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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7149#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1672 fasta sequence
[ATCGTCCTGCTTTTCGGCAAACACGAATAGATGCGTTTGGAATTTCATAATGCTGATGCGTCACCTGGTTAGGGAAATAGATTGCCCCACGAATGCTGGAGTTAGGAACTAAAAATGTCGTGAAGCGCAGGACTTACCTGTACTGCTTTCGTAACGAACCTTTCGGAAAGGAGTTCGGATGAATGAAACATTGCCTTTGCTTTGCTGCAAACCTTTCCCTTATACATCAGTAATCGTCCGGCTTGGAACGGGTTTTTATTACATCG-TTTTTTCTGTTTTGTTTTTGATTAACAAGATACGAGACGGTGGCACATGGCAGTCTCCGTACAGCTAGGTATTGTATTGATGATAGTTTTATTCGTTCGGGCACTCGAGCCCAGCGCTGCTTCATACTGCTCTGTCTCTAATGTTCTTTCCCGCTGTGAAGTGCGAATCTATTTAAAATACATTTTACACATATACTTCCCCAACATTCATACACACGGACACACATACACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTACCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTGCCTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGTTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCACATATTGGCCGGTTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCGGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAACAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCAACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCGCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGACATCTTGTCTTTGAAAAGAGAGCAAGGGAAC-----GAAGTGTTGTTAGAAAAATAAAACCATTAAAAGGGTATCGGTTTGATTCCGCGGTTCACAACGAATGACTTTGACTGTTTGCATACATGTTAGTCATCGGCGGAACGGAACGGCTGCGAAGGAACGGCTTAAGGGCAACCAAAGGGAGGCAGCGTTATTTGTCCACCATCGTGCCACTTTAGACCGTGTGTATAAGCGTGTGAGCGGGTGTGCGCGCACGCCTTGCATTATTGAACTGCACAGATGCAGTTTCCCACCTACGCTGTACGCTACGTCGTCTCAACATAAGTTCATTTCTATTGTTCCCTTGGAGTCGTATTGGTTTTCCATTCTGCCGTACGGCGTGTACTGGTTCTAATTGTCCAGTTTTCACTCTTTTTGCAGGGCCACTATATTGTATTAGAATCGTTTGCTTCCCCACCTCTTTTGGGTATGTATAGGAGAAGAGGATCAGTCGTGCTTTTGTGTTCTTCTTGTGCTCTGTTTCTTCGCTCCGTTCCGATAGTGTTTGATATTTAAGTTTCAGTTGTGGCGGGGTTTGCCCTGCATCACAATCAATAT]
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[-] EMBL BX612831 [ TTTCCCTTATACATCAGTAATCGTCCGGCTTGGAACGGGTTTTTATTACATCGTTTTTTTCTGTTTTGTTTTTGATTAACAAGATACGAGACGGTGGCACATGGCGGGCTCCGTACAGCTAGGTATTGTATTGATGATAGTTTTATTCGTTCGGGCACTCGAGCCCAGCGCTGCTTCACACTGCTCTGTCTCTAATGTTCTTTCCCGCTGTGAAGTGCGAATCTATTTAAAATACATTTTACACATATACTTCCCCAACATTCATACACACGGACACACATACACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTACCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTACCTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGGTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCACATATTGGCCGATTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCCGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGTACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAACAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCAACGTTCAAGGAACAGGTTGCA ]
[+] EMBL CNS094OD [ CAGTAATCGTCCGGCTTGGAACGGGTTTTTATTACATCG TTTTTTCTGTTTTGTTTTTGATTAACAAGATACGAGACGGTGGCACATGGCAGTCTCCGTACAGCTAGGTATTGTATTGATGATAGTTTTATTCGTTCGGGCACTCGAGCCCAGCGCTGCTTCATACTGCTCTGTCTCTAATGTTCTTTCCCGCTGTGAAGTGCGAATCTATTTAAAATACATTTTACACATATACTTCCCCAACATTCATACACACGGACACACATACACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTACCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTGCCTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGTTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCACATATTGGCCGGTTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCGGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAGCAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCAACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCGCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGACATCTTGTCTTTGAAAAGAGAGCAAGGGAAC GAA TTTTGTTAGAAAAAT AAACCATTAAAAGGGTATCG ]
[-] EMBL CNS09AQK [ TCCCCAACATTCATACACACGAAAACACATAAACTCCTTCGGTATATTTATGGGGCCAGTTTCGGGAACCGTTCCTACCGTCAACAAGCCAATTAAAATTTGTTCCATTCACAGACTTAGAGCCTACCTTTAATTGCCTCAATCCTTGGCCGGGAAGGAACCATTTTCCTGTCGGACGTGCATGCCATGTTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTTTGGAGTGCGTCGAGCCACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCAAATATTGGCCGGTTTTCTCCCCCTCCTCTGTATTATACGGTTCCCGCCCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCATGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGATACGGTACACAAAACACCACAGTTAAAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCGGACCTAACCGACCGGCGGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTTAAATTGTTGGAAAACAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACGCCAACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCGCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGACATCTTGTCTTTGAAAAGAGAGCAAGGGAACGAAGTGAAGTGTTGTTAGAAAAATAAAA ]
[-] EMBL BX627806 [ GCATGCCATGTTTTTGGCGGCTTGGCAGCCATTTATGGAGTGCGTCGAGCTACTGGCGACGTTAACGGTTAACATAAACCACATATTGGCCGGTTTTCTCCCTCACCTCTGTATTATACGGTTCCCGCTCTAGTAGCTTTCGGTTATTTATAGGTAAACGTGTTATAATCATCATCATCACAGCTATTCGTGTGTATTCGAGAAAGGCAATTTAAAACTGCAGAAAACACGGACACGGACACGGTACACAAAACACCACAGTTACAAAACACCCACCGTAACGTTAACTCCCCCCGACCTAACCGACCGGCTGCAATCGATGGTGGACGATTTTTTT TATTGTTGGAAAACAGAAGAAACTTCGCAGAGGGACACCAACGTTCAAGGAACAAGTTGCATTTTTCATTTCTCGAACATCGATAAGGACACAGACAAGACATCTTGTCTTCCAAAAGAGAGTAAGGGAAC GAAGGGTTTTTGGAAAAATAAAACCATTAAAAGGGTATCTGTTTGATTCCGCGGTTCACAACGAATGACTTTGACTGTTTGCATACATGTTAGTCATCGGCGGAACGGAACGGCTGCGAAGGAACGGCTTAAGGGCAACCAAAGGGAGGCAGCGTTATTTGTCCACCATCGTGCCACTTTAGACCGTGTGTATAAGCGTGTGAGCGGGTGTGCGCGCACGCCTTGCATTATTGAACTGCACAGATGCAGTTTCCCACCTACGCTGTACGCTACGTCGTCTCA ]
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clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||