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Apis mellifera
cluster # 144 cluster # 144       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_144#0 length = 1583 sequences # 6  

consensusID : consensus_144#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1583
fasta sequence
                              [ATTTGTAATATCCTAGAAAAAAAATGACAAAATGGTTGCTGTTGATGGTATGCCTTGGCATAGCTTGTCAAAATATTAGAGGTGGCGTTGTTCGAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGACAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTCAAGCTATGGATTCGACAAATACTATGNNGTACATGGTAGACAACAAAAATACTTTGATCATCTACCAAAATGCCGATGATTCTTTTCATCGATTGTCTTCCCACACTTTGAATCACAACTCTGACAAAATGTCAGATCAACAAGAAAATCTCACCTTGAAAGAAGTAGACAACAAAGTTTATGGAATGGCACTTAGTCCCGTGACGCATAATCTTTATTACAATTCTCCGTCTTCTGAGAATTTGTATTATGTTAACACAGAATCGTTAATGAAATCGGAAAATCAAGGAAATGACGTGCAATATGAAAGAGTCCAAGACGTTTTCGACAGTCAATTAACCGTTAAAGCAGTATCGAAAAATGGCGTACTCCTTTTCGGACTCGCGAATAATACTCTTAGTTGCTGGAACGAGCATCAGTCACTTGACAGACAAAATATCGATGTCGTAGCTCGAAATGAGGACACGCTTCAAATGGTCGTTAGTATGAAGATTAAGCAAAACGTTCCACAATCTGGCAGAGTTAATAATACGCAAAGAAATGAATATTTGTTGGCTTTAAGCGACAGAAACCAGAACGTGCTAAACAACGATCTTAATCTCGAACACGTGAACTTCCAAATTTTGGGCGCTAACGTAAACGACTTGATACGGAATAGTCGTTGCGCAAATTTTGACAATCAGGATAATAATCACTATAATCATAATCATAATCAAGCTCGTCATTCTTCAAAATCTGACAATCAGAATAACAATCAACATAACGATCAAGCTCATCATTCTTCAAAGTCTAACAATCGGCATAACAATAACGATTAAGCTCATCATTTTTCAAAATTTGATAATCAGAATAACAATCAGAATAACGATTAATATAATAATCAATTTTATCATTCTTTAAAATCTGTTAATTAATCTTTTCTCGATGTAAGTCAAATATTTTAAAAAAATTTCATTACATTATAAAACGATAAAATAAATATC]

[+] EMBL AMRJP572             [ATTTGTAATATCCTAGAAAAAAAATGACAAAATGGTTGCTGTTGATGGTATGCCTTGGCATAGCTTGTCAAAATATTAGAGGTGGCGTTGTTCGAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGACAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTCAAGCTATGGATTCGACAAATACTATGGTGTACATGGTAGACAACAAAAATACTTTGATCATCTACCAAAATGCCGATGATTCTTTTCATCGATTGTCTTCCCACACTTTGAATCACAACTCTGACAAAATGTCAGATCAACAAGAAAATCTCACCTTGAAAGAAGTAGACAACAAAGTTTATGGAATGGCACTTAGTCCCGTGACGCATAATCTTTATTACAATTCTCCGTCTTCTGAGAATTTGTATTATGTTAACACAGAATCGTTAATGAAATCGGAAAATCAAGGAAATGACGTGCAATATGAAAGAGTCCAAGACGTTTTCGACAGTCAATTAACCGTTAAAGCAGTATCGAAAAATGGCGTACTCCTTTTCGGACTCGCGAATAATACTCTTAGTTGCTGGAACGAGCATCAGTCACTTGACAGACAAAATATCGATGTCGTAGCTCGAAATGAGGACACGCTTCAAATGGTCGTTAGTATGAAGATTAAGCAAAACGTTCCACAATCTGGCAGAGTTAATAATACGCAAAGAAATGAATATTTGTTGGCTTTAAGCGACAGAAACCAGAACGTGCTAAACAACGATCTTAATCTCGAACACGTGAACTTCCAAATTTTGGGCGCTAACGTAAACGACTTGATACGGAATAGTCGTTGCGCAAATTTTGACAATCAGGATAATAATCACTATAATCATAATCATAATCAAGCTCGTCATTCTTCAAAATCTGACAATCAGAATAACAATCAACATAACGATCAAGCTCATCATTCTTCAAAGTCTAACAATCGGCATAACAATAACGATTAAGCTCATCATTTTTCAAAATTTGATAATCAGAATAACAATCAGAATAACGATTAATATAATAATCAATTTTATCATTCTTTAAAATCTGTTAATTAATCTTTTCTCGATGTAAGTCAAATATTTTAAAAAAATTTCATTACATTATAAAACGATAAAATAAATATC]
[+] EMBL BI514419             [                                                                    CAAAATATTAGAGGTGGCGTTGTTCGAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGACAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI512357             [                                                                                             GAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGACAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCNNCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI516947             [                                                                                                                        CAAATACGTTGAACGTGATTCACGAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGATAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCACAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGACTCGGGTCTTGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGCTCGCCTTTGATCTCAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTCAAGCTATGGATTCTACAAATACTATGNNGTACATGGTAGACAACAAAAATACTTTGATCATCTACCAAAATGCCGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI509410             [                                                                                                                                               gAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACGAAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTGACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTTCCTCTTTGAACGTGGTATCTGATAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATCCTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCACAAAATTGCTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGACTCGGGTCTTGTCAATAATACGCAACCCATGTGTTCTCCAAAACTGCTCGCCTTTGATCTCAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAGTCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTCAAGCTATGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI515586             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCAATTAACCGTTAAAGCAGTATCGAAAAATGGCGTACTCCTTTTCGGACTCGCGAATAATACTCTTAGTTGCTGGAACGAGCATCAGTCACTTGACAGACAAAATATCGATGTCGTAGCTCGAAATGAGGACACGCTTCAAATGGTCGTTAGTATGAAGATTAAGCAAAACGTTCCACAATCTGGCAGAGTTAATAATACGCAAAGAAATGAATATTTGTTGGCTTTAAGCGACAGAAACCAGAACGTGCTAAACAACGATCTTAATCTCGAACACGTGAACTTCCAAATTTTGGGCGCTAACGTAAACGACTTGATACGGAATAGTCGTTGCGCAAATTTTGACAATCAGGATAATAATCACTATAATCATAATCATAATCAAGCTCGTCATTCTTCAAAATCTGACAATCAGAATAACAATCAACATAACGATCAAGCTCATCATTCTTCAAAGTCTAACAATCGGCATAACAATAACGATTAAGCTCATCATTTTTCAAAATTTGATAATCAGAATAACAATCAGAATAACGATTAATATAATAATCAATTTTA                                                                                              ]


