cluster # 4838

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Oryza sativa
cluster # 4838 cluster # 4838 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4838#0 length = 675 sequences # 3

consensusID : consensus_4838#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 675
fasta sequence

                              [TTTTTTTTTTTTTGGGACAGAGGAGGACATGATAAGCATGTATAGTAGAAAAATATTAATTCTAAATCTTGACCTCATATAATTGTAGTTCAACTGTGACTTAGG-ATTGTTTATTGTA-AAATTATGCAATGAGATAATCCTTAACTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTGAGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCATGAAGAATTCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAAACTGTGCCAACAAATAAATCAACCATATACGTTAGTCTTGCTAATGTTATGTGATTTCCAATCTCCATTAATAAGCCAATCCCCAGCCTGTCCATTTGAATCATTACATTTAGATTACTCTATGAGCCATTTCACGTCTCTAGTGCCAATCATTTTATGTAGAGTGGAGCCACTGTAGTGATAATCCATCCATAGCCCAGTGAGTAGACTAAACCGCATGTTAACAAAATGTATGTATCATGTGTGTTGGTTAGCTCCTAAATAGGCCATCATGACCATAGAAGGATTAAGAAGTCTTAGCCCCTAAGCTCTCTTGCCCATAAGGTGCTTGCATGTTGAGTAATTTAAAGCCTAAGCTACCTCAATTTTCCCCCTTGGCTCGTCCGGCTCACCTAAT]

[+] EMBL CA761520             [TTTTTTTTTTTTTGGGACAGAGGAGGACATGATAAGCATGTATAGTAGAAAAATATTAATTCTAAATCTTGACCTCATATAATTGTAGTTCAACTGTGACTTAGG ATTGTTTATTGTA AAATTATGCAATGAGATAATCCTTAACTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTGAGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCATGAAGAATTCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAAACTGTGCCAACAAATAAATCAACCATATACGTTAGTCTTGCTAATGTTATGTGATTTCCAATCTCCATTAATAAGCCAATCCCCAGCCTGTCCATTTGAATCATTACATTTAGATTACTCTATGAGCCATTTCACGTCTCTAGTGCCAATCATTTTATGTAGAGTGGAGCCACTGTAGTGATAATCCATCCATAGCCCAGTGAGTAGACTAAACCGCATGTTAACAAAATGTATGTATCATGTGTGTTGGTTAGCTCCTAAATAGGCCATCATGACCATAGAAGGATTAAGAAGTCTTAGCCCCTAAGCTCTCTTGCCCATAAGGTGCTTGCATGTTGAGTAATTTAAAGCCTAAGCTACCTCAATTTTCCCCCTTGGCTCGTCCGGCTCACCTAAT]
[+] EMBL CA761240             [TTTTTTTTTTTTTGGGACAGAGGAGGACATGATAAGCATGTATAGTAGAAAAATATTAATTCTAAATCTTGACCTCATATAATTGTAGTTCAACTGTGACTTAGG ATTGTTTATTGTA AAATTATGCAATGAGATAATCCTTAACTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTGAGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCATGAAGAATTCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAAACTGTGCCAACAAATAAATCAACCATATACGTTAGTCTTGCTAATGTTATGTGATTTCCAATCTCCATTAATAAGCCAATCCCCAGCCTGTCCATTTGAATCATTACATTTAGATTACTCTATGAGCCATTTCACGTCTCTAGTGCCAATCATTTTATGTAGAGTGGAGCCACTGTAGTGATAATCCATCCATAGCCCAGTGAGTAGACTAAACCGCATGTTAACAAAATGTATGTATCATGTGTGTTGGTTAGCTCCTAAATAGGCCATCATGACCATAGAAGGATTAAGAAGTCTTAGCCCCTAAGCTCTCTTGCCCATAAGGTGCTTGCATGTTGAGTAATTTAAAGCCTAAGCTACCTCAATTTTCCCCCTTGGCTCGTCCGGCTCACCTAAT]
[-] EMBL CA765593             [                                                                                        tcCACCTGNGACTTAGGAATTGTTTAGTGNAGAAATTATGCAATGAGATAATCCTTAGCTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTGAGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCATGAAGAATCCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAANCTGTGCCAACAAATAAATCAACCATATACGTCAGTCTTGCTAATGTTATGTNATTTCCAATCTCCATaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]




>consensus_4838#0
TTTTTTTTTTTTTGGGACAGAGGAGGACATGATAAGCATGTATAGTAGAAAAATATTAAT
TCTAAATCTTGACCTCATATAATTGTAGTTCAACTGTGACTTAGGATTGTTTATTGTAAA
ATTATGCAATGAGATAATCCTTAACTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTG
AGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCAT
GAAGAATTCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAAACTGTGCCAACAAATAAATCAA
CCATATACGTTAGTCTTGCTAATGTTATGTGATTTCCAATCTCCATTAATAAGCCAATCC
CCAGCCTGTCCATTTGAATCATTACATTTAGATTACTCTATGAGCCATTTCACGTCTCTA
GTGCCAATCATTTTATGTAGAGTGGAGCCACTGTAGTGATAATCCATCCATAGCCCAGTG
AGTAGACTAAACCGCATGTTAACAAAATGTATGTATCATGTGTGTTGGTTAGCTCCTAAA
TAGGCCATCATGACCATAGAAGGATTAAGAAGTCTTAGCCCCTAAGCTCTCTTGCCCATA
AGGTGCTTGCATGTTGAGTAATTTAAAGCCTAAGCTACCTCAATTTTCCCCCTTGGCTCG
TCCGGCTCACCTAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case