Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1975 cluster # 1975       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1975#0 length = 701 sequences # 2  
consensusID : consensus_1975#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 701
fasta sequence 
                              [TTATACATGTATATAATTTATTGACAATTATAGTCAATTTTTTTTAGAGTTTGTCTATTATATAAATATTTGAAATAGAATTAAAAAATTCACAATTAATATATACACATATGTCATATGAATAGAATGATAATAAAAGTTCATAATTAAATAAAATATACACAATTATTAATAAATATGTTCAATATAAATTTTGCTAATTTTTTATTGTGAATTATAATTATAAGACTATAACATATTAAATTTGTGGATTATGAATTTGTCGCATTTACATCTACAACGTTAATCAAGTGGTTTATACCATGGATCTTCTAATTCCCACAAATCAGGAGGTAAATGTTCTCTACCTGGTGGTGGTCCACATGGTTCACAAGGAGGTGGAGGAATATGAGCTTTTATTCTTATGCCTTCTCGTTCTTCCCAAGCTATATCTTCTTCTAAAGCTGCTTCTCTTGCTTGTATCTCAGCTTTAACTTTTCTCATATGTTCACGAGCGGCAATAATATCTGGATGATCCATACCATATTCAGGTTGTAAAAATTCTTCATGTAATTCAGGAACTCTATATAAGTATCATTATTATTATGTAAATATAATGATTATAAAAATTTTATTTTATTTTAATATATAAATATAATGTATATATATTTAATATATGAAATATTACCGAACATATCGTCTTGGAGCAACAATTTCAGGAG]

[+] EMBL BI504463             [TTATACATGTATATAATTTATTGACAATTATAGTCAATTTTTTTTAGAGTTTGTCTATTATATAAATATTTGAAATAGAATTAAAAAATTCACAATTAATATATACACATATGTCATATGAATAGAATGATAATAAAAGTTCATAATTAAATAAAATATACACAATTATTAATAAATATGTTCAATATAAATTTTGCTAATTTTTTATTGTGAATTATAATTATAAGACTATAACATATTAAATTTGTGGATTATGAATTTGTCGCATTTACATCTACAACGTTAATCAAGTGGTTTATACCATGGATCTTCTAATTCCCACAAATCAGGAGGTAAATGTTCTCTACCTGGTGGTGGTCCACATGGTTCACAAGGATGTGGAGGAATATGAGCTTTTATTCTTATGCCTTCTCGTTCTTCCCAAGCTATATCTTCTTCTAAAGCTGCTTCTCTTGCTTGTATCTCAGCTTTAACTTTTCTCATATGTTCACGAGCGGCAATAATATCTGGATGATCCATACCATATTCAGGTTGTAAAAATTCTTCATGTAATTCAGGAACTCTATATAAGTATCATTATTATTA                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI514642             [                                                                                                                                                                                                                         TAATTATAAGACTATAACATATTAAATTTGTGGATTATGAATTTGTCGCATTTACATCTACAACGTTAATCAAGTGGTTTATACCATGGATCTTCTAATTCCCACAAATCAGGAGGTAAATGTTCTCTACCTGGTGGTGGTCCACATGGTTCACAAGGAGGTGGAGGAATATGAGCTTTTATTCTTATGCCTTCTCGTTCTTCCCAAGCTATATCTTCTTCTAAAGCTGCTTCTCTTGCTTGTATCTCAGCTTTAACTTTTCTCATATGTTCACGAGCGGCAATAATATCTGGATGATCCATACCATATTCAGGTTGTAAAAATTCTTCATGTAATTCAGGAACTCTATATAAGTATCATTATTATTATGTAAATATAATGATTATAAAAATTTTATTTTATTTTAATATATAAATATAATGTATATATATTTAATATATGAAATATTACCGAACATATCGTCTTGGAGCAACAATTTCAGGAG]




>consensus_1975#0
TTATACATGTATATAATTTATTGACAATTATAGTCAATTTTTTTTAGAGTTTGTCTATTA
TATAAATATTTGAAATAGAATTAAAAAATTCACAATTAATATATACACATATGTCATATG
AATAGAATGATAATAAAAGTTCATAATTAAATAAAATATACACAATTATTAATAAATATG
TTCAATATAAATTTTGCTAATTTTTTATTGTGAATTATAATTATAAGACTATAACATATT
AAATTTGTGGATTATGAATTTGTCGCATTTACATCTACAACGTTAATCAAGTGGTTTATA
CCATGGATCTTCTAATTCCCACAAATCAGGAGGTAAATGTTCTCTACCTGGTGGTGGTCC
ACATGGTTCACAAGGAGGTGGAGGAATATGAGCTTTTATTCTTATGCCTTCTCGTTCTTC
CCAAGCTATATCTTCTTCTAAAGCTGCTTCTCTTGCTTGTATCTCAGCTTTAACTTTTCT
CATATGTTCACGAGCGGCAATAATATCTGGATGATCCATACCATATTCAGGTTGTAAAAA
TTCTTCATGTAATTCAGGAACTCTATATAAGTATCATTATTATTATGTAAATATAATGAT
TATAAAAATTTTATTTTATTTTAATATATAAATATAATGTATATATATTTAATATATGAA
ATATTACCGAACATATCGTCTTGGAGCAACAATTTCAGGAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)