|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9777#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 800 fasta sequence
[CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGCAATCGTTCAAGCAACCTCAGCTCGGCAAACAACACAGACCTTTCGTGTGTCCCATCTCGTTGTGACAGAACAGAAAAACAGTCCCACAATTCTATTCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACGATCGAGAAGTCCGTCCCGACTGGCTACTCGCACCAGAGCTTCACCCAGTACCACAACAAGCAGGTCGCTGAGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTG--CC-GCCCCGGT-TGTTCACGCCGCTCC-GGCTGTGTA---TGCTGCCCCGGT--CC-AGACCGTCTACGCT---GCTGCCCCAGTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCT-CCGGTGGAGAAGACCTACACTTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCTGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGTCCTACGTCAGCAGCTACCCGTCGGTGTACGCTGCCCCGGGCCGTCTATGCTCACGATTACTAAAGCAACACTGGACTGTGTGNTCTAATTCGATCCCCTTCCCCATGCGTGCGTTCGTGCAAGCGAGAACTTTATTTTTCTCTTGTTCA]
[+] EMBL BM634608 [CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGCAATCGTTCAAGCAACCTCAGCTCGGCAAACAACACAGACCTTTCGTGTGTCCCATCTCGTTGTGACAGAACAGAAAAACAGTCCCACAATTCTATTCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACGATCGAGAAGTCCGTCCCGACTGGCTACTCGCACCAGAGCTTCACCCAGTACCACAACAAGCAGGTCGCTGAGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTG CC GCCCCGGT TGTTCACGCCGCTCC GGCTGTGTA TGCTGCCCCGGT CC AGACCGTCTACGCT GCTGCCCCAGTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACTTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCTGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGTCCTACGTCAGCAGCTACC ]
[+] EMBL BM626066 [ ccgGTTCAAGCAACCTCAACTCGGCAAACAACACAGACCTTTCGTGTGTCCCATCTCGTTGTGACAGAACAGAAAAACAGTCCCACAATTCTATTCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACGATCGAGAAGTCCGTCCCGACTGGCTACTCGCACCAAAGCTTCACCCAGTACCACAACAAGCAGGTCGCTGAGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTGCTCC GGCTGTGTATGCT GCCCCGGTCCAGACCGTCTACGCTGCTGCCCCAGTTGCCAAGAC T TACGCTTACGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGTCGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAAGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGTCCTACGTCAGCAGCTACCCGTC ]
[+] EMBL BX620827 [ GCTCGGCAAACAACACAGACCTTTCGTGTGTCCCATCTCGTTGTGACAGAACAGAAAAACAGTCCCACAATTCTATTCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACGATCGAGAAGTCCGTCCCGACTGGCTACTCGCACCAGAGCTTCACCCAGTACCACAACAAGCAGGTCGCTGAGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTG CC GCCCCGGT TGTTCACGCCGCTCC GGCTGTGTA TGCTGCCCCGGT CC AGACCGTCTACGCT GCTGCCCCAGTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACTTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCTGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGTCCT ]
[+] EMBL BM624653 [ ccGCTCGGCAAACAACACAGACCTTTCGTGTGTCCCATCTCGTTGTGACAGAACAGAAAAACAGTCCCACAATTCTATTCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACGATCGAGAAGTCCGTCCCGACTGGCTACTCGCACCAGAGCTTCACCCAGTACCACAACAAGCAGGTCGCTGAGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTG CCGGCCCCGGT TGTTCACGCCGCTCC GGCTGTGTA TGCTGCCCCGGT CC AGACCGTCTACGCT GCTGCCCCAGTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCCGGTGGAGAAGACCTACACTTATGCTGCTGCCCCGGC ]
[+] EMBL BX622758 [ AATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACGATCGAGAAGTCCGTCCCGACTGGCTACTCGCACCAGAGCTTCACCCAGTACCACAACAAGCAGGTCGCTGAGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTG CC GCCCCGGT TGTTCACGCCGCTCC GGCTGTGTA TGCTGCCCCGGT CC AGACCGTCTACGCT GCTGCCCCAGTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACTTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCTGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGTCCTACGTCAGCAGCTACCCGTCGGTGTACGCTGCCCCGGGCCGTCTATGCTCACGATTACTAAAGCAACACTGGACTGTGTGNTCTAATTCGATCCCCTTCCCCATGCGTGCGTTCGTGCAAGCGAGAACTTTATTTTTCTCTTGTTCA]
consensusID : consensus_9777#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 799 fasta sequence
[CCCCG-GCGAAGCTCATTCCAGTGATC-AACACAGACCT-CTCACCC----TTTTTGC--AAAAAC-AATCCATTTTTAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCATCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCG-CCCAGAAGGAGATCTCG-TACCAGAAG-AGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTTGTGCACGACACCAA-GGTGCGCGAGGATGTATACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA-GAAGACGACCTACG-TCCAGGCTGCCGCCCCAGTTGTTCACGCCG-CTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACG-CTG-CTG-CCCCAG-TTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCT--CCGGTGGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCT-CCCCTGAAGACGGCCTACGTCAGCA-GCTACCCGTCGGTGTACGCCGCCCCGGCCGTCTATGCTAACCAGTGGCACTAAATGGTTCCCCCCAACCCGCCTGACTGTCCATACCTTTTTCCCGGAACCCTGGAGCCGTTGCGGTGACGGGGTGCTTCTCTTTTGTTGCCTTTT]
