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Apis mellifera
cluster # 149 cluster # 149       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_149#0 length = 803 sequences # 6  

consensusID : consensus_149#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 803
fasta sequence
                              [GAAAACAAGAGCTATGTCTGACTATTACGTTGACGAATACGAACATTTTAATTACGATTACGACAAGCATATCTTTACCGGTCATAGTGGAAAACAGCGAAGCAAACGCGAAGCTCTTACACATACGAATCATTTTGATCCGTGCGGCCATTCTAGAAAGATCCTTACTAAATTGATGAATTCTGAACATAATAAGCGAAATGTTGGAAAAACTAAAGCATAAGCAGAACTCAGATTATTATCCTGCCCTGAAGTTGCTGTTTGAAAAAAGTATTTGTCAATTGATTAAAATTTCTTGAACATTTTTGAATATGATAACAATTTTTTCATTTCTTTTATTCTTAGTAATGCATTTAGTTACTAAATATAAATTTTTACTTAGAATAAGATAATTAGTATTTAGTATAAATATTATCTTACAATTATTACTATTACTCATGTTATATATTGTGACTTTAAAGTATATATAACTATCTCCTAATTAGATTACTTTTAATCCAGAATTGCCTGAATCTGGAGCTTTCACACATTAGTATACAGATATATCTGTATTAAATTTATATACACTATATAAATTTTCTAAATTTTGTGCATTTAAGTGGTTATAAATGTTTTATTTAGTTGATATTAGAACTCAATTGCTCAATTTAAAAACCAGGAATGTATGACAGCGTGAAAATACTTTATTTGATGTGAATATTAAGGGGAATGCATTTCTTTATCATGTTATGAAAAATTTTTGTTACATTCAAAAATCAACTTTAAGTTTAGTAAAAAATAAAAATATTAAATAGAAATGACTG]

