These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_1248#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 464 fasta sequence [TCCTTGAGTGAAAATTTATGTTTGATCCGAAATTTCACGATTTAAATTCGAATTGTTTGAACAATTGTGATTTCTTGCGATTTCGATCATATAAGAATAAGAATAATACTTTCGAGATTGAATAAAAGAAATTCACTATTCTATTCAGTTATAAAAATGTCAAAATTAGAAACATTGTTGAATTGAGTTAATCGATTGAGAGAAAAGTGCGACAGTATTAATCTTTGCTGATAAATAATAAAAGTGAATTTATCAATTACTATTATAATATATGATTGATCATTGATTAATATCAATTATTAATTGCCATTATTCTTATCGTATGATCGCTATTATCAACGATTATCCCCTGTACGAAGAGAAATTATTTATTATATTTGACGAAAAAGAATATAATTGTATGCGAGTGAGTGAACTGTGCGAATAAAAATTGGAATAAAAGGGGAAGAGTTTGATGATCAGCC] [+] EMBL BI507846 [TCCTTGAGTGAAAATTTATGTTTGATCCGAAATTTCACGATTTAAATTCGAATTGTTTGAACAATTGTGATTTCTTGCGATTTCGATCATATAAGAATAAGAATAATACTTTCGAGATTGAATAAAAGAAATTCACTATTCTATTCAGTTATAAAAATGTCAAAATTAGAAACATTGTTGAATTGAGTTAATCGATTGAGAGAAAAGTGCGACAGTATTAATCTTTGCTGATAAATAATAAAAGTGAATTTATCAATTACTATTATAATATATGATTGATCATTGATTAATATCAATTATTAATTGCCATTATTCTTATCGTATGATCGCTATTATCAACGATTATCCCCTGTACGAAGAGAAATTATTTATTATATTTGACGAAAAAGAATATAATTGTATGCGAGTGAGTGAACTGTGCGAATAAAAATTGGAATAAAAGGGGAAGAGTTTGATGATCAGCC] consensusID : consensus_1248#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 440 fasta sequence [AAATTTTGTCCTTGAGTGAAAATTTATGTTTGATCCGAAATTTCACGATTTAAATTCGAATTGTTTGAACAATTGTGATTTCTTGCGATTTCGATCATATAAGAATAAGAATAATACTTTCGAGATTGAATAAAAGAAATTCACTATTCTATTCAGTTATAGAAATGTCAAAATTAGAAACATTGTTGAATTGAGTTAATCGATTGAGAGAAAAGTGCGACAGTATTAATCTTTGCTGATAAATAACAAAAGTGAATTTATCAATTACGATAATTCTAATCATTACTATTATAATATATGATTGATCATTGATTAATATCAATTATTAATTGCCATTATTCTTATCGTATGATCGCTATTATCAACGATTATCCCCTGTACGAAGAGAAATTATTTATTATATTTGACGAAAAAGAATATAATTGTATGCGAGTGAGTGA] [-] EMBL BI511273 [AAATTTTGTCCTTGAGTGAAAATTTATGTTTGATCCGAAATTTCACGATTTAAATTCGAATTGTTTGAACAATTGTGATTTCTTGCGATTTCGATCATATAAGAATAAGAATAATACTTTCGAGATTGAATAAAAGAAATTCACTATTCTATTCAGTTATAGAAATGTCAAAATTAGAAACATTGTTGAATTGAGTTAATCGATTGAGAGAAAAGTGCGACAGTATTAATCTTTGCTGATAAATAACAAAAGTGAATTTATCAATTACGATAATTCTAATCATTACTATTATAATATATGATTGATCATTGATTAATATCAATTATTAATTGCCATTATTCTTATCGTATGATCGCTATTATCAACGATTATCCCCTGTACGAAGAGAAATTATTTATTATATTTGACGAAAAAGAATATAATTGTATGCGAGTGAGTGA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_1248#0 --------TCCTTGAGTGAAAATTTATGTTTGATCCGAAATTTCACGATTTAAATTCGAA 52 consensus_1248#1 AAATTTTGTCCTTGAGTGAAAATTTATGTTTGATCCGAAATTTCACGATTTAAATTCGAA 60 **************************************************** consensus_1248#0 TTGTTTGAACAATTGTGATTTCTTGCGATTTCGATCATATAAGAATAAGAATAATACTTT 112 consensus_1248#1 TTGTTTGAACAATTGTGATTTCTTGCGATTTCGATCATATAAGAATAAGAATAATACTTT 120 ************************************************************ consensus_1248#0 CGAGATTGAATAAAAGAAATTCACTATTCTATTCAGTTATAAAAATGTCAAAATTAGAAA 172 consensus_1248#1 CGAGATTGAATAAAAGAAATTCACTATTCTATTCAGTTATAGAAATGTCAAAATTAGAAA 180 ***************************************** ****************** consensus_1248#0 CATTGTTGAATTGAGTTAATCGATTGAGAGAAAAGTGCGACAGTATTAATCTTTGCTGAT 232 consensus_1248#1 CATTGTTGAATTGAGTTAATCGATTGAGAGAAAAGTGCGACAGTATTAATCTTTGCTGAT 240 ************************************************************ consensus_1248#0 AAATAATAAAAGTGAATTTATCAATTAC------------------TATTATAATATATG 274 consensus_1248#1 AAATAACAAAAGTGAATTTATCAATTACGATAATTCTAATCATTACTATTATAATATATG 300 ****** ********************* ************** consensus_1248#0 ATTGATCATTGATTAATATCAATTATTAATTGCCATTATTCTTATCGTATGATCGCTATT 334 consensus_1248#1 ATTGATCATTGATTAATATCAATTATTAATTGCCATTATTCTTATCGTATGATCGCTATT 360 ************************************************************ consensus_1248#0 ATCAACGATTATCCCCTGTACGAAGAGAAATTATTTATTATATTTGACGAAAAAGAATAT 394 consensus_1248#1 ATCAACGATTATCCCCTGTACGAAGAGAAATTATTTATTATATTTGACGAAAAAGAATAT 420 ************************************************************ consensus_1248#0 AATTGTATGCGAGTGAGTGAACTGTGCGAATAAAAATTGGAATAAAAGGGGAAGAGTTTG 454 consensus_1248#1 AATTGTATGCGAGTGAGTGA---------------------------------------- 440 ******************** consensus_1248#0 ATGATCAGCC 464 consensus_1248#1 ---------- |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |