These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_148#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 737 fasta sequence [TTTTGAATTCTATGAAAATTGTTATGCATCGATTTTTGGCTTAATTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGCGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAGAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCGTTACTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA-GTTTAAAAAGATCGTAT-CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG-TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATA-CTATGAAGTATAATTTTAATTTTATTATTCTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTAATATTTATCATACAAAAGTTTTTTCTTTCTTCATCATCTTATTTCAGATATTTCCATTTATATTTTAAAACACTTTTTTATAAACAGTTTGTAAAAAAATTTAAAAAACATTGCTCA] [+] EMBL BI946523 [TTTTGAATTCTATGAAAATTGTTATGCATCGATTTTTGGCTTAATTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGCGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAAAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCGTTATTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATACCTATGAAGGATAAATTTAAATTTATTAAT TCTTTTTTCCCCTTT CTTTAATATTTATCA ATACAAAGTTTTTCTTTCTTCATCATCTTA TTCAGATATTTCCAT ] [+] EMBL BI511001 [ ATTGTTATGCATCGATTTTTGGCTTAATTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGCGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAAAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCGTTATTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATT ] [+] EMBL BI509178 [ TTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGTGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAGAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCATTACTAAAGATTCGAAAACTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATA CTATGAAGTATAATTTTAATTTTATTATTCTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTAATATTTATCATACAAAAGTTTTTTCTTTCT ] [+] EMBL BI512175 [ TTAATAATATTTGATTATATAGTTTTTATTTTGTGTGAATATTATTTTTTTTTCTGTAATCTTTTTGAGAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCATTACTAAAGATTCGAAAACTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCNNTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTA ] [+] EMBL BI506316 [ TTCTGTAATCTTTTTGAGAGAGAAAAAATGAAAATATGAAATTTTGCATTACTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAA GTTTAAAAAGATCGTAT CAACTTTCTTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACGTTTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATA CTATGAAGTATAATTTTAATTTTATTATTCTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTAATATTTATCATACAAAAGTTTTTTCTTTCTTCATCATCTTATTTCAGATATTTCCATTTATATTTTAAAACACTT ] [-] EMBL BI946522 [ cgGTTATTAAAGATTCGAAAATTAAAGTAGATTAAAAGATTTTAAGTTTCAAGAAATTTTAAGGTTTAAAAAGATCGTATCCAACTTTCCTTTTTCTCTTCGTGTTTAAATATTTATAATCGAATACG TTTTGCATTTAGGATTTTTTTGTAGCTTCTGCAAGCTAAACTAACCAGACCGTGATGTGCAATTGCTATTCGCCATTCGAACAGTGTGCAGTATTAGCCTTTCAAATCGAATAATACCTTCAAGGAGATTCCATTGAATGTTTCATAACGTGTTGTTCAGTATCGAATTGCGAACGTATTCACATTGTCTTATGCTACTATTTCTATCATTATTCTATCTATATTATTGTTTTGCTATCATAAACATTCCATTCTATTTTCTCAATTAGACAAACACGATCAAATTATTGAATTATTGAATA CTATGAAGTATAATTTTAATTTTATTATTCTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTAATATTTATCATACAAAAGTTTTTTCTTTCTTCATCATCTTATTTCAGATATTTCCATTTATATTTTAAAACACTTTTTTATAAACAGTTTGTAAAAAAATTTAAAAAACATTGCTCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |