These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5867#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1578 fasta sequence [CCGGTAATGGCAGTAGTGCGTAAATGATAACCCACAGAACAGACACACATATACAACAAACAAACAAAAAACCGTACGCAAGGTGCATAAAAGTTCGATTATAGTAGCGAGGAATGGGTTTGCGGTACAAACAGGTTGATGAAGCTAAATGAATTTAATGTTTTTTCTTCCCTTGTATAATGTTCGCATTACCTTTCGAGGTAATTGATCCTCTGACTCACATTGATTCACATCGGTAACAGTTTACATTCGTGTGCGGAACAAAAAACAGTGAAAAGAAAAACAAAACAAAATCAGCTTCTAGTCATTTTCTTCCAGCATTGGTCAAAATTAGCCGTTAACAAAATGACATTTAATAATGTTCGTATTATTTCCGGAGCGTTTATGAAGCAATGCTTAATTAAGAGCTATTTCAGCCACTGTGCCATACTAATTTTGAGTAGTGTTTTCGTATTGCGCATCACCATAACCAGCAATCGAACAGCGAGACTCAGTTGCTCTACTAGTACCGGATCTCCTCAACCACAACCAAACTGCAAAAAATAATTGAAAATTGTTACTTGTGTTACGCATATAACGGACAAAAAAGGAAATTTAATCAAAATTAATGCAACAATTGTTGTACAAAAAAACCAAATAATAGAGCATGGT-ATGATGATTGATGGTTGAAAGGATGGATGGATAATGAGGATGATAAGTGAGGGCATGCTTTTCGTACCATATAATAATATTTAGAGGACGTAAGAATAGGCAAAAGAAGAAAAAACACACACACACATACAGAGAAAATGACATTTATTTACACTGTTTGGGCAACTGCAAATGACAAATTAGGCCACAATTCTGATTTATCGTAAAAATGAAACAGAAAGCTATAGTTTAATTAAAGTAAATCATTTTCAGTGTCGCTTTTATTCCCTTTCTAAAGTGTCACATTTGGATCAGCTTTTTCCCTACATAAATAGTACCGATAATAATCTTTAGACGGCCCCAGGTATCTCTAATGTCGTAATGTGTCACTCAAACTCAAACAAAAAAAAAGAATTCTTGGACTAAAATTTAAAACAGCTCTGTAGTATAATCCTTATACGATAAGCTCGCAAAAAAAAACATCACGTAATCAATGTAATCACTTATTGGAAAAGGTGTGTGAAACTAACGTTTAAGAAATGTTCTGAAAAGCTCTGGTTCAATGGTTGGCGGCGTTCGGTTTTGCGAAAGAAAACATCACCCCAAACAGGCAAACAAAACGAAAGAATGGAACGGTGAACCACGACACGAACAAAAACTAAATGAAACAAATATACGAACAATCACCGTTCATTAAGGAAACAACAAC-AAAAAAACACATAATTTCAGTAACATTACCCATTAAATGTAGTGGATTGCTAATAATTGCTTGCTTGATATTCGTCAAACACAGGAAATAGGCGTGTATGTGTAGGGCACGTGGAAAGAAGTAGTAATAGAAAACGCAAATGGAAAACGAATGAAAAATTGTGAAAGGATGAAAAGAAGGGAATGCGAAAAATCAATTCCCCTTTGC-AAAGAGCCAGAAAAAGCCGAACCNGAGAGCAA] [+] EMBL BM621566 [CCGGTAATGGCAGTAGTGCGTAAATGATAACCCACAGAACAGACACACATATACAACAAACAAACAAAAAACCGTACGCAAGGTGCATAAAAGTTCGATTATAGTAGCGAGGAATGGGTTTGCGGTACAAACAGGTTGATGAAGCTAAATGAATTTAATGTTTTTTCTTCCCTTGTATAATGTTCGCATTACCTTTCGAGGTAATTGATCCTCTGACTCACATTGATTCACATCGGTAACAGTTTACATTCGTGTGCGGAACAAAAAACAGTGAAAAGAAAAACAAAACAAAATCAGCTTCTAGTCATTTTCTTCCAGCATTGGTCAAAATTAGCCGTTAACAAAATGACATTTAATAATGTTCGTATTATTTCCGGAGCGTTTATGAAGCAATGCTTAATTAAGAGCTATTTCAGCCACTGTGCCATACTAATTTTGAGTAGTGTTTTCGTATTGCGCATCACCATAACCAGCAATCGAACAGCGAGACTCAGTTGCTCTACTAGTACCGGATCTCCTCAACCACAACCAAACTGCAAAAAATAATTGAAAATTGTTACTTGTGTTACGCATATAACGGACAAAAAAGGAAATTTAATCAAAATTAATGCAACAATTGTTGTACAAAAAAACCAAATAATAGAGCATGGTGATGAT ] [+] EMBL BM644881 [ ccgCTTCCCTTGTATAATGTTCACATTACCTTTCGAGGTAATTGATCCTCTGACTCACATTGATTCACATCGGTAACAGTTTACATTCGTGTGCGGAACAAAAAACAGTGAAAAGAAAAACAAAACAAAATCAGCTTCTAGTCATTTTCTTCCAGCATTGGTCAAAATTAGCCGTTAACAAAATGACATTTAATAATGTTCGTATTATTTCCGGAGCGTTTATGAAGCAATGCTTAATTAAGAGCTATTTCAGCCACTGTGCCATACTAATTTTGAGTAGTGTTTTCGTATTGCGCATAACCATAACCAGCAATCGATCAGCGAGACTCAGTTGCTCTATTAGTACCGGATCTCCTCAACCACAACCAAACTGCAAAAAATAATTGAAAATTGTTACTTGTGTTACGCATATAACGGACAAAAAAGGAAATTTAATCAAAATTAATGCAACAATTGTTGTACAAAAAAACCAAATAATAGAGCATGAT ATGATGATTGATGGTTGAAAGGATGGATGGATAATGAGGATGATAAGTGAGGGCATGCTTTTCGTACCATATAATAATATTTAGAGGACGTAAGAATAGGCAAAAGAAGAAAAAACACACACACACATACAGAGAAAATGACATTTATTTACACTGTTTGGGCAACTGCAAATGACAAATTAGGCCACAATTCTGATTTATCGTAA ] [+] EMBL BX622353 [ GACATTTATTTACACTGTTTGGGCAACTG AAATGACAAATTAGGCCACAATTCTGATTTATCGTAAAAATGAAACAGAAAGCTATAGTTTAATTAAAGTAAATCATTTTCAGTGTCGCTTTTATTCCCTTTCTAAAGTGTCACATTTGGATCAGCTTTTTCCCTACATAAATAGTACCGATAATAATCTTTAGACGGCCCCAGGTATCTCTAATGTCGTAATGTGTCACTCAAACTCAAACAAAAAAAAAGAATTCTTGGACTAAAATTTAAAACAGCTCTGTAGTATAATCCTTATACGATAAGCTCGCAAAAAAAAACATCACGTAATCAATGTAATCACTTATTGGAAAAGGTGTGTGAAACTAACGTTTAAGAAATGTTCTGAAAAGCTCTGGTTCAATGGTTGGCGGCGTTCGGTTTTGCGAAAGAAAACATCACCCCAAACAGGCAAACAAAACGAAAGAATGGAACGGTGAACCACGACACGAACAAAAACTAAATGAAACAAATATACGAACAATCACCGTTCATTAAGGAAACAACAAC AAAAAAACACATAATTTCAGTAACATTACCCATTAAATGTAGTGGATTGCTAATAATTGCTTGCTTGATATTCGTCAAACACAGGAAATAGGCGTGTATGTGTAGGGCACGTGGAAAGAAGTAGTAATAGAAAACGCAAATGGAAAACGAATGAAAAATTGTGAAAGGATGAAAAGAAGGGAATGCGAAAAATCAATTCCCCTTTGC AAAGAGCCAGAAAAAGCCGAACCNGAGAGCAA] [+] EMBL BM629953 [ ccgTAAAATTTAAAACAGCTCTGTAGTATAATCCTTATACGATAAGCTCGC AAAAAAAACATCACGTAATCAATGTAATCACTTATTGGAAAAGGTGTGTGAAACTAACGTTTAAGAAATGTTCTGAAAAGCTCTGGTTCAATGGTTGGCGGCGTTCGGTTTTGCGAAAGAAAACATCACCCCAAACAAGCAAACAAAACGAAAGAATGGAACGGTGAAC CGACACGAACACAAACTAAATGAAACAAATATACGAACAATCACCGTTCATTAAGGAAACAACAACAAAAAAAACACATAATTTCAGTAACATTACCCATTAAATGTAGTGTATTGCTAATAATTGCTTGCTTGATATTCGTCAAACACAGGAAATAGGCGTGTATGTGTAGGGCACGTGGAAAGAAGTAGTAATAGAAAACGCAAACAGAAAACGAACGAAAAATTGTGAAAGGATGAAAAGCAGGGAATGCGAAAAATCAATTCCCCTTTGCAAAAGAGCCAGAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||