cluster # 4432

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Anopheles gambiae
cluster # 4432 cluster # 4432 Sequences # 3 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_4432#0 length = 1215 sequences # 2

consensus_4432#1 length = 1106 sequences # 1

consensusID : consensus_4432#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1215
fasta sequence

                              [TATAAAGTAAATAGCATAACCGCCTCCTCCACTTCCATTTTTATTCGTCTTCTCGTTATTAATGGATGGAATAAAATAGGACCAAAGTTTGATTTTTTGTTTGTTTCGCGTATGAGTGTGCAACCGTTTTGCATCTTCCGCTCGGTTCGCTGTTAGCTCTAGTCATAGCTGCCCCGGCGAGTCTGTTTGTCTGTGTGGACAATTTGCGTGCATGCGAGCGGTATTAAGCCGTCCGCCCGCGTGTTTGTTTCACGGAGGCTACAGTGGCTCCACACAAAAAAGGAAATTAAATTAATTTAAGAAAAAAAACCCCTACCCACTCGAAAGGACACTTGAAGGTGGAGTGAAGGCACATGCACCACGAACCACGTACACGTATAATATACTCTATATCGTGTCACCTCTTATTAATACTGGCACCCTGCCTGTCTGCTCCCACCGGCAGTCTCCTCAGTGTATTGTGCGGGCCAAAATAAAATAATAATTAAAAACAAAAACAAACAAACAATTGGACGAACTGTCTGTCAAAAAGACGCCGTTTCTACGCCCTCGCCCTCATATATCGCCGTATACACTGGGTGGATGGATGGGGATTTGTATAACTACGCTTGCCTGCAGTGGTTTGCAAAACAGTTTTAAGTCTCTAGTAACCTCGGCCCGTGGAGGGAACGAATTTAAACAAAAAATAAAATAAAAAAATAGCTAAAAAGTATCGGCTAAGACGCACAGGCACATCCCGTGTACGTGTGTACAGGCTTGTTGGGTGGTGAGGCGTATATCCGCGCACACGACCCCTCTACGCTAAGCTAAGGCCTACCTATATTCGAAATGTTTGGCAAGGTACTAACACGGCGCCATAAAACTTTACTAATGTGCGTATGTATATATATAAATGTATATAAAAAATGGCCCACTCCTTCTATCCTCTGTTTTTTAGTTGTTTTGTTGCTGCGCATCCTTCACTGCGCGGGGCAGTATCGAACGATTGCTTATTAACTGTCTATCGTAATCATAAATTGGTAAGTCCTCGCGAACAAATTAACCTACTCGCTTAAGTTAGCTACTACAGTCCACGGAGGGAGGGGGAGGTGGTGAGTGACCCCCTTCCCCATTTCAGCCACCTACTCCCCCACTCCTTTTGGATAAGGCAATTCGAACGGGTCGAAAATAGAAAAAAAAATCGGAACCCTCGGAACATGTCCCGTTCCCGGCCGG]

[+] EMBL BX623309             [TATAAAGTAAATAGCATAACCGCCTCCTCCACTTCCATTTTTATTCGTCTTCTCGTTATTAATGGATGGAATAAAATAGGACCAAAGTTTGATTTTTTGTTTGTTTCGCGTATGAGTGTGCAACCGTTTTGCATCTTCCGCTCGGTTCGCTGTTAGCTCTAGTCATAGCTGCCCCGGCGAGTCTGTTTGTCTGTGTGGACAATTTGCGTGCATGCGAGCGGTATTAAGCCGTCCGCCCGCGTGTTTGTTTCACGGAGGCTACAGTGGCTCCACACAAAAAAGGAAATTAAATTAATTTAAGAAAAAAAACCCCTACCCACTCGAAAGGACACTTGAAGGTGGAGTGAAGGCACATGCACCACGAACCACGTACACGTATAATATACTCTATATCGTGTCACCTCTTATTAATACTGGCACCCTGCCTGTCTGCTCCCACCGGCAGTCTCCTCAGTGTATTGTGCGGGCCAAAATAAAATAATAATTAAAAACAAAAACAAACAAACAATTGGACGAACTGTCTGTCAAAAAGACGCCGTTTCTACGCCCTCGCCCTCATATATCGCCGTATACACTGGGTGGATGGATGGGGATTTGTATAACTACGCTTGCCTGCAGTGGTTTGCAAAACAGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BM613730             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATCGCCGTATACACTGGGTGGATGGATGGGGATTTGTGTAACTACGCTTGCCTGCAGTGGTTTGCAAAACAGTTTTAAGTCTCTAGTAACCTCGGCCCGTGGAGGGAACGAATTTAAACAAAAAATAAAATAAAAAAATAGCTAAAAAGTATCGGCTAAGACGCACAGGCACATCCCGTGTACGTGTGTACAGGCTTGTTGGGTGGTGAGGCGTATATCCGCGCACACGACCCCTCTACGCTAAGCTAAGGCCTACCTATATTCGAAATGTTTGGCAAGGTACTAACACGGCGCCATAAAACTTTACTAATGTGCGTATGTATATATATAAATGTATATAAAAAATGGCCCACTCCTTCTATCCTCTGTTTTTTAGTTGTTTTGTTGCTGCGCATCCTTCACTGCGCGGGGCAGTATCGAACGATTGCTTATTAACTGTCTATCGTAATCATAAATTGGTAAGTCCTCGCGAACAAATTAACCTACTCGCTTAAGTTAGCTACTACAGTCCACGGAGGGAGGGGGAGGTGGTGAGTGACCCCCTTCCCCATTTCAGCCACCTACTCCCCCACTCCTTTTGGATAAGGCAATTCGAACGGGTCGAAAATAGAAAAAAAAATCGGAACCCTCGGAACATGTCCCGTTCCCGGCCGG]




>consensus_4432#0
TATAAAGTAAATAGCATAACCGCCTCCTCCACTTCCATTTTTATTCGTCTTCTCGTTATT
AATGGATGGAATAAAATAGGACCAAAGTTTGATTTTTTGTTTGTTTCGCGTATGAGTGTG
CAACCGTTTTGCATCTTCCGCTCGGTTCGCTGTTAGCTCTAGTCATAGCTGCCCCGGCGA
GTCTGTTTGTCTGTGTGGACAATTTGCGTGCATGCGAGCGGTATTAAGCCGTCCGCCCGC
GTGTTTGTTTCACGGAGGCTACAGTGGCTCCACACAAAAAAGGAAATTAAATTAATTTAA
GAAAAAAAACCCCTACCCACTCGAAAGGACACTTGAAGGTGGAGTGAAGGCACATGCACC
ACGAACCACGTACACGTATAATATACTCTATATCGTGTCACCTCTTATTAATACTGGCAC
CCTGCCTGTCTGCTCCCACCGGCAGTCTCCTCAGTGTATTGTGCGGGCCAAAATAAAATA
ATAATTAAAAACAAAAACAAACAAACAATTGGACGAACTGTCTGTCAAAAAGACGCCGTT
TCTACGCCCTCGCCCTCATATATCGCCGTATACACTGGGTGGATGGATGGGGATTTGTAT
AACTACGCTTGCCTGCAGTGGTTTGCAAAACAGTTTTAAGTCTCTAGTAACCTCGGCCCG
TGGAGGGAACGAATTTAAACAAAAAATAAAATAAAAAAATAGCTAAAAAGTATCGGCTAA
GACGCACAGGCACATCCCGTGTACGTGTGTACAGGCTTGTTGGGTGGTGAGGCGTATATC
CGCGCACACGACCCCTCTACGCTAAGCTAAGGCCTACCTATATTCGAAATGTTTGGCAAG
GTACTAACACGGCGCCATAAAACTTTACTAATGTGCGTATGTATATATATAAATGTATAT
AAAAAATGGCCCACTCCTTCTATCCTCTGTTTTTTAGTTGTTTTGTTGCTGCGCATCCTT
CACTGCGCGGGGCAGTATCGAACGATTGCTTATTAACTGTCTATCGTAATCATAAATTGG
TAAGTCCTCGCGAACAAATTAACCTACTCGCTTAAGTTAGCTACTACAGTCCACGGAGGG
AGGGGGAGGTGGTGAGTGACCCCCTTCCCCATTTCAGCCACCTACTCCCCCACTCCTTTT
GGATAAGGCAATTCGAACGGGTCGAAAATAGAAAAAAAAATCGGAACCCTCGGAACATGT
CCCGTTCCCGGCCGG

consensusID : consensus_4432#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 1106
fasta sequence

                              [GTGCATGTGTTGGGTGAGAGNGGGCGCGCTGATGATCCCATGAAGTNGGCCCGAGGATCCCCGTGTCCNGGGTTAACCCTGCTCCTTATNCGCGGTTTGTAAGCCCTAAACGCNGGGTGTTGGANGTTGGAGNGAAGTGTGAAGTTGACGCGCTGTTGCAGTTGTAATTTGCAGCGTTCCGTGGGTGTNGGTTTTCACCATAACCGTCGGTGTGCTATTGTGTGTAATTGTGTCTANTANTTGCATATCTCNTTTGGNTGGTCCCTAAGGCCACCGGCTTTCGGCCCGAGTGTGTGTNTNTGCATGTTGGGCCGATGACNGATCAACTAAGATNNGCCAGAGGGCAAAAGGGTTNTCCTTGCCCATCCTNTGGACCCATAGGGTTGNGGTTTTNTAGATTTTTAGGGTNTAGCGGNCCATAGGGGGTGCNTCCTCCCATAGTATATTANTTTAATTNGTATAAATGNGTAAAGTTGCTNCTTTAATTTTNNGTAGTNTNTTTAATGCTAGCAGNAGTCAACCAGTATGNTGANTGCGTTAGGGNTGAATCCATTCTCGTTTAACCCNAGTTGAACTTGTTCTGGTGGTTAACCTGTATCTATCTGTGGTNTCCCATAGGCTCCAATNGTATATGATGTATCTGTCACAGTGTTGTTCNTCTTTACCGTCACNCATTCAGTCACACCATTTCTATTTATTGTACTCCAGGCCNCAGATAATGGCCACGCCTGGATGTGTTTGGGTATTCGTGTAATTTGCTGTGTGNAATTTTTTNGATATAGTATGACTTTAGCAGATTGGCACTGCCAAGGTGGTTTCGCCAATAATACCAAGGTTTTTAGAGGTGCATCCTGAGGTAGACCACTTCAGGGCACCAGTAGGTAGGGGTATACAGTATATCTTNANTACAAAGANTATATATATAGANAGTATAGAAAGATAATAGCTATATGATAATATCAGGCTATAGTACGCACAGGCTACATCCCGTACGTGTGTACAGGCTTGTTGGGTGTGTAGGCAGTATATCCGCGCACACGACCCCTCTACGCTAAGCTAAGGCCTACCTATATTCGAAATGTTGGCAAGTACTAACACTAACCTCG]

[-] EMBL AL930082             [GTGCATGTGTTGGGTGAGAGNGGGCGCGCTGATGATCCCATGAAGTNGGCCCGAGGATCCCCGTGTCCNGGGTTAACCCTGCTCCTTATNCGCGGTTTGTAAGCCCTAAACGCNGGGTGTTGGANGTTGGAGNGAAGTGTGAAGTTGACGCGCTGTTGCAGTTGTAATTTGCAGCGTTCCGTGGGTGTNGGTTTTCACCATAACCGTCGGTGTGCTATTGTGTGTAATTGTGTCTANTANTTGCATATCTCNTTTGGNTGGTCCCTAAGGCCACCGGCTTTCGGCCCGAGTGTGTGTNTNTGCATGTTGGGCCGATGACNGATCAACTAAGATNNGCCAGAGGGCAAAAGGGTTNTCCTTGCCCATCCTNTGGACCCATAGGGTTGNGGTTTTNTAGATTTTTAGGGTNTAGCGGNCCATAGGGGGTGCNTCCTCCCATAGTATATTANTTTAATTNGTATAAATGNGTAAAGTTGCTNCTTTAATTTTNNGTAGTNTNTTTAATGCTAGCAGNAGTCAACCAGTATGNTGANTGCGTTAGGGNTGAATCCATTCTCGTTTAACCCNAGTTGAACTTGTTCTGGTGGTTAACCTGTATCTATCTGTGGTNTCCCATAGGCTCCAATNGTATATGATGTATCTGTCACAGTGTTGTTCNTCTTTACCGTCACNCATTCAGTCACACCATTTCTATTTATTGTACTCCAGGCCNCAGATAATGGCCACGCCTGGATGTGTTTGGGTATTCGTGTAATTTGCTGTGTGNAATTTTTTNGATATAGTATGACTTTAGCAGATTGGCACTGCCAAGGTGGTTTCGCCAATAATACCAAGGTTTTTAGAGGTGCATCCTGAGGTAGACCACTTCAGGGCACCAGTAGGTAGGGGTATACAGTATATCTTNANTACAAAGANTATATATATAGANAGTATAGAAAGATAATAGCTATATGATAATATCAGGCTATAGTACGCACAGGCTACATCCCGTACGTGTGTACAGGCTTGTTGGGTGTGTAGGCAGTATATCCGCGCACACGACCCCTCTACGCTAAGCTAAGGCCTACCTATATTCGAAATGTTGGCAAGTACTAACACTAACCTCG]




>consensus_4432#1
GTGCATGTGTTGGGTGAGAGNGGGCGCGCTGATGATCCCATGAAGTNGGCCCGAGGATCC
CCGTGTCCNGGGTTAACCCTGCTCCTTATNCGCGGTTTGTAAGCCCTAAACGCNGGGTGT
TGGANGTTGGAGNGAAGTGTGAAGTTGACGCGCTGTTGCAGTTGTAATTTGCAGCGTTCC
GTGGGTGTNGGTTTTCACCATAACCGTCGGTGTGCTATTGTGTGTAATTGTGTCTANTAN
TTGCATATCTCNTTTGGNTGGTCCCTAAGGCCACCGGCTTTCGGCCCGAGTGTGTGTNTN
TGCATGTTGGGCCGATGACNGATCAACTAAGATNNGCCAGAGGGCAAAAGGGTTNTCCTT
GCCCATCCTNTGGACCCATAGGGTTGNGGTTTTNTAGATTTTTAGGGTNTAGCGGNCCAT
AGGGGGTGCNTCCTCCCATAGTATATTANTTTAATTNGTATAAATGNGTAAAGTTGCTNC
TTTAATTTTNNGTAGTNTNTTTAATGCTAGCAGNAGTCAACCAGTATGNTGANTGCGTTA
GGGNTGAATCCATTCTCGTTTAACCCNAGTTGAACTTGTTCTGGTGGTTAACCTGTATCT
ATCTGTGGTNTCCCATAGGCTCCAATNGTATATGATGTATCTGTCACAGTGTTGTTCNTC
TTTACCGTCACNCATTCAGTCACACCATTTCTATTTATTGTACTCCAGGCCNCAGATAAT
GGCCACGCCTGGATGTGTTTGGGTATTCGTGTAATTTGCTGTGTGNAATTTTTTNGATAT
AGTATGACTTTAGCAGATTGGCACTGCCAAGGTGGTTTCGCCAATAATACCAAGGTTTTT
AGAGGTGCATCCTGAGGTAGACCACTTCAGGGCACCAGTAGGTAGGGGTATACAGTATAT
CTTNANTACAAAGANTATATATATAGANAGTATAGAAAGATAATAGCTATATGATAATAT
CAGGCTATAGTACGCACAGGCTACATCCCGTACGTGTGTACAGGCTTGTTGGGTGTGTAG
GCAGTATATCCGCGCACACGACCCCTCTACGCTAAGCTAAGGCCTACCTATATTCGAAAT
GTTGGCAAGTACTAACACTAACCTCG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_4432#0      TATAAAGTAAATAGCATAACCGCCTCCTCCACTTCCATTTTTATTCGTCTTCTCGTTATT 60
consensus_4432#1      ---------------------------------------------------------GTG 3
                                                                                * 

consensus_4432#0      AATGGATGGAATAAAATAGGACCAAAGTTTGATTTTTTGT--TTGTTTCGCGTATGAGTG 118
consensus_4432#1      CATGTGTTGGGTGAGAGNGGGCGCGCTGATGATCCCATGAAGTNGGCCCGAGGATCCCCG 63
                       ***  * *  * * *  ** *       ****    **   * *   ** * **    *

consensus_4432#0      TGCAACCGTTTTGCATCTTCCGCTCGGTTCGCTGTTAGCTCTAGTCATAGCTGCCCCGGC 178
consensus_4432#1      TGTCCNGGGTTAAC--CCTGCTCCTTATNCGCGGTTTGTA--AGCCCTAAACGC------ 113
                      **     * **  *  * * * *    * *** *** *    ** * **   **      

consensus_4432#0      GAGTCTGTTTGTCTGTGTGGACAATTTGCGTGCATGCGA-GCGGTATTAAGCCGTCCGCC 237
consensus_4432#1      -NGGGTGTTGGANGTTGGAGNGAA---GTGTGAAGTTGACGCGCTGTTGCAGTTGTAATT 169
                        *  **** *    **  *  **   * *** *   ** *** * **            

consensus_4432#0      CGCGTGTTTGTTTCACGGAGGCTACAGTGGCTCCACACAAAAAAGGAAATTAAATTAATT 297
consensus_4432#1      TGCAG---CGTTCCGTGGGTG------TNGGTTTTCACCATAACCGTCGGTGTGCTA--T 218
                       **      *** *  **  *      * * *   *** * **  *    *    **  *

consensus_4432#0      TAAGAAAAAAAACCCCTACCCACTCGAAAGGACACTTGAAGGTGGAGTGAAGGCACATGC 357
consensus_4432#1      TGTGTGTAATTGTGTCTANTANTTGCATATCTCNTTTGGNTGGTCCCTAAGGCCACCGGC 278
                      *  *   **      ***     *  * *   *  ***   *     * * * ***  **

consensus_4432#0      ACCACGAACCACGTACACGTATAATATACTCTATATCG-TGTCACCTCTTATTAATACTG 416
consensus_4432#1      TTT-CGGCCCGAGTGTGTGTNTN-TGCATGTTGGGCCGATGACNGATCAACTAAGATNNG 336
                          **  **  **    ** *  *  *   *    ** ** *   **   * *     *

consensus_4432#0      GCACCCTGCCTGTCTGCTCCCACCGGCAGTCTCCTCAGTGTATTGTGCGGGCCAAAATAA 476
consensus_4432#1      CCAGAGGGCAAAAGGGTTNTCCTTGCCCATCCTNTGGACCCATA----GGGTTGNGGTTT 392
                       **    **      * *  *   * *  **   *      **     ***      *  

consensus_4432#0      AATAATAATTAAAAACAAAAACAAACAAACAATTGGACGAACTGTCTGTCAAAAAGACGC 536
consensus_4432#1      TNTAGATTTTTAGGGTNTAG-----CGGNCCATAGGGGGTGCNTCCTCCCATAGT-ATAT 446
                        **    ** *      *      *   * ** **  *  *   **  ** *   *   

consensus_4432#0      CGTTTCTACGCCCTCGCCCTCATATATCGCCGTATACACTGGGTGGATGGATGGGGATTT 596
consensus_4432#1      TANTT--------TAATTNGTATAAATGNGTAAAGTTGCTNCTTTAATTTTNNGTAGTNT 498
                         **        *       *** **      *    **   *  **     *   * *

consensus_4432#0      GTATAACTACGCTTGCCTGCAGTGGTTTGCAAAACAGTTTTAAGTCTCTAGTAACCTCGG 656
consensus_4432#1      NTTTAATGCTAGCAGNAGTCAACCAGTATGNTGANTGCGTTAGGGNTGAATCCATTCTCG 558
                       * ***        *    **     *      *  *  *** *  *  *   *     *

consensus_4432#0      CCCGTGGAGGGAACGAATTTAAACAAAAAATAAAATAAAAAAATAGCTAAAAAGTATCGG 716
consensus_4432#1      TTTA-ACCCNAGTTGAACTTGTTCTGGTGGTTAACCTGTATC-TATCTGT--GGTNTCCC 614
                                    *** **   *      * **     *   ** **     ** **  

consensus_4432#0      CTAAGACGCACAGGCACATCCCGTGTACGTGTGTACAGGCTTGTTGGGTGGTGAGG-CGT 775
consensus_4432#1      ATAGGCTCCAATNGTATATGATGTATCTGT---CACAGTGTTGTTCNTCTTTACCGTCAC 671
                       ** *   **   * * **   ** *  **    ****  *****      *   * *  

consensus_4432#0      ATATCCGCGCACACGACCCCTCTACGCTAAGCTAAGGCCTACCTATATTCGAAATGTTTG 835
consensus_4432#1      NCATTCAGTCACACCATTTCTATTTATTGTACTCCAGGCCNCAGATAATGGCCACGCCTG 731
                        ** *   ***** *   ** *    *   **   * *  *  *** * *  * *  **

consensus_4432#0      G------CAAGGTACTAACACG----GCGCCATAAAACTTTACTAATGTGCGTATGTATA 885
consensus_4432#1      GATGTGTTTGGGTATTCGTGTAATTTGCTGTGTGNAATTTTTTNGATATA-GTATGACTT 790
                      *         **** *          **    *  ** ***    ** *  *****  * 

consensus_4432#0      TATATAAATGTATATAAAAAATGGCCCACTCCTTCTATCCTCTGTTTTTTAGTTGTTT-T 944
consensus_4432#1      TAGCAGATTGGCACTGCCAAGGTGGTTTCGCCAATAATACCAAGGTTTTTAGAGGTGCAT 850
                      **    * **    *   **   *    * **    ** *   * *******  **   *

consensus_4432#0      GTTGCTGCGCATC-CTTCACTGCGCGGGGCAGTATCGAACGATTGCTTATTAACTGTCTA 1003
consensus_4432#1      CCTGAGGTAGACCACTTCAGGGCACCAGTAGGTAGGGGTATACAGTATATC--TTNANTA 908
                        **  *   * * *****  ** *  *   ***  *    *  *  ***    *   **

consensus_4432#0      TCGTAATCATAAATTGGTAAGTCCTCGCGAACAAATTAACCTACTCGCTTAAGTTAGCTA 1063
consensus_4432#1      CAAAGANTATATATATAGANAGTATAGAAAGATAAT--AGCTATATGATAATATCAG--G 964
                           *  *** **    *     * *  *   ***  * ***   * * *  * **   

consensus_4432#0      CTACAGTCCACGGAGGGAGGGGGAGGTG---GTGAGTGACCCCCTTCCCCATTTCAGCCA 1120
consensus_4432#1      CTATAGTACGCACAGGCTACATCCCGTACGTGTGTACAGGCTTGTTGGGTGTGTAGGCAG 1024
                      *** *** * *  ***         **    ***      *   **     * *  **  

consensus_4432#0      CCTACTCCCCCACTCCTTTTGGATAAGGCAATTCGAACGGGTCGAAAATAGAAAAAAAAA 1180
consensus_4432#1      TATATCCGCGCACACGACCCCTCTACGCTAAGCTAA--GGCCTACCTATATTCGAAATGT 1082
                        **  * * *** *        ** *  **    *  **       ***    ***   

consensus_4432#0      TCGGAACCCTCGGAACATGTCCCGTTCCCGGCCGG 1215
consensus_4432#1      TGGCAAGTACTAACACTAACCTCG----------- 1106
                      * * **        **    * **