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Apis mellifera
cluster # 1039 cluster # 1039       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1039#0 length = 689 sequences # 3  

consensusID : consensus_1039#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 689
fasta sequence
                              [TAATATCACAGGCAGGCTGGCATCAATATGGCTGCCAGCAGTTTTTTTATTTTCCAACCAAACAAGAAAATTTCACTTGTGCATACAACATTACACCG-CTTGTGTATAAAGTATATATATATGTATGTGTGCATGTATGTATGTATGTATGTACTTACTTGTATATGCGTGCGTATGTGAATGTACATATTAAGAGTGGTTCGGATGTAAATAAATAATCCTCTTAACGTTCTCGTTTCAAGGGGAACGAGCAGATGCGGATTAAATAATTTGGCCTAATGCGAACATTTTCTGCCGTTAATTCTCATCTTCCAATCCGAGTGTGAATCTGAATCACTGAAAAAAAGAAAAAAAAGAGATTACTCTCACCATGATGCGATCTTGACTCATCGTAAAAGGATGTTGGAAAGTGGGAATCGGATATTTAAGAGGTTTATGGATTAAGAAATGTTTAATCTAATATACGTAGGATCTGGAAATTGATTTTATAGGAAAATCTATATATTTAATTTCGATTAACTTGTCGATATTGAATATTGAAATAATTCAAAGAGATATGGAATATACTGGCAGTATATTAAATTTAATCGAACGTGAACCATTCATTTGAGATATAAAAGATAGTGAGGAATACTTTTTCAAATATAAAGTAAATTTGGAAAAAGGTGACGTAGNTAGACTCTGTTGCG]

[-] EMBL BI508846             [TAATATCACAGGCAGGCTGGCATCAATATGGCTGCCAGCAGTTTTTTTATTTTCCAACCAAACAAGAAAATTTCACTTGTGCATACAACATTACACCG CTTGTGTATAAAGTATATATATATGTATGTGTGCATGTATGTATGTATGTATGTACTTACTTGTATATGCGTGCGTATGTGAATGTACATATTAAGAGTGGTTCGGATGTAAATAAATAATCCTCTTAACGTTCTCGTTTCAAGGGGAACGAGCAGATGCGGATTAAATAATTTGGCCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI506339             [                                TGCCAGCAGTTTTTTTATTTTCCAACCAAACAAGAAAATTTCACTTGTGCATACAACATTACACCG CTTGTGTATAAAGTATATATATATGTATGTGTGCATGTATGTATGTATGTATGTACTTACTTGTATATGCGTGCGTATGTGAATGTACATATTAAGAGTGGTTCGGATGTAAATAAATAATCCTCTTAACGTTCTCGTTTCAAGGGGAACGAGCAGATGCGGATTAAATAATTTGGCCTAATGCGAACATTTTCTGCCGTTAATTCTCATCTTCCAATCCGAGTGTGAATCTGAATCACTGAAAAAAAGAAAAAAAAGAGATTACTCTCACCATGATGCGATCTTGACTCATCGTAAAAGGATGTTGGAAAGTGGGAATCGGATATTTAAGAGGTTTATGGATTAAGAAATGTTTAATCTAATATACGTAGGATCTGGAAATTGATTTTATAGGAAAATCTATATATTTAATTTCGATTAACTTGTCGATATTGAATATTGAAATAATTCAAAGAGATATGGAATATACTGGCAGTATATTAAATTTAATCGAACGTGAACCATTCATTTGAGATATAAAAGATAGTGAGGAATACTTTTTCAAATATAAAGTAAATTTGGAAAAAGGTGACGTAGNTAGACTCTGTTGCG]
[+] EMBL BI502944             [                                TGCCNNNAGTTTTTTTATTTTCCAACCAAACAAGAAAATTTCACTTGTGCATACAACATTACACCGNNNTGTGTATAAAGTATATATATATGTATGTGTGCATGTATGTATGTATGTATGTACTTACTTGTATATGCGTGCGTATGTGAATGTACATATTAAGAGTGGTTCGGATGTAAATAAATAATCCTCTTAACGTTCTCGTTTCAAGGGGAACGAGCAGATGCGGATTAAATAATTTGGCCTAATGCGAACATTTTCTGCCGTTAATTCTCATCTTCCAATCCGAGTGTGAATCTGAATCACTGAAAAAAAGAAAAAAAAGAGATTACTCTCACCATGATGCGATCTTGACTCATCGTAAAAGGATGTTGGAAAGTGGGAATCGGATATTTAAGAGGTTTATGGATTAAGAAAT                                                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_1039#0 TAATATCACAGGCAGGCTGGCATCAATATGGCTGCCAGCAGTTTTTTTATTTTCCAACCA AACAAGAAAATTTCACTTGTGCATACAACATTACACCGCTTGTGTATAAAGTATATATAT ATGTATGTGTGCATGTATGTATGTATGTATGTACTTACTTGTATATGCGTGCGTATGTGA ATGTACATATTAAGAGTGGTTCGGATGTAAATAAATAATCCTCTTAACGTTCTCGTTTCA AGGGGAACGAGCAGATGCGGATTAAATAATTTGGCCTAATGCGAACATTTTCTGCCGTTA ATTCTCATCTTCCAATCCGAGTGTGAATCTGAATCACTGAAAAAAAGAAAAAAAAGAGAT TACTCTCACCATGATGCGATCTTGACTCATCGTAAAAGGATGTTGGAAAGTGGGAATCGG ATATTTAAGAGGTTTATGGATTAAGAAATGTTTAATCTAATATACGTAGGATCTGGAAAT TGATTTTATAGGAAAATCTATATATTTAATTTCGATTAACTTGTCGATATTGAATATTGA AATAATTCAAAGAGATATGGAATATACTGGCAGTATATTAAATTTAATCGAACGTGAACC ATTCATTTGAGATATAAAAGATAGTGAGGAATACTTTTTCAAATATAAAGTAAATTTGGA AAAAGGTGACGTAGNTAGACTCTGTTGCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)