cluster # 5197

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Anopheles gambiae
cluster # 5197 cluster # 5197 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5197#0 length = 1230 sequences # 4
consensusID : consensus_5197#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1230
fasta sequence
                              [GGCAGAATCGCCACGAGGGTCCCTGTAGGTTGTACATTTTAAGCTAGAATCTGAAGAGAGGGACACAAAACACAGAGACAACCGTGTCAACCGAGTACTCTACCAGACAGTCGTTATATACAAAATAAAAGAGCTGTATTTAATTCCTAAAGATGCGGGTGCATCAACTGCAACAGCAACCTGCAACCAATTGCTCAGTACCGACGCTCAATGCTAGGGAGAATGAATTAGAGGAAAACAGAAGGCTGATTGGGTGTGTGAGACGTGAATAGTAGAAATTTGAAAAGGGGAATCGCGATATATTATATTGCACATGGTGCAATAATGAGAACAGCTTTGCTGGAAAGGAATGCCAACCATATTGCGTGAGATGTGTAAAGGAAATGCCGTGTTCGGCCAACGGCTGAACGGATCAGATATTTTGTAATTTATTTGTTAATGTT-TTTTTCTCCTTTCGTCATGTGTGTTT-TGTGAGTTTGTGTTATTTTTGAAATTT------TTTTTTTTATCGAGAGTATATATGTTTATTTTTAGTT-TGT-T-GTCTAGGTTGTTCCATATTACCATTT-GTTAGAAAATGTTGCCTTTTCCCACGTCCCCATTACCACCATTCCGCTTGAACGTTGTTATATTCGTCATGTTTATTGTTCTTCCTATTCTCATTTGTCACATGCGTAACCGTATTTAATCTGCCTAGAGCTACCCATTGGGATATTATCACACACATAAAGAAAGCTAAGACGAAACGTTGTATGCGAGATAGTACCGACAGCTCTTGTTAGCGTGTTAAAAGAAGATATTGAGTTTTTGTTGTAGCGTACTTTACTTTTACGAACNAACCACAAAGTTTTCATGTGTTGCAAGTTGGATAATGNTGTGTGGTGAAGGCAAAGTANAGCCTTGNTTTTATCATACCATGTTGACCAATTTCCAGGAGCCTTCTTTTTCGTGTTATTGGCTCCAGAGTTGTTAGTTAGCGTAGAAACAACAACCCCTTTAGTTTATTCATTAGAATATTCAGTGCAATCAGCGATCGACCGACCAGCGATCGAGCTCGTGTTACTTACCAAGCACCAAGTTGCGTATGAGTTAATGATATTTTCCACCTCCACACAACGAGTGTGGTGTGCTGTAATGTATAAATGTAGTTAATATTTTTCAATTTTTATCATCATTTTGTAAAAAAAATCAACAAAAAACCAACTCACGTTTACAAGCGTTATCTTCCAATCGTTC]

