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Oryza sativa
cluster # 7806 cluster # 7806       Sequences # 5       consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7806#0 length = 3574 sequences # 4  
 consensus_7806#1 length = 2516 sequences # 1  
consensusID : consensus_7806#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 3574
fasta sequence 
                              [CACTCCCACGCCTGATGGCTGGTGCCGCCGCCTCGCCCTCTCGCTGCAAGACGATGGTGGCGCCGTCTCCTTTCACTCGCCCTCTCTCCGCGGGATGGCGGAAGCGCCATCTCATTCCCCGGCCGCGCCCTCTCGCCGCAGGCACTGTCTCCGTTCCCTTCCCCTGACAGTTTGGGTGTCGCCGAATCTCACTGGGATTAGTTCGCCACCGTAGGGAGTTGCCGGGACTGGTTCGTCACCTCTGCGACCTGGCGACCTGACGATCTGCTACCACGCATTCTACTCCTCCCCAGGTCAACTTTACACTCCCTTTGCCTAATCCTCTTAATCAATATATATGATCGATCCAGCCTGCTTGCTTGCGCTGATTCCATATTTGTTGTTCTACTCCTCTGCTGAAGCCATCAGCAGACACAATTTGGTACACTACTACTTAAATCCCTATTATATGCATATATACATATCTGTTCTAGCCCCTGATCTCTATTCTTGACTTGCTGCTCATTATGAGTTTCACATGATTGGTAGGAAGGAAAGAAAAAAGGGAGTGCAGGCTAGAATGCTAGATTATTCAGTACTAAAGTTTAAACATCACCGTCCAGGTACAGATCAAATCCTCTCCTTCTGTCCTGTATATATTGTATTGGAATTTAATATATGTTTTCAGGTTGCTGACATCATTCTGTTGATTGCTATTATGTCTACAAAAGTTTGAGGATTACTGCAGCTGCCTATATGATATGATTAAGATCTTTTGCACTGTAATAGTTGACAGATTTTCTTGGTCATCTGTATATGTTTTTTTTACACTATATGAATGTCGTGCTAAATCAAAATAGCTTTATATAGGAGCAGCAAAATTTTACTATGAAAATATTATTATAGAAAATGGATTTGAAATGTATATTATTATGGATTCTCAACCATCTTCTCCTAACAGCATTTGTGCCCCTCACCAATGTCCTGCTACGATGGCCCACTAGATGCCATGGCCGCATGTGTTGTTCATGCTGGTGGCAGCGATGGCGGCATCCGAGCCCACATCAAGGCCTGCGCCGCGCTGGGAGCAATCTGCTCCTCCGTTGTCACCGCACATAACACCATAGTCGTTCAGGTATGCTGCTGAATTTCTTTCTTTTCAGTTTGCTCTCTTCGGCTGATTGGCTCCTATGCGGGCTTCTGAGATAAGGAGAAGAAATGATTAGGCTGACGCCAGTAAAATTTCTCTCTTTAACAAAAGCCTTCTATGTGCTTGGTAAAATTTTTAGTGGCAAATCTAAGTTTATTCTCAAATACATTTGTTCCTGCAACTTTTTAATTATAATGTCGTATAACTTTTATGCCAGCTAACTCTGCGTAAAAAACTTTTCACTAATAATGATAAAATATTGAAGATGACAGTGCACCATCTATGTCAACTACCAGAAATGTACAGGTTAAAGATGTGTACATGATCCTTCATAATGAAATCCTGATGTACATCGGTACATATATATGCCAATTGTTTCTGGAATCTTAACAAATTGGTCTACAAGAATATATACTTAAAAAAACCTTTTTTTATTATTATCAATTACGCTCATTCAGGATTGTAGATAAATGTATATGATATAGTACTACATGGCAGATGTGATTTTTTTCCCAAGATATATACTTCAAAATATAAAAAGTTAGTTGGAGAGTTCAAGTTTTGATGTTCTTTGCTTAGTTGTCCTTTTCCTGTAAATGTTAATGAGTGCGAAGTAATGTCAGTATTCCTTCATTGTACAATACTGGTAATAATATTTTGTGGGCATGTCAATGAGTTTTCTTGCTGCCACCTTTCTATGCTTCTGTTTTTAGGTATGAATGTTTTCTTATTGTCTTCTTTTGATGATATATGTGGTCTTCATATTTCTTATCAGATAATTTAGGTTTAGTTCCACGATAGCATATCATGTTTATGCTATCGGAAGGTTTTGCCTCAATTTCCTTCCTCTCCAACAAATCATATTTTATTTGTTAATTCGTCGTGCGCTAATTCAGTACACATAATGGTAACATACGCATTTGCATTGATGGTATTCTTTGTCGACAAACTTATATTGGCTATTGTGATGCATACATCATCAGAAATTCACTGTAAGCCTGACAATCTTGGCATATTACCCTTATATTTGGATCATGCAGTTAATTTTCTATGAGACAAACCTCAGGGTCTTTAGGGCTCAGTATAGACAGATAATTGTGCCGATATTAAGGTAATGATATGATTTCATGGTGCGGGTCTTTTAGCCTCCTATCTGGAGGAAGCTCCATTATTCTACGAATCATATTGTAACCAATACATTGGGTCAATATTGGGTCTATAAGTCAAGGCATTAATCACAGGTTATGTTGTACATCTAGCGAACAAATATTTATTTGGTTCGATTGAAGATTTCAGTATTTGTGAACTTTACTAGACCGCAATTACTACATTTTTAAAATCAGTGCAGGCCCTATGTATATTAGCTAACATTTTTCTTGTGCTAGAGTCATTTCTATATCTGCTACTATTGTTTAATATTTAATGGAACATTGATTTCATAGGTTAGCGTTGTTTGCAGGGTGTTTCAGTGACACTGAAACCATGGTTGCCTGAGGGAATTAAAGCCACAGGTACTTCTGAGTTGTAACCTGCATAGTTCCATTATCGGTTGATCTGTGTAGTCCATACCGATTAACAATACATATGTGCTATTCCAAAGAATCCAACCCTTAGTATCTCTAGCTTTACGTACTGTGTTATTCTCTTTTCTGCTTTGATCATAAAGTATTATTTCAATTTATTTGTGTGTGACGAAGTGACATGCACTTCAAACAATTTTACATGAGACATGTCATATGTTCCAATAGGGCACACTGGGGTGTAATTTTTTCTTGACAAGCATTATTCCTACTTTCATTTTTTTTCAGCGCTGCATTGTTTTGGAATTTTCTAATAACCCATCCTTCCAATTGAATTTTTTCTTTGCAAATATACTTATAGAGTTTTCATTATAAGCTGACTTCAAAATATGATTTTATAACTTTTTTTAATTCATGAAATGTTATGTTTGCCCCTTCTCCAAAGCTACAGAGATATTTCAACACGGTTTCTTATATGAGTATTTGTACTACCTACTATATACTCATTGTGTAGCAATATATGGATGACATCCAAAGATGCCCTGTATTCTGTAGGGGATACCTCAAAATTCTGTGCCATTATGCAAAGGAGGTACCAATCGTCTACTAATCTGTTGTAAGTGATGTACTGTTGTTTTTATTGAGCTAAAGCACTAAATTTTTCTTTGTGCTGCAGTGCTATAGATGAGAAAAGATTCAATTAGTTCATGACGAAGGTATCTATGAGAAAATGCTGCAATTCTCATATCACCTAATGATTGTTGTTTTTTCTAACCTATACTCCACATTATGTAAGATCCATTGTCCTCTGTCATTGCTACTTTTTTGTAAGTGTACATGATTGTACAAACAATTATGTGAGCAAACAGATTGTATTCACATTTAAATCTTGGTGATAGTCACAATGTGTACATGCATATGTGGG]

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[+] EMBL CF323934             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCCTCCCCAGGTCAACTTTACACTCCCTTTGCCTAATCCTCTTAATCAATATATATGATCGATCCAGCCTGCTTGCTTGCGCTGATTCCATATTTGTTGTTCTACTCCTCTGCTGAAGCCATCAGCAGACACAATTTGGTACACTACTACTTAAATCCCTATTATATGCATATATACATATCTGTTCTAGCCCCTGATCTCTATTCTTGACTTGCTGCTCATTATGAGTTTCACATGATTGGTAGGAAGGAAAGAAAAAAGGGAGTGCAGGCTAGAATGCTAGATTATTCAGTACTAAAGTTTAAACATCACCGTCCAGGTACAGATCAAATCCTCTCCTTCTGTCCTGTATATATTGTATTGGAATTTAATATATGTTTTCAGGTTGCTGACATCATTCTGTTGATTGCTATTATGTCTACAAAAGTTTGAGGATTACTGCAGCTGCCTATATGATATGATTAAGATCTTTTGCACTGTAATAGTTGACAGATTTTCTTGGTCATCTGTATATGTTTTTTTTACACTATATGAATGTCGTGCTAAATCAAAATAGCTNTATATAGGAGCAGCAAAATTTTACTATGAAAATATTATTATAGAAAATGGATTTGAAATGTATATTATTATGGATTCTCAACCATCTTCTCCT ACAGCATTTGTGCCCCTCACCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CF306960             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGAGTGCAGGCTAGAATGCTAGATTATTCAGTACTAAAGTTTAAACATCACCGTCCAGGTACAGATCAAATCCTCTCCTTCTGTCCTGTATATATTGTATTGGAATTTAATATATGTTTTCAGGTTGCTGACATCATTCTGTTGATTGCTATTATGTCTACAAAAGTTTGAGGATTACTGCAGCTGCCTATATGATATGATTAAGATCTTTTGCACTGTAATAGTTGACAGATTTTCTTGGTCATCTGTATATGTTTTTTTTACACTATATGAATGTCGTGCTAAATCAAAATAGCTTTATATAGGAGCAGCAAAATTTTACTATGAAAATATTATTATAGAAAATGGATTTGAAATGTATATTATTATGGATTCTCAACCATCTTCTCCTAACAGCATTTGTGCCCCTCACCAATAGCCTGCTACGATGGCCCACTAGATGCCATGGCCGCATGTGTTGTTCATGCTGGTGGCAGCGATGGCGGCATCCAAGCCCACATCAAGGCCTGCGCCGCGCTGGGAGCAATCTGCTCCTCCGTTGTCACCGCACATAACACCATAGTCGTTCAGGTATGCTGCTGAATTTCTTTCTTTTCAGTTTGCTCTCTTCGGCTGATTGGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CF306938             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGGTCTTTAGGGCT AGT TAGACAGATAATTG GCCGATATTAA GTAATGATATGATTT ATGGTGCGGGTCTTTTAGCCTCCTATCTGGAGGAAGCTCCATTATTCTACGAATCATATTGTAACCAATACATTGGGTCAATATTGGGTCTATAAGTCAAGGCATTAATCACAGGTTATGTTGTACATCTAGCGAACAAATATTTATTTGGTTCGATTGAAGATTTCAGTATTTGTGAACTTTACTAGACCGCAATTACTACATTTTTAAAATCAGTGCAGGCCCTATGTATATTAGCTAACATTTTTCTTGTGCTAGAGTCATTTCTATATCTGCTACTATTGTTTAATATTTAATGGAACATTGATTTCATAGGTTAGCGTTGTTTGCAGGGTGTTTCAGTGACACTGAAACCATGGTTGCCTGAGAGAATTAAAGCCACAGGTACTTCTGAGTTGTAACCTGCATAGTTCCATTATCGGTTGATCTGTGTAGTCCATACCGATTAACAATACATATGTGCTATTCCAAAGAATCCAACCCTTAGTATCTCTAGCTTTACGTACTGTGTTATTCTCTTTTCTGCTTTGATCATAAAGTATTATTTCAATTTATTTGTGTGTGACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]




>consensus_7806#0
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TTTATATAGGAGCAGCAAAATTTTACTATGAAAATATTATTATAGAAAATGGATTTGAAA
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AGATGTGTACATGATCCTTCATAATGAAATCCTGATGTACATCGGTACATATATATGCCA
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TTATTATTATCAATTACGCTCATTCAGGATTGTAGATAAATGTATATGATATAGTACTAC
ATGGCAGATGTGATTTTTTTCCCAAGATATATACTTCAAAATATAAAAAGTTAGTTGGAG
AGTTCAAGTTTTGATGTTCTTTGCTTAGTTGTCCTTTTCCTGTAAATGTTAATGAGTGCG
AAGTAATGTCAGTATTCCTTCATTGTACAATACTGGTAATAATATTTTGTGGGCATGTCA
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ATCATGCAGTTAATTTTCTATGAGACAAACCTCAGGGTCTTTAGGGCTCAGTATAGACAG
ATAATTGTGCCGATATTAAGGTAATGATATGATTTCATGGTGCGGGTCTTTTAGCCTCCT
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TATTTGGTTCGATTGAAGATTTCAGTATTTGTGAACTTTACTAGACCGCAATTACTACAT
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GTTTGCAGGGTGTTTCAGTGACACTGAAACCATGGTTGCCTGAGGGAATTAAAGCCACAG
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GGTGATAGTCACAATGTGTACATGCATATGTGGG

consensusID : consensus_7806#1
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Sequences nbr = 1
consensus length = 2516
fasta sequence 
                              [CCACGCCCGATGGATGGTGCCGCCAACTCGCCCTCTCGCTGCAAGACGATGGTGGCGCCGTCTCCATTCCCTCGCCCTCTCTCTGAAGGATGGTGGAGGCGCCATCTCATTCCCCGGCCGTGCCCTCTCGCCGCAGGCACCATCTCCGTTCCCTTCCCCTCACAGTTTGGGTGTCGCCGAATCTCACTGGAATTGGTTCGCCACCTTAGGGAGTTGCCGGGACTGGTTCGTCACCTCTGTGGCCTGACGATCTGCTACCCACGCACTCTACTCCTCCCCAGGTCAACTTTACACTCCATTTGCCTAATCCTCTTAATCGCTATGATCAATCCAGCCTGCTTGCTTGTGCTGATTCCATATTCGCTGTTCAACTCCTCTGGTGAAGGCATCAGCAGACACAATTTGGAAGCAAAGAAAAAAGGGAGTGCAGGCTAGAATGCTAGATTATTCAGTACTAATGTTTAAACATCACCGCCCAGGTACAGATCAAATCCTCTCCTTCTGTCCTGCATATATTGTATATGAATTGAATATATTGATATTGTTGGAGAGACGAGGGATTGCAGTTTTCAGGTTGCTCACATCATTCTGTTGATTGCTTTTATGTCTACAAAAGTTTAAGGATTACTGCACCAGCTGTCTATGCGATACGACTAATATCTTTTGCACTGTAATAGTTAACTGATTTTCTTGGTCATCTGTATATGTTTATGTACACTATATGAATGTCGTGCTAAATAAAAATAGCTTTATATAGGAGCAACAAAATTTTTCTATGAAAATATTATAGAAAATGGATTTGAAATGTATATTGTTATGGATTGTGTTTCTCAACCATCTTCTCCTAACAGTATCTGTGCCCCTCACCAATAGCCTGCCTATACAGGCTCACTACAATGGCCCACGAGATGCCATGGCCACATGTGTGGCGGCGATGGCAGCATCCAGGCCCACATCAAGGCCTGCGCCGCGCTGAGAGCCATCTCCGTTGTCACCGCACATAACACCATTAGTTCAGGTATGCTGCCGAATTTCCTCCTTTTCAGTTTGCTCTCTTCGGCTGATTGGCTCAATGATTAGGCTGCCAGTAAATTTCTCTTTAACAAAGGCCTTCTATATGCTTGGTCAAATTCTTAGCGGCAAATCTAAGTTTATTCTCCAAATACATTTGTTCCTGCAACTTTTTTAATTATAATGTCCTATATTTTTTATGTCAGCTAACTTCTGCGTAAAAAACATTTGTTCCTGCAACTTTTTTAATTATAATGTCCTATATTTTTTATGTCAGCTAACTTCTGCGTAAAAAACTTTTCACTAATAATGATAGAATATTGAAGATGACAGTGCACCGTCTATGTCAATTACCAAAAATGTACAGGTTAAATATGTGTACATGGTCCTTCATAATTGCATCCTGATGTACATCGGTACACGTAAATGCCAATTGTTTCTGGAATCTTAACAAATTTGGTCTACAAGAACATATGCTTTAAAAAACTGTTCTTTATTATTATCAATTACGCTCATTTGGGATTGTACATAAATGTATATCATATAGTACTACATGGTAGATGTGATTTTCTTTCTCAAGATATATACTTCAAAATATAAAAAGTTAGTTGGAGACTACAAGTTTTGATGTTCTTTGCTTAGTTGTCCTTTTCTGCAAAATGTTATTGTGTGAATTGTGAAGTAATGTCAGTGTTCCTTCATTGTACAATACTGGTAATAATATGTTGTGAGCATGTCAGTGAGTTTTCTTGCTGTCACCTTTCTATGCTTCTGTTTTTAGGTATGGATGTTTTCTTATTGTCTTTTTTGGATGATATATGTGGTCTTCATATTTCTTATCAGATTATTTAGGTTTAGTTCCATGATAGCATATCATGTTTATGCTATCAGAAGGTTTTACCTCAAGTTCTTTCCTCTCCAACAAATCATATTTTATTTGTTAATTCGTCGTGTGCTAATTCTGTACACAGAATGGCAATATACACATTTGCATTGATGATATTCTTTGTCGATCGACAATCTTATATTGGCTATTGTGATGCATACATCATCAGAAATTCTCTGTAAGCCTGACAATCTTGGCATATTACACATATATTTGGATCATGCAATTAATTTTCTATGAGACAAACCTCAGGATCTTTAGGGCTCAGAATAGATAGATGATTGTGCCGATATTAAGGTAATGATATGATTTGATGGTGCAGGTCTTTTAGCTTCGTATCTGGAGGAAGCTCAATTATTCTATGAATCATATTGTCACCAGTACATTGGGTCAATATTGGGTCTATAAGTCAAGTCAAGGCAGTGATCACAAATTATGTTGTACATCTAGCAACCAAATATTTATTTGGCTCAATTGAAGATTTCAGTATTTGTAAGAACTTTACTAGACCGCGATTACTACATTTTTAAATTCAGTGCAGGCCCTATGTATAACAAGCTAACATTTTTCTTATGCTATAGCCATTTCTATATCTGCTACTATTATTTAATATTGAATT]

[+] EMBL AK073212             [CCACGCCCGATGGATGGTGCCGCCAACTCGCCCTCTCGCTGCAAGACGATGGTGGCGCCGTCTCCATTCCCTCGCCCTCTCTCTGAAGGATGGTGGAGGCGCCATCTCATTCCCCGGCCGTGCCCTCTCGCCGCAGGCACCATCTCCGTTCCCTTCCCCTCACAGTTTGGGTGTCGCCGAATCTCACTGGAATTGGTTCGCCACCTTAGGGAGTTGCCGGGACTGGTTCGTCACCTCTGTGGCCTGACGATCTGCTACCCACGCACTCTACTCCTCCCCAGGTCAACTTTACACTCCATTTGCCTAATCCTCTTAATCGCTATGATCAATCCAGCCTGCTTGCTTGTGCTGATTCCATATTCGCTGTTCAACTCCTCTGGTGAAGGCATCAGCAGACACAATTTGGAAGCAAAGAAAAAAGGGAGTGCAGGCTAGAATGCTAGATTATTCAGTACTAATGTTTAAACATCACCGCCCAGGTACAGATCAAATCCTCTCCTTCTGTCCTGCATATATTGTATATGAATTGAATATATTGATATTGTTGGAGAGACGAGGGATTGCAGTTTTCAGGTTGCTCACATCATTCTGTTGATTGCTTTTATGTCTACAAAAGTTTAAGGATTACTGCACCAGCTGTCTATGCGATACGACTAATATCTTTTGCACTGTAATAGTTAACTGATTTTCTTGGTCATCTGTATATGTTTATGTACACTATATGAATGTCGTGCTAAATAAAAATAGCTTTATATAGGAGCAACAAAATTTTTCTATGAAAATATTATAGAAAATGGATTTGAAATGTATATTGTTATGGATTGTGTTTCTCAACCATCTTCTCCTAACAGTATCTGTGCCCCTCACCAATAGCCTGCCTATACAGGCTCACTACAATGGCCCACGAGATGCCATGGCCACATGTGTGGCGGCGATGGCAGCATCCAGGCCCACATCAAGGCCTGCGCCGCGCTGAGAGCCATCTCCGTTGTCACCGCACATAACACCATTAGTTCAGGTATGCTGCCGAATTTCCTCCTTTTCAGTTTGCTCTCTTCGGCTGATTGGCTCAATGATTAGGCTGCCAGTAAATTTCTCTTTAACAAAGGCCTTCTATATGCTTGGTCAAATTCTTAGCGGCAAATCTAAGTTTATTCTCCAAATACATTTGTTCCTGCAACTTTTTTAATTATAATGTCCTATATTTTTTATGTCAGCTAACTTCTGCGTAAAAAACATTTGTTCCTGCAACTTTTTTAATTATAATGTCCTATATTTTTTATGTCAGCTAACTTCTGCGTAAAAAACTTTTCACTAATAATGATAGAATATTGAAGATGACAGTGCACCGTCTATGTCAATTACCAAAAATGTACAGGTTAAATATGTGTACATGGTCCTTCATAATTGCATCCTGATGTACATCGGTACACGTAAATGCCAATTGTTTCTGGAATCTTAACAAATTTGGTCTACAAGAACATATGCTTTAAAAAACTGTTCTTTATTATTATCAATTACGCTCATTTGGGATTGTACATAAATGTATATCATATAGTACTACATGGTAGATGTGATTTTCTTTCTCAAGATATATACTTCAAAATATAAAAAGTTAGTTGGAGACTACAAGTTTTGATGTTCTTTGCTTAGTTGTCCTTTTCTGCAAAATGTTATTGTGTGAATTGTGAAGTAATGTCAGTGTTCCTTCATTGTACAATACTGGTAATAATATGTTGTGAGCATGTCAGTGAGTTTTCTTGCTGTCACCTTTCTATGCTTCTGTTTTTAGGTATGGATGTTTTCTTATTGTCTTTTTTGGATGATATATGTGGTCTTCATATTTCTTATCAGATTATTTAGGTTTAGTTCCATGATAGCATATCATGTTTATGCTATCAGAAGGTTTTACCTCAAGTTCTTTCCTCTCCAACAAATCATATTTTATTTGTTAATTCGTCGTGTGCTAATTCTGTACACAGAATGGCAATATACACATTTGCATTGATGATATTCTTTGTCGATCGACAATCTTATATTGGCTATTGTGATGCATACATCATCAGAAATTCTCTGTAAGCCTGACAATCTTGGCATATTACACATATATTTGGATCATGCAATTAATTTTCTATGAGACAAACCTCAGGATCTTTAGGGCTCAGAATAGATAGATGATTGTGCCGATATTAAGGTAATGATATGATTTGATGGTGCAGGTCTTTTAGCTTCGTATCTGGAGGAAGCTCAATTATTCTATGAATCATATTGTCACCAGTACATTGGGTCAATATTGGGTCTATAAGTCAAGTCAAGGCAGTGATCACAAATTATGTTGTACATCTAGCAACCAAATATTTATTTGGCTCAATTGAAGATTTCAGTATTTGTAAGAACTTTACTAGACCGCGATTACTACATTTTTAAATTCAGTGCAGGCCCTATGTATAACAAGCTAACATTTTTCTTATGCTATAGCCATTTCTATATCTGCTACTATTATTTAATATTGAATT]




>consensus_7806#1
CCACGCCCGATGGATGGTGCCGCCAACTCGCCCTCTCGCTGCAAGACGATGGTGGCGCCG
TCTCCATTCCCTCGCCCTCTCTCTGAAGGATGGTGGAGGCGCCATCTCATTCCCCGGCCG
TGCCCTCTCGCCGCAGGCACCATCTCCGTTCCCTTCCCCTCACAGTTTGGGTGTCGCCGA
ATCTCACTGGAATTGGTTCGCCACCTTAGGGAGTTGCCGGGACTGGTTCGTCACCTCTGT
GGCCTGACGATCTGCTACCCACGCACTCTACTCCTCCCCAGGTCAACTTTACACTCCATT
TGCCTAATCCTCTTAATCGCTATGATCAATCCAGCCTGCTTGCTTGTGCTGATTCCATAT
TCGCTGTTCAACTCCTCTGGTGAAGGCATCAGCAGACACAATTTGGAAGCAAAGAAAAAA
GGGAGTGCAGGCTAGAATGCTAGATTATTCAGTACTAATGTTTAAACATCACCGCCCAGG
TACAGATCAAATCCTCTCCTTCTGTCCTGCATATATTGTATATGAATTGAATATATTGAT
ATTGTTGGAGAGACGAGGGATTGCAGTTTTCAGGTTGCTCACATCATTCTGTTGATTGCT
TTTATGTCTACAAAAGTTTAAGGATTACTGCACCAGCTGTCTATGCGATACGACTAATAT
CTTTTGCACTGTAATAGTTAACTGATTTTCTTGGTCATCTGTATATGTTTATGTACACTA
TATGAATGTCGTGCTAAATAAAAATAGCTTTATATAGGAGCAACAAAATTTTTCTATGAA
AATATTATAGAAAATGGATTTGAAATGTATATTGTTATGGATTGTGTTTCTCAACCATCT
TCTCCTAACAGTATCTGTGCCCCTCACCAATAGCCTGCCTATACAGGCTCACTACAATGG
CCCACGAGATGCCATGGCCACATGTGTGGCGGCGATGGCAGCATCCAGGCCCACATCAAG
GCCTGCGCCGCGCTGAGAGCCATCTCCGTTGTCACCGCACATAACACCATTAGTTCAGGT
ATGCTGCCGAATTTCCTCCTTTTCAGTTTGCTCTCTTCGGCTGATTGGCTCAATGATTAG
GCTGCCAGTAAATTTCTCTTTAACAAAGGCCTTCTATATGCTTGGTCAAATTCTTAGCGG
CAAATCTAAGTTTATTCTCCAAATACATTTGTTCCTGCAACTTTTTTAATTATAATGTCC
TATATTTTTTATGTCAGCTAACTTCTGCGTAAAAAACATTTGTTCCTGCAACTTTTTTAA
TTATAATGTCCTATATTTTTTATGTCAGCTAACTTCTGCGTAAAAAACTTTTCACTAATA
ATGATAGAATATTGAAGATGACAGTGCACCGTCTATGTCAATTACCAAAAATGTACAGGT
TAAATATGTGTACATGGTCCTTCATAATTGCATCCTGATGTACATCGGTACACGTAAATG
CCAATTGTTTCTGGAATCTTAACAAATTTGGTCTACAAGAACATATGCTTTAAAAAACTG
TTCTTTATTATTATCAATTACGCTCATTTGGGATTGTACATAAATGTATATCATATAGTA
CTACATGGTAGATGTGATTTTCTTTCTCAAGATATATACTTCAAAATATAAAAAGTTAGT
TGGAGACTACAAGTTTTGATGTTCTTTGCTTAGTTGTCCTTTTCTGCAAAATGTTATTGT
GTGAATTGTGAAGTAATGTCAGTGTTCCTTCATTGTACAATACTGGTAATAATATGTTGT
GAGCATGTCAGTGAGTTTTCTTGCTGTCACCTTTCTATGCTTCTGTTTTTAGGTATGGAT
GTTTTCTTATTGTCTTTTTTGGATGATATATGTGGTCTTCATATTTCTTATCAGATTATT
TAGGTTTAGTTCCATGATAGCATATCATGTTTATGCTATCAGAAGGTTTTACCTCAAGTT
CTTTCCTCTCCAACAAATCATATTTTATTTGTTAATTCGTCGTGTGCTAATTCTGTACAC
AGAATGGCAATATACACATTTGCATTGATGATATTCTTTGTCGATCGACAATCTTATATT
GGCTATTGTGATGCATACATCATCAGAAATTCTCTGTAAGCCTGACAATCTTGGCATATT
ACACATATATTTGGATCATGCAATTAATTTTCTATGAGACAAACCTCAGGATCTTTAGGG
CTCAGAATAGATAGATGATTGTGCCGATATTAAGGTAATGATATGATTTGATGGTGCAGG
TCTTTTAGCTTCGTATCTGGAGGAAGCTCAATTATTCTATGAATCATATTGTCACCAGTA
CATTGGGTCAATATTGGGTCTATAAGTCAAGTCAAGGCAGTGATCACAAATTATGTTGTA
CATCTAGCAACCAAATATTTATTTGGCTCAATTGAAGATTTCAGTATTTGTAAGAACTTT
ACTAGACCGCGATTACTACATTTTTAAATTCAGTGCAGGCCCTATGTATAACAAGCTAAC
ATTTTTCTTATGCTATAGCCATTTCTATATCTGCTACTATTATTTAATATTGAATT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7806#0      CACTCCCACGCCTGATGGCTGGTGCCGCCGCCTCGCCCTCTCGCTGCAAGACGATGGTGG 60
consensus_7806#1      -----CCACGCCCGATGGATGGTGCCGCCAACTCGCCCTCTCGCTGCAAGACGATGGTGG 55
                           ******* ***** **********  *****************************

consensus_7806#0      CGCCGTCTCCTTTCACTCGCCCTCTCTCCGCGGGATGGCGGAAGCGCCATCTCATTCCCC 120
consensus_7806#1      CGCCGTCTCCATTCCCTCGCCCTCTCTCTGAAGGATGGTGGAGGCGCCATCTCATTCCCC 115
                      ********** *** ************* *  ****** *** *****************

consensus_7806#0      GGCCGCGCCCTCTCGCCGCAGGCACTGTCTCCGTTCCCTTCCCCTGACAGTTTGGGTGTC 180
consensus_7806#1      GGCCGTGCCCTCTCGCCGCAGGCACCATCTCCGTTCCCTTCCCCTCACAGTTTGGGTGTC 175
                      ***** *******************  ****************** **************

consensus_7806#0      GCCGAATCTCACTGGGATTAGTTCGCCACCGTAGGGAGTTGCCGGGACTGGTTCGTCACC 240
consensus_7806#1      GCCGAATCTCACTGGAATTGGTTCGCCACCTTAGGGAGTTGCCGGGACTGGTTCGTCACC 235
                      *************** *** ********** *****************************

consensus_7806#0      TCTGCGACCTGGCGACCTGACGATCTGCTACCACGCATTCTACTCCTCCCCAGGTCAACT 300
consensus_7806#1      TCTGTGGCCTGACGATCTG-----CTAC--CCACGCACTCTACTCCTCCCCAGGTCAACT 288
                      **** * **** *** ***     ** *  ******* **********************

consensus_7806#0      TTACACTCCCTTTGCCTAATCCTCTTAATCAATATATATGATCGATCCAGCCTGCTTGCT 360
consensus_7806#1      TTACACTCCATTTGCCTAATCCTCTTAATCGCTAT----GATCAATCCAGCCTGCTTGCT 344
                      ********* ********************  ***    **** ****************

consensus_7806#0      TGCGCTGATTCCATATTTGTTGTTCTACTCCTCTGCTGAAGCCATCAGCAGACACAATTT 420
consensus_7806#1      TGTGCTGATTCCATATTCGCTGTTCAACTCCTCTGGTGAAGGCATCAGCAGACACAATTT 404
                      ** ************** * ***** ********* ***** ******************

consensus_7806#0      GGTACACTACTACTTAAATCCCTATTATATGCATATATACATATCTGTTCTAGCCCCTGA 480
consensus_7806#1      GG---------------------------------------------------------- 406
                      **                                                          

consensus_7806#0      TCTCTATTCTTGACTTGCTGCTCATTATGAGTTTCACATGATTGGTAGGAAGGAAAGAAA 540
consensus_7806#1      -------------------------------------------------AAGCAAAGAAA 417
                                                                       *** *******

consensus_7806#0      AAAGGGAGTGCAGGCTAGAATGCTAGATTATTCAGTACTAAAGTTTAAACATCACCGTCC 600
consensus_7806#1      AAAGGGAGTGCAGGCTAGAATGCTAGATTATTCAGTACTAATGTTTAAACATCACCGCCC 477
                      ***************************************** *************** **

consensus_7806#0      AGGTACAGATCAAATCCTCTCCTTCTGTCCTGTATATATTGTATTGGAATTTAATATAT- 659
consensus_7806#1      AGGTACAGATCAAATCCTCTCCTTCTGTCCTGCATATATTGTATATGAATTGAATATATT 537
                      ******************************** ***********  ***** ******* 

consensus_7806#0      ----------------------------GTTTTCAGGTTGCTGACATCATTCTGTTGATT 691
consensus_7806#1      GATATTGTTGGAGAGACGAGGGATTGCAGTTTTCAGGTTGCTCACATCATTCTGTTGATT 597
                                                  ************** *****************

consensus_7806#0      GCTATTATGTCTACAAAAGTTTGAGGATTACTGCA---GCTGCCTATATGATATGATTAA 748
consensus_7806#1      GCTTTTATGTCTACAAAAGTTTAAGGATTACTGCACCAGCTGTCTATGCGATACGACTAA 657
                      *** ****************** ************   **** ****  **** ** ***

consensus_7806#0      GATCTTTTGCACTGTAATAGTTGACAGATTTTCTTGGTCATCTGTATATGTTTTTTTTAC 808
consensus_7806#1      TATCTTTTGCACTGTAATAGTTAACTGATTTTCTTGGTCATCTGTATATGTTTATGT-AC 716
                       ********************* ** *************************** * * **

consensus_7806#0      ACTATATGAATGTCGTGCTAAATCAAAATAGCTTTATATAGGAGCAGCAAAATTTTACTA 868
consensus_7806#1      ACTATATGAATGTCGTGCTAAATAAAAATAGCTTTATATAGGAGCAACAAAATTTTTCTA 776
                      *********************** ********************** ********* ***

consensus_7806#0      TGAAAATATTATTATAGAAAATGGATTTGAAATGTATATTATTATGGATT------CTCA 922
consensus_7806#1      TGAAAATATTA---TAGAAAATGGATTTGAAATGTATATTGTTATGGATTGTGTTTCTCA 833
                      ***********   ************************** *********      ****

consensus_7806#0      ACCATCTTCTCCTAACAGCATTTGTGCCCCTCACCAATGTCCTGC-TACGATGGCCCACT 981
consensus_7806#1      ACCATCTTCTCCTAACAGTATCTGTGCCCCTCACCAATAGCCTGCCTATACAGGCTCACT 893
                      ****************** ** ****************  ***** **    *** ****

consensus_7806#0      AGATGCCATGGCCGCATGTGTTGTTCATGCTGGTGGCAGCGATGGCGGCATCCGAGCCCA 1041
consensus_7806#1      ACAATGGCCCACGAGATGCCATGGCCACATGTGTGGCGGCGATGGCAGCATCCAGGCCCA 953
                      * *        *   ***   **  **     ***** ******** ******  *****

consensus_7806#0      CATCAAGGCCTGCGCCGCGCTGGGAGCAATCTGCTCCTCCGTTGTCACCGCACATAACAC 1101
consensus_7806#1      CATCAAGGCCTGCGCCGCGCTGAGAGCCATCT------CCGTTGTCACCGCACATAACAC 1007
                      ********************** **** ****      **********************

consensus_7806#0      CATAGTCGTTCAGGTATGCTGCTGAATTTCTTTCTTTTCAGTTTGCTCTCTTCGGCTGAT 1161
consensus_7806#1      CAT--TAGTTCAGGTATGCTGCCGAATTTCCTCCTTTTCAGTTTGCTCTCTTCGGCTGAT 1065
                      ***  * *************** ******* * ***************************

consensus_7806#0      TGGCTCC-TATGCGGGCTTCTGAGATA---------AGGAGAAG------AAATGATTAG 1205
consensus_7806#1      TGGCTCAATGATTAGGCTGCCAGTAAATTTCTCTTTAACAAAGGCCTTCTATATGCTTGG 1125
                      ******  *     **** *    * *         *  * * *      * *** ** *

consensus_7806#0      GCTGAC--------GCCAGTAAAATTTCTCTCTTTAACAAAAGCCTTCTATGTG-CTTGG 1256
consensus_7806#1      TCAAATTCTTAGCGGCAAATCTAAGTTTATTCTCCAAATACATTTGTTCCTGCAACTTTT 1185
                       *  *         ** * *  ** **   ***  **  * *    *   **   ***  

consensus_7806#0      TAAA--------------ATTTTTAGTGGCAAATCTAAGTTTATTCTCAAATACATTTGT 1302
consensus_7806#1      TTAATTATAATGTCCTATATTTTTTATGTCAG--CTAACTTCTGCGTAAAAAACATTTGT 1243
                      * **              ******  ** **   **** **     * *** ********

consensus_7806#0      TCCTGCAACTTTTT-AATTATAATGTCGTATAACTTTTATGCCAGCTAACT-CTGCGTAA 1360
consensus_7806#1      TCCTGCAACTTTTTTAATTATAATGTCCTATATTTTTTATGTCAGCTAACTTCTGCGTAA 1303
                      ************** ************ ****  ******* ********* ********

consensus_7806#0      AAAACTTTTCACTAATAATGATAAAATATTGAAGATGACAGTGCACCATCTATGTCAACT 1420
consensus_7806#1      AAAACTTTTCACTAATAATGATAGAATATTGAAGATGACAGTGCACCGTCTATGTCAATT 1363
                      *********************** *********************** ********** *

consensus_7806#0      ACCAGAAATGTACAGGTTAAAGATGTGTACATGATCCTTCATAATGAAATCCTGATGTAC 1480
consensus_7806#1      ACCAAAAATGTACAGGTTAAATATGTGTACATGGTCCTTCATAATTGCATCCTGATGTAC 1423
                      **** **************** *********** ***********   ************

consensus_7806#0      ATCGGTACATATATATGCCAATTGTTTCTGGAATCTTAACAAATT-GGTCTACAAGAATA 1539
consensus_7806#1      ATCGGTACACGTAAATGCCAATTGTTTCTGGAATCTTAACAAATTTGGTCTACAAGAACA 1483
                      *********  ** ******************************* ************ *

consensus_7806#0      TATACTTAAAAAAACCTTTTTTTATTATTATCAATTACGCTCATTCAGGATTGTAGATAA 1599
consensus_7806#1      TATGCTTTAAAAAACTGTTCTTTATTATTATCAATTACGCTCATTTGGGATTGTACATAA 1543
                      *** *** *******  ** *************************  ******** ****

consensus_7806#0      ATGTATATGATATAGTACTACATGGCAGATGTGATTTT-TTTCCCAAGATATATACTTCA 1658
consensus_7806#1      ATGTATATCATATAGTACTACATGGTAGATGTGATTTTCTTTCTCAAGATATATACTTCA 1603
                      ******** **************** ************ **** ****************

consensus_7806#0      AAATATAAAAAGTTAGTTGGAGAGTTCAAGTTTTGATGTTCTTTGCTTAGTTGTCCTTTT 1718
consensus_7806#1      AAATATAAAAAGTTAGTTGGAGACTACAAGTTTTGATGTTCTTTGCTTAGTTGTCCTTTT 1663
                      *********************** * **********************************

consensus_7806#0      CCTGTAAATGTTAATGAGTG-----CGAAGTAATGTCAGTATTCCTTCATTGTACAATAC 1773
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                      *    ******** ** ***      ************** *******************

consensus_7806#0      TGGTAATAATATTTTGTGGGCATGTCAATGAGTTTTCTTGCTGCCACCTTTCTATGCTTC 1833
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                      ************ ***** ******** *************** ****************

consensus_7806#0      TGTTTTTAGGTATGAATGTTTTCTTATTGTCTTCTTTTGATGATATATGTGGTCTTCATA 1893
consensus_7806#1      TGTTTTTAGGTATGGATGTTTTCTTATTGTCTTTTTTGGATGATATATGTGGTCTTCATA 1843
                      ************** ****************** *** **********************

consensus_7806#0      TTTCTTATCAGATAATTTAGGTTTAGTTCCACGATAGCATATCATGTTTATGCTATCGGA 1953
consensus_7806#1      TTTCTTATCAGATTATTTAGGTTTAGTTCCATGATAGCATATCATGTTTATGCTATCAGA 1903
                      ************* ***************** ************************* **

consensus_7806#0      AGGTTTTGCCTCAATTTCCTTCCTCTCCAACAAATCATATTTTATTTGTTAATTCGTCGT 2013
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                      ******* ****** *** *****************************************

consensus_7806#0      GCGCTAATTCAGTACACATAATGGTAACATACGCATTTGCATTGATGGTATTCTTTGTCG 2073
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                      * ******** ******* ***** ** **** ************** ************

consensus_7806#0      A----CAAACTTATATTGGCTATTGTGATGCATACATCATCAGAAATTCACTGTAAGCCT 2129
consensus_7806#1      ATCGACAATCTTATATTGGCTATTGTGATGCATACATCATCAGAAATTCTCTGTAAGCCT 2083
                      *    *** **************************************** **********

consensus_7806#0      GACAATCTTGGCATATTACCCTTATATTTGGATCATGCAGTTAATTTTCTATGAGACAAA 2189
consensus_7806#1      GACAATCTTGGCATATTACACATATATTTGGATCATGCAATTAATTTTCTATGAGACAAA 2143
                      ******************* * ***************** ********************

consensus_7806#0      CCTCAGGGTCTTTAGGGCTCAGTATAGACAGATAATTGTGCCGATATTAAGGTAATGATA 2249
consensus_7806#1      CCTCAGGATCTTTAGGGCTCAGAATAGATAGATGATTGTGCCGATATTAAGGTAATGATA 2203
                      ******* ************** ***** **** **************************

consensus_7806#0      TGATTTCATGGTGCGGGTCTTTTAGCCTCCTATCTGGAGGAAGCTCCATTATTCTACGAA 2309
consensus_7806#1      TGATTTGATGGTGCAGGTCTTTTAGCTTCGTATCTGGAGGAAGCTCAATTATTCTATGAA 2263
                      ****** ******* *********** ** **************** ********* ***

consensus_7806#0      TCATATTGTAACCAATACATTGGGTCAATATTGGGTCTATAAGTCAAG-----GCATTAA 2364
consensus_7806#1      TCATATTGTCACCAGTACATTGGGTCAATATTGGGTCTATAAGTCAAGTCAAGGCAGTGA 2323
                      ********* **** *********************************     *** * *

consensus_7806#0      TCACAGGTTATGTTGTACATCTAGCGAACAAATATTTATTTGGTTCGATTGAAGATTTCA 2424
consensus_7806#1      TCACAAATTATGTTGTACATCTAGCAACCAAATATTTATTTGGCTCAATTGAAGATTTCA 2383
                      *****  ****************** * *************** ** *************

consensus_7806#0      GTATTTGT--GAACTTTACTAGACCGCAATTACTACATTTTTAAAATCAGTGCAGGCCCT 2482
consensus_7806#1      GTATTTGTAAGAACTTTACTAGACCGCGATTACTACATTTTTAAATTCAGTGCAGGCCCT 2443
                      ********  ***************** ***************** **************

consensus_7806#0      ATGTATATTA-GCTAACATTTTTCTTGTGCTAGAGTCATTTCTATATCTGCTACTATTGT 2541
consensus_7806#1      ATGTATAACAAGCTAACATTTTTCTTATGCTATAGCCATTTCTATATCTGCTACTATTAT 2503
                      *******  * *************** ***** ** ********************** *

consensus_7806#0      TTAATATTTAATGGAACATTGATTTCATAGGTTAGCGTTGTTTGCAGGGTGTTTCAGTGA 2601
consensus_7806#1      TTAATATTGAATT----------------------------------------------- 2516
                      ******** ***                                                

consensus_7806#0      CACTGAAACCATGGTTGCCTGAGGGAATTAAAGCCACAGGTACTTCTGAGTTGTAACCTG 2661
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      CATAGTTCCATTATCGGTTGATCTGTGTAGTCCATACCGATTAACAATACATATGTGCTA 2721
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      TTCCAAAGAATCCAACCCTTAGTATCTCTAGCTTTACGTACTGTGTTATTCTCTTTTCTG 2781
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      CTTTGATCATAAAGTATTATTTCAATTTATTTGTGTGTGACGAAGTGACATGCACTTCAA 2841
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      ACAATTTTACATGAGACATGTCATATGTTCCAATAGGGCACACTGGGGTGTAATTTTTTC 2901
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      TTGACAAGCATTATTCCTACTTTCATTTTTTTTCAGCGCTGCATTGTTTTGGAATTTTCT 2961
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      AATAACCCATCCTTCCAATTGAATTTTTTCTTTGCAAATATACTTATAGAGTTTTCATTA 3021
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      TAAGCTGACTTCAAAATATGATTTTATAACTTTTTTTAATTCATGAAATGTTATGTTTGC 3081
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      CCCTTCTCCAAAGCTACAGAGATATTTCAACACGGTTTCTTATATGAGTATTTGTACTAC 3141
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      CTACTATATACTCATTGTGTAGCAATATATGGATGACATCCAAAGATGCCCTGTATTCTG 3201
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      TAGGGGATACCTCAAAATTCTGTGCCATTATGCAAAGGAGGTACCAATCGTCTACTAATC 3261
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      TGTTGTAAGTGATGTACTGTTGTTTTTATTGAGCTAAAGCACTAAATTTTTCTTTGTGCT 3321
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      GCAGTGCTATAGATGAGAAAAGATTCAATTAGTTCATGACGAAGGTATCTATGAGAAAAT 3381
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      GCTGCAATTCTCATATCACCTAATGATTGTTGTTTTTTCTAACCTATACTCCACATTATG 3441
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      TAAGATCCATTGTCCTCTGTCATTGCTACTTTTTTGTAAGTGTACATGATTGTACAAACA 3501
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      ATTATGTGAGCAAACAGATTGTATTCACATTTAAATCTTGGTGATAGTCACAATGTGTAC 3561
consensus_7806#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7806#0      ATGCATATGTGGG 3574
consensus_7806#1      -------------


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)