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Anopheles gambiae
cluster # 6311 cluster # 6311       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6311#0 length = 1010 sequences # 5  
consensusID : consensus_6311#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1010
fasta sequence 
                              [ACCTGCAGCAGAACCCAAGCGTCTACTACAACAAGCCACTACCGAT--CGGGGTTATAGTATTGAAGGTTGGAGGAATGCGACGCTAGCGTGTAAGTTGGGTATCGCTTTCGGAATCTAACTGACTACTTTAAGATAAGGTTCTACGTGCAGGTTTAATTTATTTAAGTTTGGAGAGCTGCAAGACTTTTGTTTGATGTGTTAAGCAAGCAGTCCACATTACATTACCATACAATTACATTCCAAAAGAATTGCGCACCTTTCGCAAAACATTCTAGCATGAGACGTTCGGTGCGCAGGCGGATCTGATTTAGCCCCTAAGTTGATTGTGATGTTTTTTCCCCTTTTCTTCAAATAATCATGTATATTTACAATAAGGTTTGCTGTATGATATAATGCTTGAGATACTCTTTTTTGATAACAAAACACTCTTAC-ACATGTCGATACGTGATGTACAATATTGTCTATGATCGAGAGATCTGTTTTAGTCGAGAGTTGTTTTTCCATCGAGTAATCTGTAAAATTAAGTGTATTAGTATAGTTTAACATCTCTTGAACTTTGAACAACTTCGAACATCAAAAGGTCTTGTTGCCTTGACTGGAGGATAAAAGCGAGGGCCATCAGTACTTTGAGACTAACTAGACGAACTGGTTTACTGATGGAGGAGGGTAGAGAATAATCGATAGTATTTCCTCTACTACTAAGCATCACTATCTGTAATGTACGCCAACGAAAATTAACTTCCCATAATATAAAAAAATGAAAACCAGCACAGCAATAATGAAACGGTTCAAAACAAGTCTCCTTTACGGTAGGAAGGACAATAGGGCATACAGTTAAGCTCTACAAAACTTAGAACTGAATGTCAGATAACAAATTACAAACGGTATAACGCCACAACACATTATTACTGCATCTGCACTACATCTCATTGCATCTTTATCCTGTGCGCTCTTAAAGCACTTAATACTCTTAGCGTCAAATAAATAAAGCATAATTCCACATACACAAT]

[+] EMBL CNS09EYF             [ACCTGCAGCAGAACCCAAGCGTCTACTACAACAAGCCACTACCGAT  CGGGGTTATAGTATTGAAGGTTGGAGGAATGCGACGCTAGCGTGTAAGTTGGGTATCGCTTTCGGAATCTAACTGACTACTTTAAGATAAGGTTCTACGTGCAGGTTTAATTTATTTAAGTTTGGAGAGCTGCAAGACTTTTGTTTGATGTGTTAAGCAAGCAGTCCACATTACATTACCATACAATTACATTCCAAAAGAATTGCGCACCTTTCGCAAAACATTCTAGCATGAGACGTTCGGTGCGCAGGCGGATCTGATTTAGCCCCTAAGTTGATTGTGATGTTTTTTCCCCTTTTCTTCAAATAATCATGTATATTTACAATAAGGTTTGCTGTATGATATAATGCTTGAGATACTCTTTTTTGATAACAAAACACTCTTAC ACATGTCGATACGTGATGTACAATATTGTCTATGATCGAGAGATCTGTTTTAGTCGAGAGTTGTTTTTCCATCGAGTAATCTGTAAAATTAAGTGTATTAGTATAGTTTAACATCTCTTGAACTTTGAACAACTTCGAACATCAAAAGGTCTTGTTGCCTTGACTGGAGGATAAAAGCGAGGGCCATCAGTACTTTGAGACTAACTAGACGAACTGGTTTACTGATGGAGGAGGGTAGAGAATAATCGATAGTATTTCCTCTACTACTAAGCATCACTATCTGTAATGTACGCCAACGAAAATTAACTTCCCATAATATAAAAAAATGAAAACCAGCACAGCAATAATGAAACGGTTCAAAACAAGTCTCCTTTACGGTAGGAAGGACAATAGGGCATACAGTTAAGCT                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CNS09PEY             [   TGCAGCAGAACCCAAGCGTCTACTACAACAAGCCACTACCGATTACGGAGTTATAGTATTGAAGGTTGGAGGAATGCGACGCTAGCGTGTAAGTTGGGTATCGCTTTCGGAATCTAACTGACTACTTTAAGATAAGGTTCTACGTGCAGGTTTAATTTATTTAAGTTTGGAGAGCTGCAAGACTTTTGTTTGATGTGTTAAGCAAGCAGTCCACATTACATTACCATACAATTACATTCCAAAAGAATTGCGCACCTTTCGCAAAACATTCTAGCATGAGACGTTCGGTGCGCAGGCGGATCTGATTTAGCCCCTAAGTTGATTGTGATGTTTTTTCCCCTTTTCTTCAAATAATCATGTATATTTACAATAAGGTTTGCTGTATGATATAATGCTTGAGATACTCTTTTTTGATAACAAAACACTCTTAC ACATGTCGATACGTGATGTACAATATTGTCTATGATCGAGAGATCTGTTTTAGTCGAGAGTTGTTTTTCCATCGAGTAATCTGTAAAATTAAGTGTATTAGTATAGTTTAACATCTCTTGAACTTTGAACAACTTCGAACATCAAAAGGTCTTGTTGCCTTGACTGGAGGATAAAAGCGAGGGCCATCAGTACTTTGAGACTAACTAGACGAACTGGTTTACTGATGGAGGAGGGTAGAGAATAATCGATAGTATTTCCTCTACTACTAAGCATCACTATCTGTAATGTACGCCAACGAAAATTAACTTCCCATAATATAAAAAAATGAAAATCAGCACAGCAATAATGAAACGGTTCAAAACAAGTCTCCTTTACG                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CNS09EYG             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTTTTCCCCCTTTTCTTCAAATAATCATGTATATTTACAATAAGGTTTGCTGTATGATATAATGCTTGAGATACTCTTTTTTGATAACAAAAAACTTTTAC ACATGTCGATACGTGATGTACAATATTGTCTATGATCGAGAGATCTGTTTTAGTCGAGAGTTGTTTTTCCATCGAGTAATCTGTAAAATTAAGTGTATTAGTATAGTTTAACATCTCTTGAACTTTGAACAACTTCGAACATCAAAAGGTCTTGTTGCCTTTACTGGAGGATAAAAGCGAGGGCCATCAGTACTTTGAGACTAACTAGACGAACTGGTTTACTGATGGAGGGGGGTAGAGAATAATCGATAGTATTTCCTCTACTACTAAGCATAACTATCTGTAATGTACGCCAACGAAAATTAACTTCCCATAATATAAAAAAATGAAAACCAGAACAGCAATAATGAAACGGTTCAAAACAAGTCTCCTTTACGGTAGGAAGGACAATAGGGCATACAGTTAAGCTCTACAAAACTTAGAACTGAATGTCAGATAACAAATTACAAACGGTATAACGCCACAACACATTATTACTGCATCTGCACTACATCTCATTGCATCTT                                                                        ]
[+] EMBL BX612021             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATCATGTATATTTACAATAAGGTTTGCTGTATGATATAATGCTTGAGATACTCTTTTTTGATAACAAAACACTCTTAC ACATGTCGATACGCGATGTACAATATTGTCTATGATCGAGAGATCTGTTTTAGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CNS09PEZ             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCATGTATATTTACAATAAGGTTTGCTGTATGATATAATGCTTGAGATACTCTTTTTTGATAACAAAAAACTCTAACAACAAGTCGATACGTGATGTACAATATTGTCTATGATCGAGAGATCTGTTTTAGTCGAGAGTTGTTTTTCCATCGAGTAATCTGTAAAATTAAGTGTATTAGTATAGTTTAACATCTCTTGAACTTTGAACAACTTCGAACATCAAAAGGTCTTGTTGCCTTAACTGGAGGATAAAAGCGAGGGCCATCAGTACTTTGAGACTAACTAGACGAACTGGTTTACTGATGGAGGAGGGTAGAGAATAATCGATAGTATTTCCTCTACTACTAAGCATAACTATCTGTAATGTACGCCAACGAAAATTAACTTCCCATAATATAAAAAAATGAAAATCAGAACAGCAATAATGAAACGGTTCAAAACAATTCTCCTTTACGGTAGGAAGGACAATAGGGCATACAGTTAAGCTCTACAAAACTTAGAACTGAATGTCAGATAACAAATTACAAACGATATAACGCCACAACACATTATTACTGCATCTGCACTACATCTCATTGCATCTCTATCCTGTGCGCTCTTAAAGCACTTAATACTCTTAGCGTCAAATAAATAAAGCATAATTCCACATACACAAT]




>consensus_6311#0
ACCTGCAGCAGAACCCAAGCGTCTACTACAACAAGCCACTACCGATCGGGGTTATAGTAT
TGAAGGTTGGAGGAATGCGACGCTAGCGTGTAAGTTGGGTATCGCTTTCGGAATCTAACT
GACTACTTTAAGATAAGGTTCTACGTGCAGGTTTAATTTATTTAAGTTTGGAGAGCTGCA
AGACTTTTGTTTGATGTGTTAAGCAAGCAGTCCACATTACATTACCATACAATTACATTC
CAAAAGAATTGCGCACCTTTCGCAAAACATTCTAGCATGAGACGTTCGGTGCGCAGGCGG
ATCTGATTTAGCCCCTAAGTTGATTGTGATGTTTTTTCCCCTTTTCTTCAAATAATCATG
TATATTTACAATAAGGTTTGCTGTATGATATAATGCTTGAGATACTCTTTTTTGATAACA
AAACACTCTTACACATGTCGATACGTGATGTACAATATTGTCTATGATCGAGAGATCTGT
TTTAGTCGAGAGTTGTTTTTCCATCGAGTAATCTGTAAAATTAAGTGTATTAGTATAGTT
TAACATCTCTTGAACTTTGAACAACTTCGAACATCAAAAGGTCTTGTTGCCTTGACTGGA
GGATAAAAGCGAGGGCCATCAGTACTTTGAGACTAACTAGACGAACTGGTTTACTGATGG
AGGAGGGTAGAGAATAATCGATAGTATTTCCTCTACTACTAAGCATCACTATCTGTAATG
TACGCCAACGAAAATTAACTTCCCATAATATAAAAAAATGAAAACCAGCACAGCAATAAT
GAAACGGTTCAAAACAAGTCTCCTTTACGGTAGGAAGGACAATAGGGCATACAGTTAAGC
TCTACAAAACTTAGAACTGAATGTCAGATAACAAATTACAAACGGTATAACGCCACAACA
CATTATTACTGCATCTGCACTACATCTCATTGCATCTTTATCCTGTGCGCTCTTAAAGCA
CTTAATACTCTTAGCGTCAAATAAATAAAGCATAATTCCACATACACAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)