These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_1117#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 930 fasta sequence [TGTATTTATAAATATAATTACACATATATTCTATAATATAGTAAAATCATAAAATAATTCAACCATAAAAATTTATAAAGATATACGAATGAATGATTAGCAAAAAAAGAAAGAAATCTTGATCAATGTATCTTAACTATATCATACTTAAAAAATAAAAAATTATAATAACTTATAATCTTACTAATCTTAAATAATATTATTAATCCTTTGCAGTCCAAAGGTGACTCTCGGTCACCACTTAAGATAATGCAATAATTCCAACAGTGACTCTCCGGCAACGAACGCACCGAACGCACTGAACGCGTGAGTTCGAGTCTGGGTTGCTGGTTCGAAACAGACTCGGAGTGCAAAGGATTAAGAATTTACACAGTTTTAAAAATTAAAATTTTAAAACTAAAATT-ATAATACATTGAACACTAAATTTTTTAGTATTTCCACGATAGATAAAACAATACGTTTTTATAATACAATTAAAAAAATTAGAATCTTTCTATCTTATATATTGATATTATCTTAAGTTATCAATAACATATATCAGACATGATATATATTATATGTTATATATAT-ATATATATATATGTTATTAATGATATAATATATAGCATGCATAATTAATGAAAC-AAAACATATAAAATATAATTATGAATAGCGAAATAATTAAAAAATATATTACATGATCTATTAATGATGCAGAGATGCTGCATTCTCCAAATTCTTTAAAGGTAAGGAGCCATTTTTTTACGATTCTTTTGAACAAAGGAAAAGGTGTACAAGTTATTTGACTCTCAAACCTTAATTGTCCAATCTCGATATATACTATGGCAGATTTTACATTTCTATTTTTTGTGAAATGTCATCTCATATTTCATTATTCAATATGTTCGCATCATTAACTTTTTATTATATAAAATTTTCATATTTTTCATT] [+] EMBL BI504588 [TGTATTTATAAATATAATTACACATATATTCTATAATATAGTAAAATCATAAAATAATTCAACCATAAAAATTTATAAAGATATACGAATGAATGATTAGCAAAAAAAGAAAGAAATCTTGATCAATGTATCTTAACTATATCATACTTAAAAAATAAAAAATTATAATAACTTATAATCTTACTAATCTTAAATAATATTATTAATCCTTTGCAGTCCAAAGGTGACTCTCGGTCACCACTTAAGATAATGCAATAATTCCAACAGTGACTCTCCGGCAACGAACGCACCGAACACACTGAACGCGTGAGTTCGAGTCTGGGTTGCTGGTTCGAAATAGACTCGGAGTGCAAAGGATTAAGAATTTACACAGTTTTAAAAATTAAAATTTTAAAACTAAAATT ATAATACACTGAACATTAAATTTTTTAGTATTTCCACAATAGATAAAACAATACGTTTTTATAATACAATTAAAAAAATTAGAATCTTTCTATCTTATATATTGATACTATCTTAAATTATCAATAACATAT AATCATGATATATATTATATGTTATATATATGTTATATATATATGTTATTAATGATATAATATATAGCATGCATAATTAATGAAAC AAAACATATAAA ] [+] EMBL BI505900 [ GAACGCACTCAACGCGTGAGTTCGAGTCTGGGTTCCTGGTTCGAAACAGACTCGGAGTGCAAAGGATTAAGAATTTACACAGTTTTAAAAATTAAAATTTTAAAACTAAAATT ATAATACATTGAACACTAAATTTTTTAGTATTTCCACGATAGATAAAACAATACGTTTTTATAATACAATTAAAAAAATTAGAATCTTTCTATCTTATATATTGATATTATCTTAAGTTATCAATAACATATATCAGACATGATATATATTATATGTTATATATAT ATATATATATATGTTATTAATGATATAATATATAGCATGCATAATTAATGAAAA AAAA ] [-] EMBL BI509757 [ GAAACAGACTCGGAGTGCAAAGGATTAAGAATTTACACAGTTTTAAAAATTAAAATTTTAAAACTAAAATTNNNAATACATTGAACACTAAATTTTTTAGTATTTCCACGATAGATAAAACAATACGTTTTTATAATACAATTAAAAAAATTAGAATCTTTCTATCTTATATATTGATATTATCTTAAGTTATCAATAACATATATCAGACATGATATATATTATATGTTATATATAT ATATATATATATGTTATTAATGATATAATATATAGCATGCATAATTAATGAAACAAAAACATATAAAATATAATTATGAATAGCGAAATAATTAAAAAATATATTACATGATCTATTAATGATGCAGAGATGCTGCATTCTCCAAATTCTTTAAAGGTAAGGAGCCATTTTTTTACGATTCTTTTGAACAAAGGAAAAGGTGTACAAGTTATTTGACTCTCAAACCTTAATTGTCCAATCTCGATATATACTATGGCAGATTTTACATTTCTATTTTTTGTGAAATGTCATCTCATATTTCATTATTCAATATGTTCGCATCATTAACTTTTTATTATATAAAATTTTCATATTTTTCATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |