|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10064#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 3555 fasta sequence
[ATCTCCCGTCTCCACTCCACTCCTTGCGCCATCTCGCGGCTGAACAGGGGAGTGGAGGGGAGGGCCGCCTATCTCCATCTGGCGAGCAGAGCAAGAGCAAGGGAGGGGATCCTGGTGTGGTGTTGTTGTTGTCGTTGTTGCTCGCCGGATGTTGGAGGTCTGCTGCTGCTCCGGCGTCCTCGGCGGGTCGCCGCCGTCGTCGAGGACTGCGGGGGTTTCCTCACCTGGACTATCGCCGTCTCGGCCCAGTAAGCGGCGAATCGGCCGCGCCCGGGTGCAGCCGCGCGCGCCGCCGCCGTGCGACGAGCGGAGGGCGGCGGAGGACGTCATCCACGCGCTCAGGTCGGCGGATGGCCCCGCCGAGGCGCTTGAGCGGTTCAGGTCGGCGGCGCGGAAGCCCAGGGTGGCCCACACGACCGCGTCGTGCAACTACATGCTCGAGCTCATGGGCGGCCATGGCCGGGTCGGGGACATGGCCGAGGTGTTCGACGTAATGCAGAGGCAGATCGTCAAGGCGAACGTGGGCACGTTCGCGGCGATCTTCGGAGGGCTTGGTGTGGAGGGGGGACTCCGGAGCGCGCCGGTGGCGCTGCCGGTCATGAAGGAGGCCGGGATTGTCTTGAACGCGTACACGTATAATGGCCTGGTTTATTTCCTTGTGAAGTCCGGGTTTGATAGGGAGGCGTTGGAGGTTTATAGGGTGATGATGGTGGATGGTGTTGTGCCTAGTGTGAGAACCTACTCTGTGCTGATGGTGGCGTTCGGGAAGAGGAGGGATGTCGAGACGGTTCTTTGGTTGTTGCGTGAAATGGAGGCTCATGGCGTGAAGCCGAATGTGTATAGCTACACCATCTGTATTCGAGTTCTTGGACAAGCCAAAAGATTCGATGAAGCTTATCGGATACTTGCGAAAATGGAGAATGAAGGGTGTAAGCCGGATGTCATTACCCATACCGTGCTTATACAGGTTCTTTGCGATGCTGGCCGTATCAGTGATGCCAAGGATGTTTTTTGGAAGATGAAGAAGAGTGATCAAAAACCTGATCGAGTGACCTACATTACTCTGTTAGATAAGTTTGCTGACAATGGTGAGTCGCAATCAGTGATGGAAATTTGGAATGCAATGAAAGCTGATGGGTACAATGACAATGTTGTTGCTTATACAGCAGTTATTGATGCATTGTGCCAAGTTGGGAGGGTCTTTGAAGCTTTGGAAATGTTTGATGAGATGAAACAAAAGGGTATAGTGCCTGAGCAGTATTCATACAACTCGCTGATATCGGGGTTTCTTAAAGCTGATAGATTCGGTGATGCCTTAGAGCTGTTTAAATATATGGATATCCATGGACCTAAACCAAATGGTTACACGCATGTTCTTTTCATAAATTACTATGGAAAATCTGGTGAATCTATAAAGGCAATACAAAGATATGAACTAATGAAGAGCAAAGGGATTGTTCCAGATGTTGTTGCTGGTAATGCTGTTTTGTTTGGTCTTGCCAAATCTGGTAGACTTGGCATGGCAAAAAGGGTATTTCATGAATTAAAAGCTATGGGGGTTTCTCCGGATACTATCACCTACACTATGATGATCAAGTGTTGCAGCAAGGCATCAAAATTTGATGAAGCTGTGAAGATTTTCTATGATATGATTGAAAATAATTGTGTTCCTGATGTTCTTGTCGTGAATTCTTTGATTGATACACTCTACAAGGCAGGCAGGGGTGATGAAGCCTGGCGGATCTTTTATCAACTAAAAGAAATGAATCTAGAGCCAACAGATGGGACTTACAATACACTTTTGGCAGGATTGGGAAGGGAAGGTAAAGTCAAGGAGGTAATGCATCTGCTTGAAGAAATGTACCACAGTAATTATCCTCCTAATTTGATAACATACAATACGATTCTTGACTGTCTCTGCAAGAACGGGGCAGTTAATGATGCACTTGATATGCTATACAGTATGACTACGAAAGGATGCATACCTGATCTTTCGTCTTACAACACTGTTATATATGGCCTTGTTAAAGAAGAAAGATATAATGAGGCATTCAGTATTTTTTGTCAGATGAAGAAGGTTCTTATTCCAGGTTATGCAACACTGTGTACTATCCTCCCAAGTTTTGTGAAAATTGGACTGATGAAGGAAGCTCTGCATATTATCAAGGACTACTTCCTCCAACCTGGCTCCAAAACAGATAGGTCTTCATGCCATTCACTAATGGAAGGGATACTGAAGAAGGCTGGCATCGAAAAGTCAATTGAGTTTGCTGAAATCATAGCATCAAGTGGTATTACCTTGGATGATTTCTTTTTGTGCCCATTAATTAAGCATCTCTGTAAGCAGAAGAAAGCTCTTGAAGCACATGAACTTGTCAAAAAGTTCAAGAGCTTTGGAGTTTCACTAAAAACTGGATTATATAATTCTTTGATTTGTGGGCTTGTTGATGAAAACCTAATAGATATTGCTGAAGGCTTGTTTGCTGAAATGAAGGAACTCGGTTGTGGTCCAGATGAGTTTACTTACAACTTACTTCTTGATGCCATGGGAAAGTCAATGCGGATAGAGGAAATGCTAAAAGTTCAAGAAGAGATGCATCGCAAGGGATATGAATCAACTTATGTTACTTATAACACAATCATTTCAGGTCTTGTAAAGTCAAGAAGGTTGGAGCAGGCTATTGATTTGTACTACAACCTGATGAGCCAAGGTTTCTCACCCACACCATGCACATATGGCCCTCTTCTTGATGGTCTGTTAAAAGCTGGAAGGATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTACAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGATTATTATTGACACACTCTGCAAGGCAGGACAGTTAAATGATGGTCTAACATATTTTAGGCAATTATTAGAGATGGGTCTTGAACCTGATCTAATTACTTACAATTTGCTCATTGATGGTCTTGGAAAATCAAAAAGATTAGAGGAAGCAGTTTCTCTATTCAATGAGATGCAGAAGAAGGGAATTGTCCCGAACTTGTACACTTATAATTCACTAATTCTCCACTTAGGAAAAGCAGGGAAGGCTGCTGAAGCTGGGAAAATGTATGAAGAGCTACTGACGAAAGGCTGGAAGCCTAACGTTTTCACGTATAACGCTCTTATTAGGGGATACAGTGTTTCCGGCAGTACTGATAGTGCCTATGCTGCCTATGGACGGATGATTGTTGGCGGGTGCCTACCCAATTCAAGCACGTACATGCAGCTCCCAAATCAGCTGTGACTAACTAGTTAGTGACTGAATGTACTTCTTCTGTATAGTTTTGTCTATAAAAGGAAAAGGATCAACTGTAGATAGTCCACTTCAGTATATCTGAGGGTTCTGCTGGTTCTTGTTCTACACTATATTTTTGTACTTGATGGAAGAAAATTATTCAATACACAGCT]
[+] EMBL AK119359 [ATCTCCCGTCTCCACTCCACTCCTTGCGCCATCTCGCGGCTGAACAGGGGAGTGGAGGGGAGGGCCGCCTATCTCCATCTGGCGAGCAGAGCAAGAGCAAGGGAGGGGATCCTGGTGTGGTGTTGTTGTTGTCGTTGTTGCTCGCCGGATGTTGGAGGTCTGCTGCTGCTCCGGCGTCCTCGGCGGGTCGCCGCCGTCGTCGAGGACTGCGGGGGTTTCCTCACCTGGACTATCGCCGTCTCGGCCCAGTAAGCGGCGAATCGGCCGCGCCCGGGTGCAGCCGCGCGCGCCGCCGCCGTGCGACGAGCGGAGGGCGGCGGAGGACGTCATCCACGCGCTCAGGTCGGCGGATGGCCCCGCCGAGGCGCTTGAGCGGTTCAGGTCGGCGGCGCGGAAGCCCAGGGTGGCCCACACGACCGCGTCGTGCAACTACATGCTCGAGCTCATGGGCGGCCATGGCCGGGTCGGGGACATGGCCGAGGTGTTCGACGTAATGCAGAGGCAGATCGTCAAGGCGAACGTGGGCACGTTCGCGGCGATCTTCGGAGGGCTTGGTGTGGAGGGGGGACTCCGGAGCGCGCCGGTGGCGCTGCCGGTCATGAAGGAGGCCGGGATTGTCTTGAACGCGTACACGTATAATGGCCTGGTTTATTTCCTTGTGAAGTCCGGGTTTGATAGGGAGGCGTTGGAGGTTTATAGGGTGATGATGGTGGATGGTGTTGTGCCTAGTGTGAGAACCTACTCTGTGCTGATGGTGGCGTTCGGGAAGAGGAGGGATGTCGAGACGGTTCTTTGGTTGTTGCGTGAAATGGAGGCTCATGGCGTGAAGCCGAATGTGTATAGCTACACCATCTGTATTCGAGTTCTTGGACAAGCCAAAAGATTCGATGAAGCTTATCGGATACTTGCGAAAATGGAGAATGAAGGGTGTAAGCCGGATGTCATTACCCATACCGTGCTTATACAGGTTCTTTGCGATGCTGGCCGTATCAGTGATGCCAAGGATGTTTTTTGGAAGATGAAGAAGAGTGATCAAAAACCTGATCGAGTGGCCTACATTACTCTGTTAGATAAGTTTGGTGACAATGGTGACTCGCAATCAGTGATGGAAATCTGGAATGCAATGAAAGCTGATGGGTACAATGACAATGTTGTTGCTTATACAGCAGTTATTGATGCATTGTGCCAAGTTGGGAGGGTCTTTGAAGCTTTGGAAATGTTTGATGAGATGAAACAAAAGGGTATAGTGCCTGAGCAGTATTCATACAACTCGCTGATATCGGGGTTTCTTAAAGCTGATAGATTTGGTGATGCCTTAGAGCTGTTTAAACATATGGATATTCATGGACCTAAACCAAATGGTTACACACATGTTCTTTTCATAAATTACTATGGAAAATCTGGTGAATCTATAAAGGCAATACAGAGATATGAACTAATGAAGAGCAAAGGGATTGTGCCAGATGTTGTTGCTGGTAATGCTGTTTTGTTTGGTCTTGCCAAATCTGGTAGACTTGGCATGGCAAAAAGGGTATTTCATGAATTAAAAGCTATGGGGGTTTCTCCGGATACTATCACCTACACTATGATGATCAAGTGTTGCAGCAAGGCATCAAAATTTGATGAAGCTGTGAAGATTTTCTATGATATGATTGAAAATAATTGTGTTCCTGATGTTCTTGCCGTGAATTCTTTGATTGATACACTCTACAAGGCAGGCAGGGGTGATGAAGCCTGGCGGATCTTTTATCAACTAAAAGAAATGAATCTAGAGCCAACAGATGGGACTTACAATACACTTTTGGCAGGATTGGGAAGGGAAGGTAAAGTCAAGGAGGTAATGCATCTGCTTGAAGAAATGTACCACAGTAATTATCCTCCTAATTTGATAACATACAATACGATTCTTGACTGTCTCTGCAAGAACGGGGCAGTTAATGATGCACTTGATATGCTATACAGTATGACTACGAAAGGATGCATACCTGATCTTTCGTCTTACAACACTGTTATATATGGCCTTGTTAAAGAAGAAAGATATAATGAGGCATTCAGTATTTTTTGTCAGATGAAGAAGGTTCTTATTCCAGGTTATGCAACACTGTGTACTATCCTCCCAAGTTTTGTGAAAATTGGACTGATGAAGGAAGCTCTGCATATTATCAAGGACTACTTCCTCCAACCTGGCTCCAAAACAGATAGGTCTTCATGCCATTCACTAATGGAAGGGATACTGAAGAAGGCTGGCATCGAAAAGTCAATTGAGTTTGCTGAAATCATAGCATCAAGTGGTATTACCTTGGATGATTTCTTTTTGTGCCCATTAATTAAGCATCTCTGTAAGCAGAAGAAAGCTCTTGAAGCACATGAACTTGTCAAAAAGTTCAAGAGCTTTGGAGTTTCACTAAAAACTGGATTATATAATTCTTTGATTTGTGGGCTTGTTGATGAAAACCTAATAGATATTGCTGAAGGCTTGTTTGCTGAAATGAAGGAACTCGGTTGTGGTCCAGATGAGTTTACTTACAACTTACTTCTTGATGCCATGGGAAAGTCAATGCGGATAGAGGAAATGCTAAAAGTTCAAGAAGAGATGCATCGCAAGGGATATGAATCAACTTATGTTACTTATAACACAATCATTTCAGGTCTTGTAAAGTCAAGAAGGTTGGAGCAGGCTATTGATTTGTACTACAACCTGATGAGCCAAGGTTTCTCACCCACACCATGCACATATGGCCCTCTTCTTGATGGTCTGTTAAAAGCTGGAAGGATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTACAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGAT ]
[+] EMBL CB663806 [ CACGTATAATGGCCTGGTTTATTTCCTTGTGAAGTCCGGGTTTGATAGGGAGGCGTTGGAGGTTTATAGGGTGATGATGGTGGATGGTGTTGTGCCTAGTGTGACAACCTACTCTGTGCTGATGGTGGCGTTCGGGAAAAGGAGGGATGTCAAGACGGTTCTTTGGTTGTTGCGTGAAATGGAGGCTCATGGCGTGACGCCGAATGTGTATAGCTACACCATCTGTATTCGAGTTCTTGGAC AGCCAAAAGATTCGATGACCCTTATCG ]
[+] EMBL CB634322 [ TCGAGTGACCTACATTACTCTGTTAGATAAGTTTGCTGACAATGGTGAGTCGCAATCAGTGATGGAAATTTGGAATGCAATGAAAGCTGATGGGTACAATGACAATGTTGTTGCTTATACAGCAGTTATTGATGCATTGTGCCAAGTTGGGAGGGTCTTTGAAGCTTTGGAAATGTTTGATGAGATGAAACAAAAGGGTATAGTGCCTGAGCAGTATTCATACAACTCGCTGATATCGGGGTTTCTTAAAGCTGATAGATTCGGTGATGCCTTAGAGCTGTTTAAATATATGGATATCCATGGACCTAAACCAAATGGTTACACGCATGTTCTTTTCATAAATTACTATGGAAAATCTGGTGAATCTATAAAGGCAATACAAAGATATGAACTAATGAAGAGCAAAGGGATTGTTCCAGATGTTGTTGCTGGTAATGCTGTTTTGTTTGGTCTTGCCAAATCTGGTAGACTTGGCATGGCAAAAAGGGTATTTCATGAATTAAAAGCTATGGGGGTTTCTCCGGATACTATCACCTACACTATGATGATCAAGTGTTGCAGCAAGGCATCAAAATTTGATGAAGCTGTGAAGATTTTCTATGATATGATTGAAAATAATTGTGTTCCTGATGTTCTTGTCGTGAATTCTTTGATTGATACACTCTACAAGGCAGGCAGGGGTGATGAAGCCTGGCGGATCTTTTATCAACTAAAAGAAATGAATCTAGAGCCAACAGATGGGACTTACAATACACTTTTGGCAGGATTGGGAA ]
[+] EMBL CB632885 [ TCGAGTGACCTACATTACTCTGTTAGATAAGTTTGCTGACAATGGTGAGTCGCAATCAGTGATGGAAATTTGGAATGCAATGAAAGCTGATGGGTACAATGACAATGTTGTTGCTTATACAGCAGTTATTGATGCATTGTGCCAAGTTGGGAGGGTCTTTGAAGCTTTGGAAATGTTTGATGAGATGAAACAAAAGGGTATAGTGCCTGAGCAGTATTCATACAACTCGCTGATATCGGGGTTTCTTAAAGCTGATAGATTCGGTGATGCCTTAGAGCTGTTTAAATATATGGATATCCATGGACCTAAACCAAATGGTTACACGCATGTTCTTTTCATAAATTACTATGGAAAATCTGGTGAATCTATAAAGGCAATACAAAGATATGAACTAATGAAGAGCAAAGGGATTGTTCCAGATGTTGTTGCTGGTAATGCTGTTTTGTTTGGTCTTGCCAAATCTGGTAGACTTGGCATGGCAAAAAGGGTATTTCATGAATTAAAAGCTATGGGGGTTTCTCCGGATACTATCACCTACACTATGATGATCAAGTGTTGCAGCAAGGCATCAAAATTTGATGAAGCTGTGAAGATTTTCTATGATATGATTGAAAATAATTGTGTTCCTGATGTTCTTGTCGTGAATTCTTTGATTGATACACTCTACAAGGCAGGCAGGGGTGATGAAGCCTGGCGGATCTTTTATCAACTAAAAGAAATGAATCTAGAGCCAACAGATGGGACTTACAATACACTTTTGGCAGGATTGGGAAGG ]
[-] EMBL CB634323 [ GGATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTATAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGATTATTATTGACACACTCTGCAAGGCAGGACAGTTAAATGATGGTCTAACATATTTTAGGCAATTATTAGAGATGGGTCTTGAACCTGATCTAATTACTTACAATTTGCTCATTGATGGTCTTGGAAAATCAAAAAGATTAGAGGAAGCAGTTTCTCTATTCAATGAGATGCAGAAGAAGGGAATTGTCCCGAACTTGTACACTTATAATTCACTAATTCTCCACTTAGGAAAAGCAGGGAAGGCTGCTGAAGCTGGGAAAATGTATGAAGAGCTACTGACGAAAGGCTGGAAGCCTAACGTTTTCACGTATAACGCTCTTATTAGGGGATACAGTGTTTCCGGCAGTACTGATAGTGCCTATGCTGCCTATGGACGGATGATTGTTGGCGGGTGCCTACCCAATTCAAGCACGTACATGCAGCTCCCAAATCAGCTGTGACTAACTAGTTAGTGACTGAATGTACTTCTTCTGTATAGTTTTGTCTATAAAAGGAAAAGGATCAACTGTAGATAGTCCACTTCAGTATATCTGAGGGTTCTGCTGGTTCTTGTTCTACACTATATTTTTGTACTTGATGGAAGAAAATTATTCAAT ]
[-] EMBL CB632886 [ GGATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTATAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGATTATTATTGACACACTCTGCAAGGCAGGACAGTTAAATGATGGTCTAACATATTTTAGGCAATTATTAGAGATGGGTCTTGAACCTGATCTAATTACTTACAATTTGCTCATTGATGGTCTTGGAAAATCAAAAAGATTAGAGGAAGCAGTTTCTCTATTCAATGAGATGCAGAAGAAGGGAATTGTCCCGAACTTGTACACTTATAATTCACTAATTCTCCACTTAGGAAAAGCAGGGAAGGCTGCTGAAGCTGGGAAAATGTATGAAGAGCTACTGACGAAAGGCTGGAAGCCTAACGTTTTCACGTATAACGCTCTTATTAGGGGATACAGTGTTTCCGGCAGTACTGATAGTGCCTATGCTGCCTATGGACGGATGATTGTTGGCGGGTGCCTACCCAATTCAAGCACGTACATGCAGCTCCCAAATCAGCTGTGACTAACTAGTTAGTGACTGAATGTACTTCTTCTGTATAGTTTTGTCTATAAAAGGAAAAGGATCAACTGTAGATAGTCCACTTCAGTATATCTGAGGGTTCTGCTGGTTCTTGTTCTACACTATATTTTTGTACTTGATGGAAGAAAA ]
[-] EMBL CB663807 [ ATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTACAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGATTATTATTGACACACTCTGCAAGGCAGGACAGTTAAATGATGGTCTAACATATTTTAGGCAATTATTAGAAATGGGTCTTGAACCTGATCTAATTACTTACAATTTGCTCATTGATGGTCTTGGAAAATCAAAAAGATTAGAGGAAGCAGTGTCTCTATTCAATGAGATGCAGAAGAAGGGAATTGTCCCGAACTTGTACACTTATAATTCACTAATTCTCCACTTAGGAAAAGCAGGGAAGGCTGCTGAAGCTGGGAAAATGTATGAAGAGCTACTGACGAAAGGCTGGAAGCCTAACGTTTTCACATATAACGCTCTTATTAGGGGGTACAGTGTTTCCGGCAGTACTGATAGTGCCTATGCTGCCTATGGTCGGATGATTGTTGGCGGGTGCCTACCCAATTCAAGCACGTACATGCAGCTCCCAAATCAGCTGTGACTAACTAGTTAGTGACTGAATGTACTTCTTCTGTATAGTTTTGTCTATAAAAGGAAAAGGATCAACTGTAGATAGTCCACTTCAATATATCTGAGGGTTCTGCTGGTTCTTGTTCTACACTATATTTTTGTACTTGATGGAAGAAAATTATTCAATACACAGCT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||