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Apis mellifera
cluster # 1567 cluster # 1567       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1567#0 length = 611 sequences # 2  

consensusID : consensus_1567#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 611
fasta sequence
                              [GACTACGAATTTACAACAACAACGACAAATCACGGAGCAGCTACGACGTGAAGCTGCTTTAAAACGAATTACGGTTAGCAAAGCTGTCGAAGATATCATGAAATATATCACAGAACACGAACAGGAAGATTATCTTTTGGTTGGTTTTTCATCACAAAAATCAAATCCCTTTCGTGAAAGAAGTTACTGTACCATTTTTTAAACTTGCATGTTTAAAATAAAACAAATTATTTTAATTTTTTTCATTAAATATTCAAATTTTAATGTTTAAATTAATATATTGTAATATCATTTATATTATGAATATTCAATATACATTTAATTCAATTTAATTTAATTCAGATCATCATTNNNTTATTTTTTATATATATAAAAAATATATTCATTTTGATATTTTGATATTTTGATATTCATTTTATATAAAAATTAAATGAGAATTATTATATTAATTAATAAAATTTGAAGAATTTCATTATTATAATTTAATGTTTCATTATTATAACTTTATTGNCCTATGAATGTATCACAAAATGCGCACACACAAGTGATTTTTAACTTGACGTATCAATATCATATTATATATATCATATATATATATATATATATATATA]

[+] EMBL BI508794             [GACTACGAATTTACAACAACAACGACAAATCACGGAGCAGCTACGACGTGAAGCTGCTTTAAAACGAATTACGGTTAGCAAAGCTGTCGAAGATATCATGAAATATATCACAGAACACGAACAGGAAGATTATCTTTTGGTTGGTTTTTCATCACAAAAATCAAATCCCTTTCGTGAAAGAAGTTACTGTACCATTTTTTAAACTTGCATGTTTAAAATAAAACAAATTATTTTAATTTTTTTCATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI516067             [           TACAACAACAACGACAAATCACGGAGCAGCTACGACGTGAAGCTGCTTTAAAACGAATTACGGTTAGCAAAGCTGTCGAAGATATCATGAAATATATCACAGAACACGAACAGGAAGATTATCTTTTGGTTGGTTTTTCATCACAAAAATCAAATCCCTTTCGTGAAAGAAGTTACTGTACCATTTTTTAAACTTGCATGTTTAAAATAAAACAAATTATTTTAATTTTTTTCATTAAATATTCAAATTTTAATGTTTAAATTAATATATTGTAATATCATTTATATTATGAATATTCAATATACATTTAATTCAATTTAATTTAATTCAGATCATCATTNNNTTATTTTTTATATATATAAAAAATATATTCATTTTGATATTTTGATATTTTGATATTCATTTTATATAAAAATTAAATGAGAATTATTATATTAATTAATAAAATTTGAAGAATTTCATTATTATAATTTAATGTTTCATTATTATAACTTTATTGNCCTATGAATGTATCACAAAATGCGCACACACAAGTGATTTTTAACTTGACGTATCAATATCATATTATATATATCATATATATATATATATATATATATA]


>consensus_1567#0 GACTACGAATTTACAACAACAACGACAAATCACGGAGCAGCTACGACGTGAAGCTGCTTT AAAACGAATTACGGTTAGCAAAGCTGTCGAAGATATCATGAAATATATCACAGAACACGA ACAGGAAGATTATCTTTTGGTTGGTTTTTCATCACAAAAATCAAATCCCTTTCGTGAAAG AAGTTACTGTACCATTTTTTAAACTTGCATGTTTAAAATAAAACAAATTATTTTAATTTT TTTCATTAAATATTCAAATTTTAATGTTTAAATTAATATATTGTAATATCATTTATATTA TGAATATTCAATATACATTTAATTCAATTTAATTTAATTCAGATCATCATTNNNTTATTT TTTATATATATAAAAAATATATTCATTTTGATATTTTGATATTTTGATATTCATTTTATA TAAAAATTAAATGAGAATTATTATATTAATTAATAAAATTTGAAGAATTTCATTATTATA ATTTAATGTTTCATTATTATAACTTTATTGNCCTATGAATGTATCACAAAATGCGCACAC ACAAGTGATTTTTAACTTGACGTATCAATATCATATTATATATATCATATATATATATAT ATATATATATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)