>consensus_144#0 ATTTGTAATATCCTAGAAAAAAAATGACAAAATGGTTGCTGTTGATGGTATGCCTTGGCA TAGCTTGTCAAAATATTAGAGGTGGCGTTGTTCGAGAAAATTCCTCGGGAAAAAACTTGA CAAATACGTTGAACGTGATTCACAAATGGAAGTATCTCGATTATGATTTCGATAACGACG AAAGGAGGCAAGCTGCGATTCAATCTGGCGAATATGATCGTACAAAAAATTATCCTCTTG ACGTCGATCAATGGCACAACAAGACTTTTCTCGCTGTAATAAGATACAATGGTGTGCCTT CCTCTTTGAACGTGGTATCTGACAAAACTGGCAACGGTGGACGACTTCTACAACCGTATC CTGATTGGTCATTTGCCAAGTACGAAGATTGCTCTGGAATCGTGAGCGCTCATAAAATTG CTATCGACGAATATGAGAGATTGTGGGTTCTGGATTCGGGTCTCGTCAATAATACGCAAC CCATGTGTTCTCCAAAACTGTTCGCTTTTGATCTTAATACCTCGCAATTGCTCAAGCAAG TCGAGATACCGCACGATGTTGCCACCACAGGAAAGGGCGAATTAGTATCTTTAACTGTTC AAGCTATGGATTCGACAAATACTATGNNGTACATGGTAGACAACAAAAATACTTTGATCA TCTACCAAAATGCCGATGATTCTTTTCATCGATTGTCTTCCCACACTTTGAATCACAACT CTGACAAAATGTCAGATCAACAAGAAAATCTCACCTTGAAAGAAGTAGACAACAAAGTTT ATGGAATGGCACTTAGTCCCGTGACGCATAATCTTTATTACAATTCTCCGTCTTCTGAGA ATTTGTATTATGTTAACACAGAATCGTTAATGAAATCGGAAAATCAAGGAAATGACGTGC AATATGAAAGAGTCCAAGACGTTTTCGACAGTCAATTAACCGTTAAAGCAGTATCGAAAA ATGGCGTACTCCTTTTCGGACTCGCGAATAATACTCTTAGTTGCTGGAACGAGCATCAGT CACTTGACAGACAAAATATCGATGTCGTAGCTCGAAATGAGGACACGCTTCAAATGGTCG TTAGTATGAAGATTAAGCAAAACGTTCCACAATCTGGCAGAGTTAATAATACGCAAAGAA ATGAATATTTGTTGGCTTTAAGCGACAGAAACCAGAACGTGCTAAACAACGATCTTAATC TCGAACACGTGAACTTCCAAATTTTGGGCGCTAACGTAAACGACTTGATACGGAATAGTC GTTGCGCAAATTTTGACAATCAGGATAATAATCACTATAATCATAATCATAATCAAGCTC GTCATTCTTCAAAATCTGACAATCAGAATAACAATCAACATAACGATCAAGCTCATCATT CTTCAAAGTCTAACAATCGGCATAACAATAACGATTAAGCTCATCATTTTTCAAAATTTG ATAATCAGAATAACAATCAGAATAACGATTAATATAATAATCAATTTTATCATTCTTTAA AATCTGTTAATTAATCTTTTCTCGATGTAAGTCAAATATTTTAAAAAAATTTCATTACAT TATAAAACGATAAAATAAATATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)