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consensusID : consensus_7931#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 973 fasta sequence
[GTCCGTTTTATGATCTAGAACTTGCTGCGGTATTCGTGCAATGATAAATCTACGATAGCGCTGATTGTTAAAATTGCCATATAGAAACTGCAACATAAGCTGACGGCAGAATGGCCCAAAAAGCGCCA-CAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTGAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAAAACG-CCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAA-CCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTATCATTTGCG-TTTATCTACGGATCTATGACCGTTCCCTTGCGTCAACTCGCTACTACACATTGCAGAACAATGGA]
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[+] EMBL CNS09C1S [ CGTTTTATGATCTAGAACTTGCTGCGGTATTCGTGCAATGATAAATCTACGATAGCGCTGATTGTTAAAATTGCCATATAGAAACTGCAACATAAGCTGACGGCAGAATGGCCCAAAAAGCGCCA CAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCT ]
[+] EMBL CNS09KCL [ TTTATGATCTAGAACTTGCTGCGGTATTCGTGCAATGATAAATCTACGATAGCGCTGATTGTTAAAATTGCCATATAGAAACTGCAACATAAGCTGACGGCAGAATGGCCCAAAAAGCGCCA CAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTAAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAAAACGCCCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAACCCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTG ]
[-] EMBL CNS09CYO [ CTGACGGCAGAATGGCCCAAAAAGCGCCAGCAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTGAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAAAACG CCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAA CCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTATCATTTGCG TTTATCTACGGATCTATGACCGTTCCCTTGCGTCAACTCGCTACTACACATTGCAGAACAATGGA]
[-] EMBL CNS09KCK [ AATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTGAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAAAACG CCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAA CCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTATCATTTGCG TTTATCTACGGATCTATGACCGTTCCCTTGCGTCAACTCGCTACTACACATTGCAGAACAAT ]
[-] EMBL CNS09C1R [ GTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTATCATTTGCGTTTTATCTACGGATCTATG ]
consensusID : consensus_7931#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 598 fasta sequence
[ATGTGTCTGTTGTTATCACCAGCAGTGAAGCATACAGTTGTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTNTTCGGTTGCTGCTGCTGCTATTTGTTTCAGCTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTGCTAGAAAGCCTAATGCGTAAAACCGTGCTGCCTGTTGCTCTATCTTAATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAAGCCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGACTGTATTGGAGTTTCATGTTAAAGAGNAAAAGCCCAGAAACTCATCTGGTACACCATTTTGATAGTTCTNTAGAGGTAAGCGTNTGCTTATTGAATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAGAAAGCAAGTTGTGTCAAAGTGTTAAGTCGAGTTANAGTCAGAAGTGCTTTTAAGCGGATAAAAGTTTCTTTTCTACGTCGTTTGTCAACCGGAGTTTGGGGATCGCAAAATGTCTTGACAAACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCACTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTCCAAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCACCTCGGGCNATTCTTGC]
[-] EMBL AL931230 [ATGTGTCTGTTGTTATCACCAGCAGTGAAGCATACAGTTGTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTNTTCGGTTGCTGCTGCTGCTATTTGTTTCAGCTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTGCTAGAAAGCCTAATGCGTAAAACCGTGCTGCCTGTTGCTCTATCTTAATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAAGCCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGACTGTATTGGAGTTTCATGTTAAAGAGNAAAAGCCCAGAAACTCATCTGGTACACCATTTTGATAGTTCTNTAGAGGTAAGCGTNTGCTTATTGAATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAGAAAGCAAGTTGTGTCAAAGTGTTAAGTCGAGTTANAGTCAGAAGTGCTTTTAAGCGGATAAAAGTTTCTTTTCTACGTCGTTTGTCAACCGGAGTTTGGGGATCGCAAAATGTCTTGACAAACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCACTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTCCAAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCACCTCGGGCNATTCTTGC]
consensusID : consensus_7931#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 522 fasta sequence
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_7931#1 GCCCAGAAACTCATCTGGTACACCATTTTGATAGTTCTNTAGAGGTAAGCGTNTGCTTAT 331
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consensus_7931#0 TAATC-----AAATGCTTTTAAGCAGATAAAA-TTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAAT 684
consensus_7931#2 TAATC-----AAATGCTTTTAAGCGGATAAAA-TTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAAC 451
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*
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consensus_7931#2 --------------------------------------------------
consensus_7931#1 --------------------------------------------------
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| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||