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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_156#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1002 fasta sequence
[AGTCAATTACCACGAGTAGAGATTTACACGAGTTGAATTGCTATGAGAGATAAATTTAAAACGGACTTTTTAATCAAAATAAATAATTTTCCCAACTTTCTCTGATTCACGAATTTTTCTCTTTTTTTTTTGTTTCCCCTTCGCTAAATCAAATAATGGAAAACAAGAATTAAATATTTATTAAACTTAATTTTTATCGTTTTCGATATAGACAATCGAGATTAAAACGAGAATATTCGTTCTCTTCTCAGGTTAACCAACATCTGAAATTCCTAAATTGTAGAATGATTCATCCTAGCCGGTAAGCGAGTCACAAATAGTAGAGATGATAATCTACTTTACCTGTTTCACGAATGAAAGCAATGAAAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAATATCACGAAGGTAGCATACAGAAATTATTAGCGATTATATACCTGTTCTTCTGAGATTAGGCGAAGAGATGATTTATCTAAAGTGAAAATTAGCTCGAGTCTAGCGTAAATGATACTTAAACACTTAACCTGTTTCCCGTCACGGATGTCAACCGATCGATTAACGTTG-TTATTGTTGGACGAATGTTTCGAGGTAGAAATTATTCTAAATTCGAATAATTTTTCAATTTTTTTAAAAATAATGATAGAAATCGATTCGAATGTGGATTTTCGATGCAACGTTGTTAATTCGAGACGGAGAGGTTAGGTTTTGATTACGTACTGCCATTACGTATTTGAATGGAAATCGATAAATTGACAAATTTAATATAAACATTCTGTAATACAGTAGAGAAAATATATGTGGAAAATTTATAATACAATGTAATTTTAAAATTTTTCTTGTATGATAAGAGCTTATATAATGAAAATATATATAATAGTATTCGTGAAATATATATTTGATGAAAACATCTACAATAGTATTTTCAATATTTAATGACACTAGTGTGAAAATTTGTCAGGTGATCGTATCAATATTGGAAATTTGTCACATCACAGG]
[+] EMBL BI946409 [AGTCAATTACCACGAGTAGAGATTTACACGAGTTGAATTGCTATGAGAGATAAATTTAAAACGGACTTTTTAATCAAAATAAATAATTTTCCCAACTTTCTCTGATTCACGAATTTTTCTCTTTTTTTTTTGTTTCCCCTTCGCTAAATCAAATAATGGAAAACAAGAATTAAATATTTATTAAACTTAATTTTTATCGTTTTCGATATAGACAATCGAGATTAAAACGAGAATATTCGTTCTCTTCTCAGGTTAACCAACATCTGAAATTCCTAAATTGTAGAATGATTCATCCTAGCCGGTAAGCGAGTCACAAATAGTAGAGATGATAATCTACTTTACCTGTTTCACGAATGAAAGCAATGAAAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAATATCACGAAGGTAGCATACAGAAATTATTAGCGATTATATACCTGTTCTTCTGAGATTAGGCGAAGAGATGATTTATCTAAAGTGAAAATTAGCTCGAGTCTAGCGTAAATGATACTTAAACACTTAACCTGTTTCCCGTCACGGATGTCAACCGATCGATTAACATTGTTTATTGTTGGACGAATGTTTCGAGGCCCAA ]
[+] EMBL BI516784 [ TATATACCTGTTCTTCTGAGATTAGGCGAAGAGATGATTTATCTAAAGTGAAAATTAGCTCGAGTCTAGCGTAAATGATACTTAAACACTTAACCTGTTTCCCGTCACGGATGTCAACCGATCGATTAACGTTG TTATTGTTGGACGAATGTTTCGAGGTAGAAATTATTCTAAATTCGAATAATTTTTCAATTTTTTTAAAAATAATGATAGAAATCGATTCGAATGTGGATTTTCGATGCAACGTTGTTAATTCGAGACGGAGAGGTTAGGTTTTGATTACGTACTGCCATTACGTATTTGAATGGAAATCGATAAATTGACAAATTTAATATAAACATTCTGTAATACAGTAGAGAAAATATATGTGGAAAATTTATAATACAATGTAATTTTAAAATTTTTCTTGTATGATAAGAGCTTATATAATGAAAATATATATAATAGTATTCGTGAAATATATATTTGATGAAAACATCTACAATAGTATTTTCAATA ]
[+] EMBL BI516591 [ CGATTAACGTTG TTATTGTTGGACGAATGTTTCGAGGTAGAAATTATTCTAAATTCGAATAATTTTTCAATTTTTTTAAAAATAATGATAGAAATCGATTCGAATGTGGATTTTCGATGCAACGTTGTTAATTCGAGACGGAGAGGTTAGGTTTTGATTACGTACTGCCATTACGTATTTGAATGGAAATCGATAAATTGACAAATTTAATATAAACATTCTGTAATACAGTAGAGAAAATATATGTGGAAAATTTATAATACAATGTAATTTTAAAATTTTTCTTGTATGATAAGAGCTTATATAATGAAAATATATATAATAGTATTCGTGAAATATATATTTGATGAAAACATCTACAATAGTATTTTCAATATTTAATGACACTAGTGTGAAAATTTGTCAGGTGATCGTATCAATATTGGAAATTTGTCACATCACAGG]
consensusID : consensus_156#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 731 fasta sequence
[ATATTGGAAATTTGTCACATCACAGGAACCGTATATNCGTACAAATATTTGAAATTTGTCACGATGTTACGATCAAAATGTCACAATGTTCGCCATGATAAAATTCAGCCATATGACAGCAAATAAATTAATCTTTGCATTTTACTAGTCATCTTACAATTTCTTCTATATAACTGTTCTTATATCTAATATAATAAAAGGGGAGGGAAAAATCCCAAATTGAACAACGACACGAATCTATTTATATTAATACTTTCATTATTGAATCAAATAGAAATAAGTTGCTTAAGATTCCAAATCTCCACGAATAATAATCTATGAGTTCTAATCTATAAATCTATTCTAATTTAATAAATCAAGATTCTATTAATTTAATCAAGTAGAAAAGATGTTTCATCAAAAATCCATGAAGAATCGAATTCGATATTCCACACCACGAACATTATATAATCCCGTTTTAAATTGAATAAAAATATTTGTTAAAAGCTACAATTGTTGCGGATCACTTCGTTCAAACTTCGCTTACACTTTATCCATGTATTTTTATAACACAAAGTGACAAAGGTGGCGCTTGTGTCCACGTGGATACGCAATCATTGTGGCTCTATCTACCTTCCAAATTTTCATAATCTCGATCTTCGATTGTTCGTACATACATACATATACGATTTAAATTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAACAAAAATAATTTTAAAGCAAAAAAATTT]
[-] EMBL BI503067 [ATATTGGAAATTTGTCACATCACAGGAACCGTATATNCGTACAAATATTTGAAATTTGTCACGATGTTACGATCAAAATGTCACAATGTTCGCCATGATAAAATTCAGCCATATGACAGCAAATAAATTAATCTTTGCATTTTACTAGTCATCTTACAATTTCTTCTATATAACTGTTCTTATATCTAATATAATAAAAGGGGAGGGAAAAATCCCAAATTGAACAACGACACGAATCTATTTATATTAATACTTTCATTATTGAATCAAATAGAAATAAGTTGCTTAAGATTCCAAATCTCCACGAATAATAATCTATGAGTTCTAATCTATAAATCTATTCTAATTTAATAAATCAAGATTCTATTAATTTAATCAAGTAGAAAAAATGTTTCATCAAAAATCCATGAAGAATCGAATTCGATATTCCACACCACGAACATTATATAATCCCGTTTTAAATTGAATAAAAATATTTGTTAAAAGCTACAATTGTTGCGGATCACTTCGTTCAAACTTCGCTTACACTTTATCCATGTATTTTTATAACACAAAGTGACAAAGGTGGCGCTTGTGTCCACGTGGATACGCAATCATTGTGGCTCTATCTACCTTCCAAATTTTCATAATCTCGATCTT ]
[+] EMBL BI505856 [ AAAATTCAGCCATATGACAGCAAATAAATTAATCTTTGCATTTTACTAGTCATCTTACAATTTCTTCTATATAACTGTTCTTATATCTAATATAATAAAAGGGGAGGGAAAAATCCCAAATTGAACAACGACACGAATCTATTTATATTAATACTTTCATTATTGAATCAAATAGAAATAAGTTGCTTAAGATTCCAAATCTCCACGAATAATAATCTATGAGTTCTAATCTATAAATCTATTCTAATTTAATAAATCAAGATTCTATTAATTTAATCAAGTAGAAAAGATGTTTCATCAAAAATCCATGAAGAATCGAATTCGATATTCCACACCACGAACATTATATAATCCCGTTTTAAATTGAATAAAAATATTTGTTAAAAGCTACAATTGTTGCGGATCACTTCGTTCAAACTTCGCTTACACTTTATCCATGTATTTTTATAACACAAAGTGACAAAGGTGGCGCTTGTGTCCACGTGGATACGCAATCATTGTGGCTCTATCTACCTTCCAAATTTTCATAATCTCGATCTTCGATTGTTCGTACATACATACATATACGATTTAAATTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAACAAAAATAATTTTAAAGCAAAAAAATTT]
[+] EMBL BI506891 [ CGATATTCCACACCACGAACATTATATAATCCCGTTTTAAATTGAATAAAAATATTTGTTAAAAGCTACAATTGTTGCGGATCACTTCGTTCAAACTTCGCTTACACTTTATCCATGTATTTTTATAACACAAAGTGACAAAGGTGGCGCTTGTGTCCACGTGGATACGCAATCATTGTGGCTCTATCTACCTTCCAAATTTTCATAATCTCGATCTTCGATTGTTCGTACATACATACATATACGATTTAAATTGCAAAAAAAAAAAA ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_156#0 AGTCAATTACCACGAGTAGAGATTTACACGAGTTGAATTGCTATGAGAGATAAATTTAAA 60
consensus_156#1 ------------------------------------------------------------
consensus_156#0 ACGGACTTTTTAATCAAAATAAATAATTTTCCCAACTTTCTCTGATTCACGAATTTTTCT 120
consensus_156#1 ------------------------------------------------------------
consensus_156#0 CTTTTTTTTTTGTTTCCCCTTCGCTAAATCAAATAATGGAAAACAAGAATTAAATATTTA 180
consensus_156#1 ---------------------------------------------------------ATA 3
**
consensus_156#0 TTAAACTTAATTTTTATCGTTTTCGATATAGACAATCGAGATTAAAACGAGAATATTCGT 240
consensus_156#1 TTGGA---AATTTGTCACATCACAGGAACCGTATATNCGTACAAATATTTGAA-ATTTGT 59
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consensus_156#0 TCTCTTCTCAGGTTAACCAACATCTGAAATTCCTAAATTGTAGAATGATTCATCCTA-GC 299
consensus_156#1 CACGATGTTACGATCAA-AATGTCACAATGTTCGCCATGATAAAAT--TCAGCCATATGA 116
* * * * * * ** ** ** * * ** ** *** * * ** *
consensus_156#0 CGGTAAGCGAGTCACAAATAGTAGAGATGATAATCTACTTTACCTGTTTCACGAATGAAA 359
consensus_156#1 CAGCAAATAAATTA--ATCTTTGCATTTTACTAGTCATCTTACA-ATTTCTTCTATATAA 173
* * ** * * * * * * * * * * **** **** ** **
consensus_156#0 GCAATGAAAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAATATCACGAAGGTAGCATA 419
consensus_156#1 -CTGTTCTTATATCTAATATAATAAAAGGGGAGGGAAAAATCCCAAATTGAACAACGACA 232
* * *** ** * ** **** *** ***** * * * * *
consensus_156#0 CAGAAATTATTAGCGATTATATACCTGTTCTTCTGAGATTAGGCGAAGAGATGATTTATC 479
consensus_156#1 C-GAATCTATTTATATTAATA---CTTTCATTATTGAATCAAAT--AGAAATAAGTTGCT 286
* *** **** * *** ** * ** * ** * *** ** * **
consensus_156#0 TAAAGTGA-AAATTAGCTCGAGTCTAGCGTAAATGATACTTAAACACTTAACCTGTTTCC 538
consensus_156#1 TAAGATTCCAAATCTCCACGAATA-ATAATCTATGAGTTCTAATCTATAAATCTATTCTA 345
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consensus_156#0 CGTCACGGATGTCAACCGATCGATTAACGTTGTTATTGTTGGACGAATGTTTCGAGGTAG 598
consensus_156#1 ATTTAATAA-ATCAAG-ATTCTATTAATTTAATCAA-GTAGAAAAGATGTTTCA--TCAA 400
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consensus_156#0 AAATTATTCTAAATTCGAATA-ATTTTTCAATTTTTTTAAAAATA-ATGATAGAAATC-G 655
consensus_156#1 AAATCCATGAAGAATCGAATTCGATATTCCACACCACGAACATTATATAATCCCGTTTTA 460
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consensus_156#0 ATTCGAATGTGGATTTTCGATGCAA--CGTTGTTAATTCGAGACGGAGAGGTTAGGTTTT 713
consensus_156#1 AATTGAATAAAAATATTTGTTAAAAGCTACAATTGTTGCGGATCACTTCGTTCAAACTTC 520
* * **** ** ** * * ** ** * ** * * * * **
consensus_156#0 GATTACGTACTGCCATTACGTATTTGAATGGAAATCGATAAATTGACAAATTTAATATAA 773
consensus_156#1 GCTTACACTTTATC--CATGTATTTTTATAACA-----CAAAGTGACAAAGGTGGCGCTT 573
* **** * * * ****** ** * *** ******* *
consensus_156#0 ACATTCTGTAATACAGTAGAGAAAATATATGTGGAAAATTTATAATACAATGTAATTTTA 833
consensus_156#1 GTGTCC----ACGTGGATACGCAATCAT-TGTGGC---TCTATCTACCTTCCAAATTTTC 625
* * * * * ** ** ***** * *** * ******
consensus_156#0 AAATTTTTCTTGTATGATAAGAGCTTATATAATGAAAATATATATAATAGTATTCGTGAA 893
consensus_156#1 ATAATCTCGATCTTCGATT---GTTCGTACA-TACATACATATACGATTTAAATTGCAAA 681
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consensus_156#0 ATATATATTTGATGAAAACATCTACAATAGTATTTTCAATATTTAATGACACTAGTGTGA 953
consensus_156#1 AAAAAAAA--AAAAAAAAAAATAACAAAAATAATTTTAAAGCAAAAAAATTT-------- 731
* * * * * **** * **** * ** *** ** ** *
consensus_156#0 AAATTTGTCAGGTGATCGTATCAATATTGGAAATTTGTCACATCACAGG 1002
consensus_156#1 -------------------------------------------------
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| Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |