cluster # 10873

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 10873 cluster # 10873 Sequences # 8 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10873#0 length = 1297 sequences # 8
consensusID : consensus_10873#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1297
fasta sequence
                              [GCCGCTCACAAACCCTAGCCCCCATGTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACGGAAATGGCGGAGGGCGAGGTCGAGAGCCGCGACTGGGCGGAGATGCCGTCGGACGCGCTCGCGGCGGTGTTCGGGAAGCTGGACGTGACCGACCTCCTGGTCGGGGCCGGGGTGGTGTGCCGCGCGTGGCGCCGGCTCGCGGCGATCGACCCCACGCTGTGGCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGG-TGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAATGTCAGTAATGAAGGGATGGCAGAGGCAATGAAGGGCTTTCCTCGGCTTGAGGAGCTGGATATTACATTCTGTTCTTTGTATGGTGATGTGTGTGCATCCGTTGGCAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA-CTGAAGCATTAGGGATTGC-AA-GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCTTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU225653             [GCCGCTCACAAACCCTAGCCCCCATGTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACGGAAATGGCGGAGGGCGAGGTCGAGAGCCGCGACTGGGCGGAGATGCCGTCGGACGCGCTCGCGGCGGTGTTCGGGAAGCTGGACGTGACCGACCTCCTGGTCGGGGCCGGGGTGGTGTGCCGCGCGTGGCGCCGGCTCGCGGCGATCGACCCCACGCTGTGGCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGG TGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAGTGTCAGTATTGAAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AK071724             [         AAACCCTAGCCCCCATGTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACGGAAATGGCGGAGGGCGAGGTCGAGAGCCGCGACTGGGCGGAGATGCCGTCGGACGCGCTCGCGGCGGTGTTCGGGAAGCTGGACGTGACCGACCTCCTGGTCGGGGCCGGGGTGGTGTGCCGCGCGTGGCGCCGGCTCGCGGCGATCGACCCCACGCTGTGGCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGG TGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAATGTCAGTAATGAAGGGATGGCAGAGGCAATGAAGGGCTTTCCTCGGCTTGAGGAGCTGGATATTACATTCTGTTCTTTGTATGGTGATGTGTGTGCATCCGTTGGCAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA CTGAAGCATTAGGGATTGC AA GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCTTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATT                         ]
[+] EMBL CB654278             [               TAGCCCCCCTGTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACGGAAATGGCGGAGGGCGAGGTCGAGAGCCGCGACTGGGCGGAGATGCCGTCGGACGCGCTCGCGGCGGTGTTCGGGAAGCTGGACGTGACCGACCTCCTGGTCGGGGCCGGGGTGGTGTGCCGCGCGTGGCGCCGGCTCGCGGCGATCGACCCCACGCTGTGGCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGG TGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAATGTCAGTAATGAAGGGATGGCAGAGGCAATGAAGGGCTTTCCTCGGCTTGAGGAGCTGGATATTACATTCTGTTCTTTGTATGGTGATGTGTGTGCATCCGTTGGCAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA CTGAAGCATTAGGGATTGC AA GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAAT AAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTTAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AU055964             [                                                                                                                                                                                             TCGCGGCGATCGACCCCACGCTGT GCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGGNTGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAATGTCAGTAATGAAGGGATGGCAGAGGCAATGAAGGGCTTTCCTCGGCTTGAGGAGCTGGATATTACATTCTGTTCTTTGTATGGTGATGTGTGTGCATCCGTTGGCAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA CTGAAGCATTAGGGATTGCAAA GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGNTTACATTTTCAGAAGCAGTG CTTTTCTGGTNCTGATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CB654279             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA CTGAAGCATTAGGGATTGC AA GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCTTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGAAGGGGGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGAGAAAACTTAAAA        ]
[+] EMBL AT003380             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCANCCCCTGATNTCATGGNTGATGNCN CTGAAGCNTTAGGGATTGC AANCCAATATGCCCAAGCTAAGAGANCTTNAGCTGATNGGCACCAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCNCTGCCAGCNCCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCCTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGAGAAAAAAAAAA         ]
[+] EMBL AU055965             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GATGACACCTGANGCATTAGGGATTGC AA GCNATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGNCTGATGTCAANCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACNCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATNCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTNCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCTTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGNGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AT003682             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTGTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCGNCAGCAGATCTGGTGGNGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGGCTTTGNTGCGAGTAGTAGTTTTGCAAACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGAGAAAAAAAAA          ]




>consensus_10873#0
GCCGCTCACAAACCCTAGCCCCCATGTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACGGAAATGG
CGGAGGGCGAGGTCGAGAGCCGCGACTGGGCGGAGATGCCGTCGGACGCGCTCGCGGCGG
TGTTCGGGAAGCTGGACGTGACCGACCTCCTGGTCGGGGCCGGGGTGGTGTGCCGCGCGT
GGCGCCGGCTCGCGGCGATCGACCCCACGCTGTGGCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGG
GAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGGTGGACCGAGCCG
CCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACA
TCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAATGTCAGTA
ATGAAGGGATGGCAGAGGCAATGAAGGGCTTTCCTCGGCTTGAGGAGCTGGATATTACAT
TCTGTTCTTTGTATGGTGATGTGTGTGCATCCGTTGGCAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAAT
GCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGG
ATGATGACACTGAAGCATTAGGGATTGCAAGCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGC
TGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACC
TTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAA
AGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACC
GGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCTTGATATGTATG
ATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATT
ATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTAC
ACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATG
GAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTG
TTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTT
GACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGA
TAATATTGCATTCCTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case