Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 972 cluster # 972       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_972#0 length = 819 sequences # 3  
consensusID : consensus_972#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 819
fasta sequence 
                              [GTTTCCTTTGACTATTTTTGGTCAATTTCATGCACTTGTTTCGATTTATGCACGAGATGGCACAGTTTCTGTTACCCATGGAGGAATTGAGTGTGGTCAGGGAATTAATACTAAGGTAGCTCAAGTAGCAGCACATACTTTAGGTATTGACTTATCATTGGTCACTGTAAAAGCAAGCAACAATTTAACATCTCCAAATAATATAGTTACTGGTGGTAGTGTTACCAGCGAGAGTTGTGCATATGCAACTATGATGGCTTGCAAAGAACTACTTCAGAGATTAGAACCTATTAAAAAGGAGTTGAAAAACTTTTCGTGGCAAAAATTAATATTCACAGCATACTCAAAAGATGTTGATTTATGTGCGCGATACATGTTTACTGTAAAAGATGATATAAAATCATATCCAGTATATGGGGCAACTATAGCAGAAGTTGAGATTGATGTATTGACCGGACAACATATTACACGCAGAGTAGATTTAATTGAAGATGTTGGAAGGAGTATGAATCCAGAACTGGATTTGGGACAAGTGGAAGGTGCTTTTATAATGGGTATCGGATATTGGATATACGAACAACTAATTTATGATCAGAAAACAGGTCAACTAACGAATTATAGAACTTGGAATTATAAACCACCAGGTGCAAAGGACATTCCTGTCGATTTTCGAGTTTATTTCCGTAAAAATAGTACTAATCCATTAAGTGTTCTTCGTTCAAAAGCTACTGGTGAACCACCATTATGTATGAGTTACGCAATACCTATTGCAATTCATAATGCACTTAATTCAGCAAGAAAAAATGCTGGAAATAATGA]

[+] EMBL BI503156             [GTTTCCTTTGACTATTTTTGGTCAATTTCATGCACTTGTTTCGATTTATGCACGAGATGGCACAGTTTCTGTTACCCATGGAGGAATTGAGTGTGGTCAGGGAATTAATACTAAGGTAGCTCAAGTAGCAGCACATACTTTAGGTATTGACTTATCATTGGTCACTGTAAAAGCAAGCAACAATTTAACATCTCCAAATAATATAGTTACTGGTGGTAGTGTTACCAGCGAGAGTTGTGCATATGCAACTATGATGGCTTGCAAAGAACTACTTCAGAGATTAGAACCTATTAAAAAGGAGTTGAAAAACTTTTCGTGGCAAAAATTAATATTCACAGCATACTCAAAAGATGTTGATTTATGTGCGCGATACATGTTTACTGTAAAAGATGATATAAAATCATATCCAGTATATGGGGCAACTATAGCAGAAGTTGAGATTGATGTATTGACCGGACAACATATTACACGCAGAGTAGATTTAATTGAAGATGTTGGAAGGAGTATGAATCCAGNACTGGATTTGGGACAAGTGGAAGGTGCTTTTATAATGGGT                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI510080             [                                                        ATGGCACAGTTTCTGTTACCCATGGAGGAATTGAGTGTGGTCAGGGAATTAATACTAAGGTAGCTCAAGTAGCAGCACATACTTTAGGTATTGACTTATCATTGGTCACTGTAAAAGCAAGCAACAATTTAACATCTCCAAATAATATAGTTACTGGTGGTAGTGTTACCAGCGAGAGTTGTGCATATGCAACTATGATGGCTTGCAAAGAACTACTTCAGAGATTAGAACCTATTAAAAAGGAGTTGAAAAACTTTTCGTGGCAAAAATTAATATTCACAGCATACTCAAAAGATGTTGATTTATGTGCGCGATACATGTTTACTGTAAAAGATGATATAAAATCATATCCAGTATATGGGGCAACTATAGCAGAAGTTGAGATTGATGTATTGACCGGACAACATATTACACGCAGAGTAGATTTAATTGAAGATGTTGGAAGGAGTATGAATCCAGAACTGGATTTGGGACAAGTGGAAGGTGCTTTTATAATGGGTATCGGATATTGGATATACGAACAACTAATTTATGATCAGAAAACAGGTCAACTAACGAATTATAGAACTTGGAATTATAAACCACCAGGTGCAAAGGACATTCCTGTCGATT                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL BI505402             [                                                                                                                                                                                                                     TGGTAGTGTTACCAGCGAGAGTTGTGCATATGCAACTATGATGGCTTGCAAAGAACTACTTCAGAGATTAGAACCTATTAAAAAGGAGTTGAAAAACTTTTCGTGGCAAAAATTAATATTCACAGCATACTCAAAAGATGTTGATTTATGTGCGCGATACATGTTTACTGTAAAAGATGATATAAAATCATATCCAGTATATGGGGCAACTATAGCAGAAGTTGAGATTGATGTATTGACCGGACAACATATTACACGCAGAGTAGATTTAATTGAAGATGTTGGAAGGAGTATGAATCCAGAACTGGATTTGGGACAAGTGGAAGGTGCTTTTATAATGGGTATCGGATATTGGATATACGAACAACTAATTTATGATCAGAAAACAGGTCAACTAACGAATTATAGAACTTGGAATTATAAACCACCAGGTGCAAAGGACATTCCTGTCGATTTTCGAGTTTATTTCCGTAAAAATAGTACTAATCCATTAAGTGTTCTTCGTTCAAAAGCTACTGGTGAACCACCATTATGTATGAGTTACGCAATACCTATTGCAATTCATAATGCACTTAATTCAGCAAGAAAAAATGCTGGAAATAATGA]




>consensus_972#0
GTTTCCTTTGACTATTTTTGGTCAATTTCATGCACTTGTTTCGATTTATGCACGAGATGG
CACAGTTTCTGTTACCCATGGAGGAATTGAGTGTGGTCAGGGAATTAATACTAAGGTAGC
TCAAGTAGCAGCACATACTTTAGGTATTGACTTATCATTGGTCACTGTAAAAGCAAGCAA
CAATTTAACATCTCCAAATAATATAGTTACTGGTGGTAGTGTTACCAGCGAGAGTTGTGC
ATATGCAACTATGATGGCTTGCAAAGAACTACTTCAGAGATTAGAACCTATTAAAAAGGA
GTTGAAAAACTTTTCGTGGCAAAAATTAATATTCACAGCATACTCAAAAGATGTTGATTT
ATGTGCGCGATACATGTTTACTGTAAAAGATGATATAAAATCATATCCAGTATATGGGGC
AACTATAGCAGAAGTTGAGATTGATGTATTGACCGGACAACATATTACACGCAGAGTAGA
TTTAATTGAAGATGTTGGAAGGAGTATGAATCCAGAACTGGATTTGGGACAAGTGGAAGG
TGCTTTTATAATGGGTATCGGATATTGGATATACGAACAACTAATTTATGATCAGAAAAC
AGGTCAACTAACGAATTATAGAACTTGGAATTATAAACCACCAGGTGCAAAGGACATTCC
TGTCGATTTTCGAGTTTATTTCCGTAAAAATAGTACTAATCCATTAAGTGTTCTTCGTTC
AAAAGCTACTGGTGAACCACCATTATGTATGAGTTACGCAATACCTATTGCAATTCATAA
TGCACTTAATTCAGCAAGAAAAAATGCTGGAAATAATGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)