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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7797#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 997 fasta sequence
[TTTTTCTGTAAAACGTTTGGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA-ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTTGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATGGGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGGTGTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTCGCAGTGTCTCTTGAAGTTCGATTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAACGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCAGGTGGGACACCTGCACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGACGAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTTTGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTGCAGATGGGACACTGGCAAGGTATAGCCTTCTTGAGGTGCCCTCTCAGCGTTTTCTTGGAGGTGAACGTTTGCTTGCACTTGTCACACCGGAACCGACCGTCCTGTGTCTCGGGACGTTTTTTGCTCCCTTCGGGTTCCATCGCTTCGTGCCAAGCAATGTGCTGCTTCATCTTTGCGACTCCTATCATTTGATCGCAGAGCGTGCACTTTGTTCGGTGCATCTTCTGTCGGTGTGCGATCAGCATCTTCCCATTCGGAAAGCTGCGGTTACACTCCGCACACGCAAACGTGTCATGGATAAAATGTCGG]
[+] EMBL CNS08LTU [TTTTTCTGTAAAA TTTGGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTACACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTGGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGAGGCCAGAGGGGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGAAGGGACACTTGCAAGGTGTACTACTATCCCTGTCCCTCTGTAAAAACACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCG ]
[+] EMBL CNS08LXA [ TTTTCTGT CAACGCCTGGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTTGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATGGGCTATTG CCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGGTGTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCT ]
[+] EMBL CNS08ZNO [ GTAAAAAGTTTTGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTTGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATGGGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGTTGTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTCGCAGTGTCTCTTGAAGTTCGATTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAACGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCAGGTGGGACA CTG ACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGGCGAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTTTGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTGCAGATGGGACACTGGCAAGGTATAGCCTTCTTGAGGTGCCCTCTCAGCGTTTTCTTGGAGGTGAACGTTTGCTTGCACTTGTCACACCGGAACCGACCGTCCTGTGTCTCGGGACGTTTTTTGCTCCCTTCGGGTTCCATCGCTT ]
[-] EMBL BX607736 [ TTTGGCTAGTTTATGTTTCTTAACATGTACAAACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACATGCTGCTGCCAGTTGTATCGGTTGTGGAACGCTTTCCCACACTTGTCACACCGGAATGCACGTTTGTGTGATGCCAGATGGGCTATTGCCCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTGCAGATGGGACACTTGCAAGGTGTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTAAAAGCACCTCATTTGCAAACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTCGCAGTGTCTCTTGAAGTTCGATTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAACGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCAGGTGGGACACCTGCACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGACGAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTTTGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTGCAGATGGGACACTGGCAAGGTATAGCCTTCTTGA ]
[+] EMBL CNS08P1O [ ATGTAC AACATACTTAAAATTTAGTACAATATTGATAAAGGTTACATTTCCTGCACTTCAACTTTA ACCTTCAACGCGTAATCCTTGGATTGAGACTTGCAGGGCACATCTCTTTGAACAT ]
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[+] EMBL CNS08LWS [ GTTTGTGTGATGCCAGAAGGGCTATTG CCTCTTGGGTCTTAGCAATACCTTTCAGATGGGACACTTGCAAGGTTTACTACTATCCCTGTGCCTCTGTA ]
[-] EMBL BM609753 [ ACGATTTGCCACACGTCTTACACCGGAACCGAGGCACGCTTGGAGTAGCATCTCCGGCTTCTCTCCCCTTGCAAATCTTCTCGCAGTGTCTCTTGCAGTTCGACTTGGTGGTAAACGTTTTACCGCACTGTTCACACCGCAACGACTCTTTGTGTGCATTCAGATGCTTTTTGGCCTTGCCAGGGCTTAGCACCTCCTTGCAGGTGGGACACCTGCACGGTAAAGCCTTTGCGGTGTGCCTTCTTAAACCTCGCTCATTGACGAACGATTTGTCGCACTTTTCACACTGGTACGGACCGTTGTGGGCCTCTAGATGTTGTTTTGCCTTTCGGGGATTTAACACTTTCTTGCAGATGGGACACTGGCAAGGTATAGCCTTCTTGAGGTGCCCTCTCAGCGTTTTCTTGGAGGTGAACGTTTGCTTGCACTTGTCACACCGGAACCGACCGTCCTGTGTCTCCGGACGTTTTTTGCTCCCTTCGGGTTCCATCGCTTCGTGCCAAGCAATGTGCTGCTTCATCTTTGCGACTCCTATCATTTGATCGCAGAGCGTGCACTTTGTTCGGTGCATCTTCTGTCGGTGTGCGATCAGCATCTTCCCATTCGGAAAGCTGCGGTTACACTCCGCACACGCAAACGTGTCATGGATAAAATGTCGG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||