cluster # 7197

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7197 cluster # 7197 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7197#0 length = 2480 sequences # 4
consensusID : consensus_7197#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2480
fasta sequence
                              [GCCCTCTGACTCATTTGCGCTCGATCTCGTCGTCCCCTCGGCCTCGAAGCGACCCCGTCTCTCGCGAGTTCTCCCGTCGTCTGCGCCGATCTCGCGAGCAGTGGGTGCCGACGTCGTGCTGCTTCCGCCGCATCCTCGCCGATTTTAGGTCAACTTTCCCAGGATTTGCTAGTCATGGCCAAAGGCAGGATATTCTCTGCCTTGTTAATGGTGTTTCTAGTTTTGGCTCCCCACTGCGAGGCGTTCTATTTGCCAGGCAGTTACATGCACACGTACCGGCAAGGCGAGGAAATATGGGCAAAGGTGAACTCACTCACTTCCATTGAGACTGAACTGCCATTCAGCTACTACAGTCTCCCATACTGCCATCCCCAAGGTGGGATAAAGAAGAGTGCTGAGAATCTAGGGGAGCTCCTGATGGGTGACCAGATTGACAATTCCCCATACCGGTTTCGTGTGAATGTCAATGAATCACTGTATCTGTGTACCACAAACCCACTTGACGAGGCTGATGTGAAGCTCCTCAAGCAGCGAAGCCGAGACCTCTACCAGGTGAACATGATTCTCGACAATCTTCCTGTGAGGAGATTTACTGAACAGAATGGAGTGACCATTCAGTGGACAGGCTATCCAGTTGGTTATACCCCGGAAGGAAGCAATGAGGTCTACATCATTAATCACCTGAAATTTAAGGTCTTGGTCCATAGGTACGAAGGAGGTAAAGTCAAGGTAGTTGGAACTGGGGAAGGAATGGAAGTGATCTCAGAGACAGAGACAGATGCCAAGTCTGGCTATGAGATTGTGGGATTTGAGGTTGTCCCATGCAGCATGAAGCGTGATCTTGAAGCTATGTCAAAGCTTAAGATGTATGAAAAAGTTGATCCTACAAGCTGCCCTGTGGAGATGGAGAAATCTCAATTGATTAGGGAAAAAGAGCAGATTACTTTTACGTATGAGGTTGAATTTGTAAACAGTGATATCAGATGGCCATCACGGTGGGATGCATACCTGAAGATGGAGGGTGCTAAAATTCACTGGTTCTCAATCATGAACTCATTGATGGTAATACTATTTTTGGCTGGAATTGTGTTTGTCATATTCTTGCGGACGGTGAGGAGAGACTTGACTAGATATGAGGAATTGGATAAGGAGGCCCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCCGGGTGGAAGCTTGTTGTTGGTGATGTCTTCAGAGAACCAACATCATCAAAGCTTCTCTGCGTCATGATTGGTGATGGGGTTCAAATTCTGGGTATGGCAATTGTTACCATCTTCTTTGCTGCCTTTGGGTTCATGTCTCCTGCATCAAGAGGAATGCTTCTCACAGGGATGATATTTCTTTATATGTTGCTTGGAATTGTGGCTGGATATGCTGCCGTTAGGCTCTGGAGGACTTTAAAAGGAACTTCTGAGGGATGGAGATCTGTCTCCTGGTCAACAGCCTGTTTCTTCCCTGGTATTGTCTTTGTTGTCCTCACTGTGTTAAATTTCATGCTGTGGTCAAGGAATAGTACAGGAGCTCTTCCCATCTCACTCTTCTTCACACTTCTGTCCTTGTGGTTCTGCATCTCTGTGCCACTTACCCTCCTCGGTGGTTTCTTTGGCACAAGGGCTGAGCCAATAGAATTCCCAGTTCGAACCAATCAAATACCAAGAGAAATCCCTGCAAAAAATTACTCTTGGCTCCTTGTGCTTGGTGCTGGGACTCTGCCTTTTGGAACACTATTCATTGAGTTGTTCTTTATTCTTTCAAGTATTTGGCTCGGAAGGTTCTACTATGTGTTTGGGTTCCTCCTTGTTGTCCTCCTCTTGCTGGTTGTGGTCTGTGCTGAGGTATCTGTTGTTCTTACCTACATGCATCTTTGTGCGGAAGATTGGCGT-TGGTGGTGGAAAGCTTTCTTTGCCTCTGGAGCAGTAGCGCTTTATGTGTTCCTGTACTCTATCAACTACTTGGTGTTTGATCTCAGAAGCTTGAGTGGCCCAGTTTCTGCTACGCTCTACATTGGATATGCTTTCGTTGTCTCTCTTGCAATTATGCTGGCTACTGGGACTGTTGGGTTCCTGACATCATTCTCTTTCGTCCACTACCTTTTCTCATCAGTTAAGATTGATTGAAGACCATACCTTACAAATCTCCAAGGATGACTGTACACTGAATCACTCTAAAGCGGCAATGATTTGATCATGGCATCTGAAGGCCCTTTACACAATTGTGATGTCTTCCTTATGTAGCTAATTACCGGGACTATTGTACCACGATGAATATGGTGATAGTAATGTACCAGCATATATGCTTTTAAGCTTGCATTCATCATCTTTTATTTGTTAAAATTTTGTTGATTGTGCAAATGCTTTCTGAAAAGACCATGAATTTTACTTAGCATATCAGTGGTACATTATGGAGTGATTGCTTTGTTATGTAAGTGGGCTTTGCAATCAACCAGTTATTATCTTGAGGT]

[+] EMBL AK064958             [GCCCTCTGACTCATTTGCGCTCGATCTCGTCGTCCCCTCGGCCTCGAAGCGACCCCGTCTCTCGCGAGTTCTCCCGTCGTCTGCGCCGATCTCGCGAGCAGTGGGTGCCGACGTCGTGCTGCTTCCGCCGCATCCTCGCCGATTTTAGGTCAACTTTCCCAGGATTTGCTAGTCATGGCCAAAGGCAGGATATTCTCTGCCTTGTTAATGGTGTTTCTAGTTTTGGCTCCCCACTGCGAGGCGTTCTATTTGCCAGGCAGTTACATGCACACGTACCGGCAAGGCGAGGAAATATGGGCAAAGGTGAACTCACTCACTTCCATTGAGACTGAACTGCCATTCAGCTACTACAGTCTCCCATACTGCCATCCCCAAGGTGGGATAAAGAAGAGTGCTGAGAATCTAGGGGAGCTCCTGATGGGTGACCAGATTGACAATTCCCCATACCGGTTTCGTGTGAATGTCAATGAATCACTGTATCTGTGTACCACAAACCCACTTGACGAGGCTGATGTGAAGCTCCTCAAGCAGCGAAGCCGAGACCTCTACCAGGTGAACATGATTCTCGACAATCTTCCTGTGAGGAGATTTACTGAACAGAATGGAGTGACCATTCAGTGGACAGGCTATCCAGTTGGTTATACCCCGGAAGGAAGCAATGAGGTCTACATCATTAATCACCTGAAATTTAAGGTCTTGGTCCATAGGTACGAAGGAGGTAAAGTCAAGGTAGTTGGAACTGGGGAAGGAATGGAAGTGATCTCAGAGACAGAGACAGATGCCAAGTCTGGCTATGAGATTGTGGGATTTGAGGTTGTCCCATGCAGCATGAAGCGTGATCTTGAAGCTATGTCAAAGCTTAAGATGTATGAAAAAGTTGATCCTACAAGCTGCCCTGTGGAGATGGAGAAATCTCAATTGATTAGGGAAAAAGAGCAGATTACTTTTACGTATGAGGTTGAATTTGTAAACAGTGATATCAGATGGCCATCACGGTGGGATGCATACCTGAAGATGGAGGGTGCTAAAATTCACTGGTTCTCAATCATGAACTCATTGATGGTAATACTATTTTTGGCTGGAATTGTGTTTGTCATATTCTTGCGGACGGTGAGGAGAGACTTGACTAGATATGAGGAATTGGATAAGGAGGCCCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCCGGGTGGAAGCTTGTTGTTGGTGATGTCTTCAGAGAACCAACATCATCAAAGCTTCTCTGCGTCATGATTGGTGATGGGGTTCAAATTCTGGGTATGGCAATTGTTACCATCTTCTTTGCTGCCTTTGGGTTCATGTCTCCTGCATCAAGAGGAATGCTTCTCACAGGGATGATATTTCTTTATATGTTGCTTGGAATTGTGGCTGGATATGCTGCCGTTAGGCTCTGGAGGACTTTAAAAGGAACTTCTGAGGGATGGAGATCTGTCTCCTGGTCAACAGCCTGTTTCTTCCCTGGTATTGTCTTTGTTGTCCTCACTGTGTTAAATTTCATGCTGTGGTCAAGGAATAGTACAGGAGCTCTTCCCATCTCACTCTTCTTCACACTTCTGTCCTTGTGGTTCTGCATCTCTGTGCCACTTACCCTCCTCGGTGGTTTCTTTGGCACAAGGGCTGAGCCAATAGAATTCCCAGTTCGAACCAATCAAATACCAAGAGAAATCCCTGCAAAAAATTACTCTTGGCTCCTTGTGCTTGGTGCTGGGACTCTGCCTTTTGGAACACTATTCATTGAGTTGTTCTTTATTCTTTCAAGTATTTGGCTCGGAAGGTTCTACTATGTGTTTGGGTTCCTCCTTGTTGTCCTCCTCTTGCTGGTTGTGGTCTGTGCTGAGGTATCTGTTGTTCTTACCTACATGCATCTTTGTGCGGAAGATTGGCGT TGGTGGTGGAAAGCTTTCTTTGCCTCTGGAGCAGTAGCGCTTTATGTGTTCCTGTACTCTATCAACTACTTGGTGTTTGATCTCAGAAGCTTGAGTGGCCCAGTTTCTGCTACGCTCTACATTGGATATGCTTTCGTTGTCTCTCTTGCAATTATGCTGGCTACTGGGACTGTTGGGTTCCTGACATCATTCTCTTTCGTCCACTACCTTTTCTCATCAGTTAAGATTGATTGAAGACCATACCTTACAAATCTCCAAGGATGACTGTACACTGAATCACTCTAAAGCGGCAATGATTTGATCATGGCA  TGAAGGCCCTTTACACAATTGTGATGTCTTCCTTATGTAGCTAATTACCGGGACTATTGTACCACGATGAATATGGTGATAGTAATGTACCAGCATATATGCTTTTAAGCT                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CB629165             [                                                                                                                                                            TCCCACCATTTGCTAGTCATGGCCAAAGGCAGGATATTCTCTGCCTTGTTAATGGTGTTTCTAGTTTTGGCTCCCCACTGCGAGGCGTTCTATTTGCCAGGCAGTTACATGCACACGTACCGGCAAGGCGAGGAAATATGGGCAAAGGTGAACTCACTCACTTCCATTGAGACTGAACTGCCATTCAGCTACTACAGTCTCCCATACTGCCATCCCCAAGGTGGGATAAAGAAGAGTGCTGAGAATCTAGGGGAGCTCCTGATGGGTGACCAGATTGACAATTCCCCATACCGGTTTCGTGTGAATGTCAATGAATCACTGTATCTGTGTACCACAAACCCACTTGACGAGGCTGATGTGAAGCTCCTCAAGCAGCGAAGCCGAGACCTCTACCAGGTGAACATGATTCTCGACAATCTTCCTGTGAGGAGATTTACTGAACAGAATGGAGTGACCATTCAGTGGACAGGCTATCCAGTTGGTTATACCCCGGAAGGAAGCAATGAGGTCTACATCATTAATCACCTGAAATTTAAGGTCTTGGTCCATAGGTACGAAGGAGGTAAAGTCAAGGTAGTTGGAACTGGGGAAGGAATGGAAGTGATCTCAGAGACGGAGACAGATGCCAAGTCTGGCTATGAGATTGTGGGATTTGAGGTTGTCCCATGCAGCGTGAAGCGTGATCTTGAAGCTATGTCAAAGCTTAAGATGTATGAAAGAGTTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CB629166             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCCTGCAAAAAATTACTCTTGGCTCCTTGTGCTTGGTGCTGGGACTCTGCCTTTTGGAACACTATTCATTGAGTTGTTCTTTATTCTTTCAAGTATTTGGCTCGGAAGGTTCTACTATGTGTTTGGGTTCCTCCTTGTTGTCCTCCTCTTGCTGGTTGTGGTCTGTGCTGAGGTATCTGTTGTTCTTACCTACATGCATCTTTGTGCGGAAGATTGGCGT TGGTGGTGGAAAGCTTTCTTTGCCTCTGGAGCAGTAGCGCTTTATGTGTTCCTGTACTCTATCAACTACTTGGTGTTTGATCTCAGAAGCTTGAGTGGCCCAGTTTCTGCTACGCTCTACATTGGATATGCTTTCGTTGTCTCTCTTGCAATTATGCTGGCTACTGGGACTGTTGGGTTCCTGACATCATTCTCTTTCGTCCACTACCTTTTCTCATCAGTTAAGATTGATTGAAGACCATACCTTACAAATCTCCAAGGATGACTGTACACTGAATCACTCTAAAGCGGCAATGATTTGATCATGGCATCTGAAGGCCCTTTACACAATTGTGATGTCTTCCTTATGTAGCTAATTACCGGGACTATTGTACCACGATGAATATGGTGATAGTAATGTACCAGCATATATGCTTTTAAGCTTGCATTCATCATCTTTTATTTGTTAAAATTTTGTTGATTGTGCAAATGCTTTCTGAAAAGACCATGAATTTTACTTAGCATATCAGTGGTACATTATGGAGTGATTGCTTTGTTATGTAAGTGGGCTTTGCAATCAACCAGTTATTATCTTGAGGT]
[+] EMBL CB632029             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCGTCTGGTGGTGGAAAGCTTTCTTTGCCTCTGGAGCAGTAGCGCTTTATGTGTTCCTGTACTCTATCAACTACTTGCTGTTTGATCTCAGAAGCTTGAGTGGCCCAGTTTCTGCTACGCTCTACATTGGATATGCTTTCGTTGTCTCTCTTGCAATTATGCTGGCTACTGGGACTGTTGGGTTCCTGACATCATTCTCTTTCGTCCACTACCTTTTCTCATCAGTTAAGATTGATTGAAGACCATACCTTACAAATCTCCAAGGATGACTGTACACTGAATCACTCTAAAGCGGCAATGATTTGATCATGGCATCTGAAGGCCCTTTACACAATTGTGATGTCTTCCTTATGTAGCTAATTACCGGGACTATTGTACCACGATGAATATGGTGATAGTAATGTACCAGCATATATGCTT                                                                                                                                                                   ]




>consensus_7197#0
GCCCTCTGACTCATTTGCGCTCGATCTCGTCGTCCCCTCGGCCTCGAAGCGACCCCGTCT
CTCGCGAGTTCTCCCGTCGTCTGCGCCGATCTCGCGAGCAGTGGGTGCCGACGTCGTGCT
GCTTCCGCCGCATCCTCGCCGATTTTAGGTCAACTTTCCCAGGATTTGCTAGTCATGGCC
AAAGGCAGGATATTCTCTGCCTTGTTAATGGTGTTTCTAGTTTTGGCTCCCCACTGCGAG
GCGTTCTATTTGCCAGGCAGTTACATGCACACGTACCGGCAAGGCGAGGAAATATGGGCA
AAGGTGAACTCACTCACTTCCATTGAGACTGAACTGCCATTCAGCTACTACAGTCTCCCA
TACTGCCATCCCCAAGGTGGGATAAAGAAGAGTGCTGAGAATCTAGGGGAGCTCCTGATG
GGTGACCAGATTGACAATTCCCCATACCGGTTTCGTGTGAATGTCAATGAATCACTGTAT
CTGTGTACCACAAACCCACTTGACGAGGCTGATGTGAAGCTCCTCAAGCAGCGAAGCCGA
GACCTCTACCAGGTGAACATGATTCTCGACAATCTTCCTGTGAGGAGATTTACTGAACAG
AATGGAGTGACCATTCAGTGGACAGGCTATCCAGTTGGTTATACCCCGGAAGGAAGCAAT
GAGGTCTACATCATTAATCACCTGAAATTTAAGGTCTTGGTCCATAGGTACGAAGGAGGT
AAAGTCAAGGTAGTTGGAACTGGGGAAGGAATGGAAGTGATCTCAGAGACAGAGACAGAT
GCCAAGTCTGGCTATGAGATTGTGGGATTTGAGGTTGTCCCATGCAGCATGAAGCGTGAT
CTTGAAGCTATGTCAAAGCTTAAGATGTATGAAAAAGTTGATCCTACAAGCTGCCCTGTG
GAGATGGAGAAATCTCAATTGATTAGGGAAAAAGAGCAGATTACTTTTACGTATGAGGTT
GAATTTGTAAACAGTGATATCAGATGGCCATCACGGTGGGATGCATACCTGAAGATGGAG
GGTGCTAAAATTCACTGGTTCTCAATCATGAACTCATTGATGGTAATACTATTTTTGGCT
GGAATTGTGTTTGTCATATTCTTGCGGACGGTGAGGAGAGACTTGACTAGATATGAGGAA
TTGGATAAGGAGGCCCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCCGGGTGGAAGCTTGTTGTT
GGTGATGTCTTCAGAGAACCAACATCATCAAAGCTTCTCTGCGTCATGATTGGTGATGGG
GTTCAAATTCTGGGTATGGCAATTGTTACCATCTTCTTTGCTGCCTTTGGGTTCATGTCT
CCTGCATCAAGAGGAATGCTTCTCACAGGGATGATATTTCTTTATATGTTGCTTGGAATT
GTGGCTGGATATGCTGCCGTTAGGCTCTGGAGGACTTTAAAAGGAACTTCTGAGGGATGG
AGATCTGTCTCCTGGTCAACAGCCTGTTTCTTCCCTGGTATTGTCTTTGTTGTCCTCACT
GTGTTAAATTTCATGCTGTGGTCAAGGAATAGTACAGGAGCTCTTCCCATCTCACTCTTC
TTCACACTTCTGTCCTTGTGGTTCTGCATCTCTGTGCCACTTACCCTCCTCGGTGGTTTC
TTTGGCACAAGGGCTGAGCCAATAGAATTCCCAGTTCGAACCAATCAAATACCAAGAGAA
ATCCCTGCAAAAAATTACTCTTGGCTCCTTGTGCTTGGTGCTGGGACTCTGCCTTTTGGA
ACACTATTCATTGAGTTGTTCTTTATTCTTTCAAGTATTTGGCTCGGAAGGTTCTACTAT
GTGTTTGGGTTCCTCCTTGTTGTCCTCCTCTTGCTGGTTGTGGTCTGTGCTGAGGTATCT
GTTGTTCTTACCTACATGCATCTTTGTGCGGAAGATTGGCGTTGGTGGTGGAAAGCTTTC
TTTGCCTCTGGAGCAGTAGCGCTTTATGTGTTCCTGTACTCTATCAACTACTTGGTGTTT
GATCTCAGAAGCTTGAGTGGCCCAGTTTCTGCTACGCTCTACATTGGATATGCTTTCGTT
GTCTCTCTTGCAATTATGCTGGCTACTGGGACTGTTGGGTTCCTGACATCATTCTCTTTC
GTCCACTACCTTTTCTCATCAGTTAAGATTGATTGAAGACCATACCTTACAAATCTCCAA
GGATGACTGTACACTGAATCACTCTAAAGCGGCAATGATTTGATCATGGCATCTGAAGGC
CCTTTACACAATTGTGATGTCTTCCTTATGTAGCTAATTACCGGGACTATTGTACCACGA
TGAATATGGTGATAGTAATGTACCAGCATATATGCTTTTAAGCTTGCATTCATCATCTTT
TATTTGTTAAAATTTTGTTGATTGTGCAAATGCTTTCTGAAAAGACCATGAATTTTACTT
AGCATATCAGTGGTACATTATGGAGTGATTGCTTTGTTATGTAAGTGGGCTTTGCAATCA
ACCAGTTATTATCTTGAGGT
clustalw multiple alignements is not computed in this case