These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7628#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1471 fasta sequence [TCCTGGGTAGGTGCTTTGTCTCAATTTTTAGGTACGGATTTCAACCCACTCAAGGCTCAAAATTATTCGTCTTGCGCGCCGTGGCAGTGCCGAGCAATAAAATTTCAAACTTCGAGCAAGGAATTAAACAGCGTGCCAGCGTCATATTTCGGTGGTGGCAGTTAAATCGCCAAGCGTAGAAAATTTGTGCTCCAGATATTTTGTTTATCCGAACGGCAAGAAGGGTTTGACAATGATGTCATTGTCAATAGCCCGGCCGCGATACATGATCGCCGACCGACTGGAGCGAGATACGGCGTGCGAGGGGAGTGCAGAGCGAGAAAAGTGTTCCCTTCGCTGCTCACTGCATCCTCCGGATATATATGTCGGCTCAGAATTTTCAGGTCTGAGCGCCCGCTTATCGTTGCGTTACGGGGCCCCCGATCGGGCAGTGCCGGAATGCCTAGGCAGTAAAACTCAAGTGTTCCGGTTTGTTCAAGGAATTGGACCGTTTGAAGGGGAAATTTGTCACGTCCCTAGCGCTCCGATTTGACACGAAACACTTCTGTGCTGCTTAATAGCGGGAAGCTAAAATCAGAATCCTGCAAAATAGGCAAATATGATGCGTATCGCAAACAGGAAGTATCTTTAGTTTCTTTATCTTCTGTCGTTAAAACGCTCTGGTTGCTCCTCTGGCAAAGTCAGCATCTTCATCGCTAGGCTTGTTAATCATTTCCTGATTCATCATCTTTGCATATCGCATTTACACTGTTCTACACGAGTCCCAGTAAACAATCTTAAGATGCTTTAAACATTGTTTTACGATAAGTAAACATTTGACATCCAACTGAAATGCGGATGCGTATCCGAGCATGGCCTATCCATCGCTGCTAAAATATTTGCTTCCTCTAGAATTATATTTGCTTTCTCCAGTACCCAGGCTCGTTCCTTTTTAATGTTTATTTTGTTGCTAATGAGTTGATCTCGTATGTATTTAATAGTCCATAAATAATTTTGGAGGTAACAGGGGATTACAGCGAACTGGATCAGGCGAAGCGAGACCTGTCGGAGATCGGGTGTCTACATGGATGGGATCGAGCATCCTGGAAAATAATTGTTGACCGGGCCATGTTACACCGACGTGCTCTATCGTGAGCAGGCCAACAAGAGAGAATAATTTTAGAGGTATCGAGATAAATTCTAATGCTTATCAATTAGTTATATTTTTCGTAAATGAAGGCACACACAAAAACCCTCAACTCCATGAAGCAAACGGGTCACCTAAGGGGTTTCAATTGTTCAGATACGATTGAACACTGTTCAGATTGGCATCAGTATTTCCGTTGACTGTGAAATGTTTACTTATAGTTGCACAATATTCAAAAGCACCTTTGTTGGGCTCGAAAACGGTGTATCTAGCTACTCGTTTGCTGATTCATTTTATCTGTACGTGTACTGTCATCCCTTCACAACACGTTGATCGTATTATACT] [+] EMBL CNS08TVO [TCCTGGGTAGGTGCTTTGTCTCAATTTTTAGGTACGGATTTCAACCCACTCAAGGCTCAAAATTATTCGTCTTGCGCGCCGTGGCAGTGCCGAGCAATAAAATTTCAAACTTCGAGCAAGGAATTAAACAGCGTGCCAGCGTCATATTTCGGTGGTGGCAGTTAAATCGCCAAGCGTAGAAAATTTGTGCTCCAGATATTTTGTTTATCCGAACGGCAAGAAGGGTTTGACAATGATGTCATTGTCAATAGCCCGGCCGCGATACATGATCGCCGACCGACTGGAGCGAGATACGGCGTGCGAGGGGAGTGCAGAGCGAGAAAAGTGTTCCCTTCGCTGCTCACTGCATCCTCCGGATATATATGTCGGCTCAGAATTTTCAGGTCTGAGCGCCCGCTTATCGTTGCGTTACGGGGCCCCCGATCGGGCAGTGCCGGAATGCCTAGGCAGTAAAACTCAAGTGTTCCGGTTTGTTCAAGGAATTGGACCGTTTGAAGGGGAAATTTGTCACGTCCCTAGCGCTCCGATTTGACACGAAACACTTCTGTGCTGCTTAATAGCGGGAAGCTAAAATCAGAATCCTGCAAAATAGGCAAATATGATGCGTATCGCAAACAGGAAGTATCTTTAGTTTCTTTATCTTCTGTCGTTAAAACGCTCTGGTTGCTCCTCTGGCAAAGTCAGCATCTTCATCGCTAGGCTTGTTAATCATTTCCTGATTCATCATCTTTGCATATCGCATTTACACTGTTCTACACGAGTCCCAGTAAACAATCTTAAGATGCTTTAAACATTGTTTTACGATAAGTAAACATTTGACATCCAACTGAAATGCGGATGCGTATCCGAGCATGGCCTATCCATCGCTGCTAAAATATTTGCTTCCTCTAGAATTATATTTGCTTTCTCCAGTACCCAGGCTCGTTCCTTTTTAATGTTTATTTTGTTGCTAATGAGTTGATCTCGTATGTATTTAATAGT ] [+] EMBL CNS08UUZ [ GCTTTGTCTCAATTTTTAGGTACGGATTTCAACCCACTCAAGGCTCAAAATTATTCGTCTTGCGCGCCGTGGCAGTGCCGAGCAATAAAATTTCAAACTTCGAGCAAGGAATTAAACAGCGTGCCAGCGTCATATTTCGGTGGTGGCAGTTAAATCGCCAAGCGTAGAAAATTTGTGCTCCAGATATTTTGTTTATCCGAACGGCAAGAAGGGTTTGACAATGATGTCATTGTCAATAGCCCGGCCGCGATACATGATCGCCGACCGACTGGAGCGAGATACGGCGTGCGAGGGGAGTGCAGAGCGAGAAAAGTGTTCCCTTCGCTGCTCACTGCATCCTCCGGATATATATGTCGGCTCAGAATTTTCAGGTCTGAGCGCCCGCTTATCGTTGCGTTACGGGGCCCCCGATCGGGCAGTGCCGGAATGCCTAGGCAGTAAAACTCAAGTGTTCCGGTTTGTTCAAGGAATTGGACCGTTTGAAGGGGAAATTTGTCACGTCCCTAGCGCTCCGATTTGACACGAAACACTTCTGTGCTGCTTAATAGCGGGAAGCTAAAATCAGAATCCTGCAAAATAGGCAAATATGATGCGTATCGCAAACAGGAAGTATCTTTAGTTTCTTTATCTTCTGTCGTTAAAACGCTCTGGTTGCTCCTCTGGCAAAGTCAGCATTTTCATCGCTAGGCTTGTTAATCATTTCCTGATTCATCATCTTTGCATATCGCATTTACACTGTTCTACACGAGTCCCAGTAAACAATCTTAAGATGCTTTAAACATTGTTCTACGATAAGTAAACATTTGACATCCAACTGAAATGCGGATGCGTATCCGAGCATGGCCTATCCATCGCTGCTAA ] [+] EMBL CNS08JFN [ CCTCCGGATATATATGTCGGCTCAGAATTTTCAGGTCTGAGCGCCCGCTTATCGTTGCGTTACGGGGCCCCCGACCGGGCAGTGCCGGAATGCCTAGGCAGTAAAACTCAAGTGTTCCGGTTTGTTCAAGGAATTGGACCGTTTGAAGGGGAAATTTGTCACGTCCCTAGCGCTCCGATTTGACACGAAACACTTC ] [-] EMBL CNS08TVP [ GTGCTGCTTAATAGCGGGAAGCTAAAATCAGAATCCTGCAAAATAGGCAAATATGATGCGTATCGCAAACAGGAAGTATCTTTAGTTTCTTTATCTTCTGTCGTTAAAACGCTCTGGTTGCTCCTCTGGCAAAGTCAGCATCTTCATCGCTAGGCTTGTTAATCATTTCCTGATTCATCATCTAAAAATATCGCATTTACACTGTTCTACACGAGTCCCAGTAAACAATCTTAAGATGCTTTAAACATTGTTTTACGATAAGTAAACATTTGACATCCAACTGAAATGCGGATGCGTATCCGAGCATGGCCTATCCATCGCTGCTAAAATATTTGCTTCCTCTAGAATTATATTTGCTTTCTCCAGTACCCAGGCTCGTTCCTTTTTAATGTTTATTTTGTTGCTAATGAGTTGATCTCGTATGTATTTAATAGTCCATAAATAATTTTGGAGGTAACAGGGGATTACAGCGAACTGGATCAGGCGAAGCGAGACCTGTCGGAGATCGGGTGTCTACATGGATGGGATCGAGCATCCTGGAAAATAATTGTTGACCGGGCCATGTTACACCGACGTGCTCTATCGTGAGCAGGCCAACAAGAGAGAATAATTTTAGAGGTATCGAGATAAATTCTAATGCTTATCAATTAGTTATATTTTTCGTAAATGAAGGCACACACAAAAACCCTCAACTCCATGAAGCAAACGGGTCACCTAAGGGGTTTCAATTGTTCAGATACGATTGAACACTGTTCAGATTGGCATCAGTATTTCCGTTGACTGTGAAATGTTTACTTATAGTTGCACAATATTCAAAAGCACCTTTGTTGGGCTCGAAAACGGTGTATCTAGCTACTCGTTTGCTGATTCATTTTATCTGTACGTGTACTGTCATCCCTTCACAACACGTTGATCGTATTATACT] [-] EMBL CNS08UV0 [ CAAATATGATGCGTATCGCAAACAGGAAGTATCTTTAGTTTCTTTATCTTCTGTCGTTAAAACGCTCTGGTTGCTCCTCTGGCAAAGTCAGCATTTTCATCGCTAGGCTTGTTAATCATTTCCTGATTCATCATCTTTGCATATCGCATTTACACTGTTCTACACGAGTCCCAGTAAACAATCTTAAGATGCTTTAAACATTGTTCTACGATAAGTAAACATTTGACATCCAACTGAAATGCGGATGCGTATCCGAGCATGGCCTATCCATCGCTGCTAAAATATTTGCTTCCTCTAGAATTATATTTGCTTTCTCCAGTACCCAGGCTCGTTCCTTTTTAATGTTTATTTTGTTGCTAATGAGTTGATCTCGTATGTATTTAATAGTCCATAAATAATTTTGGAGGTAACAGGGGATTACAGCGAACTGGATCAGGCGAAGCGAGACCTGTCGGAGATCGGGTGTCTACATGGATGGGATCGAGCATCCTGGAAAATAATTGTTGACCGGGCCATGTTACACCGACGTGCTCTATCGTGAGCAGGCCAACAAGAGAGAATAATTTTAGAGGTATCGAGATAAATTCTAATGCTTATCAATTAGTTATATTTTTCGTAAATGAAGGCACACACAAAAACCCTCAACTCCATGAAGCAAACGGGTCACCTAAGGGGTTTCAATTGTTCAGATACGATTGAACACTGTTCAGATTGGCATCAGTATTTCCGTTGACTGTGAAATGTTTACTTATAGTTGCACAATATTCAAAAGCACCTTTGTTGGGCTCGAAAACGGTGTATCTAGCTACTCGTTTGCTGATTCATTTTATCTGTACGTGTACTGTCATCCCTTCACAACACGTTGATCGTA ] [-] EMBL CNS08JFO [ CGAGCATGGCCTATCCATGGCTGCTAAAATATTTGCTTCCTCTAGAATTATATTTGCTTTCTCCAGTACCCAGGCTCGTTCCTTTTTAATGTTTATTTTGTTGCTAATGAGTTGATCTCGTATGTATTTAATAGTCCATAAATAATTTTGGAGGTAACAGGGGATTACAGCGAACTGGATCAGGCGAAGCGAGACCTGTCGGAGAT ] [-] EMBL CNS08DA5 [ ACTGGGTCAGGCGAAGCGAGACCTGTCGGAGATCGGGTGTCTACATGGATGGGGTCGAGCATCCTGGAAAATAATTGTTGACCGGGCCATGTTACACCGACGTGCTCTATCG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||