|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8822#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 2293 fasta sequence
[TTGAGTTTGGAGGGAGAGAGAGTAGAGGAAGGAAACCTCCCTCCGGATCCAGGAAATCCTCATCCATCCTCATGACTTCCGACGAGCTCGCCGGTGAGGGTGAGGTCGACGGCGCGGAGCTGATCCTGTCGCTGCCGGAGGACGTGCTCGGGCTCATCTCCGCCCACCTCCGCCCGCGCGACCTCCTCGCCCTCTCCGCCGCCTCCCGCAGCCTCCGCAACGCCGTCTCCACCGCCGACAAGGCGTGGCTCGCCCAGTGCCGCCGCCTCCTCCCCACCGCCTCCCACCTCCTCGCCTGGCGCACCGCCCTCGCCCACTCCTCCCTCGCCGTCTGCCGCTTCCTCCACTCCGCCGCCCCGCTCCTCGGCCTCTGGGCCCACCAGAACCCCGAGCTCGGCAACCTCGTCCTCGCCCTCCCTGGCTTCCTCTCCCTCGTCGCCGTCCGCTCCATCCCCCAGGAGCTCTCCCCGCGCCTCCTCTGGGCCCCCGTCTTCGAGCTCCTCGCCGACCACCGCGGCCACCCCGCCTTCCTCTTCCTCCACGGCGCCGCCCACGACTCCCTCTTCCCCGGCCTCCTCTCCTCCTCCCTCCACCCCCTCGCCAACACCCTCTTCCTCGAGGCCCACACCTCCACCTCCACCTCCCACTTCTCCCGCCTCGCCTTCGCCGACCGCCGCCGCCTCCTCAACGCCCTCGTCGCCGCCTCCCGCCTCACCCTCCCCCCCGATGTCGCCACTGCCCCGCTCTTCGCGCGCTCCGACGCCGACCTCCCGCTGCTCGCCGCGCGCCGGGAGGCCATGCTGCGCCTGCACAGCCAGTCTGGCGGGGGCATGGTGCGCAGGGCCGAGATCGAGGCGCTGCTGATCGGGGCCAGGAAGACGGCGGCGCTGCCGGCCGACACCGCCGGCGACAAGATGCGGCTGCGGAGGACCTTCTCGGTGGTCGCCGGTTTTGTCAGGAACAGCCTGCGGCAGATGGTGACACGGTCGGCGTCCGCCAATTCCAGGGCTGAGTACGCCCACCCCAAGCATCTGCCATTGGACGAGTTCCTGCG-AGCCGGAGAGAGCGTCGGCCTGAGCCTCCGTGGCGCGCGGATGAGGCTGTCTATCTACCGGAATTGGCCAAGCATGCATGACAACCGGTTTGTGCTCTACAAGCTGACGACGCAGGCGCCCATGCCTGGCCGGGAGTATGCCGGTTTGTGGGGAGGCACATTCGGGTGGCCGCCAGGGCGGCCGGAGGATGAGCGCAAACCTGGCAAGGCTCTCTTCTTCCTACTCCTCTCCTATGAGGAGGACAGCGAAGGGAAGCTTCAGCTGATTGCAACCAAGGTGTTGGAGGGTACACACTATGTCGTGCATCCGAATGGGTCCTCTATGTTTATCGTGCGGGTCGGTGAGCCATCCACTGAGACTTTTCCGTGGCAAACCGATGAGGAGTCGCGTGCTGTGGAGATCAATAGAAGCTTTGCTGGTGAGGGCATTGCCACCGGGTATGGGTTCAGGTATCCTGGCTCAAAGCCCGGATCGCTCTTTGTCCTCCTGGATGGCCGGCTTGCATTTGTTTGGAGAGAGAACAAAGCTGTTCTCACCTTGCAAAGGCTGGACCTGGAGGATATGATAAGGAGAGGGGAGCGTGTGCCTTCATTGCCGCCGATACCCAACTTCGCCTACCTCACAAAGTCTTACTCCAATGTCTTT-GCTGTGGCACCT-GGCAGCA-CGAGC-TTCCCAG-CTTCTCCAAGG--TAAAAGATGGCTT--GGGAACCGTTATGATGGTATCACCTGATACAGAGGCAACAGCGACAGATCTTTGCGGGATCATGTTCTACTGTGCTTCCTTGCCATACGTCTTGTACTGAAGATCTGAATCCCACATTTTTCACCCTGAACCTGAAGGTTGGCCATCACCGTACGTTGATCTGAGTTGATGTACCGCTGCTGCTGCTGTTAATGGAAGCAGCATGGCAGCAGTGTTAATATGGTATATATTGGTACCCTGAAGGAAATGCAGCCAACTCCATCTGTATTTCCCTTGTTACTGAACTGGCATCTTCATGCCTGCAGTAAACTAAAATGTCAAAATTTAGCAAATGAGCTACAGTCGCAGATCCAGCCTCCTGATGATAACATCATGAGGTGTTAAACTGACATGAGTTGAAAGTTACATTAATGTCAAATTGTAAAATTTTGGAGGCATACNGATACAGCTAGGTGACCAGCGCAAATTGTAAGCTGGCACAGTAATTATTTTGGCATGATGTCGCTGGGTGAATCGTTGCAGTATTGAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AK069415 [TTGAGTTTGGAGGGAGAGAGAGTAGAGGAAGGAAACCTCCCTCCGGATCCAGGAAATCCTCATCCATCCTCATGACTTCCGACGAGCTCGCCGGTGAGGGTGAGGTCGACGGCGCGGAGCTGATCCTGTCGCTGCCGGAGGACGTGCTCGGGCTCATCTCCGCCCACCTCCGCCCGCGCGACCTCCTCGCCCTCTCCGCCGCCTCCCGCAGCCTCCGCAACGCCGTCTCCACCGCCGACAAGGCGTGGCTCGCCCAGTGCCGCCGCCTCCTCCCCACCGCCTCCCACCTCCTCGCCTGGCGCACCGCCCTCGCCCACTCCTCCCTCGCCGTCTGCCGCTTCCTCCACTCCGCCGCCCCGCTCCTCGGCCTCTGGGCCCACCAGAACCCCGAGCTCGGCAACCTCGTCCTCGCCCTCCCTGGCTTCCTCTCCCTCGTCGCCGTCCGCTCCATCCCCCAGGAGCTCTCCCCGCGCCTCCTCTGGGCCCCCGTCTTCGAGCTCCTCGCCGACCACCGCGGCCACCCCGCCTTCCTCTTCCTCCACGGCGCCGCCCACGACTCCCTCTTCCCCGGCCTCCTCTCCTCCTCCCTCCACCCCCTCGCCAACACCCTCTTCCTCGAGGCCCACACCTCCACCTCCACCTCCCACTTCTCCCGCCTCGCCTTCGCCGACCGCCGCCGCCTCCTCAACGCCCTCGTCGCCGCCTCCCGCCTCACCCTCCCCCCCGATGTCGCCACTGCCCCGCTCTTCGCGCGCTCCGACGCCGACCTCCCGCTGCTCGCCGCGCGCCGGGAGGCCATGCTGCGCCTGCACAGCCAGTCTGGCGGGGGCATGGTGCGCAGGGCCGAGATCGAGGCGCTGCTGATCGGGGCCAGGAAGACGGCGGCGCTGCCGGCCGACACCGCCGGCGACAAGATGCGGCTGCGGAGGACCTTCTCGGTGGTCGCCGGTTTTGTCAGGAACAGCCTGCGGCAGATGGTGACACGGTCGGCGTCCGCCAATTCCAGGGCTGAGTACGCCCACCCCAAGCATCTGCCATTGGACGAGTTCCTGCG AGCCGGAGAGAGCGTCGGCCTGAGCCTCCGTGGCGCGCGGATGAGGCTGTCTATCTACCGGAATTGGCCAAGCATGCATGACAACCGGTTTGTGCTCTACAAGCTGACGACGCAGGCGCCCATGCCTGGCCGGGAGTATGCCGGTTTGTGGGGAGGCACATTCGGGTGGCCGCCAGGGCGGCCGGAGGATGAGCGCAAACCTGGCAAGGCTCTCTTCTTCCTACTCCTCTCCTATGAGGAGGACAGCGAAGGGAAGCTTCAGCTGATTGCAACCAAGGTGTTGGAGGGTACACACTATGTCGTGCATCCGAATGGGTCCTCTATGTTTATCGTGCGGGTCGGTGAGCCATCCACTGAGACTTTTCCGTGGCAAACCGATGAGGAGTCGCGTGCTGTGGAGATCAATAGAAGCTTTGCTGGTGAGGGCATTGCCACCGGGTATGGGTTCAGGTATCCTGGCTCAAAGCCCGGATCGCTCTTTGTCCTCCTGGATGGCCGGCTTGCATTTGTTTGGAGAGAGAACAAAGCTGTTCTCACCTTGCAAAGGCTGGACCTGGAGGATATGATAAGGAGAGGGGAGCGTGTGCCTTCATTGCCGCCGATACCCAACTTCGCCTACCTCACAAAGTCTTACTCCAATGTCTTT GCTGTGGCACCT GGCAGCA CGAGC TTCCCAG CTTCTCCAAGG TAAAAGATGGCTT GGGAACCGTTATGATGGTATCACCTGATACAGAGGCAACAGCGACAGATCTTTGCGGGATCATGTTCTACTGTGCTTCCTTGCCATACGTCTTGTACTGAAGATCTGAATCCCACATTTTTCACCCTGAACCTGAAGGTTGGCCATCACCGTACGTTGATCTGAGTTGATGTACCGCTGCTGCTGCTGTTAATGGAAGCAGCATGGCAGCAGTGTTAATATGGTATATATTGGTACCCTGAAGGAAATGCAGCCAACTCCATCTGTATTTCCCTTGTTACTGAACTGGCATCTTCATGCCTGCAGTAAACTAAAATGTCAAAATTTAGCAAATGAGCTACAGTCGCAGATCCAGCCTCCTGATGATAACATCATGAGG ]
[+] EMBL AK099227 [ GAGAGTAGAGGAAGGAAACCTCCCTCCGGATCCAGGAAATCCTCATCCATCCTCATGACTTCCGACGAGCTCGCCGGTGAGGGTGAGGTCGACGGCGCGGAGCTGATCCTGTCGCTGCCGGAGGACGTGCTCGGGCTCATCTCCGCCCACCTCCGCCCGCGCGACCTCCTCGCCCTCTCCGCCGCCTCCCGCAGCCTCCGCAACGCCGTCTCCACCGCCGACAAGGCGTGGCTCGCCCAGTGCCGCCGCCTCCTCCCCACCGCCTCCCACCTCCTCGCCTGGCGCACCGCCCTCGCCCACTCCTCCCTCGCCGTCTGCCGCTTCCTCCACTCCGCCGCCCCGCTCCTCGGCCTCTGGGCCCACCAGAACCCCGAGCTCGGCAACCTCGTCCTCGCCCTCCCTGGCTTCCTCTCCCTCGTCGCCGTCCGCTCCATCCCCCAGGAGCTCTCCCCGCGCCTCCTCTGGGCCCCCGTCTTCGAGCTCCTCGCCGACCACCGCGGCCACCCCGCCTTCCTCTTCCTCCACGGCGCCGCCCACGACTCCCTCTTCCCCGGCCTCCTCTCCTCCTCCCTCCACCCCCTCGCCAACACCCTCTTCCTCGAGGCCCACACCTCCACCTCCACCTCCCACTTCTCCCGCCTCGCCTTCGCCGACCGCCGCCGCCTCCTCAACGCCCTCGTCGCCGCCTCCCGCCTCACCCTCCCCCCCGATGTCGCCACTGCCCCGCTCTTCGCGCGCTCCGACGCCGACCTCCCGCTGCTCGCCGCGCGCCGGGAGGCCATGCTGCGCCTGCACAGCCAGTCTGGCGGGGGCATGGTGCGCAGGGCCGAGATCGAGGCGCTGCTGATCGGGGCCAGGAAGACGGCGGCGCTGCCGGCCGACACCGCCGGCGACAAGATGCGGCTGCGGAGGACCTTCTCGGTGGTCGCCGGTTTTGTCAGGAACAGCCTGCGGCAGATGGTGACACGGTCGGCGTCCGCCAATTCCAGGGCTGAGTACGCCCACCCCAAGCATCTGCCATTGGACGAGTTCCTGCG AGCCGGAGAGAGCGTCGGCCTGAGCCTCCGTGGCGCGCGGATGAGGCTGTCTATCTACCGGAATTGGCCAAGCATGCATGACAACCGGTTTGTGCTCTACAAGCTGACGACGCAGGCGCCCATGCCTGGCCGGGAGTATGCCGGTTTGTGGGGAGGCTCATTCGGGTGGCCGCCAGGGCGGCCGGAGGATGAGCGCAAACCTGGCAAGGCTCTCTTCTTCCTACTCCTCTCCTATGAGGAGGACAGCGAAGGGAAGCTTCAGCTGATTGCAACCAAGGTGTTGGAGGGTACACACTATGTCGTGCATCCGAATGGGTCATCTATGTTTATCGTGCGGGTCGGTGAGCCATCCACTGAGACTTTTCCGTGGCAAACCGATGAGGAGCCGCGTGCTGTGGAGATCAATAGAAGCTTTGCTGGTGAGGGCATTGCCACCGGGTATGGGTTCAGGTATCCTGGCTCAAAGCCCGGATCGCTCTTTGTCCTCCTGGATGGCCGGCTTGCATTTGTTTGGAGAGAGAACAAAGCTGTTCTCACCTTGCAAAGGCTGGACCTGGAGGATATGATAAGGAGAGGGGAGCGTGTGCCTTCATTGCCGCCGATACCCAACTTCGCCTACCTCACAAAGTCTTACTCCAATGTCTTT GCTGTGGCACCT GGCAGCA CGAGC TTCCCAG CTTCTCCAAGG TAAAAGATGGCTT GGGAACCGTTATGATGGTATCACCTGATACAGAGGCAACAGCGACAGATCTTTGCGGGATCATGTTCTACTGTGCTTCCTTGCCATACGTCTTGTACTGAAGATCTGAATCCCACATTTTTCACCCTGAACCTGAAGGTTGGCCATCACCGTACGTTGATCTGAGTTGATGTACCGCTGCTGCTGCTGTTAATGGAAGCAGCATGGCAGCAGTGTTAATATGGTATATATTGGTACCCTGAAGGAAATGCAGCCAACTCCATCTGTATTTCCCTTGTTACTGAACTGGCATCTTCATGCCTGCAGTAAACTAAAATGTC ]
[+] EMBL C97048 [ CGCCGCG GCCGGGA GNCATGCTGCGNCTGCACAGCCAGTCTGGCGGGGGCATGGTGCGCAGGGCCGAGATCGAGGCGCTGCTGATCGGGGCCAGGAAGACGGCGGCGCTGCCGGCCGACACCGCCGGCNACAAGATGCGGCTGCGGAGGACCTTCTCGGTGGTCGCCGGTTTTNTCAGGAACAGCCTGCGGCAGATGGTGACACGGTCGGCGTCCGCCAATTCCAGGGCTGAGTACGCCCACCCCAAGCATCTTCCATTGGACGAGTTNCTGCGAAGCCGGAGAGAGCGTCGGCCTTAGCCTCCGTGGCGCGCGGATTAAGNTGTCTATCTACCGGAATTTGNCAAGAATGAATNACAACCG ]
[+] EMBL CB654394 [ GATCGGGGCCAGGAAGACGGCGGCGCTGCCGGCCGACACCGCCGGCGACAAGATGCGGCTGCGGAGGACCTTCTCGGTGGTCGCCGGTTTTGTCAGGAACAGCCTGCGGCAGATGGTGACACGGTCGGCGTCCGCCAATTCCAGGGCTGAGTACGCCCACCCCAAGCATCTGCCATTGGACGAGTTCCTGCG AGCCGGAGAGAGCGTCGGCCTGAGCCTCCGTGGCGCGCGGATGAGGCTGTCTATCTACCGGAATTGGCCAAGCATGCATGACAACCGGTTTGTGCTCTACAAGCTGACGACGCAGGCGCCCATGCCTGGCCGGGAGTATGCCGGTTTGTGGGGAGGCACATTCGGGTGGCCGCCAGGGCGGCCGGAGGATGAGCGCAAACCTGGCAAGGCTCTCTTCTTCCTACTCCTCTCCTATGAGGAGGACAGCGAAGGGAAGCTTCAGCTGATTGCAACCAAGGTGTTGGAGGGTACACACTATGTCGTGCATCCGAATGGGTCCTCTATGTTTATCGTGCGGGTCGGTGAGCCATCCACTGAGACTTTTCCGTGGCAAACCGATGAGGAGTCGCGTGCTGTGGAGATCAATAGAAGCTTTGCTGGTGAGGGCATTGCCACCGGGTATGGGTTCAGGTATCCTGGCTCAAAGCCCGGATCGCTCTTTGTCCTCCTGGATGGCCGGCTTGCATTTGTTTGGAGAGAGAACAAAGCTGTTCTCACCTTGCAAAGGCTGGACCTGGAGGATATGATAACGAGAGGGGAGCGTGTGCCTTCATTGCCG ]
[+] EMBL CA753721 [ GCNCNCTNCTTCCTACTCCTCTCCTATGAGGAGGACAGCGAAGGGAAGCTTCAGCTGATTGCAACCAAGGTGTTGGAGGGTACACACTATGTCGTGCATCCGAATGGGTCCTCTATGTTTATCGTGCGGGTCGGTGAGCCATCCACTGAGACTTTTCCGTGGCAAACCGATGAGGAGTCGCGTGCTGTGGAGATCAAGAGAAGCTTTGCTGGTGAGGGCATTGCCACCGGGTATGGGTTCAGGTATCCTGGCTCAAAGCCCGGATCGCTCTTTGTCCTCCTGGATGGCCGGCTTGCATGTGTTTGGAGAGAGAACAAAGCTGTTCTCACCTTGCAAAGGCTGGACCTGGAGGATATGATAAGGAGAAGGGAGCGTGTGCCTTCATTGCCCCCGATACCCCACTTCGCCTACCTCCCAAAGTCTTACTCCAATGTCTTTGGCTGTTGGACCTGGGCAGCACCGAGCTTTCCCAGCCTTCTCCCAGGGTTAAAAGATGGCTTGGGGGAACCc ]
[+] EMBL C97049 [ GTTGATCTGAGTTGATGTACCGCTGCTGCTGCTGTTAATGGAAGCAGCATGGCAGCAGTGTTAATATGGTATATATTGGTACCCTGAAGGAAATGCAGCCAACTCCATCTGTATTTCCCTTGTTACTGAACTGGCATCTTCATGCCTGCAGTAAACTAAAATGTCAAAATTTAGCAAATGAGCTACAGTCGCAGATCCAGCCTCCTGATGATAACATCATGAGGTGTTAAACTGACATGAGTTGAAAGTTACATTAATGTCAAATTGTAAAATTTTGGAGGCATACNGATACAGCTAGGTGACCAGCGCAAATTGTAAGCTGGCACAGTAATTATTTTGGCATGATGTCGCTGGGTGAATCGTTGCAGTATTGAAAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||