[+] EMBL BX467355             [GGCAGAATCGCCACGAGGGTCCCTGTAGGTTGTACATTTTAAGCTAGAATCTGAAGAGAGGGACACAAAACACAGAGACAACCGTGTCAACCGAGTACTCTACCAGACAGTCGTTATATACAAAATAAAAGAGCTGTATTTAATTCCTAAAGATGCGGGTGCATCAACTGCAACAGCAACCTGCAACCAATTGCTCAGTACCGACGCTCAATGCTAGGGAGAATGAATTAGAGGAAAACAGAAGGCTGATTGGGTGTGTGAGACGTGAATAGTAGAAATTTGAAAAGGGGAATCGCGATATATTATATTGCACATGGTGCAATAATGAGAACAGCTTTGCTGGAAAGGAATGCCAACCATATTGCGTGAGATGTGTAAAGGAAATGCCGTGTTCGGCCAAGGGCTGAACGGATCAGATATTTTGTAATTTATTTGTTAATGTTGTTTTTCTCCTTTCGTCATGTGTGTTTATGTGAGTTTGTGTTATTTTTGAAATTTGGCTNATTGTGTGTATCGAGAGTATATATGTTTATTTTTAGTTNTGTATAGTCTAGGTTGTTCCATATTACCATTTAGTTAGAAAATGTTGCCTTTTCCCACGTCCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BX629253             [                                                                                     GTCAACCGAGTACTCTACCAGACAGTCGTTATATACAAAATAAAAGAGCTGTATTTAATTCCTAAAGATGCGGGTGCATCAACTGCAACAGCAACCTGCAACCAATTGCTCAGTACCGACGCTCAATGCTAGGGAGAATGAATTAGAGGAAAACAGAAGGCTGATTGGGTGTGTGAGACGTGAATAGTAGAAATTTGAAAAGGGGAATCGCGATATATTATATTGCACATGGTGCAATAATGAGAACAGCTTTGCTGGAAAGGAATGCCAACCATATTGCGTGAGATGTGTAAAGGAAATGCCGTGTTCGGCCAACGGCTGAACGGATCAGATATTTTGTAATTTATTTGTTAATGTT TTTTTCTCCTTTCGTCATGTGTGTTT TGTGAGTTTGTGTTATTTTTGAAATTT      TTTTTTTTATCGAGAGTATATATGTTTATTTTTAGTT TGT T GTCTAGGTTGTTCCATATTACCATTT GTTAGAAAATGTTGCCTTTTCCCACGTCCCCATTACCACCATTCCGCTTGAACGTTGTTATATTCGTCATGTTTATTGTTCTTCCTATTCTCATTTGTCACATGCGTAACCGTATTTAATCTGCCTAGAGCTACCCATTGGGATATTATCACACACATAAAGAAAGCTAAGACGAAACGTTGTATGCGAGATAGTACCGACAGCTCTTGTTAGCGTGTTAAAAGAAGATATTGAGTTTTTGTTGTAGCGTACTTTACTTTTACGAACNAACCACAAAGTTTTCATGTGTTGCAAGTTGGATAATGNTGTGTGGTGAAGGCAAAGTANAGCCTTGNTTTTATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX629144             [                                                                                           CGAGTACTCTACCAGACAGTCGTTATATACAAAATAAAAGAGCTGTATTTAATTCCTAAAGATGCGGGTGCATCAACTGCAACAGCAACCTGCAACCAATTGCTCAGTACCGACGCTCAATGCTAGGGAGAATGAATTAGAGGAAAACAGAAGGCTGATTGGGTGTGTGAGACGTGAATAGTAGAAATTTGAAAAGGGGAATCGCGATATATTATATTGCACATGGTGCAATAATGAGAACAGCTTTGCTGGAAAGGAATGCCAACCATATTGCGTGAGATGTGTAAAGGAAATGCCGTGTTCGGCCAACGGCTGAACGGATCAGATATTTTGTAATTTATTTGTTAATGTT TTTTTCTCCTTTCGTCATGTGTGTTT TGTGAGTTTGTGTTATTTTTGAAATTT      TTTTTTTTATCGAGAGTATATATGTTTATTTTTAGTT TGT T GTCTAGGTTGTTCCATATTACCATTT GTTAGAAAATGTTGCCTTTTCCCACGTCCCCATTACCACCATTCCGCTTGAACGTTGTTATATTCGTCATGTTTATTGTTCTTCCTATTCTCATTTGTCACATGCGTAACCGTATTTAATCTGCCTAGAGCTACCCATTGGGATATTATCACACACATAAAGAAAGCTAAGACGAAACGTTGTATGCGAGATAGTACCGACAGCTCTTGTTAGCGTGTTAAAAGAAGATATTGAGTTTTTGTTGTAGCGTACTTTACTTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BX618795             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCGACAGCTCTTGTTAGCGTGTTAAAAGAA AAATTGAGTTTTTGTTGTAGCGTACTTCACTTTTACGAACAAACCACAAAGTTTTCATGTGTTGCAAGTTGGATAATGTTGTGTGGTGAAGGCAAAGTAGAGCCTTGTTTTTATCATACCATGTTGACCAATTTCCAGGAGCCTTCTTTTTCGTGTTATTGGCTCCAGAGTTGTTAGTTAGCGTAGAAACAACAACCCCTTTAGTTTATTCATTAGAATATTCAGTGCAATCAGCGATCGACCGACCAGCGATCGAGCTCGTGTTACTTACCAAGCACCAAGTTGCGTATGAGTTAATGATATTTTCCACCTCCACACAACGAGTGTGGTGTGCTGTAATGTATAAATGTAGTTAATATTTTTCAATTTTTATCATCATTTTGTAAAAAAAATCAACAAAAAACCAACTCACGTTTACAAGCGTTATCTTCCAATCGTTC]




>consensus_5197#0
GGCAGAATCGCCACGAGGGTCCCTGTAGGTTGTACATTTTAAGCTAGAATCTGAAGAGAG
GGACACAAAACACAGAGACAACCGTGTCAACCGAGTACTCTACCAGACAGTCGTTATATA
CAAAATAAAAGAGCTGTATTTAATTCCTAAAGATGCGGGTGCATCAACTGCAACAGCAAC
CTGCAACCAATTGCTCAGTACCGACGCTCAATGCTAGGGAGAATGAATTAGAGGAAAACA
GAAGGCTGATTGGGTGTGTGAGACGTGAATAGTAGAAATTTGAAAAGGGGAATCGCGATA
TATTATATTGCACATGGTGCAATAATGAGAACAGCTTTGCTGGAAAGGAATGCCAACCAT
ATTGCGTGAGATGTGTAAAGGAAATGCCGTGTTCGGCCAACGGCTGAACGGATCAGATAT
TTTGTAATTTATTTGTTAATGTTTTTTTCTCCTTTCGTCATGTGTGTTTTGTGAGTTTGT
GTTATTTTTGAAATTTTTTTTTTTATCGAGAGTATATATGTTTATTTTTAGTTTGTTGTC
TAGGTTGTTCCATATTACCATTTGTTAGAAAATGTTGCCTTTTCCCACGTCCCCATTACC
ACCATTCCGCTTGAACGTTGTTATATTCGTCATGTTTATTGTTCTTCCTATTCTCATTTG
TCACATGCGTAACCGTATTTAATCTGCCTAGAGCTACCCATTGGGATATTATCACACACA
TAAAGAAAGCTAAGACGAAACGTTGTATGCGAGATAGTACCGACAGCTCTTGTTAGCGTG
TTAAAAGAAGATATTGAGTTTTTGTTGTAGCGTACTTTACTTTTACGAACNAACCACAAA
GTTTTCATGTGTTGCAAGTTGGATAATGNTGTGTGGTGAAGGCAAAGTANAGCCTTGNTT
TTATCATACCATGTTGACCAATTTCCAGGAGCCTTCTTTTTCGTGTTATTGGCTCCAGAG
TTGTTAGTTAGCGTAGAAACAACAACCCCTTTAGTTTATTCATTAGAATATTCAGTGCAA
TCAGCGATCGACCGACCAGCGATCGAGCTCGTGTTACTTACCAAGCACCAAGTTGCGTAT
GAGTTAATGATATTTTCCACCTCCACACAACGAGTGTGGTGTGCTGTAATGTATAAATGT
AGTTAATATTTTTCAATTTTTATCATCATTTTGTAAAAAAAATCAACAAAAAACCAACTC
ACGTTTACAAGCGTTATCTTCCAATCGTTC
clustalw multiple alignements is not computed in this case