cluster # 5567

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Oryza sativa
cluster # 5567 cluster # 5567 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5567#0 length = 619 sequences # 3

consensusID : consensus_5567#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 619
fasta sequence

                              [GAGATGCTACTACAGAAGGATTAATTAAGGTGAGGCCAGCATATTCGTTTGGCGTCGATCCTGTATGGCATGGTAGCCGCAGTGAGCTGCCTTTTCTTAACTCCTTGAAGATGAAGCTGTCTATTCTTATTGGAGTTGCACAAATGAACCTTGGAATAATGATGAGTTACTTTAACGCAAAGTTTTTCAGAAATGCTATTAATGTTTGGTATCAGTTTATTCCTCAGCTGATATTCTTGAACAGCTTATTTGGTTACCTTTCACTCCTCATCATTATTAAGTGGTGCACGGGCTCAAAAGCTGACCTTTACCATGTGATGATATATATGTTCCTGAGTCCAACTGATGATCTT--GGGGA-GAACGAGCTATTTCCT-GGGCAGAAACTAGTGCAGC-TTGTACTACTTCTGCTTGCTCTGGGTTTCTGTGCCTTGGATGCTGATTCCGAAACCATTTTTCCTGAAG-AGCAACATGAGCAGAGGCACCAAGGCCAGCAGTACACCATGCNTCANGCCACTGATGAATCAGTGACAGAGCT-AGAAGACACCAGG-TGA-CCTCACCACCATGAGG-GGTTGAATTCAG-GAA-TCCTTGTCACCAGCTGATCCACACAATTGNGTTGTGC]

[+] EMBL C73776               [GAGATGCTACTACAGAAGGATTAATTAAGGTGAGGCCAGCATATTCGTTTGGCGTCGATCCTGTATGGCATGGTAGCCGCAGTGAGCTGCCTTTTCTTAACTCCTTGAAGATGAAGCTGTCTATTCTTATTGGAGTTGCACAAATGAACCTTGGAATAATGATGAGTTACTTTAACGCAAAGTTTTTCAGAAATGCTATTAATGTTTGGTATCAGTTTATTCCTCAGCTGATATTCTTGAACAGCTTATTTGGTTACCTTTCACTCCTCATCATTATTAAGTGGTGCACGGGCTCAAAAGCTGACCTTTACCATGTGATGATATATATGTTCCTGAGTCCAACTGATGATCTTTGGGGGAGGAACGAGCTATTTCCTGGGGCAGAAACTAGTGCAGCTTTGTACTACTTCTGCTTGCTCTGGGTTTCTGTGCCTTGGATGC                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL C74779               [                                                                                                                                                         GAATAATGATGAGTTACTTTAACGCAAAGTTTTTCAGAAATGCTATTAATGTTTGGTATCAGTTTATTCCTCAGCTGATATTCTTGAACAGCTTATTTGGTTACCTTTCACTCCTCATCATTATTAAGTGGTGCACGGGCTCAAAAGCTGACCTTTACCATGTGATGATATATATGTTCCTGAGTCCAACTGATGATCTT  GGGGA GAACGAGCTATTTCCT GGGCAGAAACTAGTGCAGC TTGTACTACTTCTGCTTGCTCT GGTTTCTGTGCCTTGGATGCTGATTCCGAAACCATTTTTCCTGAAG AGCAACATGAGCAGAGGCACCAAGGCCAGCAGTACACCATGCNTCANGCCACTGATGAATCAGTGACAGAGCT AGAAGACACCAGG TGA CCTCACCACCATGAGG GGTTGAATTCAG GAA TCCTTGTCA                            ]
[+] EMBL AU030374             [                                                                                                                                                                                                          TGTTTGGTATCAGTTTATTCCTCAGCTGATATTCTTGAACAGCTTATTTGGTTACCTTTCACTCCTCATCATTATTAAGTGGTGCACGGGCTCAAAAGCTGACCTTTACCATGTGATGATATATATGTTCCTGAGTCCAACTGATGATCTT  GGGGA GAACGAGCTATTTCCT GGGCAGAAACTAGTGCAGC TTGTACTACTTCTGCTTGCTCTGGG TTCTGTGCCTTGGATGCTGATTCCGAAACCATTTTTCCTGAAGAAGCAACATGAGCAGAGGCACCAAGGCCAGCAGTACACCATGCTTCAGGGCACTGATGGATCAGTGACAGAGCTAAGAAGACACCAGGATGACCCTCACCACCATGAGGAGGTTGAATTCAGTGAAGNCTTTGTCACCAGCTGATCCACACAATTGNGTTGTGC]




>consensus_5567#0
GAGATGCTACTACAGAAGGATTAATTAAGGTGAGGCCAGCATATTCGTTTGGCGTCGATC
CTGTATGGCATGGTAGCCGCAGTGAGCTGCCTTTTCTTAACTCCTTGAAGATGAAGCTGT
CTATTCTTATTGGAGTTGCACAAATGAACCTTGGAATAATGATGAGTTACTTTAACGCAA
AGTTTTTCAGAAATGCTATTAATGTTTGGTATCAGTTTATTCCTCAGCTGATATTCTTGA
ACAGCTTATTTGGTTACCTTTCACTCCTCATCATTATTAAGTGGTGCACGGGCTCAAAAG
CTGACCTTTACCATGTGATGATATATATGTTCCTGAGTCCAACTGATGATCTTGGGGAGA
ACGAGCTATTTCCTGGGCAGAAACTAGTGCAGCTTGTACTACTTCTGCTTGCTCTGGGTT
TCTGTGCCTTGGATGCTGATTCCGAAACCATTTTTCCTGAAGAGCAACATGAGCAGAGGC
ACCAAGGCCAGCAGTACACCATGCNTCANGCCACTGATGAATCAGTGACAGAGCTAGAAG
ACACCAGGTGACCTCACCACCATGAGGGGTTGAATTCAGGAATCCTTGTCACCAGCTGAT
CCACACAATTGNGTTGTGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case