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consensusID : consensus_8910#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 972 fasta sequence
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[+] EMBL CNS097VV [ tgAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGATTGGTGCCCGTTCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCC GACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAAATTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTAATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTGGTCTTGGAGCCCTTTTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTTTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTGGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTTTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTTATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTACAAGCAGTTCCAGAACAAGCAGGCTTAATAAGAACACTTTCCTCATTTTCTACAATTATTTCCACTGGCACATAGAACAAGGAACGT ]
[+] EMBL CNS096SU [ CTTATAAAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCAGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGCACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCCGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTACAAGCAGTGCCAGAGCAAGCAGGCTTAATAAGAACACTTTCCTCATTTTCTACAATTATTTCCACTGGCACATAGAACAAGGAACGTCTGCACGTACGCGATCTCGTGGATGTGGCTTTACGAGCCACACGATCAATCCAGTAGGCCAACAGTGCCCG]
consensusID : consensus_8910#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 822 fasta sequence
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[-] EMBL CNS08ED9 [CACATGTGGCC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGGTGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA]
[-] EMBL CNS095X4 [ GGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA]
[-] EMBL CNS08I5H [ ccTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCG TGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTTGGTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA]
[-] EMBL CNS097VU [ catgtggccTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACCTTATTCAGTAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCATAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCAACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCAACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTACCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTaa]
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[+] EMBL CNS08I5I [ TTATTCAATAGAATTTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCAAAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAACCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTTTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGAGGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCCCCTTATGAAAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTGGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTTTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTAATGACCGGCACCGT ]
[+] EMBL CNS095X5 [ TTTATTCACATTTTTGTCTAAAGCTTCAAAATACCATGCATTAATCACATCTGATTTAATTACGCTATCGACTGACCGAAAACGTGAAAGCCCTAGTGGCCTTTATCGCCCTTCTTGTACCCATGCTCGCTGCCGCCAGATTTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTG ]
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[-] EMBL CNS09FOU [ TTTCCGCCCTTTTTGCCAAAATCATCCTTGTGCGAAAAGTGCGACTCGTGCCCGTGCTTGTGTTTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCGCTGCCACCGCTTTCCTCAAAAGAGCTTTCCTTCTTCTTTCCATCGCCGTTAACCACCGTTA]
[-] EMBL BM616369 [ TTCCAGCCTTTGTGCTCATCATCGAAGTGTCCCTTATCCGTGTGGCCCTTTTTGGCATATTTGTCCTCCTTGTGGGCCGACTCGTGATGGCCCCCCTTTTTGTGTTCGCCTCCGTTCTTCTTGTGGAACTCGTTGAAATCGCCAAACTTCTTATGATGGCCCTCCTTGTGATGATCATCGTAGAACTT GTGCTCCTTATGATAGTCATCTTTGTGTGATTTGTGATGATATCCAGTCGTCTTGGAGCCCTTCTTATGGCCCTTCTTGTGCCCCTTTTTACCGTGCTTAGAGCCCTTCTTTTCCTCATGGTGCTTCTTGTAGTGATCACCCTCGTCGTGGCTCTCCTTCTTATGGCCACCTTCTTCGCCGTAGTGCGATTCGTGATCTTCCTTGCCCTTGCTGCCCTTTTCCGACTTTTCTAATCCGTGCTTCTTTTCGTACCCCTTATCACCTTTGTCGCCTTTTTTCGAGTGATGATCGGCACCGTGCTCcgg ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||