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Apis mellifera
cluster # 1345 cluster # 1345       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1345#0 length = 680 sequences # 2  

consensusID : consensus_1345#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 680
fasta sequence
                              [TACGATAATCGTAATGGCTGATGATTTCTCCTCGGTGGAATATCAGTGGAATAATATCAATGGATCAGATTCATCCGGTTAATCATAATCTATAATCGATCGTAATATAATCCGAGAATTCGATTTAATAGACTCGTAAGAAATATATACGAAGGTCTCTTCGACGCCAACATATTCATTACTGTTTAAAAATTATGTAAATTCTTAAGAGGGGGAAAACGGGGCCCCGATTTTCGGGGGACTTTGAAGGGCCCTTTCCTCTCGGGGCTCTCGATTTAATCTTAGCTCGATTCGTTCGAGGTGAATAATGTCCTTTAACGTTTAAGAAAATTAAGAAAGAAAGTGTCCCGGTATCGATATTGGTCCGATATATCAGTCATTGTACGTGTATATGCAGATTTATATTACACGTGATTTGACGTGGAAGGAGNNNAAAAAGATCGTTTCTGCTTCGCAATTTTTAATTAAAAAATTTCTTTACCCGAGTTTCGTTCTTATCGGGTTTTATATAATCGAATAATGGAGTTTTTAACGTGGTTCTAAATTTAATAGCAACTTTTTTTTATCTCGTATCGTACAATATCTTGGTAATTTTATTATTTCATCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCCGATACGTTTTATCTTTTTCCACTTGTTCTT]

[+] EMBL BI507019             [TACGATAATCGTAATGGCTGATGATTTCTCCTCGGTGGAATATCAGTGGAATAATATCAATGGATCAGATTCATCCGGTTAATCATAATCTATAATCGATCGTAATATAATCCGAGAATTCGATTTAATAGACTCGTAAGAAATATATACGAAGGTCTCTTCGACGCCAACATATTCATTACTGTTTAAAAATTATGTAAATTCTTAAGAGGGGGAAAACGGGGCCCCGATTTTCGGGGGACTTTGAAGGGCCCTTTCCTCTCGGGGCTCTCGATTTAATCTTAGCTCGATTCGTTCGAGGTGAATAATGTCCTTTAACGTTTAAGAAAATTAAGAAAGAAAGTGTCCCGGTATCGATATTGGTCCGATATATCAGTCATTGTACGTGTATATGCAGATTTATATTACACGTGATTTGACGTGGAAGGAGNNNAAAAAGATCGTTTCTGCTTCGCAATTTTTAATTAAAAAATTTCTTTACCCGAGTTTCGTTCTTATC                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI508596             [                                                                                                                                                                                                                                   CGATTTTCGGGGGACTTTGAAGGGCCCTTTCCTCTCGGGGCTCTCGATTTAATCTTAGCTCGATTCGTTCGAGGTGAATAATGTCCTTTAACGTTTAAGAAAATTAAGAAAGAAAGTGTCCCGGTATCGATATTGGTCCGATATATCAGTCATTGTACGTGTATATGCAGATTTATATTACACGTGATTTGACGTGGAAGGAGAAAAAAAAGATCGTTTCTGCTTCGCAATTTTTAATTAAAAAATTTCTTTACCCGAGTTTCGTTCTTATCGGGTTTTATATAATCGAATAATGGAGTTTTTAACGTGGTTCTAAATTTAATAGCAACTTTTTTTTATCTCGTATCGTACAATATCTTGGTAATTTTATTATTTCATCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCCGATACGTTTTATCTTTTTCCACTTGTTCTT]


>consensus_1345#0 TACGATAATCGTAATGGCTGATGATTTCTCCTCGGTGGAATATCAGTGGAATAATATCAA TGGATCAGATTCATCCGGTTAATCATAATCTATAATCGATCGTAATATAATCCGAGAATT CGATTTAATAGACTCGTAAGAAATATATACGAAGGTCTCTTCGACGCCAACATATTCATT ACTGTTTAAAAATTATGTAAATTCTTAAGAGGGGGAAAACGGGGCCCCGATTTTCGGGGG ACTTTGAAGGGCCCTTTCCTCTCGGGGCTCTCGATTTAATCTTAGCTCGATTCGTTCGAG GTGAATAATGTCCTTTAACGTTTAAGAAAATTAAGAAAGAAAGTGTCCCGGTATCGATAT TGGTCCGATATATCAGTCATTGTACGTGTATATGCAGATTTATATTACACGTGATTTGAC GTGGAAGGAGNNNAAAAAGATCGTTTCTGCTTCGCAATTTTTAATTAAAAAATTTCTTTA CCCGAGTTTCGTTCTTATCGGGTTTTATATAATCGAATAATGGAGTTTTTAACGTGGTTC TAAATTTAATAGCAACTTTTTTTTATCTCGTATCGTACAATATCTTGGTAATTTTATTAT TTCATCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCCGATACGTTTT ATCTTTTTCCACTTGTTCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)