAAGATTGAAGCAATTTCAGCAGGAAAAGCAATCAGAGACGCAAAATTCACTTTTGATATTGCTCATACATCATTATTATCAAGGGCTCAAGATACTCTTAAAGCAATTCTTAAAGAAATAGGACAAGAAAACATTACTGTTCAAAAGACATGGCGATTAAATGAACGTCATTATGGAGGTTTGACTGGTTTAAATAAAGCTGAAACTGCTGCTAAATATGGTGAAGAACAAGTTCAAATTTGGAGAAGATCTTTTGATACACCTCCTCCACCTATGGAACCAGATCATAAATATTATGAAATAATAGTAAATGATCCTAGATATGCAAATGATCCAAAACCAGAGGAATTTCCTAAATTTGAGTCTCTCAAATTAACAATTGAAAGGACATTACCATATTGGAATAATACTATTATTCCTCAATTAAAAGAAGGGAAAAGAATTATCATAGCTGCTCATGGAAATAGTTTGCGTGGCATAGTTAAACATTTAGATGAAATGAGTAACGATGAAATCATGAAATTAAATTTACCAACTGGTATT                                 ]
[+] EMBL BI516433             [                             CATGGAGAAAGTGAATGGAATAAATTGAATTTATTTTGTGGATGGTATGATTCCCATTTATCCGATAAAGGTAAGATTGAAGCAATTTCAGCAGGAAAAGCAATCAGAGACGCAAAATTCACTTTTGATATTGCTCATACATCATTATTATCAAGGGCTCAAGATACTCTTAAAGCAATTCTTAAAGAAATAGGACAAGAAAACATTACTGTTCAAAAGACATGGCGATTAAATGAACGTCATTATGGAGGTTTGACTGGTTTAAATAAAGCTGAAACTGCTGCTAAATATGGTGAAGAACAAGTTCAAATTTGGAGAAGATCTTTTGATACACCTCCTCCACCTATGGAACCAGATCATAAATATTATGAAATAATAGTAAATGATTCTAGATATGCAAATGATCCAAAACCAGNGGAATTTCCTAAATTTGAGTCTCTCAAATTAACAATTGAAAGGACATTACCATATTGGAATAATACTATT                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI506164             [                                               AATAAATTGAATTTATTTTGTGGATGGTATGATTCCCATTTATCCGATAAAGGTAAGATTGAAGCAATTTCAGCAGGAAAAGCAATCAGAGACGCAAAATTCACTTTTGATATTGCTCATACATCATTATTATCAAGGGCTCAAGATACTCTTAAAGCAATTCTTAAAGAAATAGGACAAGAAAACATTACTGTTCAAAAGACATGGCGATTAAATGAACGTCATTATGGAGGTTTGACTGGTTTAAATAAAGCTGAAACTGCTGCTAAATATGGTGAAGAACAAGTTCAAATTTGGAGAAGATCTTTTGATACACCTCCTCCACCTATGGAACCAGATCATAAATATTATGAAATAATAGTAAATGATCCTAGATATGCAAATGATCCAAAACCAGAGGAATTTCCTAAATTTGAGTCTCTCAAATTAACAATTGAAAGGACATTACCATATTGGAATAATACTATTATTCCTCAATTAAAAGAAGGGAAAAGAATTATCATAGCTGCTCATGGAAATAGTTTGCGTGGCATAGTTAAACATTTAGATGAAATGAGTAACGATGAAATCATGAAATTAAATTTACCAACTGGTATTCCATTTGTTTATGAATTAGNTGAAAATTTCA  ]
[+] EMBL BI503620             [                                               AATAAATTGAATTTATTTTGTGGATGGTATGATTCCCATTTATCCGATAAAGGTAAGATTGAAGCAATTTCAGCAGGAAAAGCAATCAGAGACGCAAAATTCACTTTTGATATTGCTCATACATCATTATTATCAAGGGCTCAAGATACTCTTAAAGCAATTCTTAAAGAAATAGGACAAGAAAACATTACTGTTCAAAAGACATGGCGATTAAATGAACGTCATTATGGAGGTTTGACTGGTTTAAATAAAGCTGAAACTGCTGCTAAATATGGTGAAGAACAAGTTCAAATTTGGAGAAGATCTTTTGATACACCTCCTCCACCTATGGAACCAGATCATAAATATTATGAAATAATAGTAAATGATCCTAGATATGCAAATGATCCAAAACCAGAGGAATTTCCTAAATTTGAGTCTCTCAAATTAACAATTGAAAGGACATTACCATATTGGAATAATACTATTATTCCTCAATTAAAAGAAGGGAAAAGAATTATCATAGCTGCTCATGGAAATAGTTTGCGTGGCATAGTTAAACATTTAGATGAAATGAGTAACGATGAAATCATGAAATTAAATTTACCAACTGGTATTCCATTTGTTTATGAATTAGATGAAAATTTCA  ]




>consensus_153#0
TGTCCAAATATACGATTGTAATGGTACGTCATGGAGAAAGTGAATGGAATAAATTGAATT
TATTTTGTGGATGGTATGATTCCCATTTATCCGATAAAGGTAAGATTGAAGCAATTTCAG
CAGGAAAAGCAATCAGAGACGCAAAATTCACTTTTGATATTGCTCATACATCATTATTAT
CAAGGGCTCAAGATACTCTTAAAGCAATTCTTAAAGAAATAGGACAAGAAAACATTACTG
TTCAAAAGACATGGCGATTAAATGAACGTCATTATGGAGGTTTGACTGGTTTAAATAAAG
CTGAAACTGCTGCTAAATATGGTGAAGAACAAGTTCAAATTTGGAGAAGATCTTTTGATA
CACCTCCTCCACCTATGGAACCAGATCATAAATATTATGAAATAATAGTAAATGATCCTA
GATATGCAAATGATCCAAAACCAGAGGAATTTCCTAAATTTGAGTCTCTCAAATTAACAA
TTGAAAGGACATTACCATATTGGAATAATACTATTATTCCTCAATTAAAAGAAGGGAAAA
GAATTATCATAGCTGCTCATGGAAATAGTTTGCGTGGCATAGTTAAACATTTAGATGAAA
TGAGTAACGATGAAATCATGAAATTAAATTTACCAACTGGTATTCCATTTGTTTATGAAT
TAGATGAAAATTTCAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)