Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1353 cluster # 1353       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1353#0 length = 633 sequences # 2  

consensusID : consensus_1353#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 633
fasta sequence
                              [CCAGAGTTGCAGTTATTTTCGCAGCATGAGTACAGTGGAGAGCAGAGAAATCGACTTGACGTACCATCGCGTTTTTATATTTTCGATTACGAGTTTTTGATTGTAACAGCGGTCCAAAAAAAAAACAACAGTGTACGTGCCAATAACGAGATTCGTTAGATAAGGTAATGTCGATTAGAGCGAGATAATCGATCGAGCTCGTAACAAAGGAAATATAATAATATACATATATACATATATATATAATATAACATTATTTATTAAAATTATACATATATATGTATATATATATATACATACACTATGTATAATATACATACAAATGCATGTATGCGTATGCATTTAATACGTAAGTGTATACATATACATGCACAATTATTTTTTGTAATCGAATTAAAAATGGACGAGCTGTTTTAACAAGTCCAATCGAATAAAGGCTAATTAAAATAACGCATAAGATATAAAATAACACGTCGAGTTACTATCGTATCGGATTAAGGAGGGTCTTCTACACATATATATATATATATATATATANNNTNAGTTCAGGAAACATTATATTTTGTGTGCGTGCATAGTCTGCGTAACTCTAACGATCGATAACTAGTCCAAATGATCCTCTCACCGTAACGT]

[+] EMBL BI508921             [CCAGAGTTGCAGTTATTTTCGCAGCATGAGTACAGTGGAGAGCAGAGAAATCGACTTGACGTACCATCGCGTTTTTATATTTTCGATTACGAGTTTTTGATTGTAACAGCGGTCCAAAAAAAAAACAACAGTGTACGTGCCAATAACGAGATTCGTTAGATAAGGTAATGTCGATTAGAGCGAGATAATCGATCGAGCTCGTAACAAAGGAAATATAATAATATACATATATACATATATATATAATATAACATTATTTATTAAAATTATACATATATATGTATATATATATATACATACACTATGTATAATATACATACAAATGCATGTATGCGTATGCATTTAATACGTAAGTGTATACATATACATGCACAATTATTTTTTGTAATCGAATTAAAAATGGACGAGCTGTTTTAACAAGTCCAATCGAATAAAGGCTAATTAAAATAACGCATAAGATATAAAATAACACGTCGAGTTAC                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI506954             [             TATTTTCGCAGCATGAGTACAGTGGAGAGCAGAGAAATCGACTTGACGTACCATCGCGTTTTTATATTTTCGATTACGAGTTTTTGATTGTAACAGCGGTCC AAAAAAAAACAACAGTGTACGTGCCAATAACGAGATTCGTTAGATAAGGTAATGTCGATTAGAGCGAGATAATCGATCGAGCTCGTAACAAAGGAAATATAATAATATACATATATACATATATATATAATATAACATTATTTATTAAAATTATACATATATATGTATATATATATATACATACACTATGTATAATATACATACAAATGCATGTATGCGTATGCATTTAATACGTAAGTGTATACATATACATGCACAATTATTTTTTGTAATCGAATTAAAAATGGACGAGCTGTTTTAACAAGTCCAATCGAATAAAGGCTAATTAAAATAACGCATAAGATATAAAATAACACGTCGAGTTACTATCGTATCGGATTAAGGAGGGTCTTCTACACATATATATATATATATATATATANNNTNAGTTCAGGAAACATTATATTTTGTGTGCGTGCATAGTCTGCGTAACTCTAACGATCGATAACTAGTCCAAATGATCCTCTCACCGTAACGT]


>consensus_1353#0 CCAGAGTTGCAGTTATTTTCGCAGCATGAGTACAGTGGAGAGCAGAGAAATCGACTTGAC GTACCATCGCGTTTTTATATTTTCGATTACGAGTTTTTGATTGTAACAGCGGTCCAAAAA AAAAACAACAGTGTACGTGCCAATAACGAGATTCGTTAGATAAGGTAATGTCGATTAGAG CGAGATAATCGATCGAGCTCGTAACAAAGGAAATATAATAATATACATATATACATATAT ATATAATATAACATTATTTATTAAAATTATACATATATATGTATATATATATATACATAC ACTATGTATAATATACATACAAATGCATGTATGCGTATGCATTTAATACGTAAGTGTATA CATATACATGCACAATTATTTTTTGTAATCGAATTAAAAATGGACGAGCTGTTTTAACAA GTCCAATCGAATAAAGGCTAATTAAAATAACGCATAAGATATAAAATAACACGTCGAGTT ACTATCGTATCGGATTAAGGAGGGTCTTCTACACATATATATATATATATATATATANNN TNAGTTCAGGAAACATTATATTTTGTGTGCGTGCATAGTCTGCGTAACTCTAACGATCGA TAACTAGTCCAAATGATCCTCTCACCGTAACGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)