[+] EMBL AL932855 [CCCCG AGTAAGCTCAT CAGTGATCAAACACAGACCTCCTCACCCTTTTTTTTTGCCAAAAAACAAATCCATTTTTAAAAACAATCAATCAAAATG TCCGATTGGTGGTG TGTCCGCTCTTCTTGCCGTTG CGCTG CG T CCGGTG CCACCAT GTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCG CCCAGAAGGAGATCTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTCGTGCACGACACCAAGGGTGCGCGAGGATGTGTACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA GAAGAC ]
[+] EMBL BM657827 [ CCG GCGAAGCTCATTCCAGTGATC AACACAGACCT CTCACCC TTTTTGCA AAAAAC AATCCATTTTGAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCATCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCG CCCAGAAGGAGATCTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTTGTGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTATACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA GAAGACGACCTACG TCCAGGCTGCCGCCCCAGTTGTTCACGCCG CTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACG CTG CTG CCCCAG TTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCT CCCCTGAAGACGGCCTACGTCAGCA GCTACCCGTCGGTGTACGCCGCCCCGGCCGTCTATGCTAACCAG ]
[+] EMBL BM635330 [ CCGCGCGAAGCTCATTCCAGTGATC AACACAGACCT CTCACCC TTTTGC AAAAAC AATCCGTTTTTAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCTGCTCCCGGTGCCCAC CTGGTGCACTCTGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCACCCTCGTCG CCCAGAAGGAGATCTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAACCGGCCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCAGCCGTCGTGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTGTACGCTCCGGCCGTAAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA GAAGACGACCTACG TCCAGGCTGCTGCCCCGGTTGTTCACGCCG CTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACG CTG CTG CCCCAG TTGCCAAGACCTACGCTTACGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCCGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACTTATGCCGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCT CCCCTGAAGACGGCCTAC ]
[+] EMBL AL929653 [ gaggttaAAGCTCATTCCAGTGAT ACACAGANCT CTCACCC TTTTTGC AAAAAC AATCCATTTTTAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCAGCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCGACCCAGAAGGAGATCTCGCTACCAGAAGCAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTCGTGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTGTACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGACNAAGACGACCTACGCTCCAGGCTGCCG CCCGGTTGTTCACGCCGCCTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACGACTGCCTGACCCCAGCTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGANAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCGGctgccat ]
[+] EMBL BM654271 [ ccgGCTCATTCCAGTGATC AACACAGACCT CTCACCC TTTTGC AAAAAC AATCCGTTTTTAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCTGCTCCCGGTGCCCAC CTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCACCCTCGTCG CCCAGAAGGAGATCTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAACCGGCCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCAGCCGTCGTGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTGTACGCTCCGGCCGTAAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA GAAGACGACCTACG TCCAGGCTGCTGCCCCGGTTGTTCACGCCG CTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACG CTG CTG CCCCAG TTGCCAAGACCTACGCTTACGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCCGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACTTATGCCGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCGGCTCCCCCTGAAGACGGCCTACGTCAGCAGGCTAACCc ]
[+] EMBL BX614498 [ AATCCATTTTGAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTCCCGCTCCCGGTGCCCACCATCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCG CCCAGAAGGAGATCTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTTGTGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTATACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA GAAGACGACCTACG TCCAGGCTGCCGCCCCAGTTGTTCACGCCG CTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACG CTG CTG CCCCAG TTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTT ]
[+] EMBL BX615964 [ AATCCATTTTGAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCATCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCG CCCAGAAGGAGATCTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTTGTGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTATACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA GAAGACGACCTACG TCCAGGCTGCCGCCCCAGTTGTTCACGCCG CTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACG CTG CTG CCCCAG TTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGCCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCT CCCCTGAAGACGGCCTACGTCAGCA GCTACCCGTCGGTGTACGCCGCCCCGGCCGTCT ]
[+] EMBL BX617077 [ CAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCATCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCG CCCAGAAGGAGATCTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTTGTGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTATACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA GAAGACGACCTACG TCCAGGCTGCCGCCCCAGTTGTTCACGCCG CTCCGGCTGTGTATGCTGCTCCGGTCCAGACCGTCTACG CTG CTG CCCCAG TTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCT CCCCTGAAGACGGCCTACGTCAGCA GCTACCCGTCGGTGTACGCCGCCCCGGCCGTCTATGCTAACCAGTGGCACTAAATGGTTCCCC ]
[+] EMBL BX616184 [ ATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCATCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCG CCCAGAAGGAGATCTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTTGTGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTATACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA GAAGACGACCTACG TCCAGGCTGCCGCCCCAGTTGTTCACGCCG CTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACG CTG CTG CCCCAG TTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGTCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCT CCCCTGAAGACGGCCTACGTCAGCA GCTACCCGTCGGTGTACGCCGCCCCGGCCGTCTATGCTAACCAGTGGCACTAAATGGTTCCCCCCAACCCGCCTGACTGTCCATACCTTTTTCCCGGAACCCTGGAGCCGTTGCGGTGACGGGGTGCTTCTCTTTTGTTGCCTTTT]
[+] EMBL BX618544 [ CCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCATCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCG CCCAGAAGGAGATCTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTTGTGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTATACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA GAAGACGACCTACG TCCAGGCTGCCGCCCCAGTTGTTCACGCCG CTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACG CTG CTG CCCCAG TTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGTTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGTGGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCG ]
[+] EMBL BX614330 [ CGCTCTTCTGGCCGTGGCCGCTGCCTCTCCCGGTGCCCACCATCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCG CCCAGAAGGAGAACTCG TACCAGAAG AGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTGGGGCACGACACCAA GGTGCGCGAGGATGTATACGCTCCGGCCGGGAAGAAGACCGGCGGGGCGACGCCGGTCGA GAAGACGACCTACG TCCAGGCGGCCGCCCCAGTGGGACACGCCG CTCCG ]
[+] EMBL BM618140 [ TTGTTCACGCCG CTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACG CTG CTG CCCCAG TTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCT CCGGCGGAG ]
consensusID : consensus_9777#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 614 fasta sequence
[GGGCGAAGNTTCATTCCAGTGATCNGACACAGACCTCTCACCCTTTTTGCAAAAACAATCCATTTTTAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCAGCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTCGTGCACGACACCAAGGTGCGCGAGGATGTGTACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTGCCGCCCCGGTTGTTCACGCCGCTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTAAANCGCTGCCCCAGTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGGCCTA]
[+] EMBL BX619506 [GGGCGAAGNTTCATTCCAGTGATCNGACACAGACCTCTCACCCTTTTTGCAAAAACAATCCATTTTTAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCAGCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTCGTGCACGACACCAAGGTGCGCGAGGATGTGTACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTGCCGCCCCGGTTGTTCACGCCGCTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTAAANC ]
[+] EMBL BX625865 [ CATTCCAGTGATC AACACAGACCTCTCACCCTTTTTGCAAAAACAATCCATTTTTAAAAACAATCAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCAGCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCGCACGTTGGCACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCTCGGCCGTCGTGCACGACACCAAGGTGCGCGAGGATGTGTACGCTCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTGCCGCCCCGGTTGTTCACGCCGCTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACGCTGCTGCCCCAGTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGGCCTA]
consensusID : consensus_9777#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 439 fasta sequence
[CCGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTGCTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACGCTGCTGCCCCAGTTGCCAAGACTTACGCTTACGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTCGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGTCCTACGTTAGCAGCTACCCGTCGGTGTACGCTGCCCCGGCCGTCTATGCTCACGATTACTAAGCAACCCTGACTGTGTGTTCTAATCGATCCCTTCCCCATGCGTGCGTTCGTGCAAGCGAGAACTTTATTTTTCTCTTGTTCAAACGTTTTTTCGGACTGTTTT]
[+] EMBL BM643462 [CCGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGACCGTCGTGTCGACGCCGGTCGAGAAGACGACCTACGTCCAGGCTGCTCCGGCTGTGTATGCTGCCCCGGTCCAGACCGTCTACGCTGCTGCCCCAGTTGCCAAGACTTACGCTTACGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTCGAGAAGACCTACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCCCGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGTCCTACGTTAGCAGCTACCCGTCGGTGTACGCTGCCCCGGCCGTCTATGCTCACGATTACTAAGCAACCCTGACTGTGTGTTCTAATCGATCCCTTCCCCATGCGTGCGTTCGTGCAAGCGAGAACTTTATTTTTCTCTTGTTCAAACGTTTTTTCGGACTGTTTT]
consensusID : consensus_9777#4 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 421 fasta sequence
[ANTTTGAAAAACAGTCCCACAATTCTATTCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCCGCACCGTTTGGCACCGATCGNAGAAAGTNCCGGTCCCCGCACCTNGNNNCCACNTTNNTCCNNCCCAGCACGCCCTCTCCACCCCCCCAGGCTCACNCCAACCCACNACCAAAAGGCNNAGGGGGTTNNGGCCNTGGGANGGCCNCCCGGNTTGGTTTTTCCGGCCCNNCCCCGGGGGGCCCCGGTTTGGAAAAAAGAAAAAGAACCCCCG]
[+] EMBL BX619696 [ANTTTGAAAAACAGTCCCACAATTCTATTCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGCTGCCGCTCCCGGTGCCCACCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTGCGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGACCGTGGCCGCACCGTTTGGCACCGATCGNAGAAAGTNCCGGTCCCCGCACCTNGNNNCCACNTTNNTCCNNCCCAGCACGCCCTCTCCACCCCCCCAGGCTCACNCCAACCCACNACCAAAAGGCNNAGGGGGTTNNGGCCNTGGGANGGCCNCCCGGNTTGGTTTTTCCGGCCCNNCCCCGGGGGGCCCCGGTTTGGAAAAAAGAAAAAGAACCCCCG]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_9777#0 CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGCAATCGTTCAAGCAACCTCAGCTCGGCAAACAA 60
consensus_9777#3 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#1 -----------------------------------------CCCCGGCGAAGCT-CATTC 18
consensus_9777#2 --------------------------------------------GGGCGAAGNTTCATTC 16
consensus_9777#4 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#0 CACAGACCTTTCGTGTGTCCCATCTCGTTGTGACAGAACAGAAAAACAGTCCCACAATTC 120
consensus_9777#3 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#1 CAGTGATCA-ACACAGACCTCTCACCCTTTTTGCAAAAACAATCCATTTTTAAAAACAAT 77
consensus_9777#2 CAGTGATCNGACACAGACCTCTCACCCTTTTTGCAAAAACAATCCATTTTTAAAAACAAT 76
consensus_9777#4 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#0 TATTCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGCTGCCGCTC 180
consensus_9777#3 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#1 CAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTC 137
consensus_9777#2 CAATCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGCTCTTCTTGCCGTTGCCGCTGCCGCTC 136
consensus_9777#4 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#0 CCGGTGCCCACC---TGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCTG 237
consensus_9777#3 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#1 CCGGTGCCCACCATCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCG 197
consensus_9777#2 CCGGTGCCCACCAGCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTAGCTGCCG 196
consensus_9777#4 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#0 CGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGA 297
consensus_9777#3 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#1 CGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGA 257
consensus_9777#2 CGCCCGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTGGAGGAGCCGA 256
consensus_9777#4 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#0 CCGTGGCGCACGTTGGCACGATCGAGAAGTCCGTCCCGACTGGCTACTCGCACCAGAGCT 357
consensus_9777#3 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#1 CCGTGGCGCACGTTGGTACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCT 317
consensus_9777#2 CCGTGGCGCACGTTGGCACCGTGGTCAAGACCGTCCCGACCGGAGTGACGCACACTAGCT 316
consensus_9777#4 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#0 TCACCCAGTACCACAACAAGCAGGTCGCTGAGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGA 417
consensus_9777#3 -----------------------------CCGCCCGTGTTCGCCCCGGCCGTGAAGAAGA 31
consensus_9777#1 CGGCCGTTGTGCACGACACCAAGGTGCGCGAGGATGTATACGCTCCGGCCGTGAAGAAGA 377
consensus_9777#2 CGGCCGTCGTGCACGACACCAAGGTGCGCGAGGATGTGTACGCTCCGGCCGTGAAGAAGA 376
consensus_9777#4 ----------------------------------ANTTTGAAAAACAGTCCC--ACAATT 24
* * * * * * **
consensus_9777#0 CCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA-GAAGACGACCTACGTCCAGGCTGCCG----------- 465
consensus_9777#3 CCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA-GAAGACGACCTACGTCCAGGCTG-------------- 76
consensus_9777#1 CCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA-GAAGACGACCTACGTCCAGGCTGCCGCCCCAGTTGTT 436
consensus_9777#2 CCGTCGTGTCGACGCCGGTCGA-GAAGACGACCTACGTCCAGGCTGCCGCCCCGGTTGTT 435
consensus_9777#4 CTATTCAAAATGTTCCGATTGGTGGTGTTGTCCGTTGTTCTCGCCGTTGCCGC------- 77
* * *** * * * * * ** ** * ** *
consensus_9777#0 -------CCCCGGTTGTTCA--CGCCGC-TCCGG------CTGTGTA---TGCTGCCCCG 506
consensus_9777#3 -------CTCCGGCTGTGTA--TGCTGC-CCCGGTCCAGACCGTCTACGCTGCTGCCCCA 126
consensus_9777#1 CACGCCGCTCCGGCTGTGTA--TGCTGC-CCCGGTCCAGACCGTCTACGCTGCTGCCCCA 493
consensus_9777#2 CACGCCGCTCCGGCTGTGTA--TGCTGC-CCCGGTCCAGACCGTCTAAANCGCTGCCCCA 492
consensus_9777#4 --TGCCGCTCCCGGTGCCCACCTGGTGCACTCGGCCCCGCTCGCCTACTCGACCGTGGTA 135
* ** * ** * * ** *** * ** * *
consensus_9777#0 GTCCAGACCGTCTACGCT---GCTGCCCCAGTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCG 563
consensus_9777#3 GTTGCCAAGACTTACGCTTACGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCG 186
consensus_9777#1 GTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCGGTGGAGAAGACCTACGCTTATGCTGCTCCG 553
consensus_9777#2 GTTGCCAAGACCTACGCTTATGCTGC------------------------------TCCG 522
consensus_9777#4 GCTGCTGCGCC---CGCCCTCGTCGCCCAGAAGGAGATCTCGTACCAGAAGAGCATCGTG 192
* *** * ** *
consensus_9777#0 GTGGAGAAGACC-TACACTTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCC 622
consensus_9777#3 GTCGAGAAGACC-TACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCC 245
consensus_9777#1 GTGGAGAAGACC-TACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCC 612
consensus_9777#2 GTGGAGAAGACC-TACACGTATGCTGCTGCCCCGGCTGCCATCTCGTACGAGGCTGCTCC 581
consensus_9777#4 GAGGAGCCGACCGTGGCCGCACCGTTTGGCACCGATCGN-AGAAAGTNCCGGTCCCCGCA 251
* *** **** * * * * ** *** * * ** * * * * *
consensus_9777#0 TGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGTCCTACGTCAGCAGCTACCCGTCGGTGTACGC 682
consensus_9777#3 CGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGTCCTACGTTAGCAGCTACCCGTCGGTGTACGC 305
consensus_9777#1 CGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGGCCTACGTCAGCAGCTACCCGTCGGTGTACGC 672
consensus_9777#2 CGTTGCGTACGCCGCTCCCCTGAAGACGGCCTA--------------------------- 614
consensus_9777#4 CCTNGNNNCCACNTTNNTCCNNCCCA-GCACGCCCTCTCCACCCCCCCA--GGCTCACNC 308
* * * * ** * * *
consensus_9777#0 TGCCCCGGGCCGTCTATGCTCACGATTACTAAAGCAACACTGGACTGTGTGNTCTAATTC 742
consensus_9777#3 TGCCCCGG-CCGTCTATGCTCACGATTACTAA-GCAACCCTG-ACTGTGTGTTCTAAT-C 361
consensus_9777#1 CGCCCCGG-CCGTCTATGCTAACCAGTGGCACTAAATGGTTCCCCCCAACCCGCCTGACT 731
consensus_9777#2 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#4 CAACCCACNACCAAAAGGCNNAGGGGGTTNNGGCCNTGGGANGGCCNCCCGGNTTGGTTT 368
consensus_9777#0 GATCCCCTTCCCCATGCGTGCGTTCGTGCAAGCGAGAACTTTATTTTTCTCTTGTTCA-- 800
consensus_9777#3 GATCCC-TTCCCCATGCGTGCGTTCGTGCAAGCGAGAACTTTATTTTTCTCTTGTTCAAA 420
consensus_9777#1 GTCCATACCTTTTTCCCGGAACCCTGGAGCCGTTGCGGTGACGGGGTGCTTCTCTTTTGT 791
consensus_9777#2 ------------------------------------------------------------
consensus_9777#4 TTCCGGCCCNNCCCCGGGGGGCCCCGGTTTGGAAAAAAGAAAAAGAACCCCCG------- 421
consensus_9777#0 -------------------
consensus_9777#3 CGTTTTTTCGGACTGTTTT 439
consensus_9777#1 TGCCTTTT----------- 799
consensus_9777#2 -------------------
consensus_9777#4 -------------------
|
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||