[+] EMBL BI508759             [GAAAACAAGAGCTATGTCTGACTATTACGTTGACGAATACGAACATTTTAATTACGATTACGACAAGCATATCTTTACCGGTCATAGTGGAAAACAGCGAAGCAAACGCGAAGCTCTTACACATACGAATCATTTTGATCCGTGCGGCCATTCTAGAAAGATCCTTACTAAATTGATGAATTCTGAACATAATAAGCGAAATGTTGGAAAAACTAAAGCATAAGCAGAACTCAGATTATTATCCTGCCCTGAAGTTGCTGTTTGAAAAAAGTATTTGTCAATTGATTAAAATTTCTTGAACATTTTTGAATATGATAACAATTTTTTCATTTCTTTTATTCTTAGTAATGCATTTAGTTACTAAATATAAATTTTTACTTAGAATAAGATAATTAGTATTTAGTATAAATATTATCTTACAATTATTACTATTACTCATGTTATATATTNNGACTTTAAAGTATATATAACTATCTCCTAATTAGATTACTTTTAATCCAGAATTGCCTGAATCTGGAGCTTTCACACATTAG                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI504657             [     CAAGAGCTATGTCTGACTATTACGTTGACGAATACGAACATTTTAATTACGATTACGACAAGCATATCTTTACCGGTCATAGTGGAAAACAGCGAAGCAAACGCGAAGCTCTTACACATACGAATCATTTTGATCCGTGCGGCCATTCTAGAAAGATCCTTACTAAATTGATGAATTCTGAACATAATAAGCGAAATGTTGGAAAAACTAAAGCATAAGCAGAACTCAGATTATTATCCTGCCCTGAAGTTGCTGTTTGAAAAAAGTATTTGTCAATTGATTAAAATTTCTTGAACATTTTTGAATATGATAACAATTTTTTCATTTCTTTTATTCTTAGTAATGCATTTAGTTACTAAATATAAATTTTTACTTAGAATAAGATAATTAGTATTTAGTATAAATATTATCTTACAATTATTACTATTACTCATGTTATATATTGTGACTTTAAAGTATATATAACTATCTCCTAATTAGATTACTTTTAATCCAGAATTGCCTGAATCTGGAGCTTTCACACATTAGTATACAGATATATCTGTATTAAATTTATATACACTATATA                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI508714             [                                                       GATTACGACAAGCATATCTTTACCGGTCATAGTGGAAAACAGCGAAGCAAACGCGAAGCTCTTACACATACGAATCATTTTGATCCGTGCGGCCATTCTAGAAAGATCCTTACTAAATTGATGAATTCTGAACATAATAAGCGAAATGTTGGAAAAACTAAAGCATAAGCAGAACTCAGATTATTATCCTGCCCTGAAGTTGCTGTTTGAAAAAAGTATTTGTCAATTGATTAAAATTTCTTGAACATTTTTGAATATGATAACAATTTTTTCATTTCTTTTATTCTTAGTAATGCATTTAGTTACTAAATATAAAaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI505110             [                                                                AAGCATATCTTTACCGGTCATAGTGGAAAACAGCGAAGCAAACGCGAAGCTCTTACACATACGAATCATTTTGATCCGTGCGGCCATTCTAGAAAGATCCTTACTAAATTGATGAATTCTGAACATAATAAGCGAAATGTTGGAAAAACTAAAGCATAAGCAGAACTCAGATTATTATCCTGCCCTGAAGTTGCTGTTTGAAAAAAGTATTTGTCAATTGATTAAAATTTCTTGAACATTTTTGAATATGATAACAATTTTTTCATTTCTTTTATTCTTAGTAATGCATTTAGTTACTAAATATAAATTTTTACTTAGAATAAGATAATTAGTATTTAGTATAAATATTATCTTACAATTATTACTATTACTCATGTTATATATTGTGACTTTAAAGTATATATAACTATCTCCTAATTAGATTACTTTTAATCCAGAATTGCCTGAATCTGGAGCTTTCACACATTAGTATACAGATATATCTGTATTAAATTTATATACACTATATAAATTTTCTAAATTTTGTGCATTTAAGTGGTTATAAATGTTTTATTTAGTTGATATTAGAACTCAATTGCTCAATTTAAAAACCAGGAATGTATGACAGCGTGAAAAT                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI503512             [                                                                            ACCGGTCATAGTGGAAAACAGCGAAGCAAACGCGAAGCTCTTACACATACGAATCATTTTGATCCGTGCGGCCATTCTAGAAAGATCCTTACTAAATTGATGAATTCTGAACATAATAAGCGAAATGTTGGAAAAACTAAAGCATAAGCAGAACTCAGATTATTATCCTGCCCTGAAGTTGCTGTTTGAAAAAAGTATTTGTCAATTGATTAAAATTTCTTGAACATTTTTGAATATGATAACAATTTTTTCATTTCTTTTATTCTTAGTAATGCATTTAGTTACTAAATATAAATTTTTACTTAGAATAAGATAATTAGTATTTAGTATAAATATTATCTTACAATTATTACTATTACTCATGTTATATATTGTGACTTTAAAGTATATATAACTATCTCCTAATTAGATTACTTTTAATCCAGAATTGCCTGAATCTGGAGCTTTCACACATTAGTATACAGATATATCTGTATTAAATTTATATACACTATATAAATTTTCTAAATTTTGTGCATTTAAGTGGTTATAAATGTTTTATTTAGTTGATATTAGAACTCAATTGCTCAATTTAAAAACCAGGAATGTATGACAGTGTGAAAATACTTTATTTGATGTGAATATTAAGGGGAATGCATTTCTTTATCATG                                                                             ]
[-] EMBL BI516222             [                                                                                                                                                                                                                                                                          AAAAGTATTTGTCAATTGATCAAAATTTCTTGAACATTTTTGAATATGATAACAATTTTTTCATTTCTTTTATTCTTAGTAATGCATTTAGTTACTAAATATAAATTTTTACTTAGAATAAGATAATTAGTATTTAGTATAAATATTATCTTACAATTATTACTATTACTCATGTTATATATTGTGACTTTAAAGTATATATAACTATCTCCTAATTAGATTACTTTTAATCCAGAATTGCCTGAATCTGGAGCTTTCACACATTAGTATACAGATATATCTGTATTAAATTTATATACACTATATAAATTTTCTAAATTTTGTGCATTTAAGTGGTTATAAATGTTTTATTTAGTTGATATTAGAACTCAATTGCTCAATTTAAAAACCAGGAATGTATGACAGCGTGAAAATACTTTATTTGATGTGAATATTAAAGGGAATGCATTTCTTTATCATGTTATGAAAAATTTTTGTTACATTCAAAAATCAACTTTAAGTTTAGTAAAAAATAAAAATATTAAATAGAAATGACTG]


>consensus_149#0 GAAAACAAGAGCTATGTCTGACTATTACGTTGACGAATACGAACATTTTAATTACGATTA CGACAAGCATATCTTTACCGGTCATAGTGGAAAACAGCGAAGCAAACGCGAAGCTCTTAC ACATACGAATCATTTTGATCCGTGCGGCCATTCTAGAAAGATCCTTACTAAATTGATGAA TTCTGAACATAATAAGCGAAATGTTGGAAAAACTAAAGCATAAGCAGAACTCAGATTATT ATCCTGCCCTGAAGTTGCTGTTTGAAAAAAGTATTTGTCAATTGATTAAAATTTCTTGAA CATTTTTGAATATGATAACAATTTTTTCATTTCTTTTATTCTTAGTAATGCATTTAGTTA CTAAATATAAATTTTTACTTAGAATAAGATAATTAGTATTTAGTATAAATATTATCTTAC AATTATTACTATTACTCATGTTATATATTGTGACTTTAAAGTATATATAACTATCTCCTA ATTAGATTACTTTTAATCCAGAATTGCCTGAATCTGGAGCTTTCACACATTAGTATACAG ATATATCTGTATTAAATTTATATACACTATATAAATTTTCTAAATTTTGTGCATTTAAGT GGTTATAAATGTTTTATTTAGTTGATATTAGAACTCAATTGCTCAATTTAAAAACCAGGA ATGTATGACAGCGTGAAAATACTTTATTTGATGTGAATATTAAGGGGAATGCATTTCTTT ATCATGTTATGAAAAATTTTTGTTACATTCAAAAATCAACTTTAAGTTTAGTAAAAAATA AAAATATTAAATAGAAATGACTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)