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Apis mellifera
cluster # 176 cluster # 176       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_176#0 length = 1028 sequences # 6  
consensusID : consensus_176#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1028
fasta sequence 
                              [CGAATAAGTAAAGATCTAATCCGTTCTTTCAATCTCACTCTGTCGGTGCCGTTGCCGGTGTGCATGGTTTTGTGCTCCACATTAGTTTTACTTCATTTATTTTCTAAGTTAATAATGGCAGAGAACAAAGAACGTACGTTTATTATGATTAAGCCTGATGGTGTCCAACGTGGACTTGTTGGAAAAATAATTCAGCGTTTTGAAGAAAAAGGTTTTAAACTTGTAGCAATGAAAATGTTATGGCCAACTGAAGAATTATTAAAGAAACATTATTCAGATTTGGCATCTAGACCATTTTTCCCT-GGATTAATTAAATACATGAGTTCAGGACCAGTTGTACCAATGGTATGGGAAGGTTTAAATGCAGTAAAAACTGGTCGTTTCATGTTAGGAGAAACAAATCCAAAGGATTCTGCACCAGGAACAATTCGTGGTGATTTTTGTATTCAAGTT-GGACGTAACATTATTCATGGATCTGATTCTGTTGAATCTGCTAATAAAGAGATCAATCTATGGTTTGGAGAAGAAAAAGAAGTTATTGATTGGACATCTTGGGCAGAAAAATGGATATATGAATAAAAATAGTCCTCAGTGCAAATATTCATTTTAATATATGTTCTTTTACATAATTCAATCTGACCATGCATACTGCCAATCGGATGACATTCAGAATTTGTTGTATATAACTTTACTTAAATAGTAATAAAACAGGTTCTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGCCTCCATCCATATTTCAACATATGATGGGTCAACAAAGTGCTTCACAACAACCAGGAACATGGATGCAAATGCCACAAGTACCTCCAATGTCAATACCATGGAGTGTGCCATCTCTCCAACAACCAGAATTAGTAAGATTTACTGGTGGACCAAGTTTTGAACCAGTTCCTCATCAAAAGAGAAAACTTGAAACTTGTGATCTATTAGATATGAGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC]

[+] EMBL BI504644             [CGAATAAGTAAAGATCTAATCCGTTCTTTCAATCTCACTCTGTCGGTGCCGTTGCCGGTGTGCATGGTTTTGTGCTCCACATTAGTTTTACTTCATTTATTTTCTAAGTTAATAATGGCAGAGAACAAAGAACGTACGTTTATTATGATTAAGCCTGATGGTGTCCAACGTGGACTTGTTGGAAAAATAATTCAGCGTTTTGAAGAAAAAGGTTTTAAACTTGTAGCAATGAAAATGTTATGGCCAACTGAAGAATTATTAAAGAAACATTATTCAGATTTGGCATCTAGACCATTTTTCCCT GGATTAATTAAATACATGAGTTCAGGACCAGTTGTACCAATGGTATGGGAAGGTTTAAATGCAGTAAAAACTGGTCGTTTCATGTTAGGAGAAACAAATCCAAAGGATTCTGCACCAGGAACAATTCGTGGTGATTTTTGTATTCAAGTT GGACGTAACATTATTCATGGATCTGATTCTGTTGAATCTGCTAATAAAGAGATCAATCTATGGTTTGGAGAAGAAAAAGAAGTTATTGATTGGACATCTTGGGCAGAAAAATGGATATATGAATAAAAATAGTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI507901             [                                           CGGTGCCGTTGCCGGTGTGCATGGTTTTGTGCTCCACATTAGTTTTACTTCATTTATTTTCTAAGTTAATAATGGCAGAGAACAAAGAACGTACGTTTATTATGATTAAGCCTGATGGTGTCCAACGTGGACTTGTTGGAAAAATAATTCAGCGTTTTGAAGAAAAAGGTTTTAAACTTGTAGCAATGNNNNNGTTATGGCCAACTGAAGAATTATTAAAGAAACATTATTCAGATTTGGCATCTAGACCATTTTTCCCT GGATTAATTAAATACATGAGTTCAGGACCAGTTGTACCAATGGTATGGGAAGGTTTAAATGCAGTAAAAACTGGTCGTTACATGTTAGGAGAAACAAATCCAAAGGATTCTGCACCAGGAACAATTCGTGGTGATTTTTGTATTCAAGTT GGACGTAACATTATTCATGGATCTGATTCTGTTGAATCTGCTAATAAAGAGATCAATCTATGGTTTGGAGAAGAAAAAGAAGTTATTGATTGGACATCTTGGGCAGAAAAATGGATATATGAATAAAAATAGTCCTCAGTGCAAATATTCATTTTAATATATGTTCTTTTACATAATTCAATCTGACCATGCATACTGCCAATCGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI507694             [                                                    TGCCGGTGTGCATGGTTTTGTGCTCCACATTAGTTTTACTT  ATTATTTTCTAAG NNNTAATGGCAGAGAACAAAGAACGTACGTTTATTATGATTAAGCCTGATGGTGTCCAACGTGGACTTGTTGGAAAAATAATTCAGCGTTTTGAAGAAAAAGGTTTTAAACTTGTAGCAATGAAAATGTTATGGCCAACTGAAGAATTATTAAAGAAACATTATTCAGATTTGGCATCTAGACCATTTTTCCCT GGATTAATTAAATACATGAGTTCAGGACCAGTTGTACCAATGGTATGGGAAGGTTTAAATGCAGTAAAAACTGGTCGTTTCATGTTAGGAGAAACAAATCCAAAGGATTCTGCACCAGGAACAATTCGTGGTGATTTTTGTATTCAAGTT GGACGTAACATTATTCATGGATCTGATTCTGTTGAATCTGCTAATAAAGAGATCAATCTATGGTTTGGAGAAGAAAAAGAAGTTATTGATTGGACATCTTGGGCAGAAAAATGGATATATGAATAAAAATAGTCCTCAGTGCAAATATTCATTTTAATATATGTTCTTTTACATAATTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BE844406             [                                                            TGCATGGTTTTGTGCTCCACATTAGTTTTACTTCATTTATTTTCTAAGTTAATAATGGCAGAGAACAAAGAACGTACGTTTATTATGATTAAGCCTGATGGTGTCCAACGTGGACTTGTTGGAAAAATAATTCAGCGTTTTGAAGAAAAAGGTTTTAAACTTGTAGCAATGAAAATGTTATGGCCAACTGAAGAATTATTAAAGAAACATTATTCAGATTTGGCATCTAGACCATTTTTCCCTGGGATTAATTAAATACATGAGTTCAGGACCAGTTGTACCAATGGTATGGGAAGGGTTAAATGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BE844279             [                                                                              ACATTAGTTTTACTTCATTTATTTTCTAAGTTAATAATGGCAGAGAACAAAGAACGTACGTTTATTATGATTAAGCCTGATGGTGTCCAACGTGGACTTGTTGGAAAAATAATTCAGCGTTTTGAAGAAAAAGGTTTTAAACTTGTAGCAATGAAAATGTTATGGCCAACTGAAGAATTATTAAAGAAACATTATTCAGATTTGGCATCTAGACCATTTTTCCCT GGATTAATTAAATACATGAGTTCAGGACCAGTTGTACCAATGGTATGGGAAGGTTTAAATGCAGTAAAAACTGGTCGTTTCATGTTAGGAGAAACAAATCCAAAGGATTCTGCACCAGGAACAATTCGTGGTGATTTTTGTATTCAAGTT GGACGTAACATTATTCATGGATCTGATTCTGTTGAATCTGCTAATAAAGAGATCAATCTATGGTTTGGAGAAGAAAAAGAAGTTATTGATTGGACATCTTGGGCAGAAAAATGGATATATGAATAAAAATAGTCCTCAGTGCAAATATTCATTTTAATATATGTTCTTTTACATAATTCAATCTGACCATGCATACTGCCAATCGGATGACATTCAGAATTTGTTGTATATAACTTTACTTAAATAGTAATAAAACAGGTTCTTATAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL BE844405             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATCGTGGTGATTTTTGTATTCAAGTTGGGACGTAACATTATTCATGGATCTGATTCTGTTGAATCTGCTAATAAAGAGATCAATCTATGGTTTGGAGAAGAAAAAGAAGTTATTGATTGGACATCTTGGGCAGAAAAATGGATATATGAATAAAAATAGTCCCCAGTGCAAATATTCATTTTAATATATGTTCTTTTACATAATTCAATCTGACCATGCATACTGCCAATCGGATGACATTCAGAATTTGTTGTATATAACTTTACTTAAATAGTAATAAAACAGGTTCTTATATATAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGCCTCCATCCATATTTCAACATATGATGGGTCAACAAAGTGCTTCACAACAACCAGGAACATGGATGCAAATGCCACAAGTACCTCCAATGTCAATACCATGGAGTGTGCCATCTCTCCAACAACCAGAATTAGTAAGATTTACTGGTGGACCAAGTTTTGAACCAGTTCCTCATCAAAAGAGAAAACTTGAAACTTGTGATCTATTAGATATGAGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC]




>consensus_176#0
CGAATAAGTAAAGATCTAATCCGTTCTTTCAATCTCACTCTGTCGGTGCCGTTGCCGGTG
TGCATGGTTTTGTGCTCCACATTAGTTTTACTTCATTTATTTTCTAAGTTAATAATGGCA
GAGAACAAAGAACGTACGTTTATTATGATTAAGCCTGATGGTGTCCAACGTGGACTTGTT
GGAAAAATAATTCAGCGTTTTGAAGAAAAAGGTTTTAAACTTGTAGCAATGAAAATGTTA
TGGCCAACTGAAGAATTATTAAAGAAACATTATTCAGATTTGGCATCTAGACCATTTTTC
CCTGGATTAATTAAATACATGAGTTCAGGACCAGTTGTACCAATGGTATGGGAAGGTTTA
AATGCAGTAAAAACTGGTCGTTTCATGTTAGGAGAAACAAATCCAAAGGATTCTGCACCA
GGAACAATTCGTGGTGATTTTTGTATTCAAGTTGGACGTAACATTATTCATGGATCTGAT
TCTGTTGAATCTGCTAATAAAGAGATCAATCTATGGTTTGGAGAAGAAAAAGAAGTTATT
GATTGGACATCTTGGGCAGAAAAATGGATATATGAATAAAAATAGTCCTCAGTGCAAATA
TTCATTTTAATATATGTTCTTTTACATAATTCAATCTGACCATGCATACTGCCAATCGGA
TGACATTCAGAATTTGTTGTATATAACTTTACTTAAATAGTAATAAAACAGGTTCTTATA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGCCTCCATCCATATTTCAACATATGATGGGTCAA
CAAAGTGCTTCACAACAACCAGGAACATGGATGCAAATGCCACAAGTACCTCCAATGTCA
ATACCATGGAGTGTGCCATCTCTCCAACAACCAGAATTAGTAAGATTTACTGGTGGACCA
AGTTTTGAACCAGTTCCTCATCAAAAGAGAAAACTTGAAACTTGTGATCTATTAGATATG
AGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)