cluster # 6540

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 6540 cluster # 6540 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6540#0 length = 1507 sequences # 5
consensusID : consensus_6540#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1507
fasta sequence
                              [TTAGCATAGAGGCATCGTTTACTATTCAATTGGGATAAGAATAATATCCATGCGATTATATGATGAGGATGTCACTTATTTATGTATGATTGTGTACATTAAACAATAGAAGCATAATTGTAAGCACTAATTGTAGCTTCTGTTTAGTCGTGAAGACTCTGCCCTTAACCAGCACCATCCTAATCTTCACTTGTACTTTTAGAATAACGCCTTATGAACTAAACTTCTATGGCAGTCGTAAAATATAGTTCTGAGAGGATTTTTGCATTTTTCAATTACTATGCTGTTCGTTTTTGTTCTACAAAGACAATTTAATGTTAATTAGACACAGATTCACAATTCATCCATCCTTTGTATGTTTCATTGTTTCTATTTCATATATTGATGTTTTGTAAAAAAAATATTTATACTCTTATTTCTTGGTTGAAACTACAGATTCCGATTTACTAATGTTTATTGATTTTATAACATTATTTTATACATAAAATATTGATTTATGCCTTTTAGTGTACCTCCACCTAAAGCACGTGACTTACTACTTGTAAGATTAGTTATACGCAAATGCTGCCCATGTTTGCCACACAAATGGTTTAAAATGTTACAGTGATACGTCACATATCTCTTGCGTCTGATTAGTCCATATTACTTGCCTTCATTGAGATCATTCGTCATTGCATATAACATTATTTAAGATACATATATTTTTCTACAAGTATACTAATGCTCAACTATACCGGGTGATTTTTTGCAAGTGCTACATTAGTGAAATATTTTATATGATGTTATCTTTACATAAAATGTTTGTGTTTGTTTATTAGTTTCGGTTCAACATTAAATCCTCACACTACTGTGATTACAAACTAGAAGAATCAAACCAAATACCTCATATCCGATGTACATTCAACACGGTATAACCAAACGTATATATTTCGTGTGAAAGTCATTTCTTGCCATTAATTGTAATCCATAATATGTATCAAACAAATAAAAATGAATCATAACATCATTCGCCTGCTTGAAGAATTAGCTACAACAAATGCAATATAATAAAATGAATAAATCATCAAACAAGAATAAGTACATACATTTTTTTCCAGGCTCAAAATCAAATCCACGTCTTACAAAATTTTACAAGATTCCTGTTTCATTTACTCAAACTAATAAATACGTATCTGTTTTGCACATTAATTTTCCTAGCCAAAGCTCATACAACGGGCATGAGTACAGATTTAATATACATGATGGAGTTTATGATTATTGCATATTTTGTTGTGTGTTACGTTTAGATTGTATTATCTTTAAAAAGTACTGTACAATGCTACACATGTCACATTCGATACATTTGGAATATACTGTGTTATTACTCGAATGGTATGCAATATTTTTTAAATGCTTCACCATATCATGTATACCTTAACGGAAATGAAGGAAATATTGCAGTATTGTTAATTTTATTTAAAACAAAATGCTTTATAAATCTTTTGTGTGTACATCTCAATTTTACACG]

[-] EMBL BX613570             [TTAGCATAGAGGCATCGTTTACTATTCAATTGGGATAAGAATAATATCCATGCGATTATATGATGAGGATGTCACTTATTTATGTATGATTGTGTACATTAAACAATAGAAGCATAATTGTAAGCACTAATTGTAGCTTCTGTTTAGTCGTGAAGACTCTGCCCTTAACCAGCACCATCCTAATCTTCACTTGTACTTTTAGAATAACGCCTTATGAACTAAACTTCTATGGCAGTCGTAAAATATAGTTCTGAGAGGATTTTTGCATTTTTCAATTACTATGCTGTTCGTTTTTGTTCTACAAAGACAATTTAATGTTAATTAGACACAGATTCACAATTCATCCATCCTTTGTATGTTTCATTGTTTCTATTTCATATATTGATGTTTTGTAAAAAAAATATTTATACTCTTATTTCTTGGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL BM596811             [                                                                         ACTTATTTATGTATGATTGTGTACATTAACCAATAGAAGCATAATTGTAAGCACTAATTGTAGTTTCTGTTTAGTCGTGAAGACTCTGCCCTTAACCAGCACCATCCTAATCTTCACTTGTACTTTTAGAATAACGCCTTATGAACTAAACTTCTATGGCAGTCGTAAAATATAGTTCTGAGAGGATTTTTGTATTTTTCAATTACTATGCTGTTCGTTTTTGTTCTACAAAGACAATTTAATGTTAATTAGACACAGATTCACAATTCATCCATCCTTTGTATGTTTCATTGTTTCTATTTCATATATTGATGTTTTGTAAAAAAAATATTTATACTCTTATTTCTTGGTTGAAACTACAGATTCCGATTTACTAATGTTTATTGATTTTATAACATTATTTTATACATAAAATATTGATTTATGCCTTTTAGTGTACCTCCACCTAAAGCACGTGACTTACTACTTGTAAGATTAGTTATACGCAAATGCTGCCCATGTTTGCCACACAAATGGTTTAAAATGTTACAGTGATACGTCACATATCTCTTGCGTCTGATTAGTCCATATTACTTGCCTTCATTGAGATCATTCGTCATTGCATATAACATTATTTAAGATACATATATTTTTCTACAAGTATACTAATGCTCAACTATACCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL BM657430             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCGTCATTGCATATAACATTATTTAAGATACATATATTTTTCTACAAGTATACTAATGCTCAACTATACATAGTGATTTTTTGCAAGTGCTACATTAGTGAAATATTTTATATGATGTTATCTTTACATAAAATGTTTGTGTTTGTTTATTAGTTTCGGTTCAACATTAAATCCTCACACTACTGTGATTACAAACTAGAAGAATCAAACCAAATACCTCATATCCGATGTACATTCAACACGGTATAACCAAACGTATATATTTCGTGTGAAAGTCATTTTTTGCCATTAATTGTAATCCATAATATGTATCAAACAAATAAAAATGAATCATAACATCATTCGCCTGCTTGAAGAATTAGCTACAACAAATGCAATATAATAAAATGAATAAATCATCAAACAAGAATAAGTACATACATTTTTTTCCAGGCTCAAAATCAAATCCACGTCTTACAAAATTTTACAAGATTCCTGTTTCATTTACTTAAACTAATAAATACGTATCTGTTTTGCACATTAATTTTCCTAGCCAAAGCTCATACAACGGGCATGAGTACAGATTTAATATACATGATGGAGTTTATGATTATTGCATATTTTGTTGTGTGTTACGTTTAGATTGTATTATCTTTAAAAAGTACTGTACAATGCTACACATGTCACcgg                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AGA281608            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGTGCTACATTAGTGAAATATTTTATACGATGTTATCTTTACATAAAATGTTTGTGTTTGTTTATTAGTTTCGGTTCAACATTAAATCCTCACACTACTGTGATTACAAACTAGAAGAATCAAACCAAATACCTCATATCCGATGTACATTCAACACGGTATAACCAAACGTATATATTTCGTGTGAAAGTCATTTCTTGCCATTAATTGTAATCCATAATATGTATCAAACAAATAAAAATGAATCATAACATCATTCGCCTGCTTGAAGAATTAGCTACAACAAATGCAATATAATAAAATGAATAAATCATCAAACAAGAATAAGTACATACATTTTTTTCCAGGCTCAAAATCAAATCCACGTCTTACAAAATTTTACAAGATTCCTGTTTCATTTACTCAAACTAATAAATACGTATCTGTTTTGCACATTAATTTTCCTAGCCAAAGCTCATACAACGGGCATGAGTACAGATTTAATATACATGATGGAGTTTATGATTA TGCATATTTTGTTGTGTGTTACGTTTAGATTGTATTATCTTTAAAAAGTACTGTACAATGCTACACATGTCACATTCGATACATTTGGAATATACTGTGTTATTACTCGAATGGTATGCAATATTTTTTAAATGCTTCACCATATCATGTATACCTTAACGGAAATGAAGGAAATATTGCAGTATTGTTAATTTTATTTAAAACAAAATGCTTTATAAATCTTTTGTGTGTACATCTCAATTTTACACG]
[-] EMBL BX614154             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CCTCATATCCGATGTACATTCAACACGGTATAACCAAACGTATATATTTCGTGTGAAAGTCATTTCTTGCCATTAATTGTAATCCATAATATGTATCAAACAAATAAAAATGAATCATAACATCATTCGCCTGCTTGAAGAATTAGCTACAACAAATGCAATATAATAAAATGAATAAATCATCAAACAAGAATAAGTACATACATTTTTTTTCAGGCTCAAAATCAAATCCACGTCTTACAAAATTTTACAAGATTCCTGTTTCATTTACTCAAACTAATAAATACGTATCTGTTTTGCACATTAATTTTCCTAGCCAAAGCTCATACAACGGGCATGAGTACAGATTTAATATACATGATGGAGTTTATGATTATTGCATATTTTGTTGTGTGTTACGTTTAGATTGTATTATCTTTAAAAAGTACTGTACAATGCTACACATGTCACATTCGATACATTTGGAATATACTGT                                                                                                                                                       ]




>consensus_6540#0
TTAGCATAGAGGCATCGTTTACTATTCAATTGGGATAAGAATAATATCCATGCGATTATA
TGATGAGGATGTCACTTATTTATGTATGATTGTGTACATTAAACAATAGAAGCATAATTG
TAAGCACTAATTGTAGCTTCTGTTTAGTCGTGAAGACTCTGCCCTTAACCAGCACCATCC
TAATCTTCACTTGTACTTTTAGAATAACGCCTTATGAACTAAACTTCTATGGCAGTCGTA
AAATATAGTTCTGAGAGGATTTTTGCATTTTTCAATTACTATGCTGTTCGTTTTTGTTCT
ACAAAGACAATTTAATGTTAATTAGACACAGATTCACAATTCATCCATCCTTTGTATGTT
TCATTGTTTCTATTTCATATATTGATGTTTTGTAAAAAAAATATTTATACTCTTATTTCT
TGGTTGAAACTACAGATTCCGATTTACTAATGTTTATTGATTTTATAACATTATTTTATA
CATAAAATATTGATTTATGCCTTTTAGTGTACCTCCACCTAAAGCACGTGACTTACTACT
TGTAAGATTAGTTATACGCAAATGCTGCCCATGTTTGCCACACAAATGGTTTAAAATGTT
ACAGTGATACGTCACATATCTCTTGCGTCTGATTAGTCCATATTACTTGCCTTCATTGAG
ATCATTCGTCATTGCATATAACATTATTTAAGATACATATATTTTTCTACAAGTATACTA
ATGCTCAACTATACCGGGTGATTTTTTGCAAGTGCTACATTAGTGAAATATTTTATATGA
TGTTATCTTTACATAAAATGTTTGTGTTTGTTTATTAGTTTCGGTTCAACATTAAATCCT
CACACTACTGTGATTACAAACTAGAAGAATCAAACCAAATACCTCATATCCGATGTACAT
TCAACACGGTATAACCAAACGTATATATTTCGTGTGAAAGTCATTTCTTGCCATTAATTG
TAATCCATAATATGTATCAAACAAATAAAAATGAATCATAACATCATTCGCCTGCTTGAA
GAATTAGCTACAACAAATGCAATATAATAAAATGAATAAATCATCAAACAAGAATAAGTA
CATACATTTTTTTCCAGGCTCAAAATCAAATCCACGTCTTACAAAATTTTACAAGATTCC
TGTTTCATTTACTCAAACTAATAAATACGTATCTGTTTTGCACATTAATTTTCCTAGCCA
AAGCTCATACAACGGGCATGAGTACAGATTTAATATACATGATGGAGTTTATGATTATTG
CATATTTTGTTGTGTGTTACGTTTAGATTGTATTATCTTTAAAAAGTACTGTACAATGCT
ACACATGTCACATTCGATACATTTGGAATATACTGTGTTATTACTCGAATGGTATGCAAT
ATTTTTTAAATGCTTCACCATATCATGTATACCTTAACGGAAATGAAGGAAATATTGCAG
TATTGTTAATTTTATTTAAAACAAAATGCTTTATAAATCTTTTGTGTGTACATCTCAATT
TTACACG
clustalw multiple alignements is not computed in this case