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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6022#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1450 fasta sequence
[CCGGGGACAGAATGTAGTACAATGATCAACTTAAATGAAACAATACATCAAGAAATAGCAAACCAAGCTGTCAAGCATGAATCAAACAATACCATCAACTAGTGTATGATGTAACCACACATATTGAAAAATAGAACGCCGCACGGTCATGATCACGAACCTAGAAATAACGTAATAGTAACAAAACGCATAAAGCAACACCATGGATTGCAACGGTCGAAATATGTTCTTATCTTTCAGCATAGTTGCATAGCCACACACACACACACACACACACACACACACACACCTAACACATCTTGCAGAGCGATAAGATATGAGAAAGCTTTCATTCAATTTCCACACTAAAATTTCACATTAAGTTGTTGCTTAGCTTAGCTCTAGCTACATTTTTATCTCCTCGCGATGCATTGGTTAATCCAAACCCCCCTATCGTGTATGCGCTTTAAAGCGTGTTTTCAGAATTACAATTGCATCCTAACCAAAGATTCGGTAAAGCATACCCTACATGTATTAAATGAAATGAGACCCCACTTGATATGAAAGACACATTTTTGTAGTGTAACAAATCGGACATACAATTAACACATAGCTCAAACATCAAAGGAGATACAAGGAATAGTGAACAAATTATTAAACTATGGACCTACTATGGACATGCGGCATAAATAGCGGACATAGCACAGTCCACTTTAATTAATGATCATAGAAAAAAAAACCATTGAACTAAAGCGAAATTGATCGCTCCGGGCGTTATGTTTTGAGCTTCGGCACACGATCGAATGAAACCACTGTTTCGATGCAAAACAAAGCGAATAGTTTTAGCGAGCGACACCCCTCCCCCCATTCTCTCGGTTGTTGTGTGATAGCGTGTTGTGGGGCATAGTTTAAAACTCCCGGTAGAAGAGTAAACAGATAACAATATGCAGAATTTGTAAAGAGAACGGCATTAGGTGTGCTGTTTAGCCATATTTGTATTTACTTTGGGCGCGCACGATTTTGGTTCGGATATGGGACATATTACACC--TGTGTGCGCGTGTGTGTGTGTTTAAGATAGGAGCAAATGAAGATGATCATCGCAAAATGGGGAAGATCATATTCAGGTGAAGGAAAAAAAAGGTATATTAAATGATACACCACAAACCACCACAAGCTCTTAGCACTTACGGCACACGGTTTGACACAAACGAATGTAGGAAGAAAAGACGAATCATTATGCATTTATGTATGCACCAATCGCTATAGATAAAGAGAGCAAGGACACCTAAACGCAACGTGTAAAAACATTAGAGATGAGCAGCCTTCAAGAGGTTCGAGCCATTCCCCCGTCAACACAACACAATCGTTCGGAACGATGGAAACCGTTGTTTTTTAGACATGATTATCTTATTTTGACAGATCTCACGGCTCTGTTTCAAAAGCTAGTAGCTTGATTAAGTTGTTTTTCCCA]
[+] EMBL BM586647 [CCGGGGACAGAATGTAGTACAATGATCAACTTAAATGAAACAATACATCAAGAAATAGCAAACCAAGCTGTCAAGCATGAATCAAACAATACCATCAACTAGTGTATGATGTAACCACACATATTGAAAAATAGAACGCCGCACGGTCATGATCACGAACCTAGAAATAACGTAATAGTAACAAAACGCATAAAGCAACACCATGGATTGCAACGGTCGAAATATGTTCTTATCTTTCAGCATAGTTGCATAGCCACACACACACACACACACACACACACACACACACCTAACACATCTTGCAGAGCGATAAGATATGAGAAAGCTTTCATTCAATTTCCACACTAAAATTTCACATTAAGTTGTTGCTTAGCTTAGCTCTAGCTACATTTTTATCTCCTCGCGATGCATTGGTTAATCCAAACCCCCCTATCGTGTATGCGCTTTAAAGCGTGTTTTCAGAATTACAATTGCATCCTAACCAAAGATTCGGTAAAGCATACCCTACATGTATTAAATGAAATGAGACCCCACTTGATATGAAAGACACATTTTTGTAGTGTAACAAATCGGACATACAATTAACACATAGCTCAAACATCAAAGGAGATACAAGGAATAGTGAACAAATTATTAAACTATGGACCTACTATGGACATGCGGCATAAATAGCGGACATAGCACAGTCCACTTTAATTAA ]
[+] EMBL BM626272 [ ccgCGCACGGTCATGATCACGAACCTAGAAATAACGTAATAGTAACAAAACGCATAAAGCAACACCATGGATTGCAACGGTCGAAATATGTTCTTATCTTTCAGCATAGTTGCATAGCCACACACACACACACACACACACACACACACACACCTAACACATCTTGCAGAGCGATAAGATATGAGAAAGCTTTCATTCAATTTCCACACTAAAATTTCACATTAAGTTGTTGCTTAGCTTAGCTCTAGCTACATTTTTATCTCCTCGCGATGCATTGGTTAATCCAAACCCCCCTATCGTGTATGCGCTTTAAAGCGTGTTTTCAGAATTACAATTGCATCCTAACCAAAGATTCGGTAAAGCATACCCTACATGTATTAAATGAAATGAGACCCCACTTGATATGAAAGACACATTTTTGTAGTGTAACAAATCGGACATACAATTAACACATAGCTCAAACATCAAAGGAGATACAAGGAATAGTGAACAAATTATTAAACTATGGACCTACTATGGACATGCGGCATAAATAGCGGACATAGCACAGTCCACTTTAATTAATGATCATAGAAAAAAAAACCATTGAACTAAAGCGAAATTGATCGCTCCGGGCGTTATGTTTTGAGCTTCGGCACACGATCGAATGAAACCACTGTTTCGATGCAAAACAAAG ]
[+] EMBL CNS094BV [ aaaaaaaTCAATTTCCACACTAAAATTTCACATTAAGTTGTTGCTTAGCTTAGCTCTAGCTACATTTTTATCTCCTCGCGATGCATTGGTTAATCCAAACCCCCCTATCGTGTATGCGCTTTAAAGCGTGTTTTCAGAATTACAATTGCATCCTAACCAAAGATTCGGTAAAGCATACCCTACATGTATTAAATGAAATGAGACCCCACTTGATATGAAAGACACATTTTTGTAGTGTAACAAATCGGACATACAATTAACACATAGCTCAAACATCAAAGGAGATACAAGGAATAGTGAACAAATTATTAAACTATGGACCTACTATGGACATGCGGCATAAATAGCGGACATAGCACAGTCCACTTTAATTAATGATCATAGAAAAAAAAACCATTGAACTAAAGCGAAATTGATCGCTCCGGGCGTTATGTTTTGAGCTTCGGCACACGATCGAATGAAACCACTGTTTCGATGCAAAACAAAGCGAATAGTTTTAGCGAGCGACACCCCTCCCCCCATTCTCTCGGTTGTTGTGTGATAGCGTGTTGTGGGGCATAGTTTAAAACTCCCGGTAGAAGAGTAAACAGATAACAATATGCAGAATTTGTAAAGAGAACGGCATTAGGTGTGCTGTTTAGCCATATTTGTATTTACTTTGGGCGCGCACGATTTTGGTTCGGATATGGGACATATTACACC TGTGTGCGCGTGTGTGTGTGTTTAAGATAGGAGCAAATGAAGATGATCATCGCAAAATGGGGAAGATCATATTCAGGTGAAGGAAAAAAAAGGTATATTAAATGATACACCACAAACCACCACAAGCTCTTAGCACTTACGGCACACGGTTTGACACAAACGAATGTAGGAAGAAAAGACGAATCATTATGCATTTATGTATGCACCAATCGCTATAGATAAAGAGAGCAAGGACACCTAAACGCA ]
[+] EMBL BX621051 [ AAAGACACATTTTTGTAGTGTAACAAATCGGACATACAATTAACACATAGCTCAAACATCAAAGGAGATACAAGGAATAGTGAACAAATTATTAAACTATGGACCTACTATGGACATGCGGCATAAATAGCGGACATAGCACAGTCCACTTTAATTAATGATCATAG AAAAAAAACCATTGAACTAAAGCGAAATTGACCGCTCCGGGCGTTATGTTTTGAGCTTCGGCACACGATCGAATGAAACCATTGGTTCAATGCAAAACAAAGCGAATAGTTTTAGCGAGCGACACCCCTCCCCCCATTCTCTCGGTTGTTGTGTGATAGCGTGTTGTGGGGCATAGTTTAAAACTCCCGGTAGAAGAGTAAACAGATAACAATATGCAGAATTTGTAAAGAGAGCGGCATTAGGTGTGCTGTTTAGCCATATTTGTATTTACTTTGGGCGCGCACGATTTTGGTTAGGATATGGGACATGTTACACCTGTGTGTGCGCGTGTTTGTGTGTTTAAGATAGGAGCAAATGAAGATGATCATCGCAAAATGGGGAAGATCATATTCAGGTGAA GAAAAAAAAGGTATATTAAATGATACACCACAAACCACCACAAGCTCTTGGCACTTACGGCACACGGTTTGACACAAACGAATGTAGGAAGAAAAGACGAAGCATTATGCATTTATGTATGCACCAATCGCTATAGATAAAGAGAGCAAGGACACCT AACGCNACGTGTAAAAACATTAGAGATGAGC ]
[-] EMBL CNS094BW [ GTAGAAGAGTAAACAGATAACAATATGCAGAATTTGTAAAGAGAACGGCATTAGGTGTGCTGTTTAGCCATATTTGTATTTACTTTGGGCGCGCACGATTTTGGTTCGGATATGGGACATATTACACC TGTGTGCGCGTGTGTGTGTGTTTAAGATAGGAGCAAATGAAGATGATCATCGCAAAATGGGGAAGATCATATTCAGGTGAAGGAAAAAAAAGGTATATTAAATGATACACCACAAACCACCACAAGCTCTTAGCACTTACGGCACACGGTTTGACACAAACGAATGTAGGAAGAAAAGACGAATCATTATGCATTTATGTATGCACCAATCGCTATAGATAAAGAGAGCAAGGACACCTAAACGCAACGTGTAAAAACATTAGAGATGAGCAGCCTTCAAGAGGTTCGAGCCATTCCCCCGTCAACACAACACAATCGTTCGGAACGATGGAAACCGTTGTTTTTTAGACATGATTATCTTATTTTGACAGATCTCACGGCTCTGTTTCAAAAGCTAGTAGCTTGATTAAGTTGTTTTTCCCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||