cluster # 7953

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Anopheles gambiae
cluster # 7953 cluster # 7953 Sequences # 8 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_7953#0 length = 712 sequences # 6

consensus_7953#1 length = 424 sequences # 2

consensusID : consensus_7953#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 712
fasta sequence

                              [GCCTACTGGGAAAACGGTCCGCAACCATCGAGCGCGCGAAACCGCGGAAAGCAAAGTTTCACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCACTTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGCCTGGCCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGGCAGCAGTGGCAGCAGAACCGGTCGAGTTGGTGCAGCTGGTGCCGGCGGAAGAGCAGAATGCTGCCGCCGTTCCGGAGCCGGTCAGCGATGCGGAAGGTCAACGATCGAAGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGGATACGGAGGTGGCTATCACCGATACGGCTACCGGTACGGTGGATATGGTGGCGGCTTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTGACACTTGTGATGGTGCGTGCGTGCGT--GTGTGGTGTAAGACAATAAGCCAAAAATAAAACACAAAACTTTTTAATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCTCGAGCTGCAGGTCG]

[+] EMBL CNS091TZ             [GCCTACTGGGAAAACGGTGCACAACCATCGAGCGCGCGGAACCGCGGAAAGCAAAGTTTCACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCACTTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGCCTGGCCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGGCAGCAGTGGCAGCAGAACCGGTCGAGTTGGTGCAGCTGGTACCGGCGGAAGAGCAGAATGCTGCCGCCGTTCCGGAGCCGGTCAGCGATGCGGAAGGTCAACGATCGAAGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGGATACGGAGGCGGTTATCACCGATACGGCTACCGGTACGGTGGATATGGTGGCGGCTTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTGACACTTGTGATGGTGCGTGCGTGCGT  GTGTGGTGTAAGACAATAAGCCAAAAATAAAACACAAAACTTTTTAATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCTCGAGCTGCAGGTCG]
[+] EMBL BM633187             [                  CCGCAACCATCGAGCGCGCGAAACCGCGGAAAGCAAAGTTTCACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCACTTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGCCTGGCCATAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGGCAGCAGTGGCAGCAGAACCGGTCGAGTTGGTGCAGCTGGTGCCGGCGGAAGAGCAGAATGCTGCCGCCGTTCCGGAGCCGGTCAGCGATGCGGAAGGTCAACGATCGAAGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGGATACGGAGGTGGCTATCACCGATACGGCTACCGGTACGGTGGATATGGTGGCGGCTTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTGACACTTGTGATGGTGCGTGCGTGTGTGAGTGTGGTGTAAGACAATAA                                                                                     ]
[+] EMBL BM627672             [                  CCGCAACCATCGAGCGCGCGAAACCGCGGAAAGCAAAGTTTCACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCACTTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGCCTGGCCATAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGGCAGCAGTGGCAGCAGAACCGGTCGAGTTGGTGCAGCTGGTGCCGGCGGAAGAGCAGAATGCTGCCGCCGTTCCGGAGCCGGTCAGCGATGCGGAAGGTCAACGATCGAAGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGGATACGGAGGTGGCTATCACCGATACGGCTACCGGTACGGTGGATATGGTGGCGGCTTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTGACACTTGTGATGGTGCGTGCG                                                                                                               ]
[+] EMBL BM639819             [                                        ccgGCGGAAAGCAAAGTTTCACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCACTTCCTACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGCCTGGCCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTAATCCTCAGCCAGCGGCGGCGGCAGCAGTGGCAGCAGAACCGGTCGAGTTGGTGCAGCTGGTGCCGGCGGAAGAGCAGAATGCTGCCGCCGTTCCGGAGCCGGTCAGCGATGCGGAAGGTCAACGATCGAAGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGGATACGGAGGCGGTTACCACTGATACGGCTACCGGTACGGTGGATATGGTGGCGGCTTCGGATACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTGACACTTGTGATGGTGCGTGCGTGCGT  GTGTGGTGTAAGACAATAAGCCAAAAATAAAACACAAAAC                                                                ]
[+] EMBL BX617668             [                                                   CAAAGTTTCACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCACTTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGCCTGGTCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGGCAGCAGTGGCAGCAGAACCGGTCGAGTTGGTGCAGCTGGTGCCGGCGGAAGAGCAGAATGCTGCCGCCGTTCCGGAGCCGGTCAGCGATGCGGAAGGTCAACGATCGAAGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGGATACGGAGGTGGCTATCACCGATACGGCTACCGGTACGGTGGATATGGTGGCGGCTTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTGACACTTGTGATGGTGCGTGCGTGTGTGAGTGTGGTGTAAG                                                                                            ]
[+] EMBL BX610317             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGGGCCGGCGGAAGAGCAGAAGGCTGCCGCCGTTCCGGAGCCGGGCAGCGATGCGGAAGGGCAACGATCGAAGCGTCACATCGGAATCGGCGGTGTCGGCATAGGCGGGGGCGTCGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGGGGCTATCCCGGCTCCGGGTACGGCGGGGGCTATCCCGGCTACGGAAATGGTGGA                                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_7953#0
GCCTACTGGGAAAACGGTCCGCAACCATCGAGCGCGCGAAACCGCGGAAAGCAAAGTTTC
ACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCAC
TTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGC
CTGGCCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGGCA
GCAGTGGCAGCAGAACCGGTCGAGTTGGTGCAGCTGGTGCCGGCGGAAGAGCAGAATGCT
GCCGCCGTTCCGGAGCCGGTCAGCGATGCGGAAGGTCAACGATCGAAGCGTCACATCGGA
TTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTAT
CCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGC
TATGGATACGGAGGTGGCTATCACCGATACGGCTACCGGTACGGTGGATATGGTGGCGGC
TTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTGACACTTGTGATGGTGCGT
GCGTGCGTGTGTGGTGTAAGACAATAAGCCAAAAATAAAACACAAAACTTTTTAATCTCA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCTCGAGCTGCAGGTCG

consensusID : consensus_7953#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 424
fasta sequence

                              [CGGAAAGCAAAGTTTCACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCACTTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGCCTGGCCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCG-TTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGGATACGGAGGCGGTTATCACCGATACGGCTACCGGTACGTGGATATGGTGGCGGCTTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTG]

[-] EMBL CNS08Y2I             [CGGAAAGCAAAGTTTCACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCACTTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGCCTGGCCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCG TTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGG                                                                                                ]
[+] EMBL CNS08Y2H             [                                                                                                                                                                            GCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGCTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGGATACGGAGGCGGTTATCACCGATACGGCTACCGGTACGTGGATATGGTGGCGGCTTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTG]




>consensus_7953#1
CGGAAAGCAAAGTTTCACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAA
GTCACTTCCGACGCACTTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCT
GGCCGTGATTGCCAGCCTGGCCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGA
GCCAGCGGCGGCGTCACATCGGATTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGG
TGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTATCCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACG
GATATGGTGGATTCTACCCCGGCTATGGATACGGAGGCGGTTATCACCGATACGGCTACC
GGTACGTGGATATGGTGGCGGCTTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGT
GGTG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7953#0      GCCTACTGGGAAAACGGTCCGCAACCATCGAGCGCGCGAAACCGCGGAAAGCAAAGTTTC 60
consensus_7953#1      --------------------------------------------CGGAAAGCAAAGTTTC 16
                                                                  ****************

consensus_7953#0      ACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCAC 120
consensus_7953#1      ACTACGGTTGTTTGTTCGTTGTTGCTCTTTAAGCAGGTTAACAAGTCACTTCCGACGCAC 76
                      ************************************************************

consensus_7953#0      TTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGC 180
consensus_7953#1      TTCCGACAGACAAACATGAAGACGCTGTACAGCTTACTCGTGCTGGCCGTGATTGCCAGC 136
                      ************************************************************

consensus_7953#0      CTGGCCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCGGCA 240
consensus_7953#1      CTGGCCGTAGCATACCCCGCCGAATCGCAGGAAGCTGCTCCTGAGCCAGCGGCGGCG--- 193
                      *********************************************************   

consensus_7953#0      GCAGTGGCAGCAGAACCGGTCGAGTTGGTGCAGCTGGTGCCGGCGGAAGAGCAGAATGCT 300
consensus_7953#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7953#0      GCCGCCGTTCCGGAGCCGGTCAGCGATGCGGAAGGTCAACGATCGAAGCGTCACATCGGA 360
consensus_7953#1      --------------------------------------------------TCACATCGGA 203
                                                                        **********

consensus_7953#0      TTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTAT 420
consensus_7953#1      TTCGGCGGTGTCGGCATTGGCGTGGGCGTTGGGCTGGTGGGCGGTGGGTTCGGTGGCTAT 263
                      ************************************************************

consensus_7953#0      CCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGC 480
consensus_7953#1      CCCGGCTTCGGGTACGGCGGTGGCTATCCCGGCTACGGATATGGTGGATTCTACCCCGGC 323
                      ************************************************************

consensus_7953#0      TATGGATACGGAGGTGGCTATCACCGATACGGCTACCGGTACGGTGGATATGGTGGCGGC 540
consensus_7953#1      TATGGATACGGAGGCGGTTATCACCGATACGGCTACCGGTACG-TGGATATGGTGGCGGC 382
                      ************** ** ************************* ****************

consensus_7953#0      TTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTGACACTTGTGATGGTGCGT 600
consensus_7953#1      TTCGGACACCCGTACTACTTCTAAACTATGCCTTTGGTGGTG------------------ 424
                      ******************************************                  

consensus_7953#0      GCGTGCGTGTGTGGTGTAAGACAATAAGCCAAAAATAAAACACAAAACTTTTTAATCTCA 660
consensus_7953#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7953#0      AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCTCGAGCTGCAGGTCG 712
consensus_7953#1      ----------------------------------------------------