cluster # 5185

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Oryza sativa
cluster # 5185 cluster # 5185 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5185#0 length = 652 sequences # 3

consensusID : consensus_5185#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 652
fasta sequence

                              [CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGCGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCAACAATGCCATCCCAAATCTAACACCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGAGCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGATTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAATCACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCAGTAGTAGTAGTAGCAGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAACAAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATGTACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATTGTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTAATGAAATCTTTT]

[+] EMBL AK105150             [CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGCGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCAACAATGCCATCCCAAATCTAACACCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGAGCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGATTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAATCACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCAGTAGTAGTAGTAGCAGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAACAAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATGTACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATTGTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTAATGAAATCTTTT]
[+] EMBL AF145726             [CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGAGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCAACAATGCCATCCCAAATCTAACATCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGAGCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGATTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAATCACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCAGTAGTAGTAGT   AGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAACAAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATGTACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATTGTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTAATGAAAaaaaa ]
[+] EMBL AY206864             [CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGCGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCAACAATGCCATCCCAAATCTAACACCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGAGCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGATTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAATCACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCAGTAGTAGTAGTAGCAGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAACAAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATGTACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATTGTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTA            ]




>consensus_5185#0
CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGCGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCA
ACAATGCCATCCCAAATCTAACACCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGT
CGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGC
CGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGA
GCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGA
TTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAAT
CACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCA
GTAGTAGTAGTAGCAGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAAC
AAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATG
TACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATT
GTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTAATGAAATCTTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case