|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8429#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1244 fasta sequence
[TTTTTTTTTTTTTTTA-TTTCCTGGAAAATGCCGGATGCAGCAATTTTCCCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA-TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTT-GGAC-GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA-TGCCGCTCGCGCTGGCC-TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG-GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC---------CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG-A-CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC-CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTTTCGCCTTTGTAGATTTCGTACCGCAGCTTCCGGTTGCGTTCCATTTCCGG]
[+] EMBL CNS08Q30 [TTTTTTTTTTTTTTTATTTTCCTGGAAAATGCCGGATGCAGCAATTTTCCCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAATTTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTTGGGACGGGACCGGTGGA ]
[+] EMBL CNS08KT3 [ TTTTTTTTTTTTTTA TTTGCTGGAAAATGCCGGATGCAGCAATTTTCCCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTT GGAC GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA TGCCGCTCGCGCTGGCC TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCGCGTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTTTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGAAAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCACCA A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACAACGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTTCTCGAGGCGCATC ]
[+] EMBL CNS08KET [ CCGGATGCAGC ATTTTCCCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTT GGAC GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA TGCCGCTCGCGCTGGCC TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTTTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGGGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCA CGAA CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCG ]
[+] EMBL CNS08YVW [ gcgccTTTGGCATCTTCTTTTTTATTAACATTTATCTCGACACAACGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAGAACGCCGTCGACGATTT GGAC GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA TGCCGCTCGCGCTGGCC TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGAATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCA CG ACCAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGT ]
[+] EMBL CNS08ELJ [ TTTTATTAACATTTATCTCGACGTTGTGTTCACTAGCACACTACAGCTTAAAA TTACTAGCGATAAGGTTTTCCGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTCCCGTCCGTCTTCGCCTTCACCTGCGACCGGACCTCATCCTGCAGCTGCGAAAAAAACGCCGTCGACGATTT GGAC GGACCGGTGGAAGTTTCCGCCATTTGCTGCACGTTCTTTGCCTTCGTCACCTTCTTCAGAAGCGACGTTTGCAGCGCCCGGTTCTGCTTGGCCA TGCCGCTCGCGCTGGCC TTTTCCAGCTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAACTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCA CGAA CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCG ]
[-] EMBL CNS08YVV [ GCCATTGTCG TCGCGCTGGCCTTTTTCCAG TGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGATCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTT ]
[-] EMBL CNS08KES [ TGGCC TTTTTCCGGTGGCGCTGTTCGCGTTCCGTTTCGCGGCGGTACTTTTCCCGCTGGAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGGGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGAACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTT ]
[-] EMBL CNS08KT2 [ CCCGCTGTAAGCGCTTCTTCAGCCGCCGCTCGCGGTTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGCCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCAACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGAACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTCTCTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTT ]
[-] EMBL BX627876 [ TTCTGATCCGTCTTGGTGCGTTCGTCCTTGGACATGACGTCGCCCTTGGGTCGTCG GTGCACTTCCTCCGGGGCGAGCAGGGTGGCATCGCTCGTTGCAACGGGGGCGACCTCCTCCATGCTGATGGCGGGCGTGTTGGTGAGGATTTTCAGCTCGGGGACGGCCGGTCGCGGCGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGTACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGCCTGCTTGCGCTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTCTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCAC ]
[-] EMBL BM591583 [ CGTGTAGTGGAAGTTCGAGAGGGCATCGAGCTGGGCCAGCACCACCTTCATCATGCTCCGTATTTCCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTCCTCTTCGC CTGCAGCGTCCGGGTTTGCTAACTCGAGCTGTTTCAGATAGTCCTGCTCGTACACCTGCGCCAGCG A CAGTTTGCTCTTCTCCCCGTCCAGCACCAGCTGCTTCCGGTACTCGCGCGGATTGTCCGGCGGTCGCACCTTGCGCTCCACATCGTCGAACGCTTTGTTGCGGATGCGCTGCTTGATGATGTCCTCGAGGCGCATCGTCGTGTC CTCCGTCACGACCGGTGCCGGGCGGGTGGTGTGCTCGTACTGCAGCACCTCCTCCAGCAGCGAGTTTTTCGGTCGCGTTTCGGCCGAAATTTCACCCTTCAGCTGCCACGGCTTATCCTTCAGCATGCCTGCTTCCATTTTGGAAATCTTCTCCTTCAGCTTTTCCTGCCGCAGCTCGTACGACGATTTTGGTCCGTCCGGAGCTTTCTCCTCCTCGCTATCACTCGTGTCCGGTTGATCGATCACTGCTTTTTTGGGCGGTTTTTCCGACCGAGGCGGAGACATGCCGTTTTCGCCTTTGTAGATTTCGTACCGCAGCTTCCGGTTGCGTTCCATTTCCGG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||