These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7382#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1164 fasta sequence [AATTTATAATATCTTTCTTTATTGAACTCGCGCAATTAGTATCCAGTTTCTGCTTCTGCTTTGTGTGTGAGTTTGTGTGTAGTGTTATATCTCACTTGCTTGATGTACTCTGCTG-CCTGTAACGCTGGCCAGGCTGCTCTCGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATGTTTTTTCCTTTTTCTTCACTTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTTTGTTTTCATGTTTCTGCTCG-TTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTGTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACCGGTAATACTGTCCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTCCATAGAATTTAGCTACTTTTAGCGACGGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTGACAAGGGGG-TGTTTATTGTATCGTTTAAAACCGGTTAAATTCGAACTACGGAGAAACAAATCAATAGCCTAGTAGGAGAATAGATGTGAATAACAGTGAAAGAAT-GGTAACAGTGTTAGCTTA-GATACGCCCGCCCGTCGGTGGGGTTTAGACATCCTTCTCGGCCGAATGTGCGCCACGCGCATTATGCTCTGCTGCAGAAAAGAGGGAACAATATGTTCTTGCTACTTTCACTACTCATGCAAT] [+] EMBL CNS08PP0 [AATTTATAATATCTTTCTTTATTGAACTCGCGCAATTAGTATCCAGTTTCTGCTTCTGCTTTGTGTGTGAGTTTGTGTGTAGTGTTATATCTCACTTGCTTGATGTACTCTGCTG CCTGTAACGCTGGCCAGGCTGCTCTCGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATGTTTTTTCCTTTTTCTTCACTTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTTTTTTGCATAAACAGAAACCGAA GTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTTTGTTTTCATGTTTCTGCTCG TTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTTTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACCGGTAATACTGTTCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTTCATAGAATTTAGCTACTTTTAGCGACGGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTTAC ] [+] EMBL CNS08CLD [ TATTGAACTCGCGCAATTAGTATCCAGTTTCTGCTTCTGCTTTGTGTTTTAGTATTTTTATAGTGTTATATCTCACTTGCTTGATGTACTCTGCTG CCTGTAACGCTGGCCAGGCTGCTCTTGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTTTTGTAATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTTTTTTTTGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATAT ] [-] EMBL BM631033 [ TTCCTTGATGTACTCTGCTGCCCTGTAACGCTGGCCAGGCTGCTCTCGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTC TTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATG TTTTTCCTTTTTCTTCACGTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTATGTTTGTTTTCATGTTTCTGCTCGTTTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTcgg ] [-] EMBL CNS08POZ [ gtaAACGCTGGCCAGGCTG TCTCGCACTCCTCCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGAGTTGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATGTTTTTTCCTTTTTCTTCACTTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTATGTTTTCATGTTTCTGCTCG TTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTGTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACCGGTAATACTGTCCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTCCATAGAATTTAGCTACTTTTAGCGACGGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTGACAAGGGGG TGTTTATTGTATCGTTTAAAACCGGTTAAATTCGAACTACGGAGAAACAAATCAATAGCCTAGTAGGAGAATAGATGTGAATAACAGTGAAAGAAT GGTAACAaaa ] [-] EMBL BX617239 [ CCTTCCAATTGCTTACTTTACGCGTTTACAAGATATATGTATAATAACTTACACATTATTGGCTTTGCTTTAGTTTAGTGTTTCTTCAGAATGTAACAGTTTTCAGGCTAGCTCGAGACGAAAGAGGGA GTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGTAAATATTTAACAGTTTCCTACTTTCCTGCTAGGAGTATTTGTTGTGATTTCTTTTGTTTTCTTTATCGTTTTGTTTGATTTTGTGTTTGTCGCTTTTACTTTTTGGTATAGTTTTGCTTATATGTTTTTTCTTTTTTCTTCACTTACACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTTTGTTGTCATGTTTCTGTTCG TGTTTTGTTTCTTCATATTCGCTTGTAGTCAC ] [-] EMBL BX615490 [ ACAACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTGTGTTTGTTGTCATGTTTCTGTTCG TGTTTTGTTTCTTCATATTCGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCTATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTGTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACAAGTAATACTGTCCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTCCATAGAATTTAGCTACTTTTAGCGACGGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTGACAAGGGGG TGTTTATTGTATCGTTTAAAACCGGTTAAATTCGAACTATGGAGAAACAAATCAATAGCCTAGTAGGAGAATAGATGTGAATAACAGTGAAAGAATGGGTAACAGTGTTAGCTTA GATACGCCCGCCCGTCGGTGGGGTTT ] [-] EMBL BX623484 [ ACTACACTTTCTTTCTTACGCTCCTTCCTGCTTTGCATAAACAGAAACCGAAGGTAGAATTTATATACTAAAGTGGTTTGGTTTGTTATGTTTTATGTTTGTTTTCATGTTTCTGCTCGTTTTTTTTTGCTTCTTCATATTAGCTTGTAGTCACTTTACTGCTTTTGGATTAGCTTTTACTTCTTACTTTATTTGCATTCGTTCAATGGAGAGCTTATGCAGAACGCGTTCTATTTTTAACCTGTGTTGGATATAGGGAGTTTCGCTAGCTTTGGCTATGTACACAAGTAATACTGTCCACCGCTTAGCTATTGGTGGTCCGCCGATTTGAGCTTTTAGAAGGGGAAGAATTGAAGTAGAACTGTAGTCCATAGAATTTAGCTACGTTTAGCGACCGATAAGGAATTGGACTGACGCTGATATGAATACGAACAGATGGTCCATCCCCACTAGTGGCAAACAGTGATAGGGGGGTTGTTTATTGTATCGTTTAAAACCGGTTAAATTCGAACTACGGAGAAACAAATCAATAGCCTAGTAGGAGAATAGATGTATAGAACAGTGAAAGAATGGGTAACAGTGTTAGCTTAGGATAC CCCGCCCGTCGGTGGGGTTTAGACATCCTTCTCGGCCGAATGTGCGCCACGCGCATTATGCTCTGCTGCAGAAAAGAGGGAACAATATGTTCTTGCTACTTTCACTACTCATGCAAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||