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Apis mellifera
cluster # 1818 cluster # 1818       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1818#0 length = 687 sequences # 2  
consensusID : consensus_1818#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 687
fasta sequence 
                              [TATAAAGGTTGCTTCCGAAACAGAGAAAATTAAAAGCACTCTCGCGAATTTTAAAATAATAGCTTTTAATAAATAATTATTAATAATGAAGCTACTTTATGTTCTTTTTATTGTTTTCGTTTACATCAATGGATCACTAGGAAATGACAGTGCAACAAGATCATGTATAATAAGTAATATAGCCTGCTGATGAAAATGCGACAAAACATTGGTTGGATATGGATAAAAATTGTATTAAAAGCTTGGAATCTCAGGTGAATGTTGAAATTAAAGCTGCAATGACTTATCTTGCAATGGGTGCTCATTTTGCTCTTGATGTAATTAATCGACCTGGATTCAGCAAATTCTTTTTTGAATCTGCTACAGAAGAAAGAGAACATGCAATAAAAGTTCTTGAATATTTATTAATGCGTGGTCAATTAACTAATATTAATGAGGATAATGTTCTTTTAAGATTTCCTTTGGAAGCAGAGATTGAGAATTGGAACAGTGGCTATAAAGCCTTGAAAAAAGCTCTTAAATTAGNAACAAGTGTTACNNNAAGAATTCGTGAATTAATTAAAACATGTGAACATCCAAATGATATAAATTTAGTTGATTATCATTTGGTAGNTTATCTCACTGGAGAATTTTTAACTGAACAATATAAAGGACAGCGTGATCTNGCTGGTAAAATTTCATCTTTAG]

[+] EMBL BI507346             [TATAAAGGTTGCTTCCGAAACAGAGAAAATTAAAAGCACTCTCGCGAATTTTAAAATAATAGCTTTTAATAAATAATTATTAATAATGAAGCTACTTTATGTTCTTTTTATTGTTTTCGTTTACATCAATGGATCACTAGGAAATGACAGTGCAACAAGATCATGTATAATAAGTAATATAG CTGCTGATGAAAATGCGACAAAACATTGGTTGGATATGGATAAAAATTGTATTAAAAGCTTGGAATCTCAGGTGAATGTTGAAATTAAAGCTGCAATGACTTATCTTGCAATGGGTGCTCATTTTGCTCTTGATGTAATTAATCGACCTGGATTCAGCAAATTCTTTTTTGAATCTGCTACAGAAGAAAGAGAACATGCAATAAAAGTTCTTGAATATTTATTAATGCGTGGTCAATTAACTAATATTAATGAGGATAATGTTCTTTTAAGATTTCCTTTGGAAGCAGAGATTGAGAATTGGAACAGTGGCTATAAAGCCTTGAAAAAAGCTCTTAAATTAGAAACAAGTGTTACNNNAAGAATTCGTGAATTAATTAAAACATGTGAACATCCAAATGATATAAATTTAGTTGATTATCATTTGGTA                                                                            ]
[+] EMBL BI504924             [                                                                                                                               AATGGATCACTAGGAAATGACAGTGCAACAAGATCATGTATAATAAGTAATATAGCCTGCTGATGAAAATGCGACAAAACATTGGTTGGATATGGATAAAAATTGTATTAAAAGCTTGGAATCTCAGGTGAATGTTGAAATTAAAGCTGCAATGACTTATCTTGCAATGGGTGCTCATTTTGCTCTTGATGTAATTAATCGACCTGGATTCAGCAAATTCTTTTTTGAATCTGCTACAGAAGAAAGAGAACATGCAATAAAAGTTCTTGAATATTTATTAATGCGTGGTCAATTAACTAATATTAATGAGGATAATGTTCTTTTAAGATTTCCTTTGGAAGCAGAGATTGAGAATTGGAACAGTGGCTATAAAGCCTTGAAAAAAGCTCTTAAATTAGNAACAAGTGTTACAAAAAGAATTCGTGAATTAATTAAAACATGTGAACATCCAAATGATATAAATTTAGTTGATTATCATTTGGTAGNTTATCTCACTGGAGAATTTTTAACTGAACAATATAAAGGACAGCGTGATCTNGCTGGTAAAATTTCATCTTTAG]




>consensus_1818#0
TATAAAGGTTGCTTCCGAAACAGAGAAAATTAAAAGCACTCTCGCGAATTTTAAAATAAT
AGCTTTTAATAAATAATTATTAATAATGAAGCTACTTTATGTTCTTTTTATTGTTTTCGT
TTACATCAATGGATCACTAGGAAATGACAGTGCAACAAGATCATGTATAATAAGTAATAT
AGCCTGCTGATGAAAATGCGACAAAACATTGGTTGGATATGGATAAAAATTGTATTAAAA
GCTTGGAATCTCAGGTGAATGTTGAAATTAAAGCTGCAATGACTTATCTTGCAATGGGTG
CTCATTTTGCTCTTGATGTAATTAATCGACCTGGATTCAGCAAATTCTTTTTTGAATCTG
CTACAGAAGAAAGAGAACATGCAATAAAAGTTCTTGAATATTTATTAATGCGTGGTCAAT
TAACTAATATTAATGAGGATAATGTTCTTTTAAGATTTCCTTTGGAAGCAGAGATTGAGA
ATTGGAACAGTGGCTATAAAGCCTTGAAAAAAGCTCTTAAATTAGNAACAAGTGTTACNN
NAAGAATTCGTGAATTAATTAAAACATGTGAACATCCAAATGATATAAATTTAGTTGATT
ATCATTTGGTAGNTTATCTCACTGGAGAATTTTTAACTGAACAATATAAAGGACAGCGTG
ATCTNGCTGGTAAAATTTCATCTTTAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)