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Apis mellifera
cluster # 171 cluster # 171       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_171#0 length = 719 sequences # 6  
consensusID : consensus_171#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 719
fasta sequence 
                              [ATACAAATATCTATGTATAAAAAAGTAATAAGTACTAATACTACACCTCTATATATGTGATAAGGTTTGTAATATTTAAGGGAGGCCGATAGATTGTATAACCTACTAGATCTCAGTATAAGTTACTAGGTAAAGATCGTAATAATTCGTAAGTAACACCAAAATCACTCCGCTGTATCAAAAAAAATAATTTTTTATATAAGTTCCCACGGGCGCACATCATCTCCAATGGCACATGAGTTTTAGTAGACTTATTACGACTAACGATAGCAAGACAGATTAAGCTGGTTGTACATAAATAATAATGATGAAATGAAGAATAAATGGCTAAAATAAAGAAATGCTTGATGTTGTTAAGTAAGAGAGGACGTTGTTTACTGAGCCAACGTTGTGTTTGTTCGCACGCTTACCCTTCTGACTTCCATTACAAACTTATATTTTTATTCAAAGGAAATATAATTTATAATTTTTTATGTTGTTCATCCAAAGAATGCAAATAAACAAATTATTGGATTTCTAATGTGATTTTTTTGATGCATCATTACAAATGCATTTATTCAATATATATATATATTTTTTAATATCGTTGAAACATCAATTTAATACAAATTTAATTCATAATTTTTTTTATTTCTTTCTTCTACAAACTCGGAAATGTAACAACATGCAAAATGAAAAATATTGATTCATTCTATCGTCTCTATTTACTTAACAATATC]

[+] EMBL BI503231             [ATACAAATATCTATGTAT AAAAAGTAATAAGTACTAATACTACACCTCTATATATGTGATAAGGTTTGTAATATTTAAGGGAGGCCGATAGATTGTATAACCTACTAGATCTCAGTATAAGTTACTAGGTAAAGATCGTAATAATTCGTAAGTAACACCAAAATCACTCCGCTGTATCAAAAAAAATAATTTTTTATATAAGTTCCCACGGGCGCACATCATCTCCAATGGCACATGAGTTTTAGTAGACTTATTACGACTAACGATAGCAAGACAGATTAAGCTGGTTGTACATAAATAATAATGATGAAATGAAGAATAAATGGCTAAAATAAAGAAATGCTTGATGTTGTTAAGTAAGAGAGGACGTTGTTTACTGAGCCAACGTTGTGTTTGTTCGCACGCTTACCCTTCTGACTTCCATTACAAACTTATATTTTTATTCAAAGGAAATATAATTTATAATTTTTTATGTTGTTCATCCAAAGAATGCAAATAAACAAATTATTGGATTTCTAATGTGATTTTTTTGATGCATCATTACAAATGCATTTATTCAATATATATAT                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI506069             [           TATGTATAAAAAAGTAATAAGTACTAATACTACACCTCTATATATGTGATAAGGTTTGTAATATTTAAGGGAGGCCGATAGATTGTATAACCTACTAGATCTCAGTATAAGTTACTAGGTAAAGATCGTAATAATTCGTAAGTAACACCAAAATCACTCCGCTGTATCAAAAAAAATAATTTTTTATATAAGTTCCCACGGGCGCACATCATCTCCAATGGCACATGAGTTTTAGTAGACTTATTACGACTAACGATAGCAAGACAGATTAAGCTGGTTGTACATAAATAATAATGATGAAATGAAGAATAAATGGCTAAAATAAAGAAATGCTTGATGTTGTTAAGTAAGAGAGGACGTTGTTTACTGAGCCAACGTTGTGTTTGTTCGCACGCTTACCCTTCTGACTTCCATTACAAACTTATATTTTTATTCAAAGGAAATATAATTTATAATTTTTTATGTTGTTCATCCAAAGAATGCAAATAAACAAATTATTGGATTTCTAATGTGATTTTTTTGATGCATCATTACAAATGCATTTATTCAATATATATAT                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI504308             [           TATGTATAAAAAAGTAATAAGTACTAATACTACACCTCTATATATGTGATAAGGTTTGTAATATTTAAGGGAGGCCGATAGATTGTATAACCTACTAGATCTCAGTATAAGTTACTAGGTAAAGATCGTAATAATTCGTAAGTAACACCAAAATCACTCCGCTGTATCAAAAAAAATAATTTTTTATATAAGTTCCCACGGGCGCACATCATCTCCAATGGCACATGAGTTTTAGTAGACTTATTACGACTAACGATAGCAAGACAGATTAAGCTGGTTGTACATAAATAATAATGATGAAATGAAGAATAAATGGCTAAAATAAAGAAATGCTTGATGTTGTTAAGTAAGAGAGGACGTTGTTTACTGAGCCAACGTTGTGTTTGTTCGCACGCTTACCCTTCTGACTTCCATTACAAACTTATATTTTTATTCAAAGGAAATATAATTTATAATTTTTTATGTTGTTCATCCAAAGAATGCAAATAAACAAATTATTGGATTTCTAATGTGATTTTTTTGATGCATCATTACAAATGCATTTA                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI506909             [                                                                                    GCCGATAGATTGTATAACCTACTAGATCTCAGTATAAGTTACTAGGTAAAGATCGTAATAATTCGTAAGTAACACCAAAATCACTCCGCTGTATCAAAAAAAATAATTTTTTATATAAGTTCCCACGGGCGCACATCATCTCCAATGGCACATGAGTTTTAGTAGACTTATTACGACTAACGATAGCAAGACAGATTAAGCTGGTTGTACATAAATAATAATGATGAAATGAAGAATAAATGGCTAAAATAAAGAAATGCTTGATGTTGTTAAGTAAGAGAGGACGTTGTTTACTGAGCCAACGTTGTGTTTGTTCGCACGCTTACCCTTCTGACTTCCATTACAAACTTATATTTTTATTCAAAGGAAATATAATTTATAATTTTTTATGTTGTTCATCCAAAGAATGCAAATAAACAAATTATTGGATTTCTAATGTGATTTTTTTGATGCATCATTACAAATGCATTTATTCAATATATATATATATTTTTTAATATCGTTGAAACATCAATTTAATACAAATTTAATTCATAATTTTTTTTATTTCTTTCTTCTACAAACTCGGAAATGTAACAACATGCAAAATGAAAAATATTGATTCATTCTATCG                      ]
[+] EMBL BI507225             [                                                                                        ATAGATTGTATAACCTACTAGATCTCAGTATAAGTTACTAGGTAAAGATCGTAATAATTCGTAAGTAACACCAAAATCACTCCGCTGTATCAAAAAAAATAATTTTTTATATAAGTTCCCACGGGCGCACATCATCTCCAATGGCACATGAGTTTTAGTAGACTTATTACGACTAACGATAGCAAGACAGATTAAGCTGGTTGTACATAAATAATAATGATGAAATGAAGAATAAATGGCTAAAATAAAGAAATGCTTGATGTTGTTAAGTAAGAGAGGACGTTGTTTACTGAGCCAACGTTGTGTTTGTTCGCACGCTTACCCTTCTGACTTCCATTACAAACTTATATTTTTATTCAAAGGAAATATAATTTATAATTTTTTATGTTGTTCATCCAAAGAATGCAAATAAACAAATTATTGGATTTCTAATGTGATTTTTTTGATGCATCATTACAAATGCATTTATTCAATATATATATATATTTTTTAATATCGTTGAAACATCAATTTAATACAAATTTAATTCATAATTTTTTTTATTTCTTTCTTCTACAAACTCGGAAATGTAACAACATGCAAAATGAAAAATATTGATTCATTCTATCGTCTCTATTTACTTAACAATATC]
[+] EMBL BI509870             [                                                                                        ATAGATTGTATAACCTACTAGATCTCAGTATAAGTTACTAGGTAAAGATCGTAATAATTCGTAAGTAACACCAAAATCACTCCGCTGTATCAAAAAAAATAATTTTTTATATAAGTTCCCACGGGCGCACATCATCTCCAATGGCACATGAGTTTTAGTAGACTTATTACGACTAACGATAGCAAGACAGATTAAGCTGGTTGTACATAAATAATAATGATGAAATGAAGAATAAATGGCTAAAATAAAGAAATGCTTGATGTTGTTAAGTAAGAGAGGACGTTGTTTACTGAGCCAACGTTGTGTTTGTTCGCACGCTTACCCTTCTGACTTCCATTACAAACTTATATTTTTATTCAAAGGAAATATAATTTATAATTTTTTATGTTGTTCATCCAAAGAATGCAAATAAACAAATTATTGGATTTCTAATGTGATTTTTTTGATGCATCATTACAAATGCATTTATTCAATATATATATATATTTTTTAATATCGTTGAAACATCAATTTAATACAAATTTAATTCATAATTTTTTTTATTTCTTTCTTCTACAAACTCGGAAATGTAACAACATGCAAAATGAAAAATATTGATTCATTCTATCGTCTCTATTTACTTAACAATATC]




>consensus_171#0
ATACAAATATCTATGTATAAAAAAGTAATAAGTACTAATACTACACCTCTATATATGTGA
TAAGGTTTGTAATATTTAAGGGAGGCCGATAGATTGTATAACCTACTAGATCTCAGTATA
AGTTACTAGGTAAAGATCGTAATAATTCGTAAGTAACACCAAAATCACTCCGCTGTATCA
AAAAAAATAATTTTTTATATAAGTTCCCACGGGCGCACATCATCTCCAATGGCACATGAG
TTTTAGTAGACTTATTACGACTAACGATAGCAAGACAGATTAAGCTGGTTGTACATAAAT
AATAATGATGAAATGAAGAATAAATGGCTAAAATAAAGAAATGCTTGATGTTGTTAAGTA
AGAGAGGACGTTGTTTACTGAGCCAACGTTGTGTTTGTTCGCACGCTTACCCTTCTGACT
TCCATTACAAACTTATATTTTTATTCAAAGGAAATATAATTTATAATTTTTTATGTTGTT
CATCCAAAGAATGCAAATAAACAAATTATTGGATTTCTAATGTGATTTTTTTGATGCATC
ATTACAAATGCATTTATTCAATATATATATATATTTTTTAATATCGTTGAAACATCAATT
TAATACAAATTTAATTCATAATTTTTTTTATTTCTTTCTTCTACAAACTCGGAAATGTAA
CAACATGCAAAATGAAAAATATTGATTCATTCTATCGTCTCTATTTACTTAACAATATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)