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consensusID : consensus_272#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 607 fasta sequence
[CCAACGATCCTATCTCGTTCCTGAGGCCACTCACTCACGCGTAGAATTTTAACCTGCACAATTTGGTTTTGTCGACCAGTCGTTGTCTCTGAGTCGGTTACAACACATCGTTACAATACAAATTAACTGTCTAAATCTGTCAATTTTTGATTTCTCTCGACATTTATTAATCGTTTATAAAAATATTTGAAACATTGGAATTTCTTATTATTGATTTTTCTGAATATTTTTCTAGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTCGAGTGCATCGTGAGTAATAGATAAGCATGATCAGTGTAGGAATGGAAGATATTGGAGATCAAAAGGAAAATTTAGTGGAGTGTATAGATTTTTAAATTTTTCAGACTTGTTTTCCTTNNNNTTTCTTTTTTTTTTTTTCCTATTTTTGGATTAAATTCTTTTTAAACTTATCTAGTAAATATGATTCAATCAATAAACAGCTGATACTCTAATCGATATGATGTAAGATTGAGATTGCAATGTAATCAAAGCTCATATTCTTAGTTTGAAAAAAAAAAAATTCATATTTTCAATGGAATAATTTTGCACTATAATATTGTTAATATTCGTATATTAAATTGA]
[+] EMBL BI512699 [CCAACGATCCTATCTCGTTCCTGAGGCCACTCACTCACGCGTAGAATTTTAACCTGCACAATTTGGTTTTGTCGACCAGTCGTTGTCTCTGAGTCGGTTACAACACATCGTTACAATACAAATTAACTGTCTAAATCTGTCAATTTTTGATTTCTCTCGACATTTATTAATCGTTTATAAAAATATTTGAAACATTGGAATTTCTTATTATTGATTTTTCTGAATATTTTTCTAGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTCGAGTGCATCGTGAGTAATAGATAAGCATGATCAGTGTAGGAATGGAAGATATTGGAGATCAAAAGGAAAATTTAGTGGAGTGTATAGATTTTTAAATTTTTCAGACTTGTTTTCCTTNNNNTTTCTTTTTTTTTTTTTCCTATTTTTGGATTAAATTCTTTTTAAACTTATCTAGTAAATATGATTCAATCAATAAACAGCTGATACTCTAATCGATATGATGTAAGATTGAGATTGCAATGTAATCAAAGCTCATATTCTTAGTTTGAAAAAAAAA ]
[+] EMBL BI514709 [ AACTTATCTAGTAAATATGATTCAATCAATAAACAGCTGATACTCTAATCGATATGATGTAAGATTGAAATTGCAATGTAATCAAAGCTCATATTCTTAGTTTGAAAAAAAAAAAATTCATATTTTCAATGGAATAATTTTGCACTATAATATTGTTAATATTCGTATATTAAATTGA]
consensusID : consensus_272#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 470 fasta sequence
[CATATTTTCGATGGAATAATTTTGCACTATAATATTGTTAATATTCGTATATTAGATTGATTTTTAAATATGTATCGATCTTTGATCTGTAATTTTCAATTATTGATTCGACTTAAACTTTTGTATACGTTTTAATAATCGTATCACGATACTACGATTCCATAATCTCATCTGCTTATAAATTCACATGGCATCTCCTTCGAACGATTATTTTCCAAACGAGGAACAAAATATTTTGGATGACACAATATTTGACAATGGTATGTAATTCTCTTGAAAAAAAATTCTGTAATAATTTTATGATCCTTTTATAATTATAATAAAATTTAATAGCAATCTAGTTGAAATATTGTCATAAAATTTTGAAGACAAACCAAGAAGATTGAAAGAAAAAATTGTTTTATCCATCTTTTTTATTTTTCGGAATAAAAATTAAGCAAATATTTTTTAATAATTCGTTTCATTTTTCT]
[+] EMBL BI514489 [CATATTTTCGATGGAATAATTTTGCACTATAATATTGTTAATATTCGTATATTAGATTGATTTTTAAATATGTATCGATCTTTGATCTGTAATTTTCAATTATTGATTCGACTTAAACTTTTGTATACGTTTTAATAATCGTATCACGATACTACGATTCCATAATCTCATCTGCTTATAAATTCACATGGCATCTCCTTCGAACGATTATTTTCCAAACGAGGAACAAAATATTTTGGATGACACAATATTTGACAATGGTATGTAATTCTCTTGAAAAAAAATTCTGTAATAATTTTATGATCCTTTTATAATTATAATAAAATTTAATAGCAATCTAGTTGAAATATTGTCATAAAATTTTGAAGACAAACCAAGAAGATTGAAAGAAAAAATTGTTTTATCCATCTTTTTTATTTTTCGGAATAAAAATTAAGCAAATATTTTTTAATAATTCGTTTCATTTTT ]
[+] EMBL BI514788 [ TTCGATGGAATAATTTTGCACTATAATATTGTTAATATTCGTATATTAGATTGATTTTTAAATATGTATCGATCTTTGATCTGTAATTTTCAATTATTGATTCGACTTAAACTTTTGTATACGTTTTAATAATCGTATCACGATACTACGATTCCATAATCTCATCTGCTTATAAATTCACATGGCATCTCCTTCGAACGATTATTTTCCAAACGAGGAACAAAATATTTTGGATGACACAATATTTGACAATGGTATGTAATTCTCTTGAAAAAAAATTCTGTAATAATTTTATGATCCTTTTATAATTATAATAAAATTTAATAGCAATCTAGTTGAAATATTGTCATAAAATTTTGAAGACAAACCAAGAAGATTGAAAGAAAAAATTGTTTTATCCATCTTTTTTATTTTTCGGAATAAAAATTAAGCAAATATTTTTTAATAATTCGTTTCATTTTTCT]
[+] EMBL BI514704 [ ATTCACATGGCATCTCCTTCGAACGATTATTTTCCAAACGAGGAACAAAATATTTTGGATGACACAATATTTGACAATGGTATGTAATTCTCTTGAAAAAAAATTCTGTAATAATTTTATGATCCTTTTATAATTATAATAAAATTTAATAGCAATCTAGTTGAAATATTGTCATAAAATTTTGAAGACAAACCAAGAAGATTGAAAGAAAAAATTGTTTTATCCATCTTTTTTATTTTTCGGAATAAAAATTAAGCAAATATTTTTTAATAATTCGTTTCATTTTT ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_272#0 CCAACGATCCTATCTCGTTCCTGAGGCCACTCACTCACGCGTAGAATTTTAACCTGCACA 60
consensus_272#1 --------------------------------------------------------CATA 4
** *
consensus_272#0 ATTTGGTTTTGTCGACCAGTCGTTGTCTCTGAGTCGGTTACAACACATCGTTACAATACA 120
consensus_272#1 TTTTCG----ATGGAATAATTTTGCACTATAATATTGTTA----ATATTCGTATATT--A 54
*** * * ** * * * ** * * **** * ** ** * * *
consensus_272#0 AATTAACTGTCTAA-ATCTGTCAATTTTTGATTTCTCTCGACATTTATTAATCGTTTATA 179
consensus_272#1 GATTGATTTTTAAATATGTATCGATCTTTGATCT------GTAATTTTCAATTATTGATT 108
*** * * * ** ** * ** ** ****** * * ** * *** ** **
consensus_272#0 AAAATATTTGAAACATTGGAATTTCTTATTATTGATTTTTCTGAATATTTTTCTAGTTTA 239
consensus_272#1 CGA----CTTAAACTTTTGTATACGTTTTAATAATCGTATCACGATACTA--CGATTCCA 162
* * **** ** * ** ** * ** * ** *** * * * * *
consensus_272#0 TTTATTTATTTATTTATTTATTTTTCGAGTGCATCGTGAGTAATAGATAAGCATGATCAG 299
consensus_272#1 TAATCTCATCTGCTTATAAATTCAC--ATGGCATCTCCTTCGAACGATTATTTT--CCAA 218
* * ** * **** *** * ***** * *** * * **
consensus_272#0 TGTAGGAATGGAAGATATTGGAGATCAAAAGGAAAATTTAGTGGAGTGTATAGATTTTTA 359
consensus_272#1 ACGAGGAACAAAATATTTTGGATGACAC----AATATTTGACAATG-GTATG------TA 267
***** ** ** ***** ** ** **** * **** **
consensus_272#0 AATTTTTCAGACTTGTTTTCCTTNNNNTTTCTTTTTTTTTTTTTCCTATTTTTGGATTAA 419
consensus_272#1 ATTCTCTTGAAAAAAAATTCTGTAATAATTTTATGATCCTTTT----ATAATTATAATAA 323
* * * * * *** * ** * * * **** ** ** * ***
consensus_272#0 ATTCTTTTTAAACTTATCTAGTAAATATGATTCAATCAATAAACAGCTGATACTCTAATC 479
consensus_272#1 AAT---TTAATAGCAATCTAGTTGAAATATT---GTCA-TAAAATTTTGA-AGACAAACC 375
* * ** * * ******* * ** * *** **** *** * * ** *
consensus_272#0 GATATGATGTAAGATTGAGATTGCAATGTAATCAAAGCTCATATTCTTAGTTTGAAAAAA 539
consensus_272#1 AAGAAGATTGAAAGAAAAAATTGT--TTTATCCATCTTTTTTATTTTTCG--GAATAAAA 431
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consensus_272#0 AAAAAATTCATATTTTCAATGGAATAATTTTGCACTATAATATTGTTAATATTCGTATAT 599
consensus_272#1 ATTAAGCAAATATTTTTTAATAATTCGTTTCATTTTTCT--------------------- 470
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consensus_272#0 TAAATTGA 607
consensus_272#1 --------
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| Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |