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Oryza sativa
cluster # 13571 cluster # 13571       Sequences # 13       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_13571#0 length = 633 sequences # 13  
consensusID : consensus_13571#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 633
fasta sequence 
                              [CTCTGCTTTTCTCGCCGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG-AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTGGTCTTGGTTTCGATAAACAAATCTTACTGCGGGCACTACGCCCGCTACCGCAAAT]

[+] EMBL CF338270             [CTCTGCTTTTCTCGCCGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATAT                                                                           ]
[+] EMBL CF338602             [CTCTGCTTTTCTCGCCGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTTCCGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCA                                                                                                                   ]
[+] EMBL CF340075             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTGGTCTTGGTTTCGATAAACAAATCTTACTGCGGGCACTAC                ]
[+] EMBL CF340055             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTGG                                                      ]
[+] EMBL CF340050             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTG                                                       ]
[+] EMBL CF339560             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGA                                                          ]
[+] EMBL CF340205             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGG                                                              ]
[+] EMBL CF338460             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATAT                                                                           ]
[+] EMBL CF340467             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCTGCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTGGTCTTGGTTTCGAT AACAAATCTTACTGCGGGCACTACGCCCGCTACCGCAAAT]
[+] EMBL CF338383             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGATGCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGC                                                                                                                         ]
[+] EMBL CF338711             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTGNAAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCC                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CF338242             [               CGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGGTTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAACGCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAATACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGATTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTG AAGCGGTTAACCAGCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGTCGTTGCCGGTACAGTGGGATGC                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CF305776             [                                                                                                                                                                                                                                                              TTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGCGGGGGCCGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_13571#0
CTCTGCTTTTCTCGCCGCCCAGGCCATTCTTGGCTGCATGATTGCGCAAAACCTCACTGG
TTCGATTCTCACCACCCTGGCCGTCAACTGGCCGATCGTGCTTGCAATTTTACTGGTAAC
GCTGCTTTCCAGCGCCATTGTGGGTTGGTTATTGGTGCGCTATAGCTCATTGCCTGGAAA
TACCGGTGCCTGGGGCTCCTCTCCTGGCGGCGCGGCGGCAATGGTCGCTATGGCGCAAGA
TTACGGCGCAGATATTCGCCTGGTGGCGTTTATGCAATATCTGCGAGTGCTGTTCGTCGC
GGGGGCCGCTGTTCTGGTCACCCGCATGATGCTGGGCGATAACGCTGAAGCGGTTAACCA
GCATATCGTCTGGTTCCCGCCAGTGAGCATTAATCTCCTGCTTACTATTTTGCTCGCGGT
CGTTGCCGGTACAGTGGGATGCCTGCTGCGTCTTCCTTCCGGCACGATGCTCATCCCGAT
GCTGGCGGGCGCAGTGCTCCAGTCTGGTCAGCTCATCACCATCGAACTACCGGAATGGCT
GCTGGCGATGGCGTATATGGCAATTGGCTGGCGGATTGGTCTTGGTTTCGATAAACAAAT
CTTACTGCGGGCACTACGCCCGCTACCGCAAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)