Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 2578 cluster # 2578       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2578#0 length = 949 sequences # 2  
consensusID : consensus_2578#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 949
fasta sequence 
                              [GATGCCCTGCCACTCGACACCGTTCTACAGCCACGTGCATCAGAATGTGACGATGCGTTTCCTGCACTGCGAGCCGAACCTGACCGACCAGCCGAACTATCTGGACGAGGCAGACCAGTTCTACGCTAATCCGATGGGCTGGGTGCGCAAGAACCTGCCCGTCCATCCGCTCAGCGCTCTTCCCACGCACGTGGTCACGTTCGATGTGCTCGAGCCACAGCTGAAGGATTTCCTCTCGATTTACCAGGAAAAGGTGTCCTTCTTTCACACCGACTATCCGACGGAGCGCGTTGGCGGGTTTGTAAAGGTTTACGAGCGTTACGATCGTAATGCAGCATCGGGTGCCAGTAGTACCACGTCGACGACCGCAGTTCCTGCGATGGAGGACGAATCGGATCCTTTGTACAACCCGTAAAGGTACGAGGTAGACGATCAAAACGACCACAATCAAAAGTTGAACAAAAAAGCAAACAAAATTATTTTTCATCCATTTTTTCCTTAATTGAATTTTTTTGAACAATCTTTGTTTTACTAGCCTGCTACAGGATAGAAACATAAACAAAAAAAACATACCAATTTAATATTTGGAATAGCTATTTAAAAGCGGTTAGATTAATAACAGTTCTCGTAGGGTGTATGGAGGCAAAGTAC-AAATGTACTTTAATTTAACGATTTCTTATGCAATGATTACGAATTCGTGTAACATCTAGATGTGTAAGTGGTTTGTTTTTTCCCTCTCCAGACTAGGTTCAATTTTGGTTAGAGTTTTTTTTTTTCATTTATTTGCTGAAACATGTCACTAGCAGTGATTTTATCTACCACACTGCCAGGTTTTACGAGTGAAGAATAGTTTTATCCACGATCGATTGTAAGTAAGCTGATTTGATGCTTCCCACTGATGACAATATAGTTTGTAGGAAATTTTGTGCAAATTTAATAAAAGNGAATT]

[+] EMBL BX620512             [GATGCCCTGCCACTCGACACCGTTCTACAGCCACGTGCATCAGAATGTGACGATGCGTTTCCTGCACTGCGAGCCGAACCTGACCGACCAGCCGAACTATCTGGACGAGGCAGACCAGTTCTACGCTAATCCGATGGGCTGGGTGCGCAAGAACCTGCCCGTCCATCCGCTCAGCGCTCTTCCCACGCACGTGGTCACGTTCGATGTGCTCGAGCCACAGCTGAAGGATTTCCTCTCGATTTACCAGGAAAAGGTGTCCTTCTTTCACACCGACTATCCGACGGAGCGCGTTGGCGGGTTTGTAAAGGTTTACGAGCGTTACGATCGTAATGCAGCATCGGGTGCCAGTAGTACCACGTCGACGACCGCAGTTCCTGCGATGGAGGACGAATCGGATCCTTTGTACAACCCGTAAAGGTACGAGGTAGACGATCAAAACGACCACAATCAAAAGTTGAACAAAAAAGCAAACAAAATTATTTTTCATCCATTTTTTCCTTAATTGAATTTTTTTGAACAATCTTTGTTTTACTAGCCTGCTACAGGATAGAAACATAAACAAAAAAAACATACCAATTTAATATTTGGAATAGCTATTTAAAAGCGGTTAGATTAATAACAGTTCTCGTAGGGTGTATGGAGGCAAAGTAC AAATGTACTTTAATTTAACGATTTCTTATGCAATGATTACGAATTCGTGT                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BX627493             [                                                                                                                                                                                               TGGTCACGTTCGATGTGCTCGAGCCACAGCTGAAGGATTTCCTCTCGATTTACCAGGAAAAGGTGTCCTTCTTTCACACCGACTATCCGACGGAGCGCGTTGGCGGGTTTGTAAAGGTTTACGAGCGTTACGATCGTAATGCAGCATCGGGTGCCAGTAGTACCACGTCGACGACCGCAGTTCCTGCGATGGAGGACGAATCGGATCCTTTGTACAACCCGTAAAGGTACGAGGTAGACGATCAAAACGACCACAATCAAAAGTTGAACAAAAAAGCAAACAAAATTATTTTTCATCCATTTTTTCCTTAATTGAATTTTTTTGAACAATCTTTGTTTTACTAGCCTGCTACAGGATAGAAACATAAACAAAAAAAACATACAAATTTAATATTTGGAATAGCTATTTAAAAGCGGTTAGATTAATAACAGTTCTCGTAGGGTGTATGGAGGCAAAGTACAAAATGTACTTTAATTTAACGATTTCTTATGCAATGATTACGAATTCGTGTAACATCTAGATGTGTAAGTGGTTTGTTTTTTCCCTCTCCAGACTAGGTTCAATTTTGGTTAGAGTTTTTTTTTTTCATTTATTTGCTGAAACATGTCACTAGCAGTGATTTTATCTACCACACTGCCAGGTTTTACGAGTGAAGAATAGTTTTATCCACGATCGATTGTAAGTAAGCTGATTTGATGCTTCCCACTGATGACAATATAGTTTGTAGGAAATTTTGTGCAAATTTAATAAAAGNGAATT]




>consensus_2578#0
GATGCCCTGCCACTCGACACCGTTCTACAGCCACGTGCATCAGAATGTGACGATGCGTTT
CCTGCACTGCGAGCCGAACCTGACCGACCAGCCGAACTATCTGGACGAGGCAGACCAGTT
CTACGCTAATCCGATGGGCTGGGTGCGCAAGAACCTGCCCGTCCATCCGCTCAGCGCTCT
TCCCACGCACGTGGTCACGTTCGATGTGCTCGAGCCACAGCTGAAGGATTTCCTCTCGAT
TTACCAGGAAAAGGTGTCCTTCTTTCACACCGACTATCCGACGGAGCGCGTTGGCGGGTT
TGTAAAGGTTTACGAGCGTTACGATCGTAATGCAGCATCGGGTGCCAGTAGTACCACGTC
GACGACCGCAGTTCCTGCGATGGAGGACGAATCGGATCCTTTGTACAACCCGTAAAGGTA
CGAGGTAGACGATCAAAACGACCACAATCAAAAGTTGAACAAAAAAGCAAACAAAATTAT
TTTTCATCCATTTTTTCCTTAATTGAATTTTTTTGAACAATCTTTGTTTTACTAGCCTGC
TACAGGATAGAAACATAAACAAAAAAAACATACCAATTTAATATTTGGAATAGCTATTTA
AAAGCGGTTAGATTAATAACAGTTCTCGTAGGGTGTATGGAGGCAAAGTACAAATGTACT
TTAATTTAACGATTTCTTATGCAATGATTACGAATTCGTGTAACATCTAGATGTGTAAGT
GGTTTGTTTTTTCCCTCTCCAGACTAGGTTCAATTTTGGTTAGAGTTTTTTTTTTTCATT
TATTTGCTGAAACATGTCACTAGCAGTGATTTTATCTACCACACTGCCAGGTTTTACGAG
TGAAGAATAGTTTTATCCACGATCGATTGTAAGTAAGCTGATTTGATGCTTCCCACTGAT
GACAATATAGTTTGTAGGAAATTTTGTGCAAATTTAATAAAAGNGAATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)