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consensusID : consensus_155#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 747 fasta sequence
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consensusID : consensus_155#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 668 fasta sequence
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consensusID : consensus_155#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 523 fasta sequence
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consensusID : consensus_155#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 392 fasta sequence
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[+] EMBL BI515702 [ATCTTATCAGACAATTAAAATTTTCCCAGTTGTTAATAGTAATAAGTATCTGTGATATAATTTAAGAATCTTATCAAGCTTTATTTAATAACACTTGAAATATTTCTATTTATCAAAAGTGACTTGGAGTGGTTCGAGAATGAATTAATTTGCGCTGATATTTTTAATGTATATAAAAAAAGAGAGGAAGATATATAAGATAATAAGATTGAGTGGAAAATGAAAAAGTGAATTTTCAACTTGCAAGAGGGATTCTTGCTCGATGAATTAATGAACTTCACAGGCGCGTGTGTTGTATTCACGTAAGTAAGAATTTATTTCGTTTTTATCAAGCGCGAAATAAACGTCGAGTAATATAAGTATTTGAATGTCAAACGGAGAAATACGCTATT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_155#2 ------------------------------------------------------------
consensus_155#3 ------------------------------------------------------------
consensus_155#0 ------------------------------------------------------------
consensus_155#1 ATATAAATGGTATTCACAGCACATGGAATTTATCCATCAGATTCTGGAAGAATCCCGATG 60
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consensus_155#3 ------------------------------------------------------------
consensus_155#0 ---------AAAAAATTCTAATCTTATCGAATTATCAATTATTTATCCGTGATGTAATT- 50
consensus_155#1 GCAAAAGAATAATAAACCCGGTGGTATTGTGCCTGAACATGTTGAACTGCAACGTAGATG 120
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consensus_155#0 ---TGCAAAATCTTATCAGACAATTAAAATTTTCTCAGTTGTTAATAGTAA---TAAGTA 104
consensus_155#1 AAGCGGAACAAGCGAAGATACGATTTCAATTTG--CAGTTTTCAATGCCGACGTTAAACA 178
* * * ** *** ***** ***** * *** * *** *
consensus_155#2 TCTGTGATATAATTTAAGAATCTTATCAA-GCTTTATTT--AATAACACTTGAA-ATATT 159
consensus_155#3 TCTGTGATATAATTTAAGAATCTTATCAA-GCTTTATTT--AATAACACTTGAA-ATATT 104
consensus_155#0 TCTGTGATATAATTTAAGAATCTTATCAA-GCTTTATTT--AATAACACTTGAA-ATAT- 159
consensus_155#1 TTGGGAATACTGTCACGTTAGCAGGACAATACTCGAGCTGAAATCATACACGGACATCAT 238
* * *** * * * *** ** * * *** * ** * * **
consensus_155#2 TCTATTTATCAAAAGTGACTTGG-----------AGTGGTTCGAGAATGAATT---AATT 205
consensus_155#3 TCTATTTATCAAAAGTGACTTGG-----------AGTGGTTCGAGAATGAATT---AATT 150
consensus_155#0 -----TTATCAAAAGTGACTTGG-----------AGTGGTTCGAGAATGAATT---AATT 200
consensus_155#1 TTCCTTGGGCTATAGAGACTTGTCCATCGTCCACAGACATTTAAAGAAGAATGGTGAGGT 298
* * * ** ****** ** ** * * **** * *
consensus_155#2 TGCGCTGATATTTTTAATGTATATA-----AAAAAAGAGAGGAAGATATATAAGATAATA 260
consensus_155#3 TGCGCTGATATTTTTAATGTATATA-----AAAAAAGAGAGGAAGATATATAAGATAATA 205
consensus_155#0 TGCGCTGATATTTTTAATATATATAT----AAAAAAGAGAGGAAGATATATAAGATAATA 256
consensus_155#1 GGTATTAATGGTTAAAATACAGATAATCCAATACGAGAGCGAAAAACATAACTTGTCACA 358
* * ** ** *** * *** * * **** * ** * *** * * *
consensus_155#2 AGAT-TGAGTGGAAAATGAAAAAGTGAATTTTCAACTTGCAAGAGG--GATTCTTGCTCG 317
consensus_155#3 AGAT-TGAGTGGAAAATGAAAAAGTGAATTTTCAACTTGCAAGAGG--GATTCTTGCTCG 262
consensus_155#0 AGAT-TGAGTGGAAAATGAAAAAGTGAATTTTCAACTTGCAAGAGG--GATTCTTGCTCG 313
consensus_155#1 GGATATGGCCAGACTGTTAAAACATTCATATGGTGCAGACACTAAGTTAATTTGTGGAGG 418
*** ** ** * **** * ** * * ** * * *** ** *
consensus_155#2 ATGAATTAAT---GAACTTC-----ACAGGCGCGTGTGTTGTATTCACGCCTTTTCGTTT 369
consensus_155#3 ATGAATTAAT---GAACTTC-----ACAGGCGCGTGTGTTGTATTCACGTAAGTAAGAAT 314
consensus_155#0 ATGAATTAAT---GAACTTCGTAACACAGGCGCGTGTGTTGTATTCACTTTTCAATGCCG 370
consensus_155#1 TTTAAACAATACAGAAATTCCAGTTCATAGTAC-TGTATTGACTGCTCGTAGCAACGTTC 477
* ** *** *** *** * * *** *** * * * *
consensus_155#2 GTG------TGAAGCCACGATAAAATG-GAGCTATTGGTACCAACAGTCTCAGACGTCGT 422
consensus_155#3 TTA------TTTCGTTTTTATCAAGCGCGAAATAAACGT-CGAGTAATATAAGTATTTGA 367
consensus_155#0 ACG------TTAAACATTGGGAATACT-GTCACGTTAGC-AGGACAATACTCGAGCTGAA 422
consensus_155#1 TTGCTGAAATGATTTTGCCTTTAAAAG-AATTTAATGAGAGGAAAGATATGAAGACAAAT 536
* * *
consensus_155#2 GT-TTAAAT--ACA-------CGTGGCCTATTCCAA-ATTACAAAAGAACTATTTCGAAG 471
consensus_155#3 ATGTCAAACGGAGA-------AATACGCTATT---------------------------- 392
consensus_155#0 ATCATACACGGACATCATTTCCTTGGGCTATAGAGA-CTTGTCCATCGTCCACAGACATT 481
consensus_155#1 ACTATAAAAGATAAAATGGATACGAGAATGTTACAAGAAAATAACATAATCGATAAAGAA 596
* * * * *
consensus_155#2 AAAAGCCATATAGATAGCCCGCCCTTCAACGTCAATATAAATGGTATTCACA-------- 523
consensus_155#3 ------------------------------------------------------------
consensus_155#0 TAAAGANGAATGGTGAGGTGGTA-TTAATGGTTAAAATACAGATAATCCAATACGAGAGC 540
consensus_155#1 AGCGGACGTTTCAATGTACGTGTCAGAAGTTATTCTGTACCTGTGTTGCAGAATGTTAAT 656
consensus_155#2 ------------------------------------------------------------
consensus_155#3 ------------------------------------------------------------
consensus_155#0 GAAAAACATAACTTGTCACAGGATATGGCCAGACTGTTAAAACATTCATATGGTGCAGAC 600
consensus_155#1 TTATTTTAAGCT------------------------------------------------ 668
consensus_155#2 ------------------------------------------------------------
consensus_155#3 ------------------------------------------------------------
consensus_155#0 ACTAAGTTAATTTGTGGAGGTTTAAACAATACAGAAATTCCAGTTCATAGTACTGTATTG 660
consensus_155#1 ------------------------------------------------------------
consensus_155#2 ------------------------------------------------------------
consensus_155#3 ------------------------------------------------------------
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consensus_155#1 ------------------------------------------------------------
consensus_155#2 ---------------------------
consensus_155#3 ---------------------------
consensus_155#0 AAAGATATGAAGACAAATACTATAAAA 747
consensus_155#1 ---------------------------
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| Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |