Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 558 cluster # 558       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_558#0 length = 1165 sequences # 4  
consensusID : consensus_558#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1165
fasta sequence 
                              [TAGAGGTGCTGGCGGTTTCTGGAGAAAATATCCAGCTGAAAATCTTGCAACTCCAACAGCATTTGCAGAAAATCCTTCTTTAGTTTGGGAATTTTATGAATATCGTAGACGAGTAGCATTAGAAGCTAAACCTAATAAGGCTCATGAAGCAATAGCAACTTTCCAAGATCGTTATTTAAAAGAAGGTAAAAATGTTACAATTATAACACAAAATATTGATGAACTTCATCAAAGAGCAGGAGCTAAAAATGTAGTGGAACTTCATGNNTCACTATTTAAGACTCGTTGTACATTTTGTCATGAAGTTGTTAAAAATACAAATATTCCAATATGCCCTGCATTAAAAGGGAAAGGATCACCAGATCCAAATATTATGACTTCTGATATTCCAAAAAAAGATTTACCTCATTGTCAAAATTGTAAAAATATATTAAGACCTCATATTGTATGGTTTGGAGAAAATTTAGATGATTACATAATGCAACAAGCACATATTGCCGTTGAAAATTGTGACGTTTGCCTGGTTATCGGTACATCATCTATTGTTTACCCTGCAGCAATGTTTGCACCATATGTAGCACAGCATGGAATCCCTGTTGCTGAATTTAATTTGGAAACAACTCCTGCTACATCATATTTCGAGTATCATTTTCAAGGTCCTTGCACTGTTACTGTACCAGAAGCTTTAGGATTATGATTTCTGAATATAAACAAAACATTTTGAGCATGTAGAATATTTACCTTGTACTAAACATACTTCAATATTGAGTCCAAGTTGATGTAAGTACTCTAACCATAATTTTTGCTTTGTTGAAAGAATATCACGAGGACCTTTTACTTCTATAATTTTATGCTTTAAAAAAAATATATTTTTTTAATTAAGAAAATATGAAATTTTAATTTATGAAAAATTATATAATATAAAATATAAGAAATATATTTTTTAATAGATTTAATAATATTATTTTTTAAATAAATATACATACTTCTTTGGTATCATAATTCCAAACAATTAAATCTGGAAATCCAGCTCTCCAAAGTTTAAAATTTTCAATAAGTCGTTTACAAATTCCTATTATACCTTGTACTCCCAAACAGTGTACTATTTCCTATAAATAAAAATGTTATATATTATTACATTTTTTGATGAATCAGATAATAAATA]

[+] EMBL BI516691             [TAGAGGTGCTGGCGGTTTCTGGAGAAAATATCCAGCTGAAAATCTTGCAACTCCAACAGCATTTGCAGAAAATCCTTCTTTAGTTTGGGAATTTTATGAATATCGTAGACGAGTAGCATTAGAAGCTAAACCTAATAAGGCTCATGAAGCAATAGCAACTTTCCAAGATCGTTATTTAAAAGAAGGTAAAAATGTTACAATTATAACACAAAATATTGATGAACTTCATCAAAGAGCAGGAGCTAAAAATGTAGTGGAACTTCATGNNTCACTATTTAAGACTCGTTGTACATTTTGTCATGAAGTTGTTAAAAATACAAATATTCCAATATGCCCTGCATTAAAAGGGAAAGGATCACCAGATCCAAATATTATGACTTCTGATATTCCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI506641             [                                                                                                                             CTAAACCTAATAAGGCTCATGAAGCAATAGCAACTTTCCAAGATCGTTATTTAAAAGAAGGTAAAAATGTTACAATTATAACACAAAATATTGATGAACTTCATCAAAGAGCAGGAGCTAAAAATGTAGTGGAACTTCATGGTTCACTATTTAAGACTCGTTGTACATTTTGTCATGAAGTTGTTAAAAATACAAATATTCCAATATGCCCTGCATTAAAAGGGAAAGGATCACCAGATCCAAATATTATGACTTCTGATATTCCAAAAAAAGATTTACCTCATTGTCAAAATTGTAAAAATATATTAAGACCTCATATTGTATGGTTTGGAGAAAATTTAGATGATTACATAATGCAACAAGCACATATTGCCGTTGAAAATTGTGACGTTTGCCTGGTTATCGGTACATCATCTATTGTTTACCCTGCAGCAATGTTTGCACCATATGTAGCACAGCATGGAATCCCTGTTGCTGAATTTAATTTGGAAACAACTCCTGCTACATCATATTTCGAGTATCATTTTCAAGGTCCTTGCACTGTTACTGTACCAGAAGCTTTAGGATTATGATTTCTGAATATAAACAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL BQ103812             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACATAATGC ACAAGCACATATTGCCGTTGAAAATTGTGACGTTTGCCTGGTTATCGGTACATCATCTATTGTTTACCCTGCAGCAATGTTTGCACCATATGTAGCACAGCATGGAATCCCTGTTGCTGAATTTAATTTGGAAACAACTCCTGCTACATCATATTTCGAGTATCATTTTCAAGGTCCTTGCACTGTTACTGTACCAGAAGCTTTAGGATTATGATTTCTGAATATAAACAAAACATTTTGAGCATGTAGAATATTTACCTTGTACTAAACATACTTCAATATTGAGTCCAAGTTGATGTAAGTACTCTAACCATAATTTTTGCTTTGTTGAAAGAATATCACGAGGACCTTTTACTTCTATAATTTTATGCTTTAAAAAAAATATATTTTTTTAATTAAGAAAATATGAAATTTTAATTTATGAAAAATTATATAATATAAAATATAAGAAATATATTTTTTAATAGATTTAATAATATTATTTTTTAAATAAATATACATACTTCTTTGGTATCATAATTCCAAACAATTAAATCTGGAAATCCAGCTCTCCAAAGTTTAAAATTTTCAATAAGTCGTTTACAAATTCCTATTATACCTTGTACTCCCAAACAGTGTACTATTTCCTATAAATAAAAATGTTATATATTATTACATTTTTTGATGAATCAGATAATAAATA]
[+] EMBL BI505746             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATAATGCAACAAGCACATATTGCCGTTGAAAATTGTGACGTTTGCCTGGTTATCGGTACATCATCTATTGTTTACCCTGCAGCAATGTTTGCACCATATGTAGCACAGCATGGAATCCCTGTTGCTGAATTTAATNNNGAAACAACTCCTGCTACATCATATTTCGAGTATCATTTTCAAGGTCCTTGCACTGTTACTGTACCAGAAGCTTTAGGATTATGATTTCTGAATATAAACAAAACATTTTGAGCATGTAGAATATTTACCTTGTACTAAACATACTTCAATATTGAGTCCAAGTTGATGTAAGTACTCTAACCATAATTTTTGCTTTGTTGAAAGAATATCACGAGGACCTTTTACTTCTATAATTTTATGCTTTAAAAAAAATATATTTTTTTAATTAAGAAAATATGAAATTTTAATTTATGAAAAATTATATAATATAAAATATAAGAAATATATTTTTTAATAGATTTAATAATATTATTTTTTAAATAAATATACATACTTCTTTGGTATCATAATTCCAAACAATTAAATCTGGAAATCCAGCTCTCCAAAGTTTAAAATTTTCAATAAGTCGTTTACAAATTCCTA                                                                                          ]




>consensus_558#0
TAGAGGTGCTGGCGGTTTCTGGAGAAAATATCCAGCTGAAAATCTTGCAACTCCAACAGC
ATTTGCAGAAAATCCTTCTTTAGTTTGGGAATTTTATGAATATCGTAGACGAGTAGCATT
AGAAGCTAAACCTAATAAGGCTCATGAAGCAATAGCAACTTTCCAAGATCGTTATTTAAA
AGAAGGTAAAAATGTTACAATTATAACACAAAATATTGATGAACTTCATCAAAGAGCAGG
AGCTAAAAATGTAGTGGAACTTCATGNNTCACTATTTAAGACTCGTTGTACATTTTGTCA
TGAAGTTGTTAAAAATACAAATATTCCAATATGCCCTGCATTAAAAGGGAAAGGATCACC
AGATCCAAATATTATGACTTCTGATATTCCAAAAAAAGATTTACCTCATTGTCAAAATTG
TAAAAATATATTAAGACCTCATATTGTATGGTTTGGAGAAAATTTAGATGATTACATAAT
GCAACAAGCACATATTGCCGTTGAAAATTGTGACGTTTGCCTGGTTATCGGTACATCATC
TATTGTTTACCCTGCAGCAATGTTTGCACCATATGTAGCACAGCATGGAATCCCTGTTGC
TGAATTTAATTTGGAAACAACTCCTGCTACATCATATTTCGAGTATCATTTTCAAGGTCC
TTGCACTGTTACTGTACCAGAAGCTTTAGGATTATGATTTCTGAATATAAACAAAACATT
TTGAGCATGTAGAATATTTACCTTGTACTAAACATACTTCAATATTGAGTCCAAGTTGAT
GTAAGTACTCTAACCATAATTTTTGCTTTGTTGAAAGAATATCACGAGGACCTTTTACTT
CTATAATTTTATGCTTTAAAAAAAATATATTTTTTTAATTAAGAAAATATGAAATTTTAA
TTTATGAAAAATTATATAATATAAAATATAAGAAATATATTTTTTAATAGATTTAATAAT
ATTATTTTTTAAATAAATATACATACTTCTTTGGTATCATAATTCCAAACAATTAAATCT
GGAAATCCAGCTCTCCAAAGTTTAAAATTTTCAATAAGTCGTTTACAAATTCCTATTATA
CCTTGTACTCCCAAACAGTGTACTATTTCCTATAAATAAAAATGTTATATATTATTACAT
TTTTTGATGAATCAGATAATAAATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)