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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9146#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 1184 fasta sequence
[TGTTGTTTGAACTTAACTTACATTTATTTGTCCTATTTGTTTTAACCACCGCGCGAAGAACGACTTACGACCACTACACCTTGGGCTTCTTAGGCAGTGAACCGAACG-CCGATATAACCGTGCCCTTCGTCCCGGTGGCCGTCGTCGTGAGCCTCTGCTGTATGATGCCCGCCGGCTTCAGTGCGTTCGCCATCGCGACA-CCGCGGCCGCACCGAGCATACCGGGCGCCGCT-CCCAACACGCCCGGTTGGTCCCATTTGGATTTGCGCTTCTTCGACTCGTCCGGATCGACCCGCTTTACGCCGGTCTGTATTTCCGTCTTGGTCGCCTCCTTCCGTGCCTTTTCCACCTTTTCCATCTCGA-CCTTCTGCGCTTTCGCCAGCTCCTCGTAGTACGATT-CCTTGCCCCACTGGGATGGGTCGAATATTTCCGGCGCATAGTTCGTCCCGAGCTCGTTGATGTCGCAGAAGTGGATCAGCTTCTCGTAGATGCTCGGATTGCGGAACTCTTTGCGCTCCTGGATGATGCGGTTCGTGTCCATGTTGGAGTTTTTCATCCGTTCGTACAGGGCGGCAATCTTGTCCTGCAGCTCCTGCGAGCAGCGACCTTTCGGTTCGGGCGGTAGG-CTAAAGCCGTA-CAGCTTCG-CCCGGTCCACCTTTTCGGGGGAGGGGCTCCGTTCCGGTTCGGGCTCGTGTTCCGATTCTGGTGCTTCCTCGTG-TTCGCTCCGCTCCGGTGAGTTGTTGTCCTCGTCCGTGTCGACAATCGTATCGTCGATGTAGCTCACCAGCCGGAGTGCTTTCTTGCGCGGTGGCCCTGGCGTTCCGTTGTCACTTGCACCGCTCGGTTCGGCCGATTTGAACGGAGGAAGGCTGGCGGT-GTTGGTCTGCGTGACGGGTGTGCCCGAGCTTTCGGACATGTCCCGGAGCGGCGTTTGTTGGCGGGAGCGAATCTGTGAGACGGAACTACCGCCTTCCGACTGTGGTGAATCATCGTCCGAATGACGATCGCCCTCATTTTCCGAGTCCGTGTAGGTGGC-AGTTAGCGA-TGCAAGCGCCGAG-TTTTTGGAGCTCATACCGGAAAACTATTTTGTTGCGGGTTTTTACTAGACTTTTCGATTGAAAATCGCGGAATGT-TTCGTACGCACGATCT-CTTTGCTTTTGTTACAATNAATCCTCGGGCAATCTG]
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[+] EMBL CNS08LJ4 [ tAACTTAACTTACATTTATTTGTCCTATTTGTTTTAACCACCGCGCG AGAACGACTTACGACCACTACACCTTGGGCTTCTTAGGCAGTGAACCGAACGCCCGATATAACCGTGCCCTTCGTCCCGGTGGCCGTCGTCGTGAGCCTCTGCTGTATGAAGCCCGCCGGCTTCAGTGCGTTCGCCATCGCGACA CCGCGGCCGCACCGAGCATACCGGGCGCCGCT CCCAACACGCCCGGTTGGTCCCATTTGGATTTGCGCTTCTTCGACTCGTCCGGATCGACCCGCTTTACGCCGGTCTGTATTTCCGTCTTGGTCGCCTCCTTCCGTGCCTTTTCCACCTTTTCCATCTCGA CCTTCTGCGCTTTCGCCAGCGCCTCGTAGTACGATT CCTTGCCCCACTGGGATGGGTCGAATATTTCCGGCGCATAGTTCGTCCCGAGCTCGTTGATGTCGCAGAAGTGGATCAGCTTCTCGTAGATGCTCGGATTGCGGAACTCTTTGCGCTCCTGGATGATGCGGTTCGTGTCCATGTGGGAGTTTTTCATCCGTTCGTACAGGGCGGCAATTTTGTTCTGCAGCTCCTGCGAGCAGCGACCTTTCGGTTCGGGCGGTAGG CTAAAGCCGTA CAGCTTCG CCCGGTCCACCTTTTCGGGGGAGGGGCTCCGTTCCGGTTCGGGCTCGTGTACCGATTCTGGTGCTTCCTCGTG TTCGCTCCGCTCCGGTGA ]
[+] EMBL CNS08IX5 [ TAACTTACATTTATTTGTCCTATTTGTTTTAACCACCGCGCGAAGAACGACTTACGACCACTACACCTTGGGCTTCTTAGGCAGTGAACCGAACG CCGATATAACCGTGCCCTTCGTCCCGGTGGCCGTCGTCGTGAGCGTCTGCTGTATGATGCCCGCCGGCTTCAGTGCGTTCGCCATCGCGACAGCCGCGGCCGCACCGAGCATACCGGGCGCCGCT CCCAACACGCCCGGTTGGTCCCATTTGGATTTGCGCTTCTTCGACTCGTCCGGATCGACCCGCTTTACGCCGGTCTGTATTTCCGTCTTGGTCGCCTCCTTCCGTGCCTTTTCCACCTTTTCCATCTCGA CCTTCTGCGCTTTCGCCAGCTCCTCGTAGTACGATT CCTTGCCCCACTGGGATGGGTCGAATATTTCCGGCGCATAGTTCGTCCCGAGCTCGTTGATGTCGCAGAAGTGGATCAGCTTCTCGTAGATGCTCGGATTGCGGAACTCTTTGCGCTCCTGGATGATGCGGTTCGTGTCCATGTTGGAGTTTTTCATCCGTTCGTACAGGGCGGCAATCTTGTCCTGCAGCTCCTGCGAGCAGCGACCTTTCGGTTCGGGCGGTAGG CTAAAGCCGTA CAGCTTCG CCCGGTCCACCTTTTCGGGGGAGGGGCTCCGTTCCGGTTCGGGCTCGTGTTCCGATTCTGGTGCTTCCTCGTG TTCGCTCCGCTCCGGTGAGTTGTTGTCCTCGTCCGTGTCGACAATCGTATCGTCGATGTAGCTCACCAGCCGGAGTGCTTTCTTGCGCGGTGGCCCTGGCGTTCCGTTGTCACTTGCACCGCTCGGTTCGGCCGATTTGAACGGAGGAAGGCTGGCGGT GTTGGTCTGCATGACGGGTGT CCCGAGCTTTCGGACATGTCCCGGAGCGGCGTTTGTTGGCG ]
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[-] EMBL CNS097UG [ ACGCCCGGTTGGTCCCATTTGGATTTGCGCTTCTTCGACTCGTCCGGATCGACCCGCTTTACGCCGGTCTGTATTTCCGTCTTGGTCGCCTCCTTCCGTGCCTTTTCCACCTTTTCCATCTCGA CCTTCTGCGCTTTCGCCAGCTCCTCGTAGTACGATT CCTTGCCCCACTGGGATGGGTCGAATATTTCCGGCGCATAGTTCGTCCCGAGCTCGTTGATGTCGCAGAAGTGGATCAGCTTCTCGTAGATGCTCGGATTGCGGAACTCTTTGCGCTCCTGGATGATGCGGTTCGTGTCCATGTTGGAGTTTTTCATCCGTTCGTACAGGGCGGCAATCTTGTCCTGCAGCTCCTGCGAGCAGCGACCTTTCGGTTCGGGCGGTAGG CTAAAGCCGTA CAG TTCG CCCGGTCCACCTTTTCGGGGGAGGGGCT CGTTCCGGTTCGGGCTCGTGTTCCGATTCTGGTGCTTCCTCGTGATCCTCTCCGCTCCGGTGAGTTGTTGTCCTCGTCCGTGTCGACAATCGTATCGTCGATGTAGCTCACCAGCCGGAGTGCTTTCTTGCGCGGTGGCCCTGGCGTTCCGTTGTCACTTGCACCGCTCGGTTCGGCCGATTTGAACGGAGGAAGGCTGGCGGT GTTGGTCTGCGTGACGGGTGTGCCCGAGCTTTCGGACATGTCCCGGAGCGGCGTTTGTTGGCGGGAGCGAATCTGTGAGACGGAACTACCGCCTTCCGACTGTGGTGAATCATCGTCCGAATGACGATCGCCCTCATTTTCCGAGTCCGTGTAGGTGGC AGTTAGCGA TGCAAGCGCCGAG TTTTTGGAGCTCATACCGGAAAACTATTTTGTTGCGGGTTTTTACTAGACTTTTCGATTGAAAATCGCGGAATGT TTCGTACGCACGATCTGCTTTGCTT ]
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[-] EMBL CNS09FHA [ TCGGGCTCGTGTTCCGATTCTGGTGCTTCCTCGTGATACGCTCCGCTCCGGTGAGTTGTTGTCCTCGTCCGTGTCGACAATCGTATCGTCGATGTAGCTCACCAGCCGGAGTGCTTTCTTGCGCGGTGGCCCTGGCGTTCCGTTGTCACTTGCACCGCTCGGTTCGGCCGATTTGAACGGAGGAAGGCTG ]
